基于SWATH/DIA联合PRM技术筛选结直肠癌伴2型糖尿病血清诊断标志物的研究

目的筛选2型糖尿病(T2DM)合并结直肠癌(CRC)的血清诊断标志物。方法收集2019年6月至2020年1月就诊于本院、既往已确诊T2DM且本次经病理学确诊为原发性CRC的患者血清标本20例(T2DM+CRC组),确诊T2DM并排除各种恶性肿瘤的患者血清标本20例(T2DM组)。通过查阅病历获得患者一般资料和肿瘤标志物检测结果。随机选取两组各5例血清标本,采用数据非依赖采集(DIA)质谱技术检测血清蛋白质谱并比较两组间差异表达的蛋白;以此差异表达的蛋白建库,用平行反应监测(PRM)靶向质谱检测技术检测两组血清样本(各20例)中这些差异表达蛋白的水平。两组间差异比较采用独立样本t检验或Mann-Whitney检验,相关性分析采用Pearson相关性分析,联合诊断效能分析采用Logistic回归分析,各项标志物的诊断效能采用受试者工作特征(ROC)曲线评估。结果DIA质谱检测获得两组间差异的表达蛋白共13个,其中7个蛋白上调、6个蛋白下调。以此13个蛋白建库进行PRM分析共筛选到6个候选蛋白,其中4个(APOC1、RBP4、IGFBP3和KAIN)的水平在两组间差异有统计学意义(P<0.05)。此4个差异表达蛋白与肿瘤标志物CEA联合应用可以在T2DM患者中精准鉴别CRC,曲线下面积达0.923(P<0.001)。结论APOC1、RBP4、IGFBP3和KAIN可能成为预测T2DM患者罹患CRC的特异性血清蛋白标志物,四者与肿瘤标志物CEA联合应用的诊断效能更强。

SWATH/DIA联合PRM技术在2型糖尿病合并肺癌患者血清诊断标志物筛选中的应用

目的应用质谱技术(sequential window acquisition of all theoretical mass spectra,SWATH)联合平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)技术筛选早期鉴别2型糖尿病(type 2 diabetes,T2DM)罹患肺癌(lung cancer,LC)的特异生物标志物。方法收集2019年6月-2020年1月就诊于南京医科大学附属无锡人民医院、既往确诊T2DM、且经病理学确诊为原发性早期LC的20例患者血清标本(T2DM+LC组),确诊T2DM并排除恶性肿瘤的20例患者血清标本(T2DM组)。2组随机各选取5份标本,采用数据非依赖采集(data independent acquisition,DIA)质谱技术分析血清蛋白质谱并分析两组间差异血清蛋白。采用PRM技术验证两组间的差异血清蛋白。通过logistic回归分析法探索鉴别T2DM患者罹患LC的最佳生物标志物组合。结果两组间共提取13个差异血清蛋白,其中9个蛋白上调,4个蛋白下调。对13个蛋白进行PRM建库分析,检测到7个候选蛋白,其中3个蛋白(PZP、IBP3、IGJ)含量两组间比较差异有统计学意义(P<0.05),具有潜在的诊断价值。3个候选蛋白联合鉴别T2DM患者罹患LC的线下面积(AUC)为0.860。结论SWATH/DIA联合PRM筛选特异性血清蛋白标志物PZP、IBP3、IGJ可用于T2DM患者罹患LC的早期诊断,三者联合应用诊断效能更强。