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ssc-miR-196a靶向PPARGC1A基因影响猪骨骼肌发育
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作者 张展境 李淑怡 +5 位作者 张瑞 郑美丽 林涛 董新星 韩海银 白莹 《现代畜牧科技》 2024年第7期78-81,共4页
该研究运用miRsystem和MiRWalk 2个在线软件筛选与PPARGC1A基因具有潜在调控关系的microRNA;构建psiCHECK2-PPARGC1A-3’UTR-WT和psiCHECK2-PPARGC1A-3’UTR-MUT双荧光素酶报告载体,并检测候选microRNA与PPARGC1A基因间的靶向调控关系... 该研究运用miRsystem和MiRWalk 2个在线软件筛选与PPARGC1A基因具有潜在调控关系的microRNA;构建psiCHECK2-PPARGC1A-3’UTR-WT和psiCHECK2-PPARGC1A-3’UTR-MUT双荧光素酶报告载体,并检测候选microRNA与PPARGC1A基因间的靶向调控关系。结果显示,ssc-miR-196a与PPARGC1A基因具有潜在的调控关系,ssc-miR-196a可与PPARGC1A 3’UTR区结合并显著降低细胞中荧光素酶的活性(P<0.01),ssc-miR-196a在金华猪90日龄和180日龄背最长肌中的表达水平略高于大白猪,ssc-miR-196a在180日龄猪背最长肌中表达水平显著高于30日龄和90日龄(P<0.05)。ssc-miR-196a靶向结合PPARGC1A基因3’UTR,为进一步开展microRNA介导PPARGC1A基因调控猪骨骼肌发育方面的研究提供参考。 展开更多
关键词 ssc-miR-196a ppargc1A 背最长肌
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宁乡猪FTO和PPARGC1A基因多态性及其与肌内脂肪含量的关联研究
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作者 贺兴龙 高伟 +5 位作者 黄涛 王文梅 徐语涵 王桂文 李艺阳 曾青华 《湖南畜牧兽医》 2024年第4期37-41,共5页
试验旨在探索宁乡猪FTO和PPARGC1A基因的遗传变异,并分析这些变异位点与肌内脂肪(IMF)含量之间的相关性。试验采用PCR-RFLP的方法对135头宁乡去势公猪FTO基因外显子3处594C>G和PPARGC1A基因外显子9处1747A>C的多态性进行检测,并对... 试验旨在探索宁乡猪FTO和PPARGC1A基因的遗传变异,并分析这些变异位点与肌内脂肪(IMF)含量之间的相关性。试验采用PCR-RFLP的方法对135头宁乡去势公猪FTO基因外显子3处594C>G和PPARGC1A基因外显子9处1747A>C的多态性进行检测,并对这2个基因的多态性位点与宁乡猪IMF含量的关联性进行分析。结果表明:宁乡猪FTO-BstUI酶切位点存在多态性,达到Hardy-Weinberg平衡状态,TT基因型个体的IMF含量最高,其次为CT、CC基因型,TT基因型个体的IMF含量极显著高于CT基因型个体(P<0.01),与CC基因型个体IMF含量无显著差异(P>0.05)。PPARGC1A-DdeI酶切位点同样存在多态性,未达到Hardy-Weinberg平衡状态,GG基因型个体的IMF含量最高,与AA基因型的IMF含量无显著差异(P>0.05),但GG和AA基因型个体的IMF含量显著高于AG基因型个体的IMF含量(P<0.05)。综上所述,FTO和PPARGC1A基因DdeI酶切位点多态性与宁乡猪IMF含量显著关联,研究结果可为高IMF宁乡猪的早期选育提供参考。 展开更多
关键词 宁乡猪 FTO ppargc1A 肌内脂肪含量
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中国北方地区汉族男性PPARGC1基因多态性与耐力训练效果的关联性研究 被引量:8
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作者 何子红 胡扬 +2 位作者 刘刚 席翼 文立 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期156-160,共5页
目的:探讨中国北方平原地区汉族男子过氧化物酶体增殖受体γ辅激活因子α(PPARGC1)基因多态性分布特点以及与耐力训练效果的关联性。方法:102名无训练史的健康男子进行18周有氧耐力训练,测试训练前后的最大摄氧量、跑节省化。用PCR-RFL... 目的:探讨中国北方平原地区汉族男子过氧化物酶体增殖受体γ辅激活因子α(PPARGC1)基因多态性分布特点以及与耐力训练效果的关联性。方法:102名无训练史的健康男子进行18周有氧耐力训练,测试训练前后的最大摄氧量、跑节省化。用PCR-RFLP法分析PPARGC1基因的G482S、A2962G和T394T多态性。结果:(1)3个多态位点分布频率均符合H-W平衡,且有显著的种族差异。(2)A2962G多态性与ΔVO2max(ml/min/wt)可能关联,GG基因型群体显著性高于AG和AA,但GG基因型频率仅为3%;未发现其他单点多态性和单体型与训练敏感性有较强的关联。结论:PPARGC1基因的G482S和T394T多态性不是预测个体耐力训练敏感性的基因标记;对于A2962G,则有必要加大样本进一步确认。 展开更多
关键词 过氧化物酶体增殖受体γ辅激活因子α 有氧能力 中国北方地区 汉族男性 ppargc1基因 基因多态性 耐力训练
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猪PPARGC1A基因的遗传变异检测及与胴体性状的关联分析 被引量:4
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作者 韩雪蕾 刘榜 +2 位作者 彭勇波 刘雪颖 张庆德 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期587-590,共4页
采用PCR-SSCP方法检测PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪及其杂交群体中的遗传变异,并分析其对胴体性状的影响。猪PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪(n=24)、瑞典长白猪(n=26)、英国大白猪(n=23)、长大通(n=43)、大长通(n... 采用PCR-SSCP方法检测PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪及其杂交群体中的遗传变异,并分析其对胴体性状的影响。猪PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪(n=24)、瑞典长白猪(n=26)、英国大白猪(n=23)、长大通(n=43)、大长通(n=40)存在多态分布,在长白猪中只有AA基因型。基因型频率分析表明国外品种中CC基因型频率低于国内地方品种;性状关联分析结果表明:CC基因型个体的胸腰椎背膘厚、肩部背膘厚和三点平均背膘厚显著高于AA基因型个体,等位基因C是胸腰椎背膘厚和三点平均背膘厚的增效等位基因。 展开更多
关键词 ppargc1A PCR-SSCP 关联分析
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中国荷斯坦奶牛PPARGC1A基因内含子9的SNP与产奶性状的相关分析 被引量:3
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作者 王杰 原清会 +2 位作者 张明 曾长军 赖松家 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2010年第2期219-222,共4页
采用PCR产物直接测序的方法,对213头中国荷斯坦奶牛的PPARGC1A基因进行单核苷酸多态性分析,并研究不同基因型与产奶性状的相关关系。结果表明,PPARGC1A基因内含子9存在C>T SNP位点,可分为有CC、CT和TT这3种基因型,基因型频率分别为0.... 采用PCR产物直接测序的方法,对213头中国荷斯坦奶牛的PPARGC1A基因进行单核苷酸多态性分析,并研究不同基因型与产奶性状的相关关系。结果表明,PPARGC1A基因内含子9存在C>T SNP位点,可分为有CC、CT和TT这3种基因型,基因型频率分别为0.3568、0.6291和0.0141;该位点突变偏离Hardy-Weinberg平衡状态且中度多态;CC基因型与中国荷斯坦奶牛的乳脂肪率显著相关。PPARGC1A基因可以作为研究中国荷斯坦奶牛泌乳性状的候选基因。 展开更多
关键词 中国荷斯坦奶牛 ppargc1A基因 单核苷酸多态性 产奶量 乳脂率 乳蛋白率
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三个品种马PPARGC1A基因PCR-SSCP多态性分析 被引量:1
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作者 刘婷婷 孟军 +7 位作者 王建文 姚新奎 韩煜茹 晏华春 张亚昂 曾亚琦 王宁 朱文强 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1926-1931,共6页
【目的】研究三个品种马PPARGC1A基因的多态性,为马分子育种奠定一定基础。【方法】以焉耆马、伊犁马、纯血马共161匹马为对象,用PCR-SSCP、DNA测序等技术研究分析马PPARGC1A基因的多态性。【结果】焉耆马和伊犁马PPARGC1A基因均有多态... 【目的】研究三个品种马PPARGC1A基因的多态性,为马分子育种奠定一定基础。【方法】以焉耆马、伊犁马、纯血马共161匹马为对象,用PCR-SSCP、DNA测序等技术研究分析马PPARGC1A基因的多态性。【结果】焉耆马和伊犁马PPARGC1A基因均有多态性,在75682碱基处发生G→A的突变,导致等位基因A变为等位基因B,产生从、BB、AB 3种基因型,基因频率计算结果显示,焉耆马,伊犁马处于Hardy-Weinberg非平衡状态。【结论】PPARGC1A基因在焉耆马与伊犁马中均存在多态性。 展开更多
关键词 ppargc1A基因 PCR—SSCP 遗传多态性
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荷斯坦母牛PPARGC1A基因多态性与产奶性状关联分析 被引量:1
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作者 王凭青 何玺 +3 位作者 储明星 方丽 狄冉 安永福 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期601-608,共8页
设计18对引物,采用PCR-RFLP、PCR-PAGE及PCR-SSCP技术检测过氧化物酶增殖激活受体γ辅激活蛋白1α(peroxisome proliferator activated receptor gamma coactivator 1 alpha,PPARGC1A)基因在435头荷斯坦母牛中的多态性,分析该基因对荷... 设计18对引物,采用PCR-RFLP、PCR-PAGE及PCR-SSCP技术检测过氧化物酶增殖激活受体γ辅激活蛋白1α(peroxisome proliferator activated receptor gamma coactivator 1 alpha,PPARGC1A)基因在435头荷斯坦母牛中的多态性,分析该基因对荷斯坦母牛5个产奶性状(305 d产奶量、蛋白率、乳脂率、乳糖率、干物质率)的影响。结果表明仅引物P1、P2、P16和P18扩增片段存在多态性。引物P1扩增片段经HaeⅢ酶切产生CC、CT、TT3种基因型;TT和CT基因型乳脂率最小二乘均值显著高于CC基因型所对应的值(P<0.05),TT和CT基因型乳脂率最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。引物P2扩增片段经NheⅠ酶切产生AA、AC、CC 3种基因型;AA和AC基因型蛋白率最小二乘均值显著高于CC基因型所对应的值(P<0.05),AA和AC基因型蛋白率最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。对于引物P16扩增片段,检测到EE、EF、FF 3种基因型;EE、EF和FF基因型5个产奶性状最小二乘均值差异均不显著(P>0.05)。对于引物P18扩增片段,检测到GG、GH、HH3种基因型;GG、GH和HH基因型5个产奶性状最小二乘均值差异均不显著(P>0.05)。本研究结果初步表明PPARGC1A基因C85330T多态位点的T等位基因是提高奶牛乳脂率的一个潜在DNA标记,A103592C多态位点的A等位基因是提高奶牛乳蛋白率的一个潜在DNA标记。 展开更多
关键词 荷斯坦母牛 ppargc1A基因 多态性 产奶性状
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孕期运动调节高血压大鼠子代血管平滑肌表型的Ppargc1α去甲基化机制 被引量:1
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作者 陈渝 李珊珊 +3 位作者 张严焱 刘晨喆 李丽 石丽君 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期2122-2130,共9页
目的:探讨孕期运动是否抑制高血压大鼠子代血管重构及其可能的表观遗传机制。方法:选用自发性高血压大鼠(SHR)及其正常血压对照大鼠(WKY),同品系进行配种,见栓且阴道涂片见精子确定为配种成功,记为妊娠第1天。孕鼠随机分为安静(p-WKY-SE... 目的:探讨孕期运动是否抑制高血压大鼠子代血管重构及其可能的表观遗传机制。方法:选用自发性高血压大鼠(SHR)及其正常血压对照大鼠(WKY),同品系进行配种,见栓且阴道涂片见精子确定为配种成功,记为妊娠第1天。孕鼠随机分为安静(p-WKY-SED和p-SHR-SED)组和运动(p-WKY-EX和p-SHR-EX)组,每组25只。运动组进行无负重游泳运动(每天60 min,每周6 d,至妊娠第19天)。每天监测孕鼠进食量和体重;妊娠第21天,一部分孕鼠剖腹取胎鼠监测胎鼠体重和胎盘效率,另一部分孕鼠待自然分娩;雄性子代3月龄时,进行尾动脉无创血压监测,采用HE染色观察肠系膜动脉形态,采用RT-qPCR和Western blot检测肠系膜动脉过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α(PGC1α)的mRNA和蛋白水平及TET2蛋白水平,亚硫酸氢盐测序和ELISA分别检测肠系膜动脉Ppargc1α基因(编码PGC1α)甲基化水平和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)水平。结果:孕期运动抑制SHR子代胎盘效率下降(P<0.05),显著降低SHR子代的舒张压和平均动脉压(P<0.05),显著减小SHR子代的血管中膜厚度/内径比值(P<0.01),抑制血管平滑肌收缩表型向合成表型转换(P<0.05),显著上调SHR子代肠系膜动脉减少的PGC1αmRNA和蛋白表达,抑制Ppargc1α基因甲基化(P<0.05);与去甲基化密切相关的TET2蛋白(P<0.05)和5hmC(P<0.01)在SHR子代肠系膜动脉中显著降低,孕期运动显著增加二者水平(P<0.05)。结论:孕期运动可通过增加TET2介导的Ppargc1α基因启动子区去甲基化,抑制高血压大鼠子代成年后血管平滑肌由收缩表型向合成表型转换,缓解其血管重构。 展开更多
关键词 孕期运动 自发性高血压大鼠 TET2蛋白 ppargc1α基因 血管平滑肌表型
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PPARGC1A/NRF1/TFAM通路核心基因在湖羊睾丸发育过程中的表达变化 被引量:9
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作者 安世钰 张国敏 +6 位作者 尤佩华 孟繁星 刘建玲 张婷婷 杨花 樊懿萱 王锋 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期345-351,共7页
[目的]本试验旨在探究PPARGC1A/NRF1/TFAM通路核心基因在湖羊性成熟前后的表达变化。[方法]选取体况良好和系谱清楚的雄性湖羊18只(3和9月龄,各9只),颈静脉采血后进行阉割处理。ELISA检测血样中睾酮(T)、瘦素、胰岛素及胰岛素样生长因子... [目的]本试验旨在探究PPARGC1A/NRF1/TFAM通路核心基因在湖羊性成熟前后的表达变化。[方法]选取体况良好和系谱清楚的雄性湖羊18只(3和9月龄,各9只),颈静脉采血后进行阉割处理。ELISA检测血样中睾酮(T)、瘦素、胰岛素及胰岛素样生长因子Ⅰ(IGF-Ⅰ)的浓度;免疫组化法检测睾丸组织中PPARGC1A/NRF1/TFAM通路相关蛋白的表达定位; RT-qPCR和Western blot检测睾丸组织中PPARGC1A/NRF1/TFAM通路相关基因与蛋白的表达变化。[结果]与3月龄湖羊相比,9月龄湖羊外周血中T、瘦素、胰岛素及IGF-Ⅰ的浓度显著升高(P<0.05)。免疫组化法检测发现PPARGC1A、NRF1和TFAM蛋白在3月龄和9月龄湖羊睾丸组织的多种细胞内均呈时空特异性表达。此外,与3月龄湖羊相比,9月龄湖羊睾丸组织中PPARGC1A、NRF1和TFAM m RNA和蛋白表达水平均显著升高(P<0.05)。[结论]PPARGC1A/RNF1/TFAM通路相关基因可能与湖羊睾丸发育和性成熟过程密切相关。 展开更多
关键词 湖羊 睾丸 性成熟前后 ppargc1A/RNF1/TFAM通路
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PPARGC1A基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病患者肾脏疾病风险的研究 被引量:4
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作者 刘鹏 赵海玲 +3 位作者 马亮 申正日 邱新萍 李平 《中国中西医结合肾病杂志》 2020年第10期866-870,共5页
目的:探讨糖尿病(diabetes mellitus,DM)患者中PPARGC1A rs8192678(G>A)基因多态性与糖尿病肾病(Diabetic kidney disease,DKD)风险的相关性。方法:利用TaqMan SNP基因分型分析DM与DKD患者rs8192678基因多态性,进行卡方检验和多变量... 目的:探讨糖尿病(diabetes mellitus,DM)患者中PPARGC1A rs8192678(G>A)基因多态性与糖尿病肾病(Diabetic kidney disease,DKD)风险的相关性。方法:利用TaqMan SNP基因分型分析DM与DKD患者rs8192678基因多态性,进行卡方检验和多变量逻辑回归分析,评估rs8192678与DKD易感性之间的关联。结果:次要等位基因(A)与DKD低风险之间存在显著相关性(P<0.02)。在显性模型中,与GG基因型相比,GA+AA基因型的DKD风险显着降低(P=0.007);在加性模型中,与GG基因型相比,GA和AA基因型的DKD风险显着降低(P=0.027)。在亚组分析中,TC正常组显性模型GG较GA+AA基因型的DKD风险显着降低(P=0.018);在TG正常组显性模型中,GG较GA+AA基因型的DKD风险显着降低(P=0.001);在加性模型中,GG较GA和AA基因型的DKD风险显着降低(P=0.001)。结论:中国汉族人群糖尿病患者中PPARGC1A rs8192678等位基因A与DKD的低风险显著相关。 展开更多
关键词 ppargc1A基因 rs8192678 糖尿病肾病 糖尿病 基因多态性
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3种警犬不同肌肉中PPARGC1A基因的发育性表达研究 被引量:1
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作者 李静 万九生 +4 位作者 陈超 邓卫东 岳锐 熊和丽 黎立光 《安徽农业科学》 CAS 2021年第4期92-95,共4页
[目的]探究PPARGC1A基因mRNA在昆明犬、马里努阿犬、德国牧羊犬不同肌肉组织中的发育性表达规律,为研究犬的肌肉和运动能力形成机理提供理论参考。[方法]采用实时荧光定量PCR技术检测昆明犬、马里努阿犬、德国牧羊犬3种警犬在6月龄、1... [目的]探究PPARGC1A基因mRNA在昆明犬、马里努阿犬、德国牧羊犬不同肌肉组织中的发育性表达规律,为研究犬的肌肉和运动能力形成机理提供理论参考。[方法]采用实时荧光定量PCR技术检测昆明犬、马里努阿犬、德国牧羊犬3种警犬在6月龄、1岁龄的臀腿肌肉组织中PPARGC1A基因mRNA表达量。[结果]随着年龄的增长,PPARGC1A基因在3种警犬肌肉中呈现逐渐上升的表达趋势。马里努阿犬在6月龄和1岁龄时臀腿肌中的表达量极显著高于昆明犬和德国牧羊犬(P<0.01)。[结论]PPARGC1A基因在肌肉发育和肌内脂肪沉积过程中起着很重要的作用。该研究结果可为探索肌肉发育及肌内脂肪沉积相关研究提供理论参考和研究基础。 展开更多
关键词 昆明犬 ppargc1A基因 发育性表达 肌肉组织
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PPARGC1α基因与肉质品质相关性研究进展 被引量:2
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作者 尚进 靳烨 《肉类研究》 2012年第3期42-44,共3页
肉质品质与物种的遗传因素有着密切而直接的关系。本文通过分析PPARGC1α基因的作用机制,阐述了PPARGC1α对骨骼肌肌纤维类型、基因型表达和多种生化过程的调控作用,体现出PPARGC1α作为一种辅转录激活因子能停靠多种转录因子增强靶基... 肉质品质与物种的遗传因素有着密切而直接的关系。本文通过分析PPARGC1α基因的作用机制,阐述了PPARGC1α对骨骼肌肌纤维类型、基因型表达和多种生化过程的调控作用,体现出PPARGC1α作为一种辅转录激活因子能停靠多种转录因子增强靶基因转录效率,可以通过调控线粒体表达和生物氧化等途径来影响肉质品质。 展开更多
关键词 ppargc1α基因 功能机制 肌纤维 多态性 生化过程
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PPARGC1A通过影响肿瘤微环境中免疫成分改善肾透明细胞癌的预后 被引量:1
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作者 储昭阳 朱向明 +5 位作者 江峰 刘表虎 李国杰 龚儒杰 马平川 徐凯慧 《右江民族医学院学报》 2020年第6期716-722,共7页
目的通过分析肿瘤微环境(TME),确定与肾透明细胞癌(KIRC)关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值。方法应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基... 目的通过分析肿瘤微环境(TME),确定与肾透明细胞癌(KIRC)关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值。方法应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基质成分的数量和TICs的比例。通过对差异表达基因(DEGs)进行了分析并进行Cox回归分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。然后,通过单因素Cox与PPI的交集分析,确定过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子-1A(PPARGC1A)为预后因子。进一步对PPARGC1A的表达进行差异分析、生存分析、临床相关性分析、基因集富集分析(GSEA)、TICs组成比例及相关性分析。结果PPARGC1A的表达与临床病理特征(临床分期、远处转移)呈负相关,与KIRC患者的生存呈正相关。GSEA显示,高表达PPARGC1A组的基因主要富集于代谢途径和免疫相关活性。对TICs比例的CIBERSORT分析表明,幼稚B细胞、巨噬细胞M2与PPARGC1A表达呈正相关,但调节性T细胞(Treg)和T细胞滤泡辅助因子(Tfh)与PPARGC1A表达呈负相关,提示PPARGC1A可能负责调控TME的免疫成分。结论PPARGC1A的表达水平可能有助于改善KIRC患者的预后,特别可能通过影响TME的免疫成分发挥作用,同时也揭示了PPARGC1A作为免疫治疗发展的潜在靶点和生物标志物。 展开更多
关键词 ppargc1A 肿瘤微环境 ESTIMATE CIBERSORT 肿瘤浸润免疫细胞 肾透明细胞癌
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金华猪PPARGC1A基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究 被引量:6
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作者 刘玉芳 郭思武 +3 位作者 张清阳 张鑫 杨俊琦 白莹 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第3期696-705,共10页
试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α(PPARGC1A)在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank... 试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α(PPARGC1A)在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank中公布的猪PPARGC1A基因序列(登录号:NM_213963.2)设计编码区和实时定量PCR引物,以猪GAPDH基因和β-actin蛋白作为内参,应用多种生物信息学方法对PPARGC1A基因编码蛋白进行功能分析,并通过实时荧光定量PCR及Western blotting检测其在金华猪背脂中的表达水平。结果表明,金华猪PPARGC1A基因CDS区全长2361 bp,编码786个氨基酸,该蛋白分子大小90336.01 u,其中丝氨酸(ser)所占比例最高(13.7%),色氨酸(Trp)所占比例最低(0.8%)。同源性比对结果显示,金华猪PPARGC1A基因与山羊、牛和绵羊的同源性较高,分别为95.0%、94.9%和94.9%,在物种进化中具有较强的保守性;金华猪PPARGC1A蛋白不稳定指数为74.88,属于不稳定亲水蛋白,无跨膜结构,其二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角及无规则卷曲4种结构组成,所占比例分别为26.59%、5.73%、5.73%和61.96%,PPARGC1A蛋白同源建模经折叠、弯曲等一系列复杂的过程获得三级结构模型;实时荧光定量PCR试验和Western blotting试验结果一致,显示PPARGC1A基因在背脂较厚的金华猪中表达量显著低于瘦肉型的大白猪(P<0.05)。本研究为探明PPARGC1A基因对猪脂肪沉积的分子生物学功能提供了理论基础。 展开更多
关键词 金华猪 ppargc1A基因 生物信息学分析 组织表达 脂肪沉积
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PPARGC1启动子甲基化与Ⅱ型糖尿病发病相关性分析 被引量:16
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作者 梁爽 王伟伟 +2 位作者 孙力 邹广慧 董志武 《分子诊断与治疗杂志》 2019年第2期91-95,共5页
目的探讨过氧化物酶体增殖活化受体γ辅激活因子1(peroxisome proliferators activated receptor gamma coactivator-1,PPARGC1)基因启动子甲基化状况在Ⅱ型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)发生中的作用。方法选取2015年1月至201... 目的探讨过氧化物酶体增殖活化受体γ辅激活因子1(peroxisome proliferators activated receptor gamma coactivator-1,PPARGC1)基因启动子甲基化状况在Ⅱ型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)发生中的作用。方法选取2015年1月至2017年12月我院T2DM患者57例,对照组(健康人)152例,采集空腹静脉血检测血糖、胆固醇、甘油三酯、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白和脂蛋白a;测量身高、体重、腰围和血压并进行问卷调查。提取研究对象的全血基因组DNA并检测PPARGC1基因启动子甲基化程度,分析其与T2DM发生的相关性。结果糖尿病组研究对象的腰围、体重和身体质量指数均大于对照组;糖尿病组具有糖尿病家族史的明显高于非糖尿病组;PPARGC1启动子甲基化程度与T2DM发病呈低度正相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论糖尿病发病受多种因素影响,阐明PPARGC1启动子甲基化与糖尿病发病的相关性,对预测糖尿病发病具有重要意义。 展开更多
关键词 T2DM ppargc1 PPARΓ 甲基化
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PPARGC1A rs8192678 G>A polymorphism affects the severity of hepatic histological features and nonalcoholic steatohepatitis in patients with nonalcoholic fatty liver disease 被引量:2
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作者 Rui-Nan Zhang Feng Shen +3 位作者 Qin Pan Hai-Xia Cao Guang-Yu Chen Jian-Gao Fan 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2021年第25期3863-3876,共14页
BACKGROUND The association between PPARGC1A rs8192678 and nonalcoholic fatty liver disease(NAFLD)requires further confirmation.In addition,it is still unknown whether PPARGC1A rs8192678 is associated with hepatic hist... BACKGROUND The association between PPARGC1A rs8192678 and nonalcoholic fatty liver disease(NAFLD)requires further confirmation.In addition,it is still unknown whether PPARGC1A rs8192678 is associated with hepatic histological features in NAFLD in the Chinese population.AIM To investigate the interaction between PPARGC1A rs8192678 and nonalcoholic steatohepatitis(NASH),and whether this polymorphism is associated with hepatic histological features.METHODS Fifty-nine patients with liver biopsy-proven NAFLD and 93 healthy controls were recruited to a cohort representing the Chinese Han population.The SAF(steatosis,activity,and fibrosis)scoring system was used for hepatic histopathological evaluation.The polymorphisms of PPARGC1A rs8192678 and patatin-like phospholipase domain-containing protein 3(PNPLA3)rs738409 were genotyped.The intrahepatic mRNA expression of PPARGC1A was evaluated by real-time polymerase chain reaction.RESULTS Thirty-seven patients with NAFLD had NASH,of which 12 were nonobese.The PPARGC1A rs8192678 risk A allele(carrying GA and AA genotypes)had the lowest P value in the dominant model;the odds ratio(OR)for NAFLD was 2.321[95%confidence interval(CI):1.121-4.806].After adjusting for age,sex,and the PNPLA3 rs738409 risk G allele,the PPARGC1A rs8192678 A allele was a risk factor for NAFLD(OR 2.202,95%CI:1.030-4.705,P=0.042).The genetic analysis showed that patients with NAFLD,moderate-to-severe steatosis(S2-3),and Activity 2-4(A≥2)were more likely to carry A in PPARGC1A rs8192678(OR 5.000,95%CI:1.343-18.620,P=0.012;and OR 4.071,95%CI:1.076-15.402,P=0.031).The multivariate logistic regression analysis showed that PPARGC1A rs8192678 risk A allele was also independently associated with S2-3,A≥2,and NASH(OR 6.190,95%CI:1.508-25.410,P=0.011;OR 4.506,95%CI 1.070-18.978,P=0.040;and OR 6.337,95%CI:1.135-35.392,P=0.035,respectively)after adjusting for age,sex,body mass index,and PNPLA3 rs738409 risk G allele.The results also showed that this polymorphism was associated with nonobese NASH(OR 22.000,95%CI:1.540-314.292,P=0.021).The intrahepatic expression of PPARGC1A mRNA was significantly lower in the group of patients who carried the risk A allele(P=0.014).CONCLUSION The PPARGC1A rs8192678 risk A allele is associated with NAFLD,and with S2-3,A≥2 and NASH in NAFLD patients,independent of PNPLA3 rs738409,and may be associated with nonobese NASH. 展开更多
关键词 Nonalcoholic fatty liver disease Nonalcoholic steatohepatitis ppargc1A rs8192678 polymorphism STEATOSIS ACTIVITY
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猪PPARGC1A和CAPNS1基因多态性及其与肉质性状的关联性分析 被引量:2
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作者 G.Gandolfi 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第10期44-44,共1页
试验旨在研究猪PPARGC1A和CAPNS1基因多态性及其与肉质性状的相关性。结果发现,PPARGC1A基因存在4个多态位点,CAPNS1基因存在3个多态位点。PPARGC1A基因突变位点c.1288T>A与杜洛克×皮特兰杂交F2代(DuPi,n=313)猪肉质pH和蒸煮损... 试验旨在研究猪PPARGC1A和CAPNS1基因多态性及其与肉质性状的相关性。结果发现,PPARGC1A基因存在4个多态位点,CAPNS1基因存在3个多态位点。PPARGC1A基因突变位点c.1288T>A与杜洛克×皮特兰杂交F2代(DuPi,n=313)猪肉质pH和蒸煮损失显著相关(P<0.05),与大白猪(ILW,n=380)和长白猪(ILA,n=158)肉质pH显著相关(P<0.05);CAPNS1基因突变位点c.429A>C与杜洛克×皮特兰杂交猪pH、导电率显著相关(P<0.05),与长白猪肉质色度显著相关(P<0.05)。PPARGC1A基因mRNA表达与蒸煮损失呈极显著相关(P<0.01);CAPNS1基因mRNA表达与蒸煮损失也存在一定相关性,但差异不显著(P=0.06)。CAPNS1基因表达调控中没有发生启动子甲基化。因此,PPARGC1A和CAPNS1基因与猪肉质性状存在显著关联,且由于物种间差异,可作为候选基因用于猪肉质性状的改良。 展开更多
关键词 ppargc1A CAPNS1 肉质性状 DNA多态性 基因表达
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昆明犬PPARGC1A基因编码区克隆及生物信息学分析
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作者 李静 万九生 +3 位作者 邓卫东 陈超 岳锐 黎立光 《饲料博览》 2020年第7期1-10,共10页
文章旨在获得昆明犬PPARGC1A基因的编码区域cds序列,并对其进行生物信息学分析。根据Gen Bank中公布的序列设计一对特异性引物,采集昆明犬的肌肉组织提取总RNA,反转录成c DNA。以c DNA为模板进行RT-PCR扩增,并获得目的基因片段,将其插... 文章旨在获得昆明犬PPARGC1A基因的编码区域cds序列,并对其进行生物信息学分析。根据Gen Bank中公布的序列设计一对特异性引物,采集昆明犬的肌肉组织提取总RNA,反转录成c DNA。以c DNA为模板进行RT-PCR扩增,并获得目的基因片段,将其插入载体,利用生物信息学软件对所获序列进行分析。试验成功克隆出昆明犬基因,cds长度为2 246 bp,共编码724个氨基酸序列。比对结果显示,昆明犬PPARGC1A基因与参考序列的同源性为100%。同源性比对结果昆明犬PPARGC1A基因的同源性与赤狐(登录号:XM025997319.1)、野牦牛(登录号:XM005897079.2)、牛(登录号:NM177945.3)、人(登录号:NM013261.5)、家鼠(登录号:NM008904.2)、卡氏小鼠(登录号:XM021162167.2)、欧亚野猪(登录号:NM213963.2)的同源性分别为99.6%、95%、95%、95.4%、91.7%、91.6%、95%。系统进化树分析发现,昆明犬与家犬的遗传距离最近,与小鼠遗传关系最远。PPARGC1A蛋白分子质量0971.82 ku,理论等电点p I为11.20。氨基酸组成亮氨酸Leu(L)占比最高,比例为11.3%。PPARGC1A蛋白不稳定性指数(Ⅱ)为59.16,这表明PPARGC1A基因编码蛋白质分类是不稳定的。脂肪指数为81.60,平均亲水系数(GRAVY)为-0.336,表明此蛋白亲水性差,脂溶性强。昆明犬PPARGC1A编码蛋白存在1个跨膜结构,二级结构预测昆明犬PPARGC1A蛋白中α螺旋、延伸链、β转角及无规则卷曲分别占28.04%、20.99%、6.77%、48.62%,三级结构与二级结构相一致。试验成功克隆出昆明犬PPARGC1A基因的编码区域cds序列,并对其进行生物信息学分析,为研究PPARGC1A基因对警犬的肌肉形成机理和产能等影响提供理论依据。 展开更多
关键词 昆明犬 ppargc1A基因 克隆 生物信息学分析 同源性分析
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Ppargc1α基因与肉质品质的相关性
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作者 尚进 《肉类工业》 2012年第4期52-55,共4页
Ppargc1α是一种核转录辅激活因子,能在棕色脂肪组织、骨骼肌等部位大量表达,而在白色脂肪组织、胰腺及大脑中的分布较少。Ppargc1α通过参与机体能量平衡和多种代谢调控过程,有效诱导线粒体生物合成并且上调线粒体生物氧化功能从而影... Ppargc1α是一种核转录辅激活因子,能在棕色脂肪组织、骨骼肌等部位大量表达,而在白色脂肪组织、胰腺及大脑中的分布较少。Ppargc1α通过参与机体能量平衡和多种代谢调控过程,有效诱导线粒体生物合成并且上调线粒体生物氧化功能从而影响机体的生长、疾病的发生和生物体内各种物质的合成。肉质品质与物种的遗传因素有着密切而直接的关系。本文通过分析ppargc1α基因的作用机制,阐述了ppargc1α对骨骼肌肌纤维类型、基因型表达和多种生化过程的调控作用,体现出ppargc1α作为一种辅转录激活因子能停靠多种转录因子增强靶基因转录效率,可以通过调控线粒体表达和生物氧化等途径来影响肉质品质。 展开更多
关键词 ppargc1α基因功能机制肌纤维多态性生化过程
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成都地区汉族人群PPARGC1A基因Thr394Thr位点G/A多态性与2型糖尿病及胰岛素抵抗的相关性研究 被引量:2
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作者 宋洁 刘圆圆 +7 位作者 龙洋 田浩明 刘瑞 李秀钧 陈涛 张翔迅 喻红玲 任艳 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期550-553,共4页
目的 了解中国成都地区汉族人群过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子-1α基因(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,coactivator 1 alpha,PPARGC1A;又名PGC-1α)Thr394Thr位核苷酸G/A的基因型分布,探讨该多态性与... 目的 了解中国成都地区汉族人群过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子-1α基因(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,coactivator 1 alpha,PPARGC1A;又名PGC-1α)Thr394Thr位核苷酸G/A的基因型分布,探讨该多态性与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)、胰岛素抵抗及其他代谢异常的关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测151例无亲缘关系的T2DM患者和156名糖耐量正常对照者PPARGC1A基因Thr394Thr位核苷酸G/A多态性.所有研究对象均测定血糖、胰岛素、血脂,测量身高、体重、腰围、血压.结果 与正常对照组相比,T2DM组的体重指数、腰围、血压、甘油三酯水平均显著增高(P<0.05),而高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein-cholesterol,HDL-C)水平显著降低(P<0.05).A等位基因的频率在T2DM及正常对照组分别为22.5%、18.6%,AG基因型频率在两组分别为43.7%、37.2%,差异无统计学意义.在T2DM组中,AA+AG基因型的空腹胰岛素、稳态模型评估法胰岛素抵抗指数(homeostasis model aseessment-insulin resistance,HOMA-IR)及腰围明显高于GG基因型,HDL-C显著低于GG基因型(P<0.05).无论T2DM和正常对照,A等位基因携带者HOMA-IR明显高于GG者.结论 PPARGC1A基因Thr394Thr位核苷酸G/A多态性与胰岛素抵抗存在明显相关,并可能与T2DM患者中心性肥胖及低HDL-C水平相关,其与T2DM发病的关系有待进一步研究. 展开更多
关键词 ppargc1A基因 Thr394Thr多态性 2型糖尿病 胰岛素抵抗
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