贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析

为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG岛及转录因子。结果表明,POLRMT基因启动子区存在2个SNP位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT基因核心启动子范围发生改变,SNP位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG岛增加1个。