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普通丝瓜PYL基因家族鉴定及其在果实发育中的表达分析 被引量:1
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作者 王玉倩 彭丽娟 +3 位作者 刘建汀 温庆放 钟凤林 朱海生 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期408-420,共13页
【目的】探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路。【方法】用生物信息学方法,对普通丝瓜PYL基因家族进行全基因组鉴定,染色体定位,以... 【目的】探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路。【方法】用生物信息学方法,对普通丝瓜PYL基因家族进行全基因组鉴定,染色体定位,以及基因结构、基因共线性、选择压力、进化亲缘关系和顺式作用元件分析,并通过qRT-PCR验证在不同浓度ABA下基因特征表达。【结果】在普通丝瓜全基因组中鉴定到11个LcPYL基因,CDS长度576~966 bp,编码蛋白均具有典型PYR_PYL_RCAR_like结构;共线性分析发现7对片段复制基因对,普通丝瓜PYL基因启动子含多个与植物激素相关的顺式作用元件,其成员的表达具有一定的组织特异性;普通丝瓜果实在不同浓度外源ABA处理下:2 mg/mL ABA处理LcPYLs表达无显著变化,4 mg/mL ABA处理LcPYL5、LcPYL7、LcPYL11显著上调表达,8 mg/mL ABA处理LcPYL1、LcPYL7开花当天显著表达。【结论】对普通丝瓜PYL家族成员进行了系统的鉴定与分析,明确其分子结构特征和表达模式,其中LcPYL1、LcPYL5、LcPYL7和LcPYL11可能是与内源ABA生物合成密切相关的关键基因。 展开更多
关键词 普通丝瓜 PYL基因家族 果实发育 外源ABA处理 表达分析
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EL1-like Casein Kinases Suppress ABA Signaling and Responses by Phosphorylating and Destabilizing the ABA Receptors PYR/PYLs in Arabidopsis 被引量:21
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作者 Hu-Hui Chen Li Qu +2 位作者 Zhi-Hong Xu Jian-Kang Zhu Hong-Wei Xue 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期706-719,共14页
Unveiling the signal transduction of phytohormone abscisic acid (ABA) and its regulatory mechanisms is critical for developing the strategies toward improving plant responses to stressful environments. ABA signaling... Unveiling the signal transduction of phytohormone abscisic acid (ABA) and its regulatory mechanisms is critical for developing the strategies toward improving plant responses to stressful environments. ABA signaling is perceived and mediated by multiple PYR/PYL receptors, whose post-translational modifications, especially phosphorylation, remain largely unknown. In this study, we demonstrate thatArabidopsis ELl-like (AEL) protein, a casein kinase that regulates various physiological processes, phosphorylate PYR/PYLs to promote their ubiquitination and degradation, resulting in suppressed ABA responses. Arabidopsis ael triple mutants display hypersensitive responses to ABA treatment, which is consistent with the suppressed degradation of PYR/PYL proteins. PYR/PYLs are phosphorylated in vivo and mutation of the conserved AEL phosphorylation sites results in reduced phosphorylation, ubiquitination, and degradation of PYR/PYLs, and hence enhanced ABA responses. Taken together, these results demonstrate that AEL-mediated phosphorylation plays crucial roles in regulating the stability and function of PYR/ PYLs, providing significant insights into the post-translational regulation of PYR/PYL receptors and ABA signaling. 展开更多
关键词 ARABIDOPSIS ABA AEL (Arabidopsis EL1 -like) PYR/pyls PHOSPHORYLATION degradation
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葡萄CYP707A基因家族的鉴定及对果实成熟的功能验证
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作者 龚丽丽 余花 +3 位作者 杨杰 陈天池 赵双滢 吴月燕 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期160-171,共12页
【目的】CYP707A是细胞色素P450家族的亚家族成员,所编码的ABA8'-羟化酶是ABA分解代谢的关键酶,对植物生长发育起着重要作用。鉴定葡萄CYP707A基因家族,可为进一步研究葡萄果实成熟机理和生物育种技术提供理论依据。【方法】利用生... 【目的】CYP707A是细胞色素P450家族的亚家族成员,所编码的ABA8'-羟化酶是ABA分解代谢的关键酶,对植物生长发育起着重要作用。鉴定葡萄CYP707A基因家族,可为进一步研究葡萄果实成熟机理和生物育种技术提供理论依据。【方法】利用生物学信息方法分析葡萄中CYP707A家族基因的基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性、系统进化关系及启动子区顺式作用元件等,并利用RT-q PCR分析VvCYP707A基因在葡萄不同品种(早熟和中熟)的时空表达模式、组织表达模式以及对外源ABA处理的响应模式,并利用果实瞬时表达技术对Vitvi07g01751进行功能验证。【结果】葡萄基因组鉴定出5个VvCYP707As基因,分布于5条染色体,其中Vitvi02g01269、Vitvi07g01751和Vitvi18g00792为片段复制基因。CYP707A基因家族高度保守,其中,基因结构和蛋白基序相似,亚细胞定位均位于内质网;VvCYP707A启动子区域富含与生长发育和激素响应相关的顺式作用元件,均含有ABA激素响应元件;通过RT-qPCR检测基因的表达模式发现,VvCYP707A基因具有时空特异性和组织特异性,主要在果实的幼果期与膨大期和茎、叶组织中高表达,其中Vitvi07g01751基因在早熟品种‘甬早红’膨大期果实中特异性高表达,且在两个品种间的表达模式一致,随着果实的成熟其表达先升高后降低。外源ABA处理下VvCYP707A分为两种表达模式,在浆果肉中外源ABA可诱导5个VvCYP707A基因高表达,在浆果皮中会显著抑制VvCYP707A基因的表达;在葡萄果实中瞬时表达Vitvi07g01751,葡萄的糖度积累缓慢,显著增加编码ABA的受体VvPYL4基因表达量,推测了Vitvi07g01751介导ABA调控葡萄果实成熟的机制。【结论】研究结果揭示了葡萄Vitvi07g01751在果实成熟中起着重要作用。 展开更多
关键词 葡萄 CYP707A基因 全基因组鉴定 生物信息学 果实成熟 脱落酸 PYL基因
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菊花脑PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析
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作者 郑重玖 宋孜文 +2 位作者 杨俊俊 张兵 艾鹏慧 《天津农业科学》 CAS 2024年第8期9-17,26,共10页
PYL(Pyrabactin resistance 1-like)蛋白作为脱落酸信号转导的核心组件,在植物生长发育和逆境胁迫响应中起到重要作用。为探究菊花脑PYL家族的功能,利用生物信息学方法鉴定菊花脑(Chrysanthemum nankingense)PYL基因家族成员,并利用RNA-... PYL(Pyrabactin resistance 1-like)蛋白作为脱落酸信号转导的核心组件,在植物生长发育和逆境胁迫响应中起到重要作用。为探究菊花脑PYL家族的功能,利用生物信息学方法鉴定菊花脑(Chrysanthemum nankingense)PYL基因家族成员,并利用RNA-Seq数据分析CnPYLs在不同组织中的表达情况。结果表明:CnPYL家族包括11个成员,分为3个亚家族,同一个亚家族的各成员蛋白结构域和基因结构高度保守,其中亚家族I基因含有2个内含子,其他2个亚家族基因没有内含子;CnPYL家族基因启动子区域顺式作用元件主要包括逆境胁迫响应元件、植物生长发育相关元件、光响应元件和激素响应元件。同时,RNA-Seq数据分析表明,PYL基因在菊花脑中的表达具有组织特异性,除CnPYL2基因在根中的表达量较低外,其他CnPYLs基因在菊花脑各组织中的表达都很高。这说明PYL作为ABA受体成员,参与了ABA调控的菊花脑各组织的生长发育过程。综上,本研究结果为深入研究CnPYLs基因的功能提供了基础信息。 展开更多
关键词 PYL 基因家族 生物信息学 菊花脑 基因表达
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普通烟草PYL基因家族成员鉴定及干旱胁迫下基因表达分析
5
作者 扈佳慧 徐腾航 +5 位作者 刘杰 王雨果 刘红峰 王世泽 余世洲 王丰 《核农学报》 CAS 北大核心 2025年第1期47-58,共12页
PYR/PYL/RCAR(PYL)蛋白作为脱落酸(ABA)的直接受体,在ABA信号转导途径中发挥着关键调控作用。为探究PYL基因在烟草中的系统发育和表达模式,本研究利用生物信息学手段在普通烟草品种K326全基因组范围内进行了鉴定分析,并利用实时荧光定量... PYR/PYL/RCAR(PYL)蛋白作为脱落酸(ABA)的直接受体,在ABA信号转导途径中发挥着关键调控作用。为探究PYL基因在烟草中的系统发育和表达模式,本研究利用生物信息学手段在普通烟草品种K326全基因组范围内进行了鉴定分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测了各基因在遭受干旱胁迫0、1、3、6、12、24、36和48 h的基因表达量。结果共鉴定到26个烟草PYL基因,依据系统发育和结构特点可划分为3个亚家族(Ⅰ~Ⅲ),成员数目分别为9、11和6。蛋白理化性质分析结果表明,所有烟草PYL蛋白都呈亲水性,氨基酸长度在173~586 aa之间,相对分子量在16 763.26~65 709.39 Da之间,等电点(pI)在4.73~9.05之间。顺式作用元件分析结果发现,烟草PYL基因启动子区含有MYB、NAC、WARKY、TCP、ZF-HD等逆境胁迫响应相关元件。基因表达结果显示,烟草PYL基因在遭受干旱胁迫后,除NtPYL8、NtPYL9、NtPYL17和NtPYL21基因外、其余基因表达量整体表现为上调趋势,但各亚家族成员间基因表达具有明显差异。其中亚家族Ⅱ中NtPYL1、NtPYL2、NtPYL4基因和亚家族Ⅲ中NtPYL25基因在遭受干旱胁迫6~12 h后基因表达量达到最高,且相对表达量较0 h上升显著,可作为烟草应答干旱胁迫的重要候选基因。本研究为进一步开展烟草候选抗旱PYL基因功能研究及育种利用奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草 PYL家族 干旱胁迫 基因表达分析 脱落酸
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5种山茶属植物PYL基因密码子偏好性分析
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作者 刘丹丹 王雷刚 +4 位作者 吴琼 孙明慧 焦小雨 阮旭 王文杰 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1919-1932,共14页
为了更深入地了解PYL基因的遗传和进化特征,本研究针对5种山茶属植物的PYL基因密码子使用模式进行分析。基于公布的浙江红山茶、狭叶油茶、‘云抗10号’、野生大树茶、‘铁观音’基因组数据共鉴定出55个PYL基因。系统发育结果显示,PYL... 为了更深入地了解PYL基因的遗传和进化特征,本研究针对5种山茶属植物的PYL基因密码子使用模式进行分析。基于公布的浙江红山茶、狭叶油茶、‘云抗10号’、野生大树茶、‘铁观音’基因组数据共鉴定出55个PYL基因。系统发育结果显示,PYL基因可分为4类。共线性分析表明,PYL基因在进化过程中受到的选择压力较小,主要受到纯化选择的作用。密码子偏好指数和同义密码子使用偏差分析,59个同义密码子的使用存在显著差异。PYL基因偏好使用GCC、ATC、CTC、ACC、GTC等以G/C结尾编码疏水性氨基酸的密码子。通过ENC plot、PR2-plot、GC3-GC12分析表明,自然选择在PYL基因进化中发挥了重要作用。在异源表达时,PYL基因密码子使用频率相似性高的受体为最佳受体。本研究揭示PYL基因在山茶属植物中的密码子使用特点和进化关系,为深入理解其功能及适应性机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 山茶属 PYL基因 系统发育分析 共线性分析 密码子偏好性
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枇杷PYL基因家族鉴定及表达分析
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作者 林秋香 韩雨昕 《亚热带植物科学》 CAS 2024年第1期1-11,共11页
脱落酸(ABA)是调节植物生长发育与非生物胁迫的重要激素之一,ABA受体Pyrabactin Resistance 1(PYR)-like(PYL)于信号通路的顶端发挥核心调控作用,但枇杷Eriobotrya japonica的PYL基因家族尚未鉴定。本研究通过生物信息学分析鉴定出枇杷1... 脱落酸(ABA)是调节植物生长发育与非生物胁迫的重要激素之一,ABA受体Pyrabactin Resistance 1(PYR)-like(PYL)于信号通路的顶端发挥核心调控作用,但枇杷Eriobotrya japonica的PYL基因家族尚未鉴定。本研究通过生物信息学分析鉴定出枇杷12个PYL基因家族成员,枇杷PYL蛋白分子量为10.47~29.12 kDa,且主要定位于细胞质。枇杷PYL基因家族成员分布在8条染色体上,进化树分析显示PYL基因家族包含三个亚家族,且枇杷EjPYL1与拟南芥AtPYL13亲缘关系较近。枇杷PYL蛋白含有1~6个motif,其中motif3为家族成员共有。枇杷PYL基因家族成员在物种内存在共线性,与拟南芥的物种间共线性有2对。顺式作用元件分析发现枇杷PYL基因启动子含有低温、干旱、光以及激素响应元件。枇杷幼果转录组分析表明,果肉和种子中EjPYL6和EjPYL8基因受低温诱导上调表达。该研究结果将为枇杷ABA信号转导途径的解析和抗冻新品种培育提供理论依据。 展开更多
关键词 枇杷 PYL基因家族 ABA 冻害胁迫
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脱落酸受体PYLs的结构与功能研究进展 被引量:4
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作者 丁冰杰 孔祥强 董合忠 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第20期6844-6852,共9页
脱落酸(abscisic acid, ABA)在响应生物及非生物胁迫和调控植物生长发育中发挥重要作用。ABA功能的发挥是通过一系列信号转导来实现的。ABA信号通路主要包括ABA受体PYR/PYL/RCAR、PP2C和SnRK2 3类核心组分。在ABA信号转导过程中,ABA受体... 脱落酸(abscisic acid, ABA)在响应生物及非生物胁迫和调控植物生长发育中发挥重要作用。ABA功能的发挥是通过一系列信号转导来实现的。ABA信号通路主要包括ABA受体PYR/PYL/RCAR、PP2C和SnRK2 3类核心组分。在ABA信号转导过程中,ABA受体PYLs作为ABA信号通路上游调控因子,首先感受ABA信号;然后,通过抑制PP2C磷酸酶活性进而激活SnRK2,促进下游基因表达,开启ABA信号通路,调控植物耐逆或生长发育。本研究主要对ABA信号通路,特别是PYLs蛋白的发现、结构及功能等方面进行了评述,并以棉花为例,对如何深化棉花PYLs蛋白功能研究作了展望。 展开更多
关键词 ABA PYL 棉花 非生物胁迫 耐逆
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番茄脱落酸受体PYL基因家族全基因组鉴定及表达分析 被引量:4
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作者 王傲雪 孟令君 +6 位作者 陈秀玲 莫福磊 吕瑞 薛小棚 孟凡越 齐浩楠 张珍珠 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期21-32,共12页
脱落酸受体家族包含许多功能基因,其中PYR/PYL/RCARs(PYL)在植物生长发育和防御反应等方面发挥重要生物学功能。PYL基因表达可参与ABA通路调节,对非生物胁迫作出响应。PYL基因家族成员在其他植物中已被鉴定和研究,但在番茄中研究较少。... 脱落酸受体家族包含许多功能基因,其中PYR/PYL/RCARs(PYL)在植物生长发育和防御反应等方面发挥重要生物学功能。PYL基因表达可参与ABA通路调节,对非生物胁迫作出响应。PYL基因家族成员在其他植物中已被鉴定和研究,但在番茄中研究较少。研究首次在番茄中鉴定出20个PYL基因家族成员,分别命名为SlPYL1~SlPYL20。利用生物信息学方法,分析其理化性质、基因结构、系统发育关系、染色体定位、共线性关系和顺式作用元件等,通过顺式作用元件分析发现其含有胁迫响应元件、光响应相关元件和植物生长发育相关元件,预示PYL基因家族功能多样性。转录组数据分析表明,干旱和高温处理前后SlPYL基因表达模式不同,q RTPCR分析发现6个SlPYLs基因全部响应干旱和外源ABA处理,部分响应冷胁迫和盐胁迫。研究为提高番茄逆境抵抗能力研究提供新的候选基因。 展开更多
关键词 PYL 基因家族 生物信息学 逆境胁迫 番茄
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黑果枸杞PYL转录因子家族鉴定与生物信息学分析 被引量:1
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作者 胡晓桐 刘筠 +2 位作者 杜雨 贾西贝 马彦军 《草原与草坪》 CAS CSCD 2023年第3期14-20,共7页
【目的】基于黑果枸杞(Lycium ruthenicum)果实发育过程中转录组测序结果,对黑果枸杞PYL转录因子家族成员进行鉴定。【方法】将黑果枸杞果实发育过程中鉴定出的PYL转录因子进行理化性质、多序列对比、保守基序、果实发育过程中的表达谱... 【目的】基于黑果枸杞(Lycium ruthenicum)果实发育过程中转录组测序结果,对黑果枸杞PYL转录因子家族成员进行鉴定。【方法】将黑果枸杞果实发育过程中鉴定出的PYL转录因子进行理化性质、多序列对比、保守基序、果实发育过程中的表达谱分析。【结果】与黑果枸杞果实发育相关的9个PYL转录因子氨基酸数目介于166~255,分子量18229.42~24689.97 D,理论等电点5.33~7.14,不稳定系数为35.08~44.05,家族成员中含有1个稳定碱性蛋白、4个稳定酸性蛋白、4个不稳定酸性蛋白。【结论】通过分析基因表达谱发现,LrPYL7和LrPYL8成员在黑果枸杞果实发育全时期中(绿熟期、变色期、完熟期)均呈现高表达,可能对该过程具有重要调控作用,这将为黑果枸杞及PYL转录因子的进一步研究奠定基础。 展开更多
关键词 黑果枸杞 果实发育 PYL转录因子 生物信息学 系统性发育分析
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PYR/PYL/RCAR蛋白介导植物ABA的信号转导 被引量:29
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作者 胡帅 王芳展 +2 位作者 刘振宁 刘亚培 余小林 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期560-572,共13页
脱落酸(ABA)在各个植物生长发育阶段以及植物对生物与非生物胁迫的响应过程中都发挥着重要的作用。最近研究表明,在ABA信号转导途径中有3种核心组份:ABA受体PYR/PYL/RCAR蛋白、负调控因子2C类蛋白磷酸酶(PP2C)和正调控因子SNF1相关的蛋... 脱落酸(ABA)在各个植物生长发育阶段以及植物对生物与非生物胁迫的响应过程中都发挥着重要的作用。最近研究表明,在ABA信号转导途径中有3种核心组份:ABA受体PYR/PYL/RCAR蛋白、负调控因子2C类蛋白磷酸酶(PP2C)和正调控因子SNF1相关的蛋白激酶2(SnRK2),它们共同组成了一个双重负调控系统——PYR/PYL/RCAR—|PP2C—|SnRK2来调控ABA信号转导及其下游反应,且3种核心组份在植物体内的结合方式受时空和生化等因素的影响,通过特定组合形成的ABA信号转导复合体介导特定的ABA信号反应。文章就PYR/PYL/RCAR蛋白介导的植物ABA信号识别与转导途径的分子基础及其调控机制,以及PYR/PYL/RCAR—PP2C—SnRK2参与的ABA信号调控网络等研究进展做一概述,并对该领域今后的研究进行了展望。 展开更多
关键词 ABA 信号转导 PYR/PYL/RCAR蛋白 PP2C SnRK2
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适于烟草脆裂病毒诱导的本氏烟基因沉默分析的对照载体构建(英文) 被引量:6
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作者 程维舜 徐秋芳 +2 位作者 黎飞 徐幼平 蔡新忠 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期10-20,共11页
对烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)诱导的基因沉默分析体系中目前最常用的对照载体——空pYL156载体(pYL156∷00)对沉默处理后番茄和本氏烟(Nicotiana benthamiana)植株的病毒症状和生长影响进行分析.结果表明:pYL156∷00沉默... 对烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)诱导的基因沉默分析体系中目前最常用的对照载体——空pYL156载体(pYL156∷00)对沉默处理后番茄和本氏烟(Nicotiana benthamiana)植株的病毒症状和生长影响进行分析.结果表明:pYL156∷00沉默处理后的番茄和本氏烟植株均表现出严重的系统性病毒症状,生长受到显著抑制,因此,pYL156∷00并不是一个用于TRV诱导的番茄和本氏烟基因沉默分析的好的对照载体;为获得更好的对照载体,试验构建了2个新的对照载体pYL156∷NIRi和pYL156∷eGFP,它们分别通过在pYL156∷00载体多克隆位点插入253bp菜豆亚硝酸还原酶基因内含子序列和400bp eGFP基因片段而获得,对这2个对照载体对沉默处理后本氏烟植株的病毒症状和生长情况的影响与pYL156∷00进行比较分析.结果表明:pYL156∷00沉默处理后的植株表现出较严重的系统性病毒症状,生长受到显著抑制,其中26.7%植株死亡;pYL156∷NIRi沉默处理后的植株也表现出明显的病毒症状以及生长受抑制现象,但与pYL156∷00相比,所受影响较小,只有13.3%植株死亡;而pYL156∷eGFP沉默处理后的植株不表现明显的病毒症状,植株生长也不受显著影响;病毒积累量检测结果显示,3个对照载体沉默处理的植株病毒症状和生长受抑制情况与植株体内TRV病毒的积累水平密切相关.这些结果表明,新构建的pYL156∷eGFP可以作为一个优越的对照载体应用于TRV诱导的基因沉默分析. 展开更多
关键词 烟草脆裂病毒 基因沉默 对照载体 pYL156∷eGFP pYL156∷NIRi
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葡萄PYL基因家族的鉴定与表达分析 被引量:13
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作者 马宗桓 陈佰鸿 +1 位作者 李文芳 毛娟 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期265-274,共10页
【目的】通过分析葡萄(Vitis vinifera L.)PYL基因在非生物胁迫条件下的响应情况,丰富PYR/PYL/RCAR(Pyrabactin Resistance/Pyr1-Like/Regulatory Components of ABA Receptor)在ABA信号和启动信号转导中的功能。【方法】利用生物信息... 【目的】通过分析葡萄(Vitis vinifera L.)PYL基因在非生物胁迫条件下的响应情况,丰富PYR/PYL/RCAR(Pyrabactin Resistance/Pyr1-Like/Regulatory Components of ABA Receptor)在ABA信号和启动信号转导中的功能。【方法】利用生物信息学方法,筛选葡萄中的PYL基因,并对其进行生物信息学及非生物胁迫下的响应分析。【结果】从葡萄基因组中共鉴定出6个PYL基因,Vv PYL家族无染色体偏好性,Vv PYL5无内含子结构;除Vv PYL4外均富含酸性氨基酸,该家族成员主要定位于细胞质中,并有多个保守位点。10%(ω)PEG和100μmol·L^(-1)ABA处理6 h后,Vv PYL1和Vv PYL2表达水平与对照相比差异显著,分别为对照的1.3~1.8倍。50μmol·L^(-1)ABA处理6 h后,Vv PYL1表达水平与对照差异显著,为对照的1.5倍;400 mmol·L^(-1)Na Cl、10%PEG、50μmol·L^(-1)ABA和100μmol·L^(-1)ABA处理24 h后,Vv PYL1和Vv PYL2的表达水平显著高于对照,为对照的1.2~2.2倍,400 mmol·L^(-1)Na Cl处理24 h后,Vv PYL6的表达水平显著高于对照,为对照的1.6倍。【结论】克隆得到葡萄的6个PYL基因,高度保守,分为3个亚组;能够响应不同非生物胁迫。本研究为葡萄PYL基因在逆境应答中的功能研究提供了基础。 展开更多
关键词 葡萄 PYR/PYL/RCAR家族 生物信息学 实时荧光定量PCR
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马铃薯PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:4
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作者 贾小霞 齐恩芳 +4 位作者 马胜 黄伟 郑永伟 白永杰 文国宏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期2533-2545,共13页
作为关键信号分子,脱落酸(ABA)通过其核心信号通路PYLs-PP2Cs-SnRK2s广泛调控植物的生长发育和逆境响应过程,PYLs蛋白作为ABA信号传导的核心组件,在ABA信号传导中发挥着不可替代的作用。为探究PYLs(PYR/PYL/RCARs)基因在马铃薯中的进化... 作为关键信号分子,脱落酸(ABA)通过其核心信号通路PYLs-PP2Cs-SnRK2s广泛调控植物的生长发育和逆境响应过程,PYLs蛋白作为ABA信号传导的核心组件,在ABA信号传导中发挥着不可替代的作用。为探究PYLs(PYR/PYL/RCARs)基因在马铃薯中的进化以及表达模式,本研究从马铃薯全基因组‘DM-v 6.1’共鉴定到17个StPYLs基因,并对其分布、蛋白理化性质、系统进化、基因结构特征以及基因表达模式进行了分析。结果表明,17个StPYLs基因不均匀分布在8条染色体上,其氨基酸大小在163~231 aa之间,等电点在4.5~8.6之间,相对分子量在18.71~25.29 kD之间。根据基因结构和蛋白的系统发育特征,StPYL家族成员共分为3个亚组,motif 1存在于本家族所有基因中,说明它在StPYLs的进化过程中较为保守。基因表达模式分析表明,StPYL家族成员具有明显的组织表达特异性,且除StPYL1在外源激素(BAP、ABA和IAA)和非生物胁迫(高温、盐和干旱)下均上调表达外,其余基因存在功能分化,不同胁迫下的表达模式各异。本研究结果为进一步阐明StPYLs基因在马铃薯中的功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 马铃薯 PYL基因家族 脱落酸 基因表达分析
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植物激素脱落酸受体及其信号转导途径研究进展 被引量:8
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作者 曹婧 兰海燕 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期22-28,共7页
脱落酸是广泛存在于植物体的多功能激素,通过与体内受体及随后的复杂信号网络互作进而调节植物生长发育、抵御环境胁迫。脱落酸受体的筛选和鉴定一直备受关注,并已取得较大突破,其信号转导机制也再次成为人们研究的热点。对脱落酸受体... 脱落酸是广泛存在于植物体的多功能激素,通过与体内受体及随后的复杂信号网络互作进而调节植物生长发育、抵御环境胁迫。脱落酸受体的筛选和鉴定一直备受关注,并已取得较大突破,其信号转导机制也再次成为人们研究的热点。对脱落酸受体的鉴定以及介导的信号转导途径方面最新进展进行了综述并展望,以期对相关研究领域提供参考。 展开更多
关键词 脱落酸 受体 PYR/PYL/RCAR 信号转导
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PaPYL9 is involved in the regulation of apricot fruit ripening through ABA signaling pathway 被引量:2
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作者 Mengxiao Jia Jing Feng +2 位作者 Lina Zhang Shikui Zhang Wanpeng Xi 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2022年第4期461-473,共13页
Abscisic acid(ABA)is a major regulator of non-climacteric fruit ripening;however,the role of ABA in the ripening of climacteric fruit is not clear.Here,as a typical climacteric fruit,apricots were used to investigate ... Abscisic acid(ABA)is a major regulator of non-climacteric fruit ripening;however,the role of ABA in the ripening of climacteric fruit is not clear.Here,as a typical climacteric fruit,apricots were used to investigate the role of ABA in fruit ripening.Based on weighted gene coexpression network analysis(WGCNA)of our previous transcriptome data,we treated‘Danxing’fruit with exogenous ABA and obtained ABA receptor genes,genes related to ABA biosynthesis and signal transduction,and analyzed the response of these candidate genes to exogenous ABA during fruit ripening.Subsequently,the full length of candidate PYLs genes were cloned,and their putative function were analyzed by phylogenetic analysis and protein structure domain analysis.And then the function of one candidate gene PaPYL9 was verified by using transgenic tomato.Furthermore,the response genes in transgenic tomato were screened by transcriptome sequencing,and ultimately the related regulatory network was proposed.The results showed that the injection of exogenous 1.89 mmol·L^(-1) ABA remarkably promoted fruit coloration,and increased the color index for red grapes(CIRG)and the total soluble solids(TSS)content,but significantly decreased the firmness and titratable acid(TA)content(p<0.01).Nordihydroguaiaretic acid(NDGA),the inhibitor of ABA,appeared to have the converse role in TA,TSS,CIRG and firmness,during the ripening process.One NCED(9-cis-epoxycarotenoiddioxygenase)and five ABA receptor genes related to signal transduction were mined from the transcriptome data of apricot fruit through WGCNA.Compared with the control,the expression levels of NCED1,PYL9(PYR/PYL/RCAR),SnRK2(SUCROSE NON-FERMENTING1(SNF1)-RELATED PROTEIN KINASE 2S),and ABF2(ABRE-binding bZIP transcription)were induced dramatically by ABA treatment(p<0.01),while NDGA treatment significantly inhibited their expression.Based on gene expression and protein domain analysis,we inferred that PaPYL9 is putatively involved in apricot fruit ripening.Overexpression of PaPYL9 in Micro-TOM tomatoes resulted in the promotion of early ripening.Simultaneously,the expression levels of genes related ethylene biosynthesis,chlorophyll degradation,fruit softening,flavor formation,pigment synthesis,and metabolism were all significantly induced in overexpression of PaPYL9 tomatoes.This indicates the central role of ABA in climacteric fruit ripening.A regulatory network was tentatively proposed,laying the foundation to unveil the molecular mechanism of the regulatory role of PaPYL9 in fruit ripening. 展开更多
关键词 APRICOT pyls Abscisic acid ETHYLENE Fruit ripening
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植物激素——脱落酸(ABA)的细胞信号转导机制 被引量:4
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作者 周杨杨 左圆圆 李小平 《黑龙江农业科学》 2011年第7期14-17,共4页
植物激素脱落酸(ABA)参与从种子萌发到植物开花、结果和衰老等多个生长发育过程。研究ABA细胞信号转导的分子机制对进一步阐明其功能具有重要的意义。通过介绍FCA(Flowering Control Locus A)、Mg离子螯合酶H亚基(ABAR/CHLH)、G蛋白偶... 植物激素脱落酸(ABA)参与从种子萌发到植物开花、结果和衰老等多个生长发育过程。研究ABA细胞信号转导的分子机制对进一步阐明其功能具有重要的意义。通过介绍FCA(Flowering Control Locus A)、Mg离子螯合酶H亚基(ABAR/CHLH)、G蛋白偶联受体(GCR2)、GTG1/GTG2(GPCR-type G-Proteins1/2)和PYR1/PYL/RCAR在ABA信号传导途径中的作用模式,阐述了其能够接受ABA信号并激活相关下游组分,从而完成其生理功能。 展开更多
关键词 ABA受体 信号转导 PYR1/PYL/RCAR
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烟草脱落酸受体基因NtPYR1和NtPYL9的克隆及表达模式分析 被引量:4
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作者 黄佳 夏玉珍 +10 位作者 赵影影 史艳梅 李锋 金立锋 谢贺 魏攀 王晨 杨军 陈继峰 林福呈 王燃 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1-8,共8页
为揭示烟草脱落酸(ABA)受体基因NtPYR1和NtPYL9的生物学功能,以拟南芥PYR1和PYL9基因为探针,在NCBI中通过同源比对查找普通烟草表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)序列,将EST序列进行拼接并设计特异性引物,从普通烟草红花大金元c... 为揭示烟草脱落酸(ABA)受体基因NtPYR1和NtPYL9的生物学功能,以拟南芥PYR1和PYL9基因为探针,在NCBI中通过同源比对查找普通烟草表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)序列,将EST序列进行拼接并设计特异性引物,从普通烟草红花大金元c DNA文库中克隆出NtPYR1和NtPYL9基因,其开放阅读框长分别为678 bp和564 bp,分别编码225个和187个氨基酸。NtPYR1和NtPYL9蛋白都具有一个保守的疏水性结构域,同属于PYR/PYL/RCAR ABA受体基因家族,NtPYR1和NtPYL9与番茄同源蛋白的相似性分别达到79.10%和95.24%。遗传聚类分析结果显示:NtPYR1和NtPYL9与番茄和马铃薯同源基因的遗传进化距离最近,说明PYR1和PYL9在茄科植物中较为保守。定量PCR对烟草不同组织表达模式分析表明,NtPYR1和NtPYL9在烟草不同组织中均有表达,分别在子叶和须根中的表达量最高。NtPYR1和NtPYL9表达均受ABA抑制,同时受H2O2诱导,说明两基因可能参与烟草的抗逆生理过程。 展开更多
关键词 烟草 脱落酸(ABA) 受体基因 NT PYR1 NT PYL9 克隆 表达模式
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基因枪介导的转PYL5基因小麦的获得与鉴定 被引量:3
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作者 池青 周鹏 +2 位作者 刘香利 程绘绘 赵惠贤 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2015年第2期72-78,共7页
【目的】通过基因枪介导共转化,获得转拟南芥抗旱基因PYL5的小麦植株,为转基因小麦的抗旱功能研究奠定基础。【方法】以小麦品种西农889、绵阳19和宁春16为供试材料,通过基因枪介导法将诱导型启动子Rd29A启动的PYL5基因和筛选标记基因Ba... 【目的】通过基因枪介导共转化,获得转拟南芥抗旱基因PYL5的小麦植株,为转基因小麦的抗旱功能研究奠定基础。【方法】以小麦品种西农889、绵阳19和宁春16为供试材料,通过基因枪介导法将诱导型启动子Rd29A启动的PYL5基因和筛选标记基因Bar共转化到小麦幼胚愈伤组织中,经过除草剂PPT(Phosphinothricin)筛选和愈伤组织分化,获得再生植株。根据目标基因PYL5和Bar基因序列分别设计特异引物,对移栽成活的小麦T0代再生植株进行基因特异性PCR检测。【结果】采用基因枪分别轰击西农889的1800个、绵阳19的800个和宁春16的800个幼胚愈伤组织,经过筛选和分化分别获得了9,5和14株小麦再生植株;对转基因小麦T0代再生植株的基因特异性PCR检测结果表明,西农889、绵阳19和宁春16 Bar基因的转化率分别为0.280%,0.500%和0.750%,PYL5基因的转化率分别为0.110%,0.125%和0.500%,Bar和PYL5基因的共转化率分别为0.110%,0.125%和0.500%。【结论】PYL5基因成功转入到了小麦品种西农889、绵阳19和宁春16中。 展开更多
关键词 小麦 基因枪法 共转化法 PYL5基因
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蒺藜苜蓿PYL基因家族的全基因组鉴定、表达和功能分析 被引量:9
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作者 黄思源 呼天明 杨培志 《草业科学》 CAS CSCD 2019年第2期422-433,共12页
脱落酸(ABA)是一种内源性激素,在调节植物的生长发育、非生物胁迫和生物胁迫反应方面发挥着重要作用。Pyrabactin resistance 1-like(PYR/PYL)蛋白在ABA信号传导途径中起核心调控作用。然而,在蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)中并没有关... 脱落酸(ABA)是一种内源性激素,在调节植物的生长发育、非生物胁迫和生物胁迫反应方面发挥着重要作用。Pyrabactin resistance 1-like(PYR/PYL)蛋白在ABA信号传导途径中起核心调控作用。然而,在蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)中并没有关于这个家族的细节。本研究根据拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的14个PYL基因,利用BLAST方法鉴定蒺藜苜蓿基因组中的PYL家族成员。结果表明,鉴定得到14个蒺藜苜蓿PYL基因家族成员,且所有成员均含有PYR-PYL-RCAR-like功能域。预测启动子中的顺式元件发现所有蒺藜苜蓿PYL基因家族成员均含有与胁迫以及激素相关的元件。基因本体论(GO)富集分析与KEGG通路分析显示其主要参与到脱落酸信号通路及对外界刺激的反应。基因表达模式分析显示,其在逆境胁迫下表现出特定的表达模式。本研究为进一步研究蒺藜苜蓿PYL基因奠定了基础。 展开更多
关键词 蒺藜苜蓿 脱落酸 PYL 基因表达模式 非生物胁迫
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