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7个灵长类物种PRSS12基因编码区序列测定与进化分析
被引量:
1
1
作者
徐怀亮
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期85-88,101,共5页
参考人的PRSS12基因组序列(NT016354),分段设计多对引物,对灵长类系统发育中代表不同谱系的7个物种的PRSS12基因蛋白质编码序列进行了PCR扩增、序列测定和拼接,结果获得了7个非人灵长类物种PRSS12基因的完全编码序列,全长为2628bp(大猩...
参考人的PRSS12基因组序列(NT016354),分段设计多对引物,对灵长类系统发育中代表不同谱系的7个物种的PRSS12基因蛋白质编码序列进行了PCR扩增、序列测定和拼接,结果获得了7个非人灵长类物种PRSS12基因的完全编码序列,全长为2628bp(大猩猩2631bp,黄猩猩2634bp),均含有13个完整的外显子。同源性分析表明,灵长类PRSS12的核苷酸和氨基酸序列均显示出高度的保守性。其基因进化速率也非常缓慢,每10亿年每个位点的平均非同义替换数仅为0.20个,平均同义替换数仅为1.13个。选择性检验表明,在灵长类的进化历程中,PRSS12其因保持着由纯化性选择所致的强烈的功能束缚,这暗示着该基因在灵长类的神经系统发育和认知能力发展中可能起着关键的功能性作用。进一步分析表明,纯化性选择实际上主要作用于PRSS12基因的SRCR功能结构域编码区,该结构域起着介导PRSS12基因编码蛋白结合于其它细胞表面或胞外蛋白质的重要作用。
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关键词
prss12基因
灵长类
分子进化
纯化性选择
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职称材料
题名
7个灵长类物种PRSS12基因编码区序列测定与进化分析
被引量:
1
1
作者
徐怀亮
机构
四川农业大学
出处
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期85-88,101,共5页
基金
中国博士后科学基金项目(2005037803)
四川省教育厅自然科学基金重点项目(08ZA076)
四川农业大学"双支计划"项目(01570104)
文摘
参考人的PRSS12基因组序列(NT016354),分段设计多对引物,对灵长类系统发育中代表不同谱系的7个物种的PRSS12基因蛋白质编码序列进行了PCR扩增、序列测定和拼接,结果获得了7个非人灵长类物种PRSS12基因的完全编码序列,全长为2628bp(大猩猩2631bp,黄猩猩2634bp),均含有13个完整的外显子。同源性分析表明,灵长类PRSS12的核苷酸和氨基酸序列均显示出高度的保守性。其基因进化速率也非常缓慢,每10亿年每个位点的平均非同义替换数仅为0.20个,平均同义替换数仅为1.13个。选择性检验表明,在灵长类的进化历程中,PRSS12其因保持着由纯化性选择所致的强烈的功能束缚,这暗示着该基因在灵长类的神经系统发育和认知能力发展中可能起着关键的功能性作用。进一步分析表明,纯化性选择实际上主要作用于PRSS12基因的SRCR功能结构域编码区,该结构域起着介导PRSS12基因编码蛋白结合于其它细胞表面或胞外蛋白质的重要作用。
关键词
prss12基因
灵长类
分子进化
纯化性选择
Keywords
prss
12
gene
Primates
Molecular evolution
Purifying selection
分类号
Q959.848 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
7个灵长类物种PRSS12基因编码区序列测定与进化分析
徐怀亮
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
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