PSCA基因rs2976392位点多态性与胃癌发病的关系

目的研究PSCA基因（pmstatestemcellantigen，PSCA）rs2976392位点多态性与胃癌发病的关系。方法收集155例汉族胃癌患者与210名健康人群的外周血液样本，提取基因组DNA，采用DNA直接测序法进行PSCA基因rs2976392位点的基因分型。结果PSCA基因rs2976392位点3种基因型GG型、GA型和AA型在胃癌组中的频率分别为43．23％、41．94％和14．84％，在对照组中分别为50．95％、41．43％和7．62％。与GG型比较，携带GA型和AA型基因型者胃癌发生的风险性增加，OR分别为1．19（95％CI=0．77～1．86）（P〉0．05）和2．30（95％CI=1．13～4．66）（P〈0．05）。结论PSCA基因rs2976392位点AA基因型与中国汉族人群的胃癌发病有关。

PSCA基因单核苷酸多态性位点与胃溃疡易感性的研究

目的探讨PSCA基因多态性位点与胃溃疡的遗传学关联。方法采用候选基因的遗传学关联研究策略,基于来自中国汉族人群的688名胃溃疡患者以及1442名健康对照受试者,对覆盖PSCA基因的11个SNP位点与胃溃疡的潜在关联进行考察。利用c2检验来对单个SNP位点的关联信号进行统计分析。结果SNP位点rs2294008与胃溃疡的疾病状态存在显著性关联(OR=0.73,P=4.78×10^ 5),该SNP的T等位基因在对照组中的分布频率高于病例组差异有统计学意义(P<0.05),因而具有一定的保护性作用。结论PSCA基因可能是胃溃疡的易感基因。

PSCA基因rs2294008多态性与胃癌的关系

目的了解前列腺干细胞抗原（PSCA）基因rs2294008位点多态性与胃癌的关系。方法收集196例汉族胃癌病人与246例无胃部疾病体检者的外周血样本,提取基因组DNA,采用DNA直接测序法进行PSCA基因rs2294008位点分型。结果胃癌组PSCA基因rs2294008位点3种基因型CC、CT、TT频率分别为43.40%、47.40%和9.20%,对照组分别为53.70%、39.00%和7.30%。与CC型比较,携带CT和TT型基因型者胃癌发生的危险性增加,OR值分别为1.50（95%CI 1.01~2.23）和1.55（95%CI 0.77~3.15）。结论汉族人群PSCA基因rs2294008位点为CT和TT基因型者胃癌发病风险增加。

激光显微切割分选少量胃癌细胞中PSCA基因的SNP分析

随着基因组关联分析方法的应用,越来越多与胃癌相关的易感基因被发现.易感基因的多态性检测已逐步进入胃癌临床诊断和研究.然而,利用少量胃粘膜细胞开展单核苷酸多态性(SNP)分析对胃癌进行早期诊断常遇下述困难,一是少量胃癌细胞混杂在多种细胞中,异常信号常易被淹没,二是细胞量极少,因此获得的基因组DNA量微,进行多位点或全基因组分析存在困难.本文利用激光显微切割技术分选少量胃癌细胞,结合全基因组放大技术,进行胃癌相关的前列腺干细胞抗原基因(PSCA)的SNP分析.通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和克隆测序方法分析,在分选的胃癌细胞中检测到PSCA的rs2976392位点胃癌相关的"A"等位与rs2294008位点胃癌相关的"T"等位.研究结果表明,所采用的全基因组放大方法保真性高,经过分选的胃癌细胞中SNP位点的检测灵敏度和可靠性大为提高.所建立的少量细胞基因多位点检测方法将同样应用于其它肿瘤和组织的少量细胞研究中,全基因组放大产物也可进行高通量的基因芯片和第二代测序研究.