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野生型p53对肝癌细胞POLD1基因表达及细胞恶性表型的影响 被引量:4
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作者 韦长元 刘起理 +2 位作者 廖柳凤 徐恒 谭晓虹 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2011年第23期2443-2449,共7页
目的:探讨野生型p53对人肝癌细胞SMMC-7721细胞增殖和细胞恶性表型影响的一种可能机制.方法:设计并构建p53特异性小干扰shRNA绿色荧光真核表达质粒(p53-siRNA)和表达EGFP-p53融合蛋白的p53绿色荧光真核增强表达质粒(pEGFP-p53),通过脂质... 目的:探讨野生型p53对人肝癌细胞SMMC-7721细胞增殖和细胞恶性表型影响的一种可能机制.方法:设计并构建p53特异性小干扰shRNA绿色荧光真核表达质粒(p53-siRNA)和表达EGFP-p53融合蛋白的p53绿色荧光真核增强表达质粒(pEGFP-p53),通过脂质体Lipofection-2000介导转染,将表达pEGFP-p53重组质粒、p53-siRNA及空载体pEGFP-C1转染入SMMC-7721细胞;经G418筛选,获得稳定细胞系7721-p53、7721-C1;7721-p53RNAi、7721-NC.通过RT-PCR检测转染后p53、POLD1mRNA表达水平.通过生长曲线测定,克隆形成实验,了解SMMC-7721细胞在p53表达水平改变后细胞癌性的变化.结果:与人肝癌细胞SMMC-7721比较,转染质粒pEGFP-p53的野生型p53高表达组,p53mRNA表达量增高,POLD1基因的表达量降低;而转染pGPU6/GFP/neo-p53i-769的p53低表达组,p53mRNA表达量降低,POLD1mRNA表达量增高,其他组较空白对照无明显变化.对高表达野生型p53的人肝癌细胞系SMMC-7721-pEGFP-C1-p53,低表达野生型p53的人肝癌细胞系SMMC-7721-pGPU6/GFP/neo-p53i-769,和普通人肝癌细胞SMMC-7721分别进行MTT和平板克隆形成实验.MTT结果发现:SMMC-7721-pGPU6/GFP/neo-p53i-769的细胞其生长速度比普通肝癌细胞的要快,而SMMC-7721-pEGFP-p53的细胞较普通肝癌细胞生长速度较慢.克隆形成实验结果显示:pEGFP-C1-p53、pGPU6/GFP/neo-p53i-769组克隆形成率分别为38.1%和72.6%,与普通肝癌细胞SMMC-7721的克隆形成率52.6%相比,均有统计学差异(P<0.05).结果显示:在人肝癌细胞SMMC-7721中,野生型p53高表达组能够抑制POLD1的基因转录,并抑制细胞增殖活性;而低表达组能够促进POLD1的基因转录,促进细胞增殖.结论:p53对POLD1的调控作用可能是p53对肝癌细胞增殖和细胞恶性表型影响的一种新的机制. 展开更多
关键词 SMMC-7721 pold1 P53 RNA干扰
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P53亚细胞定位变化对POLD1基因启动子活性的影响 被引量:9
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作者 朱晓宇 徐恒 +5 位作者 李莉 张海江 宋楠萌 孙建华 石磊 桑建利 《自然科学进展》 北大核心 2006年第5期555-562,共8页
POLD1基因编码DNA聚合酶δ(pol δ)的催化亚基.体外实验表明p53能够抑制POLD1 基因启动子活性.文中探讨p53是否在细胞内直接与POLD1启动子结合调节POLD1基因表达.在瞬时转染pEGFP-p53重组质粒的人乳腺癌MCF7细胞中,p53表达增强;RT-PC... POLD1基因编码DNA聚合酶δ(pol δ)的催化亚基.体外实验表明p53能够抑制POLD1 基因启动子活性.文中探讨p53是否在细胞内直接与POLD1启动子结合调节POLD1基因表达.在瞬时转染pEGFP-p53重组质粒的人乳腺癌MCF7细胞中,p53表达增强;RT-PCR结果显示 POLD1基因mRNA表达受到抑制.染色体免疫共沉淀和荧光素酶报告基因实验证明p53在细胞内与POLD1启动子直接结合抑制其启动子活性.荧光显微镜观察发现EGFP-p53在G1期进入细胞核而在S期和G2期则被转运至细胞质.在稳定表达的pEGFP-p53细胞系中,细胞周期同步化后POLD1启动子活性在细胞周期各时相均处于较低水平.证明了细胞内p53高表达后通过直接与 POLD1启动子结合而抑制POLD1基因表达,且这种抑制作用不受细胞周期进程的影响. 展开更多
关键词 MCF7 pold1 启动子 P53 细胞周期 CHIP
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人突变型CDK4真核荧光表达质粒的构建及对人肝细胞SMMC-7702中POLD1基因表达的调控 被引量:2
3
作者 李永继 黄怡 +4 位作者 阮细玲 廖柳凤 吴琼 黄文涛 徐恒 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2012年第19期1705-1712,共8页
目的:构建包含突变型CDK4基因的真核绿色荧光表达载体,作为POLD1基因依赖的细胞周期复制调控的模型,研究POLD1基因相关的癌性增殖的机制,为干预细胞恶性增殖提供新的思路.方法:设计人突变型CDK4基因全长特异性引物进行P C R扩增人肝癌... 目的:构建包含突变型CDK4基因的真核绿色荧光表达载体,作为POLD1基因依赖的细胞周期复制调控的模型,研究POLD1基因相关的癌性增殖的机制,为干预细胞恶性增殖提供新的思路.方法:设计人突变型CDK4基因全长特异性引物进行P C R扩增人肝癌细胞系SMMC-7721总cDNA,以pEGFP-C1质粒为模板连接,得到重组质粒GFP-CDK4后进行测序和生物信息学比对分析;转染细胞分3组:实验组(转染突变型CDK4重组真核表达质粒GFP-CDK4),阴性对照组(转染空载体pEGFP-C1组)和空白对照组(SMMC-7702).通过MTT试验分析细胞增殖变化;实时荧光定量PCR技术检测CDK4、POLD1及细胞周期相关因子的表达量,Western blot检测蛋白表达的差异.结果:成功构建了人突变型CDK4基因真核表达质粒GFP-CDK4,转染到肝细胞SMMC-7702后使细胞表达融合绿色荧光的C D K4蛋白;S M M C-7721细胞中突变型的C D K4存在5个碱基突变,4个碱基插入,2个碱基缺失,这使得5个氨基酸序列发生了改变;与空白对照组及阴性对照组相比,实验组细胞增殖明显升高(0.826±0.08vs0.596±0.06,0.609±0.10,F=7.033,均P<0.05);实验组CDK4mRNA表达水平差异明显(1.94±0.11vs1.01±0.00,1.05±0.12,F=54.046,P<0.01),POLD1mRNA相应地升高(2.47±0.25vs1.16±0.00,1.26±0.23,F=135.496,P<0.01);稳定转染细胞的蛋白水平变化趋势与基因相同,其中实验组CDK4(0.65±0.03vs0.41±0.03,0.39±0.05,F=14.665,均P<0.05),P125(0.54±0.04vs0.30±0.07,0.25±0.06,F=11.788,均P<0.05).结论:人突变型CDK4基因的真核表达载体GFP-CDK4显著促进肝细胞的增殖能力,这与POLD1基因及P125蛋白的高表达相关. 展开更多
关键词 肝细胞癌 突变 CDK4 pold1
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RNA干扰技术抑制人肝癌细胞POLD1基因表达的研究 被引量:2
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作者 吴琼 黄文涛 +3 位作者 黄怡 廖柳凤 谭晓红 徐恒 《广西医学》 CAS 2014年第5期549-551,共3页
目的应用RNA干扰技术抑制人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的表达,探索该技术干预肝癌的可行性。方法制备4个针对人POLD1基因的shRNA表达质粒,转染SMMC-7721细胞48 h后,荧光定量PCR法检测POLD1基因的表达,CCK-8检测细胞生长情况。结果测... 目的应用RNA干扰技术抑制人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的表达,探索该技术干预肝癌的可行性。方法制备4个针对人POLD1基因的shRNA表达质粒,转染SMMC-7721细胞48 h后,荧光定量PCR法检测POLD1基因的表达,CCK-8检测细胞生长情况。结果测序鉴定证实4个shRNA表达质粒构建成功,将其转染SMMC-7721细胞后,NEO-POLD1-1和NEO-POLD1-4表达质粒抑制效果明显,使SMMC-7721细胞的增殖受到抑制,并且使POLD1基因表达在mRNA水平抑制,NEO-POLD1-1相对表达量为(0.1425±0.0205),NEO-POLD1-4相对表达量为(0.209±0.009)。结论针对POLD1基因设计的shRNA在体外有效地抑制了POLD1基因mRNA的表达和肝癌细胞的增殖,且实现RNA干扰具有序列选择性。 展开更多
关键词 肝肿瘤 pold1基因 RNA干扰技术
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POLD1基因反义RNA对人正常肝细胞和肝癌细胞增殖的影响 被引量:1
5
作者 吴琼 黄怡 +1 位作者 谭晓虹 徐恒 《广西医学》 CAS 2015年第7期885-887,共3页
目的分析POLD1基因的反义RNA对人肝癌细胞SMMC-7721和人正常肝细胞HL-7702增殖的影响,以探讨利用POLD1基因反义RNA干预治疗肝癌的可行性。方法构建人POLD1基因的反义RNA表达质粒;将实验分为阴性对照组(转染空质粒的肝癌细胞SMMC-7721和... 目的分析POLD1基因的反义RNA对人肝癌细胞SMMC-7721和人正常肝细胞HL-7702增殖的影响,以探讨利用POLD1基因反义RNA干预治疗肝癌的可行性。方法构建人POLD1基因的反义RNA表达质粒;将实验分为阴性对照组(转染空质粒的肝癌细胞SMMC-7721和肝细胞HL-7702)、空白对照组(未转染质粒的肝癌细胞SMMC-7721和肝细胞HL-7702)和实验组(转染人POLD1基因反义RNA表达质粒的肝癌细胞SMMC-7721和肝细胞HL-7702);采用CCK-8法分析细胞增殖情况。结果在转染0 h、24 h、48 h、72 h后,3组间肝细胞HL-7702的450 nm处吸光度值(A450值)差异无统计学意义(P>0.05)。实验组肝癌细胞SMMC-7721在转染24 h、48 h、72 h后,A450值均低于空白对照组和阴性对照组(P<0.05)。结论 POLD1基因的反义RNA可在对正常肝细胞生长无明显影响下抑制肝癌细胞的增殖。 展开更多
关键词 肝肿瘤 pold1基因 反义RNA 正常肝细胞 细胞增殖
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人肝癌SMMC-7721细胞中POLD1基因CDS突变的检测
6
作者 黄文涛 吴琼 +2 位作者 李锦源 黄怡 徐恒 《中国癌症防治杂志》 CAS 2013年第1期35-38,共4页
目的检测人肝癌细胞株SMMC-7721中POLD1基因CDS的突变情况,以期从DNA复制最关键酶的编码基因POLD1的突变为干预细胞恶性增殖提供新的思路。方法设计人POLD1基因CDS特异性引物,以人肝癌细胞株SMMC-7721总RNA为模板进行RT-PCR扩增,将扩增... 目的检测人肝癌细胞株SMMC-7721中POLD1基因CDS的突变情况,以期从DNA复制最关键酶的编码基因POLD1的突变为干预细胞恶性增殖提供新的思路。方法设计人POLD1基因CDS特异性引物,以人肝癌细胞株SMMC-7721总RNA为模板进行RT-PCR扩增,将扩增产物纯化后加入"腺嘌呤"并与T载体连接,将连接产物进行测序,与数据库中的序列进行比对。结果成功扩增了人肝癌细胞中POLD1基因的CDS片段。SMMC-7721细胞中POLD1基因的CDS存在11个碱基替换,1个碱基缺失。结论人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的CDS发生了突变,进而导致其编码的氨基酸序列发生改变。 展开更多
关键词 肝肿瘤 pold1 突变
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P21对胃癌细胞MGC-803的增殖抑制及对POLD1基因表达的调控 被引量:5
7
作者 阮细玲 李永继 +2 位作者 吴琼 廖柳凤 徐恒 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2011年第19期1990-1995,共6页
目的:研究P21对POLD1基因的调控通路,以探索阻断癌细胞恶性增殖的机制.方法:实验主要分3组:阴性对照组(转染空载体pXJ41-neo的803-pXJ细胞)、空白对照组(胃癌细胞MGC-803)、实验组(转染P21重组真核表达质粒pXJ41-p21的803-p21细胞).MTT... 目的:研究P21对POLD1基因的调控通路,以探索阻断癌细胞恶性增殖的机制.方法:实验主要分3组:阴性对照组(转染空载体pXJ41-neo的803-pXJ细胞)、空白对照组(胃癌细胞MGC-803)、实验组(转染P21重组真核表达质粒pXJ41-p21的803-p21细胞).MTT实验分析细胞增殖变化,流式细胞仪检测细胞凋亡水平,实时荧光定量PCR技术检测基因表达水平的变化,Westernblot分析蛋白表达差异.结果:MTT实验显示,与空白对照和阴性对照组相比,实验组细胞增殖受到明显抑制,凋亡率(%)增高(11.36±0.51vs7.39±0.17,7.69±0.47,F=85.338,均P<0.05).实验组P21mRNA表达水平显著提高(2.15±0.23vs1.05±0.11,1.00±0.00,F=59.054,均P<0.05),POLD1则显著下调(0.45±0.07vs1.09±0.13,1.00±0.00,F=49.907,均P<0.05);P21、P125蛋白表达变化与基因变化相一致.cyclinE、Rb1基因表达均上调,CDK2基因表达下调,c-myc基因表达则变化不大.结论:P21抑制了胃癌细胞的增殖、促进其凋亡,同时抑制了POLD1基因的表达,这种抑制作用可能通过CDK2、cyclinE、Rb1等细胞周期因子实现. 展开更多
关键词 胃癌 P21 pold1 表达调控
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野生型p53对SMMC-7721细胞中POLD1基因的影响 被引量:4
8
作者 刘起理 谭晓虹 +2 位作者 徐恒 韦长元 洪伟 《中国癌症防治杂志》 CAS 2011年第1期5-9,共5页
目的探讨野生型p53基因表达对人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的影响。方法设计并构建p53特异性小干扰shRNA绿色荧光真核表达质粒(p53-siRNA)和表达EGFP-p53融合蛋白的p53绿色荧光真核增强表达质粒(pEGFP-p53),通过稳定转染,将表达pEGFP... 目的探讨野生型p53基因表达对人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的影响。方法设计并构建p53特异性小干扰shRNA绿色荧光真核表达质粒(p53-siRNA)和表达EGFP-p53融合蛋白的p53绿色荧光真核增强表达质粒(pEGFP-p53),通过稳定转染,将表达pEGFP-p53重组质粒、p53-siRNA转染入SMMC-7721细胞;经G418筛选,获得稳定细胞系7721-p53、7721-p53RNAi。通过RT-PCR检测转染后p53、POLD1的mRNA。结果在人肝癌细胞SMMC-7721中,野生型p53高表达组能够抑制POLD1的基因转录(P<0.001);而低表达组能够促进POLD1的基因转录(P<0.001)。结论在人肝癌细胞SMMC-7721中,p53能够调控POLD1的基因转录。 展开更多
关键词 SMMC-7721 pold1 P53 RNA干扰
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G1期细胞周期相关蛋白对POLD1基因启动子活性的调控 被引量:4
9
作者 徐恒 朱晓宇 +4 位作者 张海江 石磊 李莉 宋楠萌 桑建利 《自然科学进展》 北大核心 2007年第6期716-723,共8页
POLD1基因编码DNA聚合酶δ的催化亚基.然而作为最重要的复制蛋白,目前并不清楚其表达的细胞周期调控机制.研究中运用细胞周期同步化及荧光素酶报告基因测定了POLD1启动子在细胞周期不同时相的活性,结果显示启动子活性随着细胞周期进程... POLD1基因编码DNA聚合酶δ的催化亚基.然而作为最重要的复制蛋白,目前并不清楚其表达的细胞周期调控机制.研究中运用细胞周期同步化及荧光素酶报告基因测定了POLD1启动子在细胞周期不同时相的活性,结果显示启动子活性随着细胞周期进程而变化,在早S期最高.为进一步确定调控POLD1表达的细胞周期相关因子,应用不同质粒转染MCF7细胞,分别筛选得到稳定细胞系.荧光素酶实验表明增强p53或p21的表达,抑制CyclinE或CDK2的表达都能抑制POLD1启动子活性;而抑制CDK4或Cyclin D1的表达对启动子活性没有明显影响.瞬时共转染实验进一步验证Cyclin E或CDK2受到抑制后能够降低POLD1启动子活性.研究初步探讨了POLD1基因表达的细胞周期调控通路,进一步了解细胞周期因子对DNA复制体调控的复杂机制. 展开更多
关键词 MCF7 细胞周期调控 pold1基因表达 启动子
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白藜芦醇通过下调POLD1抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞上皮间质转化 被引量:2
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作者 王梦欣 梁至洁 +5 位作者 黄东琳 万言 蒋洪棉 黎洪棉 陈茂剑 韦长元 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 2021年第5期445-450,共6页
目的探讨白藜芦醇(RSV)通过下调POLD1对MDA-MB-231细胞上皮间质转化的影响。方法CCK-8检测RSV对MDA-MB-231细胞活性的抑制能力。使用重组慢病毒转染MDA-MB-231细胞构建POLD1-OE及POLD1-NC细胞系,RSV分别刺激各细胞后,蛋白印迹法检测POLD... 目的探讨白藜芦醇(RSV)通过下调POLD1对MDA-MB-231细胞上皮间质转化的影响。方法CCK-8检测RSV对MDA-MB-231细胞活性的抑制能力。使用重组慢病毒转染MDA-MB-231细胞构建POLD1-OE及POLD1-NC细胞系,RSV分别刺激各细胞后,蛋白印迹法检测POLD1、EMT相关蛋白E-cadherin、N-cadherin及Vimentin的表达;Transwell侵袭和划痕实验分别检测各实验组细胞的侵袭和迁移能力。结果RSV能显著抑制MDA-MB-231细胞的存活率,同时能够降低POLD1、N-cadherin及Vimentin的表达,上调E-cadherin的表达,且明显抑制细胞的迁移和侵袭能力;但上述作用效应在POLD1过表达的MDA-MB-231中被一定程度拮抗。结论RSV能够抑制MDA-MB-231细胞的活性及EMT,下调POLD1是RSV抑制MDA-MB-231细胞EMT的关键机制之一。 展开更多
关键词 白藜芦醇 乳腺癌 pold1 上皮间质转化
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POLD1基因突变及蛋白表达在胃癌组织中的临床意义 被引量:1
11
作者 阮细玲 吴传智 +3 位作者 翁阳 黄幼生 吴琼 徐恒 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第5期843-847,共5页
目的:观察DNA聚合酶δ(polymerase data, Polδ)的催化亚基p125与胃癌细胞恶性增殖的关系,并探讨p125的编码基因POLD1与胃癌发生、发展的关系。方法:采用免疫组化法检测胃癌组织及癌旁组织中p125的表达;沉默胃癌细胞中POLD1基因,用MTT... 目的:观察DNA聚合酶δ(polymerase data, Polδ)的催化亚基p125与胃癌细胞恶性增殖的关系,并探讨p125的编码基因POLD1与胃癌发生、发展的关系。方法:采用免疫组化法检测胃癌组织及癌旁组织中p125的表达;沉默胃癌细胞中POLD1基因,用MTT实验检测POLD1基因沉默前后胃癌细胞的增殖速率。采用Sanger测序法对胃癌细胞株MGC-803中POLD1基因cDNA进行测序。结果:免疫组化结果显示,胃癌组织中p125表达明显高于癌旁组织。MTT实验结果显示,POLD1基因沉默的胃癌细胞生长速率明显低于对照组细胞。Sanger测序结果显示,胃癌细胞中POLD1基因cDNA的碱基序列发生了4处点突变,1个碱基插入,1个碱基缺失。结论:p125高表达与胃癌细胞恶性增殖相关;胃癌细胞中POLD1基因cDNA碱基序列发生点突变、碱基插入从而引起其氨基酸序列改变,这有可能是导致胃癌细胞中p125高表达并引起癌细胞恶性增殖的分子机制之一。 展开更多
关键词 胃癌 p125 pold1 细胞增殖 测序
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p21调控胃癌POLD1基因的初步机制探究
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作者 阮细玲 黄幼生 +4 位作者 翁阳 杨丞 陈孟柚 胡嘉影 徐恒 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期404-409,共6页
目的分析p21调控胃癌POLD1基因表达的初步机制,以探索基于降低胃癌POLD1基因表达并阻断癌细胞恶性增殖的分子靶点。方法利用生物信息学软件Cytoscape、String分析p21与POLD1基因的相互关系;干扰胃癌细胞中p21基因的表达,采用荧光定量PCR... 目的分析p21调控胃癌POLD1基因表达的初步机制,以探索基于降低胃癌POLD1基因表达并阻断癌细胞恶性增殖的分子靶点。方法利用生物信息学软件Cytoscape、String分析p21与POLD1基因的相互关系;干扰胃癌细胞中p21基因的表达,采用荧光定量PCR及Western blot法检测POLD1基因及细胞周期调控因子CDK2、CDK4、p53、PCNA的表达变化,采用免疫共沉淀实验分析p21与POLD1基因编码的蛋白p125之间的相互作用。结果生物信息学分析发现,p21通过CDK2、PCNA与POLD1直接关联,并与CDK4等细胞周期因子间接相关。干扰胃癌细胞中p21的表达后,POLD1、CDK2、CDK4表达上调,而p53表达下调。免疫共沉淀实验未检测到p21与p125直接相互作用。结论p21能负调控胃癌中POLD1基因的表达,这种调控作用与细胞周期调控因子CDK2、CDK4、p53、PCNA等密切相关。 展开更多
关键词 胃肿瘤 P21 pold1 p125 细胞周期
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POLD1对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭的影响及调控机制 被引量:1
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作者 张莹 吴利 +3 位作者 陈羽菱 林云涛 沈月洪 杨宏宇 《中国口腔颌面外科杂志》 CAS 2021年第4期302-308,共7页
目的:探讨人源DNA聚合酶δ催化亚基(POLD1)的表达对口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期的影响及其相关机制。方法:使用生物信息数据分析POLD1在头颈部鳞癌及癌旁组织中的表达,利用免疫... 目的:探讨人源DNA聚合酶δ催化亚基(POLD1)的表达对口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)细胞增殖、迁移、侵袭、细胞周期的影响及其相关机制。方法:使用生物信息数据分析POLD1在头颈部鳞癌及癌旁组织中的表达,利用免疫组织化学染色检测POLD1在40对口腔鳞癌及癌旁组织中的表达。慢病毒感染SCC9及CAL27细胞系,蛋白免疫印迹检测POLD1在稳转细胞系中的表达。CCK-8实验和EdU实验检测细胞增殖能力,划痕实验和Transwell迁移和侵袭实验检测细胞的迁移和侵袭能力。流式细胞周期实验检测POLD1对细胞周期的影响。蛋白免疫印迹法研究POLD1影响细胞周期的相关通路。采用SPSS 21.0软件包和GraphPad Prism进行数据分析和绘图。结果:POLD1在头颈部鳞癌及40对OSCC组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.001);慢病毒感染SCC9及CAL27细胞系后,POLD1的表达显著下降,且在细胞核及细胞质中的表达降低。实验组SCC9及CAL27细胞的增殖、迁移、侵袭能力下降。流式细胞周期实验检测到实验组细胞在G2/M期阻滞,G1期缩短。蛋白免疫印迹结果显示,实验组P-Cdc2(Tyr15)、P-Rb(Ser807)表达显著升高。结论:敲低POLD1的表达可抑制OSCC细胞增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 口腔鳞癌 pold1 增殖 迁移 侵袭 细胞周期/G2期阻滞 P-Cdc2
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POLE/POLD1突变对结直肠癌预后及免疫治疗影响的生物信息学分析
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作者 赵龙 杨长江 +1 位作者 叶颖江 申占龙 《肿瘤学杂志》 CAS 2024年第6期439-448,共10页
[目的]利用生物信息学方法对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的DNA聚合酶ε(POLE)和DNA聚合酶δ1(POLD1)的突变情况进行分析,并探索两者对CRC预后及免疫治疗的影响。[方法]基于TCGA数据库的数据集,利用c BioPortal工具对所有癌症中的... [目的]利用生物信息学方法对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)中的DNA聚合酶ε(POLE)和DNA聚合酶δ1(POLD1)的突变情况进行分析,并探索两者对CRC预后及免疫治疗的影响。[方法]基于TCGA数据库的数据集,利用c BioPortal工具对所有癌症中的POLE/POLD1的改变及其预后进行分析,利用MSIsensor、MANTIS两种评分系统对POLE/POLD1野生型和突变型的CRC患者微卫星不稳定性进行评价,并利用TIMER数据库分析CRC的免疫细胞浸润以及免疫检查点表达与POLE/POLD1突变之间相关性。[结果]在CRC中POLE/POLD1基因的改变频率为6%,且均以错义突变为主。在泛癌中POLE的突变后患者无进展生存期(P<0.001)、无病生存期(P<0.001)及疾病特异性生存期(P=0.017 8)均显著延长。POLE/POLD1突变型CRC患者的微卫星不稳定性占比相比较于野生型患者显著提高(P<0.001),且免疫检查点相关基因CD274、HAVCR2、PDCD1、CTLA4、LAG3、TIGIT和PDCD1LG2的表达均显著上升。CRC中POLE和POLD1基因表达均与肿瘤突变负荷显著相关。此外,CRC中POLE/POLD1突变还与CD8^(+)T细胞、中性粒细胞、树突状细胞等免疫细胞的浸润相关。[结论]POLE/POLD1基因的改变在CRC中较为常见,在泛癌中POLD1突变与患者预后相关。POLE/POLD1基因突变后可能造成微卫星不稳定性增高、免疫检查点的表达上调和免疫细胞浸润程度增加,其可能成为免疫治疗的新靶点。 展开更多
关键词 POLE突变 pold1突变 结直肠肿瘤 生物信息学 免疫治疗
原文传递
POLD1基因在非小细胞肺癌中表达的生物信息学分析及相关性研究
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作者 何梦钰 陈玲 +1 位作者 李南 金琳羚 《中国呼吸与危重监护杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期104-110,共7页
目的应用生物信息学方法探究POLD1基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及临床意义。方法应用TIMER数据库分析POLD1在NSCLC及正常肺组织中的表达差异,UALCAN数据库进一步验证并分析POLD1在不同临床亚组间的表... 目的应用生物信息学方法探究POLD1基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及临床意义。方法应用TIMER数据库分析POLD1在NSCLC及正常肺组织中的表达差异,UALCAN数据库进一步验证并分析POLD1在不同临床亚组间的表达。利用GEPIA、TIMER数据库探索POLD1表达水平与NSCLC患者预后的关系,cBioPortal、STRING数据库研究POLD1在NSCLC中突变及蛋白相互作用,TISIDB数据库探索POLD1表达与NSCLC肿瘤免疫浸润的关系。结果POLD1在肺腺癌及肺鳞癌组织中表达均高于正常组织。POLD1低表达的肺腺癌患者较高表达患者预后更好,POLD1与肺鳞癌患者预后无明显相关性。突变分析发现1.2%的肺腺癌患者及1.8%的肺鳞癌患者携带POLD1突变,主要为错义突变。蛋白互作分析发现POLD1可能与POLD2、POLD3、POLD4、POLE、RPA1、PCNA、MSH6、MSH2、FEN1蛋白有相互作用,功能集中于DNA复制、错配修复等。此外,POLD1与NSCLC组织中免疫细胞浸润相关。结论POLD1在NSCLC中高表达,其表达与肺腺癌生存预后呈负相关。POLD1基因可能成为NSCLC早期诊断、预后判断及免疫疗效标志物。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 pold1 预后 生物信息分析
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POLD1基因突变型子宫内膜癌的免疫特征分析
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作者 王樱儒 苏小敏 +1 位作者 黄育刚 汤显斌 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2023年第12期198-204,共7页
探讨POLD1(DNA polymeraseδ,Polδ)基因突变型子宫内膜癌(EC)的免疫特征。方法 基于TCGA数据库,分析POLD1基因突变的免疫浸润情况,主要包括CD4、CD8、PD-L1 mRNA的表达及相关预后分析。结果 基于TCGA数据集,与POLD1野生型EC相比,POLD1... 探讨POLD1(DNA polymeraseδ,Polδ)基因突变型子宫内膜癌(EC)的免疫特征。方法 基于TCGA数据库,分析POLD1基因突变的免疫浸润情况,主要包括CD4、CD8、PD-L1 mRNA的表达及相关预后分析。结果 基于TCGA数据集,与POLD1野生型EC相比,POLD1突变型的趋化因子家族(如CXCL9、CXCL13)、同源异型盒家族(EN2、HOXC10)及免疫应答基因的表达有显著差异(均P<0.05)。POLD1突变型样本中,主要富集的信号途径包括免疫调控、细胞周期、DNA复制等(均P<0.01)。相较于POLD1野生型,POLD1突变型EC样本中CD8+ T细胞、髓样树突状细胞的丰度较高(均P<0.05)。TISIDB平台分析表明,POLD1突变状态下,显著驱动了免疫细胞的生物学行为,包括树突状细胞、NK细胞、T细胞等免疫细胞的募集和活化、淋巴细胞归巢等。另外,POLD1突变型样本中,多种免疫检查点抑制基因(包括PD-L1、PD-1、LAG等)显著高表达。基于TCGA数据库对免疫细胞标记物亚组的预后分析显示:免疫细胞标记物(CD4、T-bet、IFN-γ、CD8A、EOMES)或PD-L1高表达且POLD1突变型亚组生存期最长,免疫细胞标记物(CD4、T-bet、IFN-γ、CD8A、EOMES)或PD-L低表达且POLD1野生型亚组生存期最短,均具有统计学意义(P<0.05)。结论 EC患者中,免疫细胞浸润丰度、PD-L1表达情况对POLD1突变型的预后或治疗有重要的临床价值。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 pold1突变 免疫特征分析 生物信息学分析
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反义RNA技术对抑制人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因表达的研究 被引量:5
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作者 吴琼 黄文涛 +1 位作者 黄怡 徐恒 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2013年第4期241-244,共4页
目的:应用反义RNA技术抑制人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的表达,探索采用该技术干预肝癌的可行性。方法:制备人POLD1基因的反义RNA表达质粒,同时建立空白对照组与阴性对照组,由此将实验分为阴性对照组(转染空载体的SMMC-7721细胞)、... 目的:应用反义RNA技术抑制人肝癌细胞SMMC-7721中POLD1基因的表达,探索采用该技术干预肝癌的可行性。方法:制备人POLD1基因的反义RNA表达质粒,同时建立空白对照组与阴性对照组,由此将实验分为阴性对照组(转染空载体的SMMC-7721细胞)、空白对照组(肝癌细胞SMMC-7721)和实验组(转染人POLD1基因反义RNA表达质粒的肝癌SMMC-7721细胞)3组。MTT实验分析细胞增殖变化,并在转染SMMC-7721细胞48h后,实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测POLD1基因的表达。结果:MTT实验显示,与空白对照和阴性对照组相比,转染了反义RNA的实验组细胞增殖受到明显抑制。在转染后24~72h,实验组吸光度24h为0.306 7±0.015 4,48h为0.459 2±0.033 2,72h为0.567 1±0.061 1,与空白和阴性对照组相比,P值均<0.05。实时荧光定量PCR实验显示,实验组POLD1的mRNA表达明显下调为0.142 5±0.020 5,阴性对照组为1.017±0.188,空白对照组为1.00±0.00(F=26.5,P<0.05),说明POLD1基因表达受抑制。蛋白质印迹实验显示,POLD1基因蛋白水平(p125)变化趋势与mRNA相同,均为下调,其中实验组为0.222 3±0.009 7,阴性对照组为0.237 9±0.005 9,空白对照组为0.235 4±0.003 4(F=1 365.754,P值均<0.05),说明反义RNA可抑制p125蛋白表达,结论与基因水平趋势一致。结论:针对POLD1基因设计的反义RNA体外抑制了肝癌细胞SMMC-7721的增殖,这与POLD1在基因和蛋白水平的表达下调有关。 展开更多
关键词 肝肿瘤 pold1 反义RNA 基因表达
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POLD1基因启动子中CDE/CHR元件的鉴定及功能分析 被引量:2
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作者 宋楠萌 朱晓宇 +3 位作者 石磊 安婧 武彦威 桑建利 《中国科学(C辑)》 CSCD 北大核心 2009年第5期449-459,共11页
POLD1基因编码真核生物DNA聚合酶δ的催化亚基,其表达调控与细胞周期密切相关.为了探讨POLD1基因表达的调控机理,本研究首次在POLD1基因启动子中鉴定出CDE/CHR元件,随后通过分析元件序列定点突变对其转录活性的影响,以及与细胞周期相关... POLD1基因编码真核生物DNA聚合酶δ的催化亚基,其表达调控与细胞周期密切相关.为了探讨POLD1基因表达的调控机理,本研究首次在POLD1基因启动子中鉴定出CDE/CHR元件,随后通过分析元件序列定点突变对其转录活性的影响,以及与细胞周期相关的转录因子E2F和CDK及抑制因子p21WAF1/Cip1对其转录活性的调控作用,对此元件的功能进行了分析.结果显示,CDE/CHR元件序列突变后POLD1基因启动子转录活性明显升高,其转录活性不再受到E2F和p21WAF1/Cip1的调控,转录活性的细胞周期依赖性调控消失.与此同时本研究对直接参与CDE/CHR元件调控的蛋白进行了初步检测,结果显示,至少存在3种蛋白复合体能够与POLD1基因启动子中的CDE/CHR元件结合.由此证实,POLD1基因启动子中存在CDE/CHR元件,此元件与POLD1基因转录的细胞周期依赖性调控直接相关. 展开更多
关键词 pold1基因 启动子活性 CDE/CHR元件 定点突变
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POLE/POLD1突变在肿瘤免疫治疗预后中的价值 被引量:3
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作者 周越 苑珩珩 +1 位作者 韩宇 白玉贤 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期215-220,共6页
免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)已在多种肿瘤中显示出持续的临床疗效。错配修复蛋白缺陷(mismatch repair deficient,dMMR)或微卫星高度不稳定性(microsatellite instability-high,MSI-H)的转移性结直肠癌患者已... 免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors,ICIs)已在多种肿瘤中显示出持续的临床疗效。错配修复蛋白缺陷(mismatch repair deficient,dMMR)或微卫星高度不稳定性(microsatellite instability-high,MSI-H)的转移性结直肠癌患者已从免疫治疗中获益。然而,部分PD-L1阴性和微卫星稳定(microsatellite stability,MSS)型结直肠癌患者对免疫治疗也有持续的反应。因此,为了给患者制定最佳治疗方案,选择能够识别免疫检查点阻断疗效的可靠生物标志物,实现精准治疗是至关重要的。DNA聚合酶亚基的关键编码基因POLE/POLD1是除MSI-H和肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)外,最具潜力的免疫治疗预测指标。全文就POLE/POLD1的分子机制及其突变在免疫治疗中的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 POLE/pold1 免疫治疗 生物标志物 肿瘤
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POLE/POLD1突变与肿瘤免疫治疗研究进展 被引量:1
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作者 麦宗炯 蒲恒颖 王峰 《科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期38-47,共10页
阐述了DNA聚合酶?(polymerase epsilon,POLE)和DNA聚合酶delta 1(polymerase delta 1,POLD1)基因编码的亚基参与DNA复制和校对,总结了POLE/POLD1突变对肿瘤突变负荷以及肿瘤内免疫细胞浸润的影响,综述了POLE/POLD1突变在子宫内膜癌、结... 阐述了DNA聚合酶?(polymerase epsilon,POLE)和DNA聚合酶delta 1(polymerase delta 1,POLD1)基因编码的亚基参与DNA复制和校对,总结了POLE/POLD1突变对肿瘤突变负荷以及肿瘤内免疫细胞浸润的影响,综述了POLE/POLD1突变在子宫内膜癌、结直肠癌、肺癌中的研究进展,并讨论了POLE/POLD1突变作为潜在的免疫检查点抑制剂疗效预测分子标志物面临的诸多挑战。 展开更多
关键词 POLE pold1 基因突变 免疫治疗 分子标志物
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