智力发育迟缓新候选基因POSTN对脑损伤神经元体外保护作用研究

目的通过对1例智力发育迟缓患儿全外显子组测序(WES),旨在为该患儿寻找潜在的致病原因。方法纳入1例在复旦大学附属儿科医院(我院)住院期间诊断不明患儿,采用Sure Selct Human All Exon捕获试剂盒和Illumina Hi Seq2000测序平台,行WES检测;数据分析采用我院分子诊断中心建立的高通量测序数据分析流程;结果采用Sanger直接测序法进行验证。建立体外大鼠神经元原代培养和糖氧剥夺(OGD)模型,分为空白对照组(Sham+PBS亚组、Sham+POSTN亚组)、OGD组(OGD+PBS亚组和OGD+POSTN亚组),采用免疫荧光、LDH毒性检测、Brd U和TUNEL方法检测POSTN对2组及其亚组神经元生长增殖和凋亡的影响。结果患儿WES共检测到532 151个变异,筛选后检测到POSTN基因(NM_006475)外显子23:c.A2475T:p.G825G和外显子19:c.G2251A:p.E751K。Sanger测序显示p.G825G来自母亲,p.E751K来自父亲,符合复合杂合遗传模式。培养的大鼠原代神经元(MAP-2或Neu N阳性细胞)中有内源性POSTN的表达。LDH活性Sham+POSTN亚组与Sham+PBS亚组差异无统计学意义,OGD+POSTN亚组与OGD+PBS亚组差异有统计学意义。OGD+PBS亚组致神经元细胞缺氧2、6、12 d后比Sham+PBS亚组Brd U阳性的神经元数量增高,TUNEL阳性神经元凋亡也增高;OGD+POSTN亚组各时间点神经元增殖较OGD+PBS亚组均明显增高,但凋亡减少。结论 POSTN可以减少脑损伤后LDH对于神经元的细胞毒性,促进损伤后神经元的增殖,抑制凋亡。

胃癌组织POSTN mRNA表达与患者预后关系的大数据分析

目的探讨胃癌组织POSTN mRNA表达与患者预后的关系。方法利用Kaplan-Meier plotter在线生存分析数据库对胃癌组织POSTN mRNA表达与患者预后的关系进行大数据分析。结果全部876例胃癌患者癌组织POSTN mRNA表达与其总生存时间(OS)有关(P<0.05)。按Lauren分类分层,肠型胃癌组织POSTN mRNA表达、弥漫性胃癌组织POSTN mRNA表达均与患者OS有关(P均<0.05)。按性别分层,男性、女性胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达均与其OS有关(P均<0.05)。按HER2表达情况分层,HER2表达阴性及阳性胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达均与其OS有关(P均<0.05)。按临床分期分层,Ⅰ、Ⅱ期胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达与其OS无关(P均>0.05),Ⅲ、Ⅳ期胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达均与其OS有关(P均<0.05)。按病理分级分层,Ⅰ级胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达与其OS有关(P<0.05),Ⅱ、Ⅲ级胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达均与其OS无关(P均>0.05)。按治疗方式分层,采用单纯手术治疗及采用5-FU为基础的辅助治疗配合手术治疗的胃癌患者胃癌组织POSTN mRNA表达均与其OS有关(P均<0.05)。结论胃癌组织POSTN mRNA表达与患者预后有关。POSTN mRNA能够作为胃癌患者预后的独立预测因子。

基于TCGA数据库分析POSTN在头颈部鳞癌中的表达和临床意义

目的利用在线数据库和生物信息学方法分析POSTN基因在头颈部鳞状细胞癌中的差异表达对其预后的临床意义,寻找头颈部鳞状细胞癌新的生物标志物。方法使用TCGA公共数据库获取头颈部鳞癌患者的基本信息、POSTN的表达情况;利用Kaplan-Meier Plotter分析不同POSTN表达水平的头颈部鳞癌患者生存曲线;采用TIMER数据库分析POSTN与头颈部鳞癌中各种免疫细胞浸润的相关性;GEPIA数据库分析POSTN表达与免疫细胞标志物表达的相关性;GO和KEGG基因富集分析探索POSTN共表达基因的功能及其作用通路。结果POSTN在头颈部鳞癌中高表达(P<0.05),其表达与头颈部鳞癌患者的预后呈正相关;头颈部鳞癌患者的累积生存率与多种免疫细胞的浸润程度相关;POSTN表达水平与头颈部鳞癌中的巨噬细胞浸润程度呈正相关关系(P=0.024),并与M2型巨噬细胞标志物呈正相关关系(P<0.001),POSTN高表达促进巨噬细胞向M2型极化。富集分析显示POSTN与细胞外基质调节过程相关。结论POSTN表达与头颈部鳞癌患者预后及免疫浸润相关,并且其可能通过调节巨噬细胞极化而导致患者的不良预后。