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CLIC3在胰腺癌中的表达及预后相关性的生物信息学分析
1
作者
龚治忠
李清月
刘刚
《安徽卫生职业技术学院学报》
2020年第6期85-87,共3页
目的:通过GEPIA和Ualcan数据库分析CLIC3在胰腺癌中的表达及意义。方法:分析CLIC3在胰腺癌中的表达水平,同时分析其与肿瘤分期、性别、年龄、病理亚型和甲基化之间的关系;利用GEPIA数据库分析CLIC3在胰腺癌的预后和无病生存期的表达情况...
目的:通过GEPIA和Ualcan数据库分析CLIC3在胰腺癌中的表达及意义。方法:分析CLIC3在胰腺癌中的表达水平,同时分析其与肿瘤分期、性别、年龄、病理亚型和甲基化之间的关系;利用GEPIA数据库分析CLIC3在胰腺癌的预后和无病生存期的表达情况,对胰腺癌中CLIC3与MMP28和TRIM29的协同表达情况进行分析。结果:CLIC3在胰腺癌组织中的表达高于正常组织,与肿瘤年龄、性别和病理组织学分级存在部分相关性,CLIC3高表达的胰腺癌患者预后较差,CLIC3与MMP28和TRIM29的表达存在明显的正相关性。结论:CLIC3可能是治疗胰腺癌的潜在靶点。
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关键词
CLIC3
paad
GEPIA数据库
Ualcan数据库
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职称材料
IBM推出新手表电脑
2
《计算机》
2002年第31期66-66,共1页
关键词
IBM
手表电脑
LINUX
WATCH
paad
1.5
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职称材料
MRX-2LHR2型采集站噪声故障分析
3
作者
祝彩霞
王泰昆
范方龙
《石油仪器》
2006年第2期87-88,90,共3页
针对MRX-2LHR2型采集站PAAD板的噪声超标问题展开分析研究,发现问题是因AD8221放大器工作不稳定所致,结合电路的实际应用,从理论上对AD8221器件进行分析,找出噪声产生的原因,并提出器件筛选的重要性。
关键词
paad
板
AD8221器件
噪声分析
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职称材料
MiR-206调控DDX3X促进胰腺癌不良预后及其机制的分析
4
作者
段怡平
陈梁玥
+6 位作者
朱翠雯
马甜甜
李东旭
柳家翠
赵允畅
朱光庭
喻明霞
《分子诊断与治疗杂志》
2022年第2期222-227,共6页
目的研究miR-206在胰腺癌(PAAD)中表达和关键靶基因预测,分析靶基因DDX3X在PAAD中表达及突变与预后的关系,研究其在PAAD恶性进展中的分子机制。方法利用TCGA公共数据集进行生物信息学分析,比较miR-206在PAAD样本和正常样本的表达差异。...
目的研究miR-206在胰腺癌(PAAD)中表达和关键靶基因预测,分析靶基因DDX3X在PAAD中表达及突变与预后的关系,研究其在PAAD恶性进展中的分子机制。方法利用TCGA公共数据集进行生物信息学分析,比较miR-206在PAAD样本和正常样本的表达差异。通过starBase、TargetScan和miRDB在线数据库对PAAD中miR-206的靶基因进行预测,并用韦恩图整合了重叠基因。PPI分析获得评分最高模块的基因,确定关键候选靶基因。利用卡方检验分析DDX3X与患者肿瘤远处转移的关系。通过Kaplan-Meier法分析DDX3X在PAAD中的预后价值。利用KEGG和GO分析探索DDX3X参与的分子通路。结果与正常组织比较,miR-206在PAAD组织表达下调,差异有统计学意义(P<0.05);筛选出369个基因作为miR-206的潜在靶标;PPI评分最高模块中的14个靶基因作为miR-206在PAAD起关键调控作用的候选基因;靶基因DDX3X在PAAD的突变率为1.1%,与患者不良预后的高风险有关。DDX3X在PAAD组织中表达显著上调,差异有统计学意义(P<0.05),且DDX3X高表达与PAAD患者差的总体生存率相关(HR=1.6,P<0.05);DDX3X与远处转移显著相关(P<0.05);DDX3X高表达与较差的OS有关(HR=1.61,95%CI:1.05~2.48,Logrank P<0.05)。靶基因DDX3X的GO分析发现其可能在蛋白磷酸化、核斑点和转录共激活因子活性等中发挥重要作用;在KEGG数据集中,对靶基因DDX3X显著富集的信号通路分析预测,其主要参与了细胞周期、胰腺癌和调节干细胞多能性、TGF-β、FoxO、MAPK等信号通路的调控,大多与肿瘤相关信号通路有关(P<0.05)。结论MiR-206的低表达水平使DDX3X在PAAD中显著上调,可通过多条分子通路调控PAAD的发生发展,DDX3X可作为PAAD潜在的新型标志物。
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关键词
胰腺癌
MiR-206
TCGA
预后
DDX3X
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职称材料
题名
CLIC3在胰腺癌中的表达及预后相关性的生物信息学分析
1
作者
龚治忠
李清月
刘刚
机构
安徽医科大学生命科学学院
出处
《安徽卫生职业技术学院学报》
2020年第6期85-87,共3页
文摘
目的:通过GEPIA和Ualcan数据库分析CLIC3在胰腺癌中的表达及意义。方法:分析CLIC3在胰腺癌中的表达水平,同时分析其与肿瘤分期、性别、年龄、病理亚型和甲基化之间的关系;利用GEPIA数据库分析CLIC3在胰腺癌的预后和无病生存期的表达情况,对胰腺癌中CLIC3与MMP28和TRIM29的协同表达情况进行分析。结果:CLIC3在胰腺癌组织中的表达高于正常组织,与肿瘤年龄、性别和病理组织学分级存在部分相关性,CLIC3高表达的胰腺癌患者预后较差,CLIC3与MMP28和TRIM29的表达存在明显的正相关性。结论:CLIC3可能是治疗胰腺癌的潜在靶点。
关键词
CLIC3
paad
GEPIA数据库
Ualcan数据库
Keywords
CLIC3
paad
GEPIA database
ualcan database
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
IBM推出新手表电脑
2
出处
《计算机》
2002年第31期66-66,共1页
关键词
IBM
手表电脑
LINUX
WATCH
paad
1.5
分类号
TP368 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
MRX-2LHR2型采集站噪声故障分析
3
作者
祝彩霞
王泰昆
范方龙
机构
东方地球物理公司仪器测量服务中心
出处
《石油仪器》
2006年第2期87-88,90,共3页
文摘
针对MRX-2LHR2型采集站PAAD板的噪声超标问题展开分析研究,发现问题是因AD8221放大器工作不稳定所致,结合电路的实际应用,从理论上对AD8221器件进行分析,找出噪声产生的原因,并提出器件筛选的重要性。
关键词
paad
板
AD8221器件
噪声分析
分类号
P631.432 [天文地球—地质矿产勘探]
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职称材料
题名
MiR-206调控DDX3X促进胰腺癌不良预后及其机制的分析
4
作者
段怡平
陈梁玥
朱翠雯
马甜甜
李东旭
柳家翠
赵允畅
朱光庭
喻明霞
机构
武汉大学中南医院检验科
武汉大学第二临床学院
出处
《分子诊断与治疗杂志》
2022年第2期222-227,共6页
基金
国家自然科学基金(81472033)
湖北省医学青年后备人才(青年拔尖人才)(HB20200409)
+6 种基金
湖北省卫生健康科研基金资助(WJ2019M203)
武汉市应用基础研究(2017060201010171)
湖北省卫生和计划生育委员会联合基金项目(WJ2018H0028)
武汉大学医学部教学研究项目(No.2020048)
武汉大学大学生创新项目(202110486085、W2021303003、W2020303005、W2020301001、MS2017045、S2018301747)
武汉大学中南医院转化医学及交叉学科研究联合基金资助项目(ZNJC202010)
武汉大学中南医院科技创新培育基金(cxpy2019051、cxpy2018031)。
文摘
目的研究miR-206在胰腺癌(PAAD)中表达和关键靶基因预测,分析靶基因DDX3X在PAAD中表达及突变与预后的关系,研究其在PAAD恶性进展中的分子机制。方法利用TCGA公共数据集进行生物信息学分析,比较miR-206在PAAD样本和正常样本的表达差异。通过starBase、TargetScan和miRDB在线数据库对PAAD中miR-206的靶基因进行预测,并用韦恩图整合了重叠基因。PPI分析获得评分最高模块的基因,确定关键候选靶基因。利用卡方检验分析DDX3X与患者肿瘤远处转移的关系。通过Kaplan-Meier法分析DDX3X在PAAD中的预后价值。利用KEGG和GO分析探索DDX3X参与的分子通路。结果与正常组织比较,miR-206在PAAD组织表达下调,差异有统计学意义(P<0.05);筛选出369个基因作为miR-206的潜在靶标;PPI评分最高模块中的14个靶基因作为miR-206在PAAD起关键调控作用的候选基因;靶基因DDX3X在PAAD的突变率为1.1%,与患者不良预后的高风险有关。DDX3X在PAAD组织中表达显著上调,差异有统计学意义(P<0.05),且DDX3X高表达与PAAD患者差的总体生存率相关(HR=1.6,P<0.05);DDX3X与远处转移显著相关(P<0.05);DDX3X高表达与较差的OS有关(HR=1.61,95%CI:1.05~2.48,Logrank P<0.05)。靶基因DDX3X的GO分析发现其可能在蛋白磷酸化、核斑点和转录共激活因子活性等中发挥重要作用;在KEGG数据集中,对靶基因DDX3X显著富集的信号通路分析预测,其主要参与了细胞周期、胰腺癌和调节干细胞多能性、TGF-β、FoxO、MAPK等信号通路的调控,大多与肿瘤相关信号通路有关(P<0.05)。结论MiR-206的低表达水平使DDX3X在PAAD中显著上调,可通过多条分子通路调控PAAD的发生发展,DDX3X可作为PAAD潜在的新型标志物。
关键词
胰腺癌
MiR-206
TCGA
预后
DDX3X
Keywords
paad
MiR-206
TCGA
Prognosis
DDX3X
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CLIC3在胰腺癌中的表达及预后相关性的生物信息学分析
龚治忠
李清月
刘刚
《安徽卫生职业技术学院学报》
2020
0
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职称材料
2
IBM推出新手表电脑
《计算机》
2002
0
下载PDF
职称材料
3
MRX-2LHR2型采集站噪声故障分析
祝彩霞
王泰昆
范方龙
《石油仪器》
2006
0
下载PDF
职称材料
4
MiR-206调控DDX3X促进胰腺癌不良预后及其机制的分析
段怡平
陈梁玥
朱翠雯
马甜甜
李东旭
柳家翠
赵允畅
朱光庭
喻明霞
《分子诊断与治疗杂志》
2022
0
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职称材料
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