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长臂虾亚科9个种系统发育关系的16SrDNA序列分析
被引量:
4
1
作者
窦红霞
张彤晴
+4 位作者
许志强
陈婵娟
张鑫
葛家春
黄亚红
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2008年第1期40-43,共4页
分析了日本沼虾(Macrobrachium nipponense)线粒体基因16S rDNA部分序列,并将其与GenBank中的相关4属8个种的16S rDNA序列进行了同源性比对,探讨其系统发育关系。结果显示,在分析的442个比对位点中,变异位点188个,简约信息位点125个,碱...
分析了日本沼虾(Macrobrachium nipponense)线粒体基因16S rDNA部分序列,并将其与GenBank中的相关4属8个种的16S rDNA序列进行了同源性比对,探讨其系统发育关系。结果显示,在分析的442个比对位点中,变异位点188个,简约信息位点125个,碱基转换与颠换值比为1.134。以鼓虾(Alpheus cylindricus)为外群,分别用MP法、NJ法及ML法构建的长臂虾亚科4属的系统发育关系分支图显示:白虾属(Exopalaemon)首先与长臂虾属(Palaemon)以及小长臂虾属(Palaemonetes)聚在一起,然后与沼虾属(Macrobrachium)聚为一支;长臂虾属和小长臂虾属出现4个种混合相聚的现象;属间结点置信值以及聚集情况稳定。
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关键词
长臂虾亚科(
palaemoninae
rafinesque)
16S
RDNA
系统发育
日本沼虾(Macrobrachium
nipponease)
下载PDF
职称材料
题名
长臂虾亚科9个种系统发育关系的16SrDNA序列分析
被引量:
4
1
作者
窦红霞
张彤晴
许志强
陈婵娟
张鑫
葛家春
黄亚红
机构
南京大学生命科学学院
江苏省淡水水产研究所
南京农业大学动物科技学院
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2008年第1期40-43,共4页
基金
江苏省科技厅公益研究与服务专项(BM2005706)
2007农业科技跨越计划“青虾优良品系的规模化繁育和产业化示范”
江苏渔业种质资源保藏与保护利用研究中心建设(BM2006503)
文摘
分析了日本沼虾(Macrobrachium nipponense)线粒体基因16S rDNA部分序列,并将其与GenBank中的相关4属8个种的16S rDNA序列进行了同源性比对,探讨其系统发育关系。结果显示,在分析的442个比对位点中,变异位点188个,简约信息位点125个,碱基转换与颠换值比为1.134。以鼓虾(Alpheus cylindricus)为外群,分别用MP法、NJ法及ML法构建的长臂虾亚科4属的系统发育关系分支图显示:白虾属(Exopalaemon)首先与长臂虾属(Palaemon)以及小长臂虾属(Palaemonetes)聚在一起,然后与沼虾属(Macrobrachium)聚为一支;长臂虾属和小长臂虾属出现4个种混合相聚的现象;属间结点置信值以及聚集情况稳定。
关键词
长臂虾亚科(
palaemoninae
rafinesque)
16S
RDNA
系统发育
日本沼虾(Macrobrachium
nipponease)
Keywords
palaemoninae
rafinesque
16S rDNA
phylogeny
Macrobrachium nipponense
分类号
Q173 [生物学—水生生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长臂虾亚科9个种系统发育关系的16SrDNA序列分析
窦红霞
张彤晴
许志强
陈婵娟
张鑫
葛家春
黄亚红
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2008
4
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职称材料
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参考文献
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