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生物信息学技术分析人结直肠癌中蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)表达与患者预后及免疫浸润的关系
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作者 梁小洁 程照翔 +2 位作者 尚维伟 陈信浩 李俊 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期591-604,共14页
目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中... 目的通过分析蛋白磷酸酶2A催化亚基α(PPP2CA)在结直肠癌(CRC)中表达水平与患者预后及免疫浸润的关系,进一步了解CRC发生和进展中的相关机制。方法基于基因芯片数据库Oncomine和肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析在CRC组织和正常组织中PPP2CA表达水平的差异性;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(UALCAN)和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析PPP2CA的表达水平对CRC患者预后的影响;基于LinkedOmics平台构建PPP2CA的共表达网络并进行基因本体论(GO)富集分析和京东基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析;基于TIMER和GEPIA数据库分析PPP2CA与免疫浸润之间的相关性。基于c-BioPortal平台分析结肠腺癌(COAD)中PPP2CA的基因突变情况。结果与正常结直肠组织相比,在CRC组织中PPP2CA表达下调。高表达水平的PPP2CA预示着更好的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。在COAD中,PPP2CA的表达水平与包括CD8^(+)T细胞、中性粒细胞和树突状细胞在内的免疫浸润细胞呈正相关。而某些免疫细胞标志物,包括B细胞的CD19和CD38、M1巨噬细胞的一氧化氮合酶2(NOS2)、M2巨噬细胞的精氨酸酶1(Arg1)和甘露糖受体C1(MRC1)、肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的人类白细胞抗原G(HLA-G)和CD80、单核细胞的CD14和IgG Fc段受体Ⅲa(FCGR3A),却显示出不同的PPP2CA相关免疫浸润模式:即PPP2CA表达水平与COAD和直肠腺癌(READ)中的B细胞、巨噬细胞、单核细胞、TAM、1型辅助T(Th1)细胞、Th2细胞、调节性T细胞、衰竭T细胞和中性粒细胞均显著相关。结论PPP2CA在CRC组织表达水平下调,并且与免疫浸润密切相关。 展开更多
关键词 蛋白磷酸酶2A催化亚基α基因(ppp2ca) 结直肠癌(CRC) 免疫浸润 预后
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PPP2CA基因突变致智力障碍伴癫痫1例并文献复习
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作者 韩翔宇 陶德双 +3 位作者 曹洪涛 王菊莉 吴丹 曹思齐 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2021年第4期318-320,共3页
蛋白磷酸酶2A(protein phosphatases of the type2A,PP2A)是非常重要的蛋白磷酸酶,几乎存在于所有真核细胞中,该酶由3种亚基组成异三聚体结构,包括一个65 k U的结构亚基A(α/β),一个36 k U的催化亚基C(α/β)形成的核心酶和一个多样化... 蛋白磷酸酶2A(protein phosphatases of the type2A,PP2A)是非常重要的蛋白磷酸酶,几乎存在于所有真核细胞中,该酶由3种亚基组成异三聚体结构,包括一个65 k U的结构亚基A(α/β),一个36 k U的催化亚基C(α/β)形成的核心酶和一个多样化的调节亚基B[1]。亚基的多样性决定了该酶具有多种催化作用,结合的调节亚基不同,去磷酸化底物就不同,其参与多种细胞信号通路,能调节细胞周期、细胞分化、肿瘤抑制等多种生物学过程[2-3]。 展开更多
关键词 ppp2ca基因 癫痫 智力障碍
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Potential Role and Clinical Value of PPP2CA in Hepatocellular Carcinoma
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作者 Cheng-Lei Yang Xue Qiu +8 位作者 Jin-Yan Lin Xiao-Yu Chen Yu-Mei Zhang Xiao-Yin Hu Jian-Hong Zhong Shen Tang Xi-Yi Li Bang-De Xiang Zhi-Ming Zhang 《Journal of Clinical and Translational Hepatology》 SCIE 2021年第5期661-671,共11页
Background and Aims:Protein phosphatase 2A(PP2A)is associated with many cancers.This study aimed to clarify whether PPP2CA,which encodes the alpha isoform of the catalytic subunit of PP2A,plays a role in hepatocellula... Background and Aims:Protein phosphatase 2A(PP2A)is associated with many cancers.This study aimed to clarify whether PPP2CA,which encodes the alpha isoform of the catalytic subunit of PP2A,plays a role in hepatocellular carcinoma(HCC)and to identify the potential underlying molecular pathways.Methods:Based on bioinformatics,public databases and our in-house RNA-Seq database,we analyzed the clinical value and molecular mechanism of PPP2CA in HCC.Results:Data were analyzed from 2,545 patients with HCC and 1,993 controls without HCC indexed in The Cancer Genome Atlas database,the Gene Expression Omnibus database and our in-house RNA-Seq database.PPP2CA expression was significantly higher in HCC tissue than in non-cancerous tissues(standardized mean difference:0.69,95%confidence interval[CI]:0.50–0.89).PPP2CA expression was able to differentiate HCC from non-HCC,with an area under the summary receiver operator characteristic curve of 0.79(95%CI:0.75–0.83).Immunohistochemistry of tissue sections confirmed that PPP2CA protein was up-regulated in HCC tissues.High PPP2CA expression in HCC patients was associated with shorter overall,progression-free and disease-free survival.Potential molecular pathways through which PPP2CA may be involved in HCC were determined using miRWalk 2.0 as well as analysis of Gene Ontology categories,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways,and protein-protein interaction networks.Conclusions:PPP2CA is up-regulated in HCC and higher expression correlates with worse prognosis.PPP2CA shows potential as a diagnostic marker for HCC.Future studies should examine whether PPP2CA contributes to HCC through the candidate microRNAs,pathways and hub genes identified in this study. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma ppp2ca Molecular mechanism Diagnostic marker
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抑制PP2Acα促进胃癌进展中WTAP高表达 被引量:2
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作者 程照翔 方超 吕纯业 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1128-1134,共7页
目的:探讨蛋白磷酸酶2A催化亚基Cα(PP2Acα)的抑制是否会影响胃癌细胞的恶性表型,以及维尔姆肿瘤1相关蛋白(Wilms’tumour 1-associating protein,WTAP)在这一进展中的表达。方法:使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数... 目的:探讨蛋白磷酸酶2A催化亚基Cα(PP2Acα)的抑制是否会影响胃癌细胞的恶性表型,以及维尔姆肿瘤1相关蛋白(Wilms’tumour 1-associating protein,WTAP)在这一进展中的表达。方法:使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分别比较PP2Acα编码基因(PPP2CA)、WTAP基因在胃癌组织与正常胃黏膜组织中的表达量;使用KM-plot网站(http://kmplot.com/analysis/)分析PPP2CA、WTAP与胃癌预后的关系;使用慢病毒介导的短发卡RNA(short hairpin RNA,sh RNA)在胃癌细胞中敲减PPP2CA,从而抑制PP2Acα的表达;随后提取RNA、蛋白分别进行定量逆转录PCR(quantitative reverse transcription PCR,RT-qPCR)、蛋白免疫印迹(Western blot),检测PPP2CA、WTAP的mRNA水平及蛋白的表达;最后在离体与活体层面观察抑制PP2Acα对于胃癌细胞恶性表型的影响。结果:抑制PP2Acα后,胃癌细胞发生上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)形态改变,且增殖、迁移与侵袭能力均得到了增强,并伴随着WTAP蛋白及mRNA水平的显著升高。结论:抑制PP2Acɑ促进胃癌细胞的恶性表型,可能是通过上调WTAP的表达水平实现的。 展开更多
关键词 胃癌 PP2Acα ppp2ca WTAP
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