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1株猪4型细小病毒的分子鉴定与全基因组分析
1
作者
尹苗
扶星星
+3 位作者
董鹏宇
王聪
陈俊巧
陈希文
《现代畜牧兽医》
2023年第10期55-58,共4页
试验旨在查明四川某发病猪场猪细小病毒的基因类型,掌握该地区猪细小病毒的分子流行病学特征。试验采集发病猪场的猪肺脏、淋巴结、血液等病料,进行PCR扩增和全基因组测序。结果显示,试验成功获得1株新型猪细小病毒4型PPV4-MY。全基因...
试验旨在查明四川某发病猪场猪细小病毒的基因类型,掌握该地区猪细小病毒的分子流行病学特征。试验采集发病猪场的猪肺脏、淋巴结、血液等病料,进行PCR扩增和全基因组测序。结果显示,试验成功获得1株新型猪细小病毒4型PPV4-MY。全基因组测序结果显示,PPV4-MY全基因组存在一定程度的突变,全基因组前端和末端各序列存在较大差异,中段序列基本一致,差异较小;系统发育树分析发现,分离株PPV4-MY与山东、韩国检出的毒株亲缘性最近。
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关键词
猪细小病毒4型(
ppv4
)
分子鉴定
全基因组
序列分析
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职称材料
2020年福建地区4/6/7型猪细小病毒感染调查
被引量:
5
2
作者
张鑫杰
陈羽璇
+1 位作者
戴爱玲
杨小燕
《中国动物保健》
2022年第4期14-15,共2页
猪细小病毒(PPV)是临床上造成母猪繁殖障碍的重要致病原,4/6/7型猪细小病毒是近几年发现的新型猪细小病毒,并且均已在流产胎儿中发现。为了解福建地区三种猪细小病毒的感染情况,本研究收集2020年福建地区68份发病猪血清和20份发病猪组...
猪细小病毒(PPV)是临床上造成母猪繁殖障碍的重要致病原,4/6/7型猪细小病毒是近几年发现的新型猪细小病毒,并且均已在流产胎儿中发现。为了解福建地区三种猪细小病毒的感染情况,本研究收集2020年福建地区68份发病猪血清和20份发病猪组织样品进行调查,发现PPV4、PPV6、PPV7在福建地区存在较高的感染率分别为9.09%、12.50%、37.50%。PPV4与PPV6之间存在着较高的共感染率,为5.68%,分别占PPV4、PPV6阳性样品的62.50%及45.45%。另外,本次调查发现PPV4、PPV6血清样品的检出率均低于组织样品,而PPV7在血清样品的检出率高于组织样品。本研究初步调查了2020年福建地区4/6/7型猪细小病毒的感染情况,为未来新型猪细小病毒的防控提供数据参考。
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关键词
ppv4
PPV6
PPV7
病原检测
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职称材料
6型及4型猪细小病毒双重实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
被引量:
1
3
作者
陈羽璇
张鑫杰
+9 位作者
吕紫欣
薛少华
刘小梅
黄喜荣
蒙宁
邱飞铭
许雨航
俞国华
杨小燕
戴爱玲
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1133-1138,1161,共7页
根据6型猪细小病毒(porcine parvovirus 6,PPV6)和4型猪细小病毒(porcine parvovirus 4,PPV4)全基因组的保守区域基因序列,分别设计了2对特异性的引物和2种不同荧光基团标记的Taqman探针。经过条件优化,建立能够同时诊断PPV6和PPV4的双...
根据6型猪细小病毒(porcine parvovirus 6,PPV6)和4型猪细小病毒(porcine parvovirus 4,PPV4)全基因组的保守区域基因序列,分别设计了2对特异性的引物和2种不同荧光基团标记的Taqman探针。经过条件优化,建立能够同时诊断PPV6和PPV4的双重荧光定量PCR方法,并对其特异性、灵敏性、稳定性以及与常规PCR方法的符合率进行研究。结果显示,该方法能够同时检测鉴别PPV6和PPV4,且特异性良好,与猪伪狂犬病病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、猪轮状病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、日本乙型脑炎病毒及猪细小病毒1型核酸均无交叉反应;本方法灵敏性强,PPV6和PPV4的最小检出限分别为7.7拷贝/μL和9.3拷贝/μL;组间和组内变异系数均未超过2%,具有良好的重复性;利用所建立的双重荧光定量PCR方法对福建省采集的68份猪血清及20份组织样本进行检测,PPV6阳性率为37.5%(33/88),PPV4阳性率为12.5%(11/88),混合感染率为11.36%,该结果与常规PCR的符合率分别为81.8%(PPV6),90.9%(PPV4)和90.05%(混合感染率),并且常规PCR鉴定的阳性样品通过本研究建立的方法复检时均未出现漏检。结果表明,本试验建立的检测方法对PPV6和PPV4的鉴别诊断、病原监测、流行病学调查等具有重要意义。
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关键词
猪细小病毒6型
猪细小病毒4型
TAQMAN探针
双重荧光定量PCR
原文传递
题名
1株猪4型细小病毒的分子鉴定与全基因组分析
1
作者
尹苗
扶星星
董鹏宇
王聪
陈俊巧
陈希文
机构
四川百诺吉科技有限公司
四川生猪重大疫病监测与防控工程研究中心
出处
《现代畜牧兽医》
2023年第10期55-58,共4页
基金
四川省农业农村厅项目(SCNYTG20-184)
四川省科技厅重点研发项目(2023YFN0045)。
文摘
试验旨在查明四川某发病猪场猪细小病毒的基因类型,掌握该地区猪细小病毒的分子流行病学特征。试验采集发病猪场的猪肺脏、淋巴结、血液等病料,进行PCR扩增和全基因组测序。结果显示,试验成功获得1株新型猪细小病毒4型PPV4-MY。全基因组测序结果显示,PPV4-MY全基因组存在一定程度的突变,全基因组前端和末端各序列存在较大差异,中段序列基本一致,差异较小;系统发育树分析发现,分离株PPV4-MY与山东、韩国检出的毒株亲缘性最近。
关键词
猪细小病毒4型(
ppv4
)
分子鉴定
全基因组
序列分析
Keywords
Porcine parvovirus type 4(
ppv4
)
Molecular identification
Whole genome
Sequence analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
2020年福建地区4/6/7型猪细小病毒感染调查
被引量:
5
2
作者
张鑫杰
陈羽璇
戴爱玲
杨小燕
机构
龙岩学院生命科学学院
福建省生猪疫病防控工程技术研究中心
福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室
出处
《中国动物保健》
2022年第4期14-15,共2页
基金
中央引导地方科技发展专项(2021L3028)
福建省科技重大专项项目(2019NZ09005)
+1 种基金
龙岩市科技计划重大项目(2019LY1001)
上杭县奇迈科技创新基金项目(2019SHQM06)。
文摘
猪细小病毒(PPV)是临床上造成母猪繁殖障碍的重要致病原,4/6/7型猪细小病毒是近几年发现的新型猪细小病毒,并且均已在流产胎儿中发现。为了解福建地区三种猪细小病毒的感染情况,本研究收集2020年福建地区68份发病猪血清和20份发病猪组织样品进行调查,发现PPV4、PPV6、PPV7在福建地区存在较高的感染率分别为9.09%、12.50%、37.50%。PPV4与PPV6之间存在着较高的共感染率,为5.68%,分别占PPV4、PPV6阳性样品的62.50%及45.45%。另外,本次调查发现PPV4、PPV6血清样品的检出率均低于组织样品,而PPV7在血清样品的检出率高于组织样品。本研究初步调查了2020年福建地区4/6/7型猪细小病毒的感染情况,为未来新型猪细小病毒的防控提供数据参考。
关键词
ppv4
PPV6
PPV7
病原检测
分类号
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
6型及4型猪细小病毒双重实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
被引量:
1
3
作者
陈羽璇
张鑫杰
吕紫欣
薛少华
刘小梅
黄喜荣
蒙宁
邱飞铭
许雨航
俞国华
杨小燕
戴爱玲
机构
龙岩学院生命科学学院
福建省生猪疫病防控工程技术研究中心
福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1133-1138,1161,共7页
基金
中央引导地方科技发展专项资助项目(2021L3028)
福建省科技重大专项资助项目(2019NZ09005)
+2 种基金
福建省大学生创新创业训练计划资助项目(S202211312046)
龙岩市科技计划重大项目(2019LY1001)
福建省上杭县奇迈科技创新基金资助项目(2019SHQM06)。
文摘
根据6型猪细小病毒(porcine parvovirus 6,PPV6)和4型猪细小病毒(porcine parvovirus 4,PPV4)全基因组的保守区域基因序列,分别设计了2对特异性的引物和2种不同荧光基团标记的Taqman探针。经过条件优化,建立能够同时诊断PPV6和PPV4的双重荧光定量PCR方法,并对其特异性、灵敏性、稳定性以及与常规PCR方法的符合率进行研究。结果显示,该方法能够同时检测鉴别PPV6和PPV4,且特异性良好,与猪伪狂犬病病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、猪轮状病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、日本乙型脑炎病毒及猪细小病毒1型核酸均无交叉反应;本方法灵敏性强,PPV6和PPV4的最小检出限分别为7.7拷贝/μL和9.3拷贝/μL;组间和组内变异系数均未超过2%,具有良好的重复性;利用所建立的双重荧光定量PCR方法对福建省采集的68份猪血清及20份组织样本进行检测,PPV6阳性率为37.5%(33/88),PPV4阳性率为12.5%(11/88),混合感染率为11.36%,该结果与常规PCR的符合率分别为81.8%(PPV6),90.9%(PPV4)和90.05%(混合感染率),并且常规PCR鉴定的阳性样品通过本研究建立的方法复检时均未出现漏检。结果表明,本试验建立的检测方法对PPV6和PPV4的鉴别诊断、病原监测、流行病学调查等具有重要意义。
关键词
猪细小病毒6型
猪细小病毒4型
TAQMAN探针
双重荧光定量PCR
Keywords
PPV6
ppv4
TaqMan probe
duplex real-time PCR
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1株猪4型细小病毒的分子鉴定与全基因组分析
尹苗
扶星星
董鹏宇
王聪
陈俊巧
陈希文
《现代畜牧兽医》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
2020年福建地区4/6/7型猪细小病毒感染调查
张鑫杰
陈羽璇
戴爱玲
杨小燕
《中国动物保健》
2022
5
下载PDF
职称材料
3
6型及4型猪细小病毒双重实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
陈羽璇
张鑫杰
吕紫欣
薛少华
刘小梅
黄喜荣
蒙宁
邱飞铭
许雨航
俞国华
杨小燕
戴爱玲
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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