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基于网络药理学联合GEO芯片探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制
被引量:
3
1
作者
吴汶丰
张泽鑫
+4 位作者
梁一飞
王家爵
杨贤平
裴悦
李红毅
《广东药科大学学报》
CAS
2020年第4期545-551,共7页
目的基于网络药理学方法联合GEO芯片差异基因分析,探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制。方法检索GEO数据库,获取特应性皮炎的基因芯片,绘制差异基因火山图与热图。运用TCMSP、BATMAN-TCM、Drugbank数据库,获取培土清心方治疗特应...
目的基于网络药理学方法联合GEO芯片差异基因分析,探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制。方法检索GEO数据库,获取特应性皮炎的基因芯片,绘制差异基因火山图与热图。运用TCMSP、BATMAN-TCM、Drugbank数据库,获取培土清心方治疗特应性皮炎的有效成分及基因,并利用cytoscape 3.7.2,构建培土清心方-特应性皮炎-分子基因网络,行拓扑网络分析。运用R软件,对基因进行GO功能与KEGG通路富集分析。结果获得培土清心方治疗特应性皮炎的143个活性成分,治疗特应性皮炎的主要活性成分为槲皮素、豆甾醇、木犀草素。培土清心方对应疾病的核心基因共42个,其中重要候选基因为PPARG等。拓扑网络分析重要候选基因为TP53、NTRK1等。GO分析生物通路共516条,细胞成分8个,分子功能44个,主要涉及response to steroid hormone生物过程,nuclear receptor activity分子功能,condensed chromosome细胞过程。KEGG通路22条,主要涉及AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications。结论培土清心方治疗特应性皮炎是通过多成分、多基因、多通路,发挥抗炎、调节细胞免疫、抑菌的作用,这将为进一步研究此方作用机制提供参考,也为培土清心方治疗AD的基础、临床研究及新药研制提供一定的理论依据。
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关键词
网络药理学
GEO芯片
培土清心方
特应性皮炎
分子机制
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职称材料
培土清心方对特应性皮炎儿童肠道菌群的影响
被引量:
15
2
作者
裴悦
肖水明
+6 位作者
莫秀梅
刘俊峰
梁家芬
张瑜
王楚阳
黄志海
李红毅
《中国皮肤性病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期688-691,共4页
目的通过高通量测序手段检测比较特应性皮炎(AD)患儿与健康对照儿童肠道菌群结构差异,并对比培土清心方干预前后对AD患儿的临床疗效及肠道菌群的改变情况,初步探索培土清心方对肠道菌群的影响。方法共纳入60例受试者(实验组、健康对照组...
目的通过高通量测序手段检测比较特应性皮炎(AD)患儿与健康对照儿童肠道菌群结构差异,并对比培土清心方干预前后对AD患儿的临床疗效及肠道菌群的改变情况,初步探索培土清心方对肠道菌群的影响。方法共纳入60例受试者(实验组、健康对照组各30例),实验组分别在口服培土清心方0周(AD.0W)、4周(AD.4W)进行SCORAD评分并采集粪便样品,对照组在0周时采集粪便样品,统一对粪便样品进行16S rRNA基因测序检测。结果实验组用药4周(AD.4W)SCORD评分降低,差异有统计学意义(P<0.05)。肠道菌群测序结果:①Alpha多样性:AD.0W组>AD.4W组>健康对照组(P>0.05)。②差异菌门水平:Firmicutes(厚壁菌门)相对丰度:AD.0W组<健康对照组<AD.4W组(P>0.05);Bacteroidetes(拟杆菌门)相对丰度:AD.4W组<健康对照组<AD.0W组(P>0.05);Faecalibacterium(柔嫩梭菌属)相对丰度:AD.0W组<AD.4W组<健康对照组,差异有统计学意义(P=0.00<0.05)。结论特应性皮炎儿童和健康儿童肠道菌群多样性方面无差异,柔嫩梭菌属为健康人优势菌属;培土清心方可改善AD患儿病情,对肠道菌群多样性无明显影响,其可能通过上调厚壁菌门、柔嫩梭菌属,下调拟杆菌门丰度来达到减轻肠道炎症、改善AD的作用。
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关键词
特应性皮炎
肠道菌群
培土清心方
16S
rRNA基因测序检测
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学联合GEO芯片探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制
被引量:
3
1
作者
吴汶丰
张泽鑫
梁一飞
王家爵
杨贤平
裴悦
李红毅
机构
广州中医院大学第二临床医学院
广东省中医院
出处
《广东药科大学学报》
CAS
2020年第4期545-551,共7页
基金
国家中医药管理局禤国维国医大师传承工作室项目
国家中医药管理局中医学术流派传承工作室建设项目“岭南皮肤病流派传承工作室项目”(LP0119045)
广东省中医院院内专项(2017KT1661)。
文摘
目的基于网络药理学方法联合GEO芯片差异基因分析,探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制。方法检索GEO数据库,获取特应性皮炎的基因芯片,绘制差异基因火山图与热图。运用TCMSP、BATMAN-TCM、Drugbank数据库,获取培土清心方治疗特应性皮炎的有效成分及基因,并利用cytoscape 3.7.2,构建培土清心方-特应性皮炎-分子基因网络,行拓扑网络分析。运用R软件,对基因进行GO功能与KEGG通路富集分析。结果获得培土清心方治疗特应性皮炎的143个活性成分,治疗特应性皮炎的主要活性成分为槲皮素、豆甾醇、木犀草素。培土清心方对应疾病的核心基因共42个,其中重要候选基因为PPARG等。拓扑网络分析重要候选基因为TP53、NTRK1等。GO分析生物通路共516条,细胞成分8个,分子功能44个,主要涉及response to steroid hormone生物过程,nuclear receptor activity分子功能,condensed chromosome细胞过程。KEGG通路22条,主要涉及AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications。结论培土清心方治疗特应性皮炎是通过多成分、多基因、多通路,发挥抗炎、调节细胞免疫、抑菌的作用,这将为进一步研究此方作用机制提供参考,也为培土清心方治疗AD的基础、临床研究及新药研制提供一定的理论依据。
关键词
网络药理学
GEO芯片
培土清心方
特应性皮炎
分子机制
Keywords
network pharmacology
GEO chip
ptqx formula
atopic dermatitis
molecular mechanism
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
培土清心方对特应性皮炎儿童肠道菌群的影响
被引量:
15
2
作者
裴悦
肖水明
莫秀梅
刘俊峰
梁家芬
张瑜
王楚阳
黄志海
李红毅
机构
广州中医药大学第二附属医院皮肤科
中国中医科学院中药研究所
出处
《中国皮肤性病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期688-691,共4页
基金
广东省中医院中医药科技技术研究专项(YN2016ML08)
国家自然科学基金(81774307)
+1 种基金
广东省中医药局科研项目(20182042)
国家中医药管理局中医学术流派传承工作室建设项目-岭南皮肤病流派传承工作室(LP0119045),国家中医药管理局禤国维国医大师传承工作室。
文摘
目的通过高通量测序手段检测比较特应性皮炎(AD)患儿与健康对照儿童肠道菌群结构差异,并对比培土清心方干预前后对AD患儿的临床疗效及肠道菌群的改变情况,初步探索培土清心方对肠道菌群的影响。方法共纳入60例受试者(实验组、健康对照组各30例),实验组分别在口服培土清心方0周(AD.0W)、4周(AD.4W)进行SCORAD评分并采集粪便样品,对照组在0周时采集粪便样品,统一对粪便样品进行16S rRNA基因测序检测。结果实验组用药4周(AD.4W)SCORD评分降低,差异有统计学意义(P<0.05)。肠道菌群测序结果:①Alpha多样性:AD.0W组>AD.4W组>健康对照组(P>0.05)。②差异菌门水平:Firmicutes(厚壁菌门)相对丰度:AD.0W组<健康对照组<AD.4W组(P>0.05);Bacteroidetes(拟杆菌门)相对丰度:AD.4W组<健康对照组<AD.0W组(P>0.05);Faecalibacterium(柔嫩梭菌属)相对丰度:AD.0W组<AD.4W组<健康对照组,差异有统计学意义(P=0.00<0.05)。结论特应性皮炎儿童和健康儿童肠道菌群多样性方面无差异,柔嫩梭菌属为健康人优势菌属;培土清心方可改善AD患儿病情,对肠道菌群多样性无明显影响,其可能通过上调厚壁菌门、柔嫩梭菌属,下调拟杆菌门丰度来达到减轻肠道炎症、改善AD的作用。
关键词
特应性皮炎
肠道菌群
培土清心方
16S
rRNA基因测序检测
Keywords
Atopic dermatitis
Gut microbiota
ptqx formula
e
16S rRNA tests
分类号
R758.2 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学联合GEO芯片探析培土清心方治疗特应性皮炎的分子机制
吴汶丰
张泽鑫
梁一飞
王家爵
杨贤平
裴悦
李红毅
《广东药科大学学报》
CAS
2020
3
下载PDF
职称材料
2
培土清心方对特应性皮炎儿童肠道菌群的影响
裴悦
肖水明
莫秀梅
刘俊峰
梁家芬
张瑜
王楚阳
黄志海
李红毅
《中国皮肤性病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
15
下载PDF
职称材料
已选择
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