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硬粒小麦基因组中疑似硒蛋白生物信息分析
1
作者
肖庆
杨广笑
何光源
《生物技术》
CAS
CSCD
2008年第3期20-24,共5页
目的:用生物信息学的方法对硬粒小麦基因组中疑似硒蛋白的氨基酸序列进行综合分析,进一步找寻其为硒蛋白的生物信息依据,并初步分析推断其功能。方法:利用VectorNTI等多种生物信息学工具对硬粒小麦AY146587.1序列中发现的疑似硒蛋白编...
目的:用生物信息学的方法对硬粒小麦基因组中疑似硒蛋白的氨基酸序列进行综合分析,进一步找寻其为硒蛋白的生物信息依据,并初步分析推断其功能。方法:利用VectorNTI等多种生物信息学工具对硬粒小麦AY146587.1序列中发现的疑似硒蛋白编码序列进行综合分析研究。结果:发现2段目标编码序列具有与某些蛋白酶相似的生物信息学特征,并推测其蛋白编码具有目前未知的机理。结论:推断AY146587.1序列中存在编码未知硒蛋白的编码段,其编码的硒蛋白参与硬粒小麦胚芽生长发育时期能量调节。
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关键词
硒蛋白
SECIS
prosite
BLOCK
硬粒小麦
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职称材料
题名
硬粒小麦基因组中疑似硒蛋白生物信息分析
1
作者
肖庆
杨广笑
何光源
机构
华中科技大学中英HUST-RRes基因工程和基因组学联合实验室
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
2008年第3期20-24,共5页
基金
国家"973"计划项目资助(2002CB111302)
文摘
目的:用生物信息学的方法对硬粒小麦基因组中疑似硒蛋白的氨基酸序列进行综合分析,进一步找寻其为硒蛋白的生物信息依据,并初步分析推断其功能。方法:利用VectorNTI等多种生物信息学工具对硬粒小麦AY146587.1序列中发现的疑似硒蛋白编码序列进行综合分析研究。结果:发现2段目标编码序列具有与某些蛋白酶相似的生物信息学特征,并推测其蛋白编码具有目前未知的机理。结论:推断AY146587.1序列中存在编码未知硒蛋白的编码段,其编码的硒蛋白参与硬粒小麦胚芽生长发育时期能量调节。
关键词
硒蛋白
SECIS
prosite
BLOCK
硬粒小麦
Keywords
Selenoproteins
SECIS
prosite
BLOCK
Triticum durum Deft.
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
硬粒小麦基因组中疑似硒蛋白生物信息分析
肖庆
杨广笑
何光源
《生物技术》
CAS
CSCD
2008
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