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题名蛋白质关系网络可视化系统的研究与实现
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作者
王健
谢冬
杨志豪
林鸿飞
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机构
大连理工大学计算机科学与技术学院
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出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2011年第12期232-235,共4页
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基金
国家自然科学基金(60673039
60973068
+4 种基金
61070098)
国家社科基金(08BTQ025)
国家863高科技计划(2006AA01Z151)
教育部留学回国人员科研启动基金
高等学校博士学科点专项科研基金(20090041110002)资助
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文摘
蛋白质关系网络的研究在生物医学领域中已成为一个热点。研究者通过对蛋白质关系网络进行分析和聚类,能够发现其中的复合体,进一步理解细胞组织原理。在对关系网络进行分析的过程中,将网络拓扑显示为图形,以直观地表示出关系网络的结构,便于对比聚类方法,辅助关系网络的研究。利用网络建模与可视化工具包JUNG设计并实现了一个蛋白质关系网络可视化系统,它能够解析多种格式的蛋白质关系网络数据,集成了几种有效的图聚类算法,并实现了一种基于蛋白质功能标注的发现复合体的聚类算法。用户能够通过二维网络视图方便地观察原始网络和聚类后的结果。
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关键词
蛋白质关系网络
网络可视化
图聚类
jung工具包
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Keywords
ppi network,network visualization,graph clustering,jung toolkit
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分类号
TP391
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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