一例糖原累积病Ⅵ型患儿的PYGL基因变异分析

目的分析1例糖原累积病Ⅵ型(glycogen storage disease typeⅥ,GSD-Ⅵ)患儿的临床特征和基因变异情况,明确其致病原因。方法收集1例GSD-Ⅵ患儿的临床资料,采集患儿及其父母外周血提取基因组DNA,应用全外显子测序对患者进行基因检测,对疑似变异进行Sanger测序验证并行生物信息学分析。结果患儿表现为空腹低血糖、肝大、生长迟缓、转氨酶增高、代谢性酸中毒、高乳酸,肝穿刺病理提示糖原累积病。基因测序提示患儿PYGL基因存在c.2089A>G(p・Asn697Asp)和c.158_160delACT(p.Tyr53del)复合杂合变异。Sanger测序验证提示患儿母亲存在c.2089A>G杂合变异,患儿父亲存在c.158_160delACT杂合变异。这两种变异均为罕见的变异,既往未见报道,其位点高度保守且Provean、MutationTaster预测为有害。结论PYGL基因复合杂合变异(c.2089A>G/c.158_160delACT)为患儿的致病原因。新变异位点的检出丰富了PYGL基因的变异谱,为该家系的遗传咨询提供了依据。

基于GEO数据库挖掘乳腺癌他莫昔芬耐药相关的糖酵解基因及其机制探讨

目的:寻找糖酵解相关的他莫昔芬耐药(tamoxifen resistance,TamR)基因标志物,为乳腺癌(breast cancer,BC)的耐药机制提供理论依据。方法:从基因表达数据库GEO下载GSE67916,差异分析后与糖酵解相关基因集取交集,通过GSEA富集分析找到与他莫昔芬耐药相关的糖酵解基因,后续在外部独立数据集GSE125738和GSE9893对耐药基因进行验证。此外,在构建的他莫昔芬耐药细胞株中,对耐药基因使用qRT-PCR和Western blot技术在mRNA和蛋白层面进行验证,并通过CCK-8实验进一步验证耐药基因。结果:差异分析得到730个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),与糖酵解相关基因集取交集得到19个DEGs,对这19个DEGs进行GSEA富集,我们发现PYGL与他莫昔芬耐药信号通路和内分泌治疗抵抗信号通路相关。在数据集GSE125738和GSE9893验证PYGL在他莫昔芬耐药组中表达上调。在乳腺癌他莫昔芬耐药细胞株中,PYGL的mRNA水平和蛋白水平均表达上调。此外,CCK-8实验表明,降低PYGL的表达可增强MCF7-TamR对他莫昔芬的反应性。结论:糖酵解基因PYGL是潜在的乳腺癌他莫昔芬耐药基因,可能为乳腺癌治疗提供新的认识和靶向策略。

不同类型糖原贮积症的临床特点分析及治疗效果随访

目的总结经基因诊断的6例不同类型(Ⅰa、Ⅵ及Ⅸa型各2例)糖原贮积症(glycogen storage disease,GSD)患儿的临床特点及治疗效果,提高临床对GSD的认识。方法回顾性分析经基因诊断确诊的GSDⅠa型、Ⅵ型及Ⅸa型各2例患儿的临床资料及基因结果。结果6例患儿中,男5例,女1例,确诊年龄2岁10月龄至7岁。6例患儿均有肝脏肿大和转氨酶升高,空腹低血糖5例,高乳酸血症及高尿酸血症各2例(Ⅰa型),高甘油三酯血症3例(Ⅰa型2例、Ⅵ型1例),生长迟缓及身材矮小4例(Ⅰa型2例、Ⅵ型及Ⅸa型各1例),肾脏损伤2例(Ⅰa型)。2例GSDⅠa型患儿发现2种G6PC基因突变,1种为c.648G>T,另1种为新突变c.346C>T;2例GSDⅥ型患儿发现3种PYGL基因突变,c.1768+1G>A、c.730C>T及c.1121C>T(新突变);2例GSDⅨa型患儿发现2种PHKA2基因突变,c.557G>A及新突变c.3337A>C。经过生玉米淀粉治疗后6例患儿转氨酶均明显下降;5例血糖均升至正常,其中患儿血糖恢复正常时间2例Ⅰa型为10个月,2例Ⅵ型为3~4个月,1例Ⅸa型为3个月;2例Ⅰa型肝脏肿大程度无改变,2例Ⅵ型及2例Ⅸa型肝脏肿大好转;2例Ⅰa型及2例Ⅵ型身高均有所改善,身高增加0.5SD~0.9SD。结论肝脏肿大伴转氨酶升高的患儿需警惕GSD;糖原贮积症Ⅰa型临床表现较重,Ⅸa型及Ⅵ型表现较轻;生玉米淀粉治疗后Ⅵ型及Ⅸa型空腹血糖恢复较Ⅰa型快。该研究发现的G6PC基因c.346C>T、PYGL基因c.1121C>T及PHKA2基因c.3337A>C均为新发突变,拓展了基因谱。

一例糖原贮积症Ⅵ型患儿的临床表型及致病变异分析

目的对一例糖原贮积症Ⅵ型(glycogen storage diseaseⅥ,GSD-Ⅵ)患儿进行表型和致病变异分析,明确其遗传学病因。方法分析患儿的临床资料,应用全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)对其进行致病变异检测,用Sanger测序对候选变异进行验证。结果患儿男,3岁9个月,表现为腹部膨隆、肝脏肿大、身材矮小,WES检测发现其携带PYGL基因c.320dupA(p.Asn107fs)和c.697G>A(p.Gly233Ser)复合杂合变异,Sanger测序证实二者分别遗传自其父母,其中c.320dupA(p.Asn107fs)既往未见报道。结论上述发现明确了该GSD-Ⅵ患儿的遗传学病因,丰富了PYGL基因的变异谱,并为患儿的治疗和遗传咨询提供了依据。