基于PRIN描述子的肽毛细管区带电泳迁移率支持向量回归预测模型

基于氨基酸描述子PRIN,利用加和法构建了102个混杂肽(从2肽到14肽)毛细管区带电泳迁移率的支持向量回归(SVR)预测模型(ε=0.012、σ=5和C=5),并与多元线性回归作了比较研究,结果表明SVR要好于多元线性回归方法,SVR方法对训练集和预测集的预测残差平方和(PRESS)分别是0.0097和0.0135及预测复相关系数分别为0.9774和0.9419,其预测结果与实验值一致,且提出了一个简单的方法并指出迁移率与描述肽的分子结构信息的PRIN参数存在着非线性关系。