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Burden of severe infections due to carbapenem-resistant pathogens in intensive care unit 被引量:2
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作者 Maria Caterina Pace Antonio Corrente +4 位作者 Maria Beatrice Passavanti Pasquale Sansone Stephen Petrou Sebastiano Leone Marco Fiore 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第13期2874-2889,共16页
Intensive care units(ICU)for various reasons,including the increasing age of admitted patients,comorbidities,and increasingly complex surgical procedures(e.g.,transplants),have become"the epicenter"of nosoco... Intensive care units(ICU)for various reasons,including the increasing age of admitted patients,comorbidities,and increasingly complex surgical procedures(e.g.,transplants),have become"the epicenter"of nosocomial infections,these are characterized by the presence of multidrug-resistant organisms(MDROs)as the cause of infection.Therefore,the perfect match of fragile patients and MDROs,as the cause of infection,makes ICU mortality very high.Furthermore,carbapenems were considered for years as last-resort antibiotics for the treatment of infections caused by MDROs;unfortunately,nowadays carbapenem resistance,mainly among Gram-negative pathogens,is a matter of the highest concern for worldwide public health.This comprehensive review aims to outline the problem from the intensivist's perspective,focusing on the new definition and epidemiology of the most common carbapenem-resistant MDROs(Acinetobacter baumannii,Pseudomonas aeruginosa and Enterobacterales)to emphasize the importance of the problem that must be permeating clinicians dealing with these diseases. 展开更多
关键词 Antimicrobial resistance MULTIDRUG-resistANT pdr Carbapenem-resistance Multidisciplinary critical care Intensive care unit
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头孢哌酮/舒巴坦联合中药对PDR-AB抗菌活性研究 被引量:2
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作者 谭俊青 李蔼文 +2 位作者 王康椿 黄双旺 周兵 《四川中医》 2016年第5期63-65,共3页
目的:对头孢哌酮/舒巴坦联合中药在泛耐药鲍曼不动杆菌(PDR-AB)抗菌活性进行分析探究。方法:采用K-B法选出泛耐药鲍曼不动杆菌50株,根据微量肉汤稀释方法对单独头孢哌酮/舒巴坦与头孢哌酮/舒巴坦联合中药两种方法中药物的最小抑菌浓度(M... 目的:对头孢哌酮/舒巴坦联合中药在泛耐药鲍曼不动杆菌(PDR-AB)抗菌活性进行分析探究。方法:采用K-B法选出泛耐药鲍曼不动杆菌50株,根据微量肉汤稀释方法对单独头孢哌酮/舒巴坦与头孢哌酮/舒巴坦联合中药两种方法中药物的最小抑菌浓度(MIC)情况进行检测,并计算抑菌浓度指数(FIC)情况。结果:头孢哌酮/舒巴坦联合中药方法中,两种药物联合对泛耐药鲍曼不动杆菌(PDR-Ab)的MIC_(range)(7.32±0.25)μg/ml、MICG(5.42±0.48)μg/ml与单独头孢哌酮/舒巴坦药物对PDR-Ab的MIC_(range)(11.54±0.31)μg/ml、MICG(12.47±0.42)μg/ml相比明显减小,差异有统计学意义(t=74.9282、78.1598,p=2.4855×10-88、4.2424×10-90)。结论:单独应用头孢哌酮/舒巴坦抑制泛耐药鲍曼不动杆菌(PDR-AB)抗菌活性的效果并不是十分显著,将该药物与中药联合应用后,显著降低了最小抑菌浓度,两种药物发挥协同作用,具有重要临床意义,值得广泛推广。 展开更多
关键词 头孢哌酮/舒巴坦 中药 泛耐药鲍曼不动杆菌(pdr-AB) 抗菌活性
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烟草祖先种及重要野生种PDR1基因的生物信息学分析
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作者 平文丽 李雪君 +1 位作者 孙计平 孙焕 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第2期71-78,共8页
植物的多向耐药性(Pleiotropic drug resistance,PDR)转运蛋白隶属于ATP结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白家族的G亚家族。该类蛋白参与植物多种初生、次生代谢物的跨膜运输,在植物的生长发育、响应逆境胁迫、解毒过程中起着重... 植物的多向耐药性(Pleiotropic drug resistance,PDR)转运蛋白隶属于ATP结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白家族的G亚家族。该类蛋白参与植物多种初生、次生代谢物的跨膜运输,在植物的生长发育、响应逆境胁迫、解毒过程中起着重要作用。近年的研究还表明,该蛋白与多种植物对真菌病原的抗性有关。本文以烟草祖先种和重要野生种为研究对象,以拟南芥PDR12蛋白、烟草的PDR1基因为探针,通过搜索同源序列,从数据库中提取烟草及祖先种、重要野生种中的PDR基因、蛋白序列,并通过生物信息学分析手段对其编码蛋白的理化特性、氨基酸序列特征、蛋白结构、功能、启动子序列及表达调控特征进行了分析,并以本氏烟(Nicotiana benthamiana)NbPDR1为代表,预测了该基因启动子的顺式作用元件,以普通烟草(Nicotiana tabacum)NtPDR1基因为例,预测了其基因编辑位点。结果表明,这些PDR基因相似性高,均编码跨膜蛋白,具有典型的跨膜结构域和核酸结合结构域。该基因启动子区有多个与病原真菌诱导、干旱等逆境胁迫响应相关的元件,暗示该基因可能是抗真菌病害、响应逆境胁迫的广谱抗性基因。最后,本文预测的基因编辑位点,为烟草PDR基因的功能研究、基因编辑及抗病育种提供理论基础。 展开更多
关键词 多抗性基因 生物信息学分析 烟草 DON毒素
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凉山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素分析 被引量:2
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作者 梁洪远 刘梅 +4 位作者 李文胜 刘玲 丁苹 周仙 曹汴川 《传染病信息》 2023年第3期213-218,共6页
目的分析凉山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素,为制定针对性抗反转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)方案,减少整体抗病毒治疗失败率提供理论依据。方法选取2022年6—12月间,于凉山州某县医院就诊的拟启动ART的HIV-1... 目的分析凉山州某县HIV-1感染者治疗前耐药情况及影响因素,为制定针对性抗反转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)方案,减少整体抗病毒治疗失败率提供理论依据。方法选取2022年6—12月间,于凉山州某县医院就诊的拟启动ART的HIV-1感染者107例,完善治疗前耐药(pretreatment drug resistance,PDR)基因检测及HIV-1亚型检测,同时收集基线血CD4+T细胞计数、HIV-1病毒载量及常规检查指标,分析PDR总体发生率及相关危险因素。结果107例HIV-1感染者中基因扩增成功101例,成功率为94.4%。101例感染的HIV-1主要基因型为B+C亚型(48/101,47.5%)和CRF07_BC重组型(46/101,45.5%)。共检测出存在耐药基因突变者21例,PDR发生率为20.8%,实际耐药者11(耐药率10.9%)。核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变1例为A62V位点。非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变15例,主要突变位点为K103N、Y181C、V179D及V179VD等,分别造成依非韦仑、奈韦拉平、利匹韦林、依曲韦林等药物的不同程度耐药。还有6例为整合酶抑制剂耐药突变,突变位点包含E157Q、A128T及G163R。经单因素及多因素Logistic回归分析,汉族及B+C亚型与发生PDR突变具有相关性,其中汉族为风险因素,B+C亚型为保护性因素。结论凉山州某县初始ART的HIV-1感染者中,存在较大比例的PDR基因突变,除了常见的核苷类及非核苷类逆转录酶抑制剂耐药外还出现了整合酶抑制剂的耐药突变,应该引起高度注意。 展开更多
关键词 HIV AIDS 治疗前耐药 耐药基因突变 治疗失败
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2010年至2013年我院鲍曼不动杆菌耐药趋势分析 被引量:8
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作者 张利国 周颖 +1 位作者 张琼丹 张卫萍 《中国药业》 CAS 2014年第18期89-92,共4页
目的了解医院鲍曼不动杆菌感染的临床分布和耐药现状,为规范临床合理应用抗菌药物提供依据。方法对医院2010年至2013年临床各科室送检标本中分离的580株鲍曼不动杆菌药物敏感性试验结果进行统计和分析。结果 4年来,微生物送检标本共计88... 目的了解医院鲍曼不动杆菌感染的临床分布和耐药现状,为规范临床合理应用抗菌药物提供依据。方法对医院2010年至2013年临床各科室送检标本中分离的580株鲍曼不动杆菌药物敏感性试验结果进行统计和分析。结果 4年来,微生物送检标本共计88 715例,检出鲍曼不动杆菌580株,占致病菌总数的1.63%;检出鲍曼不动杆菌的标本83.10%来源于痰液;215株鲍曼不动杆菌来自重症监护病房(ICU),占所有感染病区的37.07%,其次是神经内科76株(13.10%);对抗菌药物敏感(S)、多重耐药(NDR)、广泛耐药(XDR)菌株、全耐药(PDR)的菌株分别占检出鲍曼不动杆菌总数的19.83%,8.45%,16.90%,54.83%;ICU全耐药菌株占全耐药菌株总数的47.16%;鲍曼不动杆菌对亚胺培南的敏感率最高。结论鲍曼不动杆菌的耐药现象非常严重,且耐药率呈逐年上升趋势,需加强鲍曼不动杆菌耐药监测和临床合理应用抗菌药物管理,重视医院环境、工作人员消毒,遏制鲍曼不动杆菌在医院内的传播和流行。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 多重耐药 广泛耐药 全耐药 抗菌药物
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植物抗病毒基因工程研究进展 被引量:4
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作者 马丽 周玉亮 张春庆 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第3期14-20,共7页
为了得到抗病毒的寄主植物,很多学者进行了大量研究,形成了许多行之有效的抗病毒育种策略。利用来源于病毒自身基因的一些抗病毒策略(Pathogen-derived resistance,PDR),如病毒外壳蛋白基因,复制酶基因,反义RNA、移动蛋白基因等,均可以... 为了得到抗病毒的寄主植物,很多学者进行了大量研究,形成了许多行之有效的抗病毒育种策略。利用来源于病毒自身基因的一些抗病毒策略(Pathogen-derived resistance,PDR),如病毒外壳蛋白基因,复制酶基因,反义RNA、移动蛋白基因等,均可以获得一些抗病毒植物。近年来,对RNA介导的抗病毒策略机制进行了深入研究。基因沉默的发现使得人们对植物和病毒的相互关系有了一个新的认识。转录后基因沉默(Post-transcriptional gene silencing,PT-GS)现象是植物抵御病毒入侵,保持自身基因组完整性的一种防御机制。对于PTGS产生的机理,已经提出不少模型,但是都未能较全面地解释基因沉默中出现的各种实验现象。对转录后基因沉默的特点、发生机理和作为抗病毒防卫机制,在改良植物抗病性方面的应用和进展进行了综述。 展开更多
关键词 病原体起源抗性(pdr) RNA介导抗性 转录后基因沉默
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细胞基因与转基因对病毒进化的影响
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作者 石鹏君 刘金亮 +2 位作者 竺晓平 田延平 李向东 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第1期120-123,共4页
本文介绍了突变、重组和重排等病毒进化的主要推动力 ,分析了细胞基因。
关键词 细胞基因 转基因 病毒进化 植物病毒 突变 重组 重排 pdr 抗病性
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ICU病区泛耐药的鲍曼不动杆菌碳青霉烯类药物耐药基因分析 被引量:1
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作者 陈士华 魏取好 吕火烊 《医学研究杂志》 2012年第6期64-67,共4页
目的研究ICU区病区分离的泛耐药(pandrug-resistant,PDR)鲍曼不动杆菌的耐药机制,检测菌株所含的主要基因型别及其流行情况,指导临床合理用药。方法收集2009~2010年两年分离自ICU病区的PDR鲍曼不动杆菌20株,用浓度梯度法(E-试条法)检... 目的研究ICU区病区分离的泛耐药(pandrug-resistant,PDR)鲍曼不动杆菌的耐药机制,检测菌株所含的主要基因型别及其流行情况,指导临床合理用药。方法收集2009~2010年两年分离自ICU病区的PDR鲍曼不动杆菌20株,用浓度梯度法(E-试条法)检测15种抗菌药物的耐药率,用PCR法检测blaOXA-23、blaOXA-24、blaOXA-51、blaOXA-58、blaVIM、blaNDM-1和blaIMP 7种基因型别。结果 20株PDR鲍曼不动杆菌,对常规的14种抗菌药物耐药率阿米卡星55%,米诺环素70%,复方新诺明80%,其他药物均100%;对多黏菌素B的耐药率为0;PCR检测结果显示,检测到3种耐药基因,blaOXA-23、blaVIM和blaIMP;其中14株细菌blaOXA-23阳性,2株blaVIM阳性,1株blaIMP阳性,总阳性率85.5%。结论 PDR-AB对绝大多数常规药物均有较高的耐药性,其耐药机制复杂,对碳青霉烯类耐药的耐药基因主要为blaOXA-23,亟待我们积极深入地探索研究。 展开更多
关键词 泛耐药 鲍曼不动杆菌 基因型别 PCR
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艾滋病合并结核病患者结核分枝杆菌耐药分析 被引量:2
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作者 古丽米拉·达列力汗 宋玉霞 +2 位作者 李弘 钟燕霞 齐曼古力·吾守尔 《传染病信息》 2022年第3期245-247,258,共4页
目的通过对比分析单纯结核病(tuberculosis,TB)患者与AIDS合并TB(AIDS/TB)患者的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)耐药鉴定结果,探讨AIDS/TB患者MTB耐药情况。方法选取2017年1月—2018年12月新疆医科大学第八附属医院收治... 目的通过对比分析单纯结核病(tuberculosis,TB)患者与AIDS合并TB(AIDS/TB)患者的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)耐药鉴定结果,探讨AIDS/TB患者MTB耐药情况。方法选取2017年1月—2018年12月新疆医科大学第八附属医院收治的268例MTB核酸阳性患者作为研究对象。根据是否合并AIDS分为单纯TB组(n=184)和AIDS/TB组(n=84),对2组患者的MTB耐药结果进行分析。结果2组均以男性患者为主(TB组男性占69.6%、AIDS/TB组男性占70.2%),30~44岁年龄段居多(TB组为59.8%、AIDS/TB组为50.0%),标本类型中以痰液标本构成比较高(TB组为78.8%、AIDS/TB组为72.6%)。2组患者耐药类型构成比排名前4位的均为耐多药、仅二线注射剂耐药、多耐药、利福平耐药,且AIDS/TB组耐多药、仅二线注射剂耐药、多耐药、利福平耐药构成比均高于单纯TB组。AIDS/TB组中耐药TB患者占41.67%(35例),明显高于单纯TB组的27.72%(51例),2组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论AIDS/TB患者的MTB耐药TB发生率明显高于单纯TB患者,对此类患者应进行治疗前耐药检测,并在治疗过程中定期监测耐药情况,以便及时调整方案,提高疗效。 展开更多
关键词 艾滋病 结核病 结核分枝杆菌 耐多药结核病 多耐药结核病 DNA微阵列芯片 耐药性检测
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替加环素联合药物治疗泛耐药鲍曼不动杆菌中枢神经系统感染临床观察 被引量:1
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作者 贾建成 孙东辉 +1 位作者 夏冬雪 王彦彬 《中国实用神经疾病杂志》 2021年第4期323-328,共6页
目的探讨替加环素(TGC)联合药物治疗泛耐药鲍曼不动杆菌(PDR-Ab)中枢神经系统感染的效果。方法选取2017-02—2020-02驻马店市第一人民医院收治的108例PDR-Ab中枢神经系统感染患者为研究对象,根据随机数表法分为TGC-头孢哌酮/舒巴坦(CPZ/... 目的探讨替加环素(TGC)联合药物治疗泛耐药鲍曼不动杆菌(PDR-Ab)中枢神经系统感染的效果。方法选取2017-02—2020-02驻马店市第一人民医院收治的108例PDR-Ab中枢神经系统感染患者为研究对象,根据随机数表法分为TGC-头孢哌酮/舒巴坦(CPZ/SB)组(TGC-CPZ/SB组)和TGC-异帕米星(ISM)组(TGC-ISM组),比较2组患者入院后24 h内及治疗10 d炎性指标、急性生理功能与慢性健康状况Ⅱ(APACHEⅡ)评分、细菌清除率、不良反应发生情况及临床总有效率。结果治疗10 d后TGC-CPZ/SB组和TGC-ISM组白细胞数(14.33±2.16 vs 12.59±3.10)、C反应蛋白(75.85±16.27 vs 63.16±15.33)、脂多糖(15.58±4.23 vs 12.11±2.34)、降钙素原(2.26±0.77 vs 1.43±0.57)、白细胞介素-6(39.84±5.25 vs 31.42±4.29)比较差异有统计学意义(P<0.05),且均显著低于治疗前(P<0.05);治疗10 d后TGC-ISM组APACHEⅡ评分(11.57±3.28)分,显著低于TGC-CPZ/SB组的(13.66±4.25)分(P<0.05);TGC-ISM组细菌清除率(74.07%)显著高于TGC-CPZ/SB组(55.56%)(P<0.05);2组恶心呕吐、听力减退、头痛、关节痛、视力模糊等不良反应发生率比较差异无统计学意义(P>0.05);TGC-ISM组临床总有效率88.89%,显著高于TGC-CPZ/SB组的70.37%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论TGC联合ISM方案治疗PDR-Ab中枢神经系统感染的临床疗效良好,抑炎效果更好,且安全性高。 展开更多
关键词 替加环素 泛耐药 鲍曼不动杆菌 中枢神经系统感染
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小麦野生近缘植物多药抗性基因PDR7的生物信息学分析 被引量:2
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作者 侯文倩 李小梅 +7 位作者 谢玫瑰 张磊 穆可卿 郭娟 蒋克云 杜旭烨 令狐绍凤 常红毯 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第24期7913-7924,共12页
小麦的野生近缘植物,尤其山羊草属中含有丰富的抗病虫基因,是小麦遗传育种的重要基因来源。针对禾谷镰刀菌入侵引起的小麦赤霉病,在山羊草属中尚未找到相应抗性基因。多药抗性基因(pleiotropic drug resistance, PDR)是ABC (ATP-binding... 小麦的野生近缘植物,尤其山羊草属中含有丰富的抗病虫基因,是小麦遗传育种的重要基因来源。针对禾谷镰刀菌入侵引起的小麦赤霉病,在山羊草属中尚未找到相应抗性基因。多药抗性基因(pleiotropic drug resistance, PDR)是ABC (ATP-binding cassette)转运蛋白基因三大亚家族中的一个,具有对生物和非生物胁迫的广谱抗性。本研究以D、C、U、M、S染色体基组的山羊草属植物为研究材料,对PDR7基因进行分离鉴定和生物信息学分析。结果表明,这些PDR7基因为半个PDR基因,具有PDR基因的典型结构域,是膜蛋白;同源序列对比和进化分析均表明,在山羊草属植物中,PDR7基因具有高度的保守性。以AePDR7为代表进行了启动子预测,表明AePDR7对禾谷镰刀菌等真菌、脱氧雪腐镰刀烯醇(deoxynivalenol, DON)、生物激素、盐胁迫、冷胁迫、干旱胁迫等均有响应元件,说明其可能是一个广谱抗性基因。 展开更多
关键词 小麦 野生近缘植物 多药抗性基因 pdr7 生物信息学分析
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Characterization of a PDR type ABC transporter gene from wheat (Triticum aestivum L.) 被引量:3
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作者 SHANG Yi XIAO Jin +5 位作者 MA LuLin WANG HaiYan QI ZengJun CHEN PeiDu LIU DaJun WANG XiuE 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2009年第18期3249-3257,共9页
DON, as a virulence factor, plays an important role in the infection of Fusarium graminearum in wheat. The infection ability of F. graminearum depends on its capacity of producing DON. The production of DON by F. gram... DON, as a virulence factor, plays an important role in the infection of Fusarium graminearum in wheat. The infection ability of F. graminearum depends on its capacity of producing DON. The production of DON by F. graminearum is significantly decreased in the wheat varieties with scab resistance. In this study, GeneChip analysis indicated that an EST encoding an ATP-binding cassette (ABC) transporter was up-regulated by 45 times in a wheat landrace Wangshuibai, which is resistant to DON accumulation. A pair of EST-derived primers were designed based on the EST sequence, and a clone was then isolated from a wheat genomic DNA TAC library. The TAC clone was sequenced using chromosome walking and gene prediction was conducted using Softberry. A cDNA clone of this gene was subsequently isolated from Wangshuibai induced by DON using gene-specific primers designed according to the untranslated sequence of the gene. The genome size of the gene is 7377 bp, consisting of 19 exons with coding sequences of 4308 bp. It encodes a protein with 1435 amino acid residues and the calculated molecular weight is about 161 kD. BLAST analysis indicated that the gene may belong to pleiotropic drug resistance (PDR) sub-family, and hence designated as TaPDR1 (Triticum aestivum pleiotropic drug resistance). TaPDR1 was located on chromosome 5A of wheat using nullisomic-tetrasomic lines of Chinese Spring. TaPDR1 was up-regulated by induction of both DON and F. graminearum. Expression patterns of TaPDR1 were different in wild-type Wangshuibai and the fast-neutron induced Wangshuibai mutant lacking FHB1, a major QTL of FHB resistance and DON resistance in chromosome arm 3BS. These results suggested that TaPDR1 might be a candidate gene responsible for DON ac-cumulation resistance. The expression profile showed that TaPDR1 expression was neither induced by hormones typically involved in biotic stress, such as JA and SA, nor by abiotic stresses, such as heat, cold, wounding and NaCl. However, TaPDR1 expression was regulated by Al3+ and [Ca2+], indicating that [Ca2+]i might mediate the signal of TaPDR1 expression. 展开更多
关键词 小麦 多样性 pdr ABC
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测定多粘菌素B对泛耐药鲍曼不动杆菌的最小抑菌浓度 被引量:3
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作者 胡丽庆 吕火祥 +5 位作者 胡庆丰 赵丽玲 张丹晨 沈蓓琼 张玉霞 朱永泽 《中国卫生检验杂志》 CAS 2009年第12期2861-2862,共2页
目的:通过研究多粘菌素B对泛耐药不动杆菌的体外抗菌活性,为临床治疗、控制感染提供依据。方法:对已经上机鉴定的100株泛耐药鲍曼不动杆菌进行多粘菌素B的药敏E-试验。结果:100株鲍曼不动杆菌对多粘菌素B的MIC值均≤2 mg/L,MIC值分布情... 目的:通过研究多粘菌素B对泛耐药不动杆菌的体外抗菌活性,为临床治疗、控制感染提供依据。方法:对已经上机鉴定的100株泛耐药鲍曼不动杆菌进行多粘菌素B的药敏E-试验。结果:100株鲍曼不动杆菌对多粘菌素B的MIC值均≤2 mg/L,MIC值分布情况为0.25 mg/L 7株、0.38 mg/L 35株、0.5 mg/L 42株、0.75 mg/L 9株、1.0 mg/L 6株、1.5 mg/L1株。结论:多粘菌素B对泛耐药鲍曼不动杆菌具有良好的抑菌效果,临床可根据微生物实验室检测结果与本地区用药特点相结合,控制剂量,将多粘菌素B合理应用于泛耐药鲍曼不动杆菌的临床感染。 展开更多
关键词 泛耐药 鲍曼不动杆菌 多粘菌素B 最小抑菌浓度
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人参多向耐药性转运蛋白基因保守区序列的克隆及分析 被引量:2
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作者 张儒 黄景嘉 +3 位作者 谢小雷 陈湘晖 张变玲 罗志勇 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1590-1594,共5页
目的对人参多向耐药性(PDR)转运蛋白基因进行克隆及序列分析。方法利用其他植物PDR基因的保守区域设计简并引物,以人参根总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增人参PDR基因片段并连接至pGEM-T Easy载体上,阳性克隆经PCR检测后测序。结果得到... 目的对人参多向耐药性(PDR)转运蛋白基因进行克隆及序列分析。方法利用其他植物PDR基因的保守区域设计简并引物,以人参根总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增人参PDR基因片段并连接至pGEM-T Easy载体上,阳性克隆经PCR检测后测序。结果得到一段长693 bp的基因序列,序列分析表明,该片段编码231个氨基酸,与植物PDR基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别在76%和80%以上。分析表明该序列属于PDR转运蛋白的核苷酸结合域,具有PDR转运蛋白的C端Walker A、ABC标签模体和C端walker B 3个保守功能域。结论首次从人参中克隆出PDR转运蛋白基因,为研究人参次生代谢产物的转运和积累机制奠定了基础。 展开更多
关键词 人参 多向耐药性pdr转运蛋白 次生代谢产物 基因克隆:序列分析
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2019—2021年西昌市HIV-1感染者治疗前耐药性分析 被引量:1
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作者 李玲 殷俊 +7 位作者 梁姝 李一平 周玚 苏玲 杨洪 叶黎 张燕 袁丹 《预防医学情报杂志》 CAS 2022年第12期1529-1534,1540,共7页
目的分析2019—2021年凉山彝族自治州西昌市新报告的抗病毒治疗前的HIV-1感染者的耐药情况及其分子网络特征,为制定更科学有效的治疗方案提供参考。方法采集西昌市2019—2021年新报告的抗病毒治疗前的HIV-1感染者的血浆样本,采用巢式PC... 目的分析2019—2021年凉山彝族自治州西昌市新报告的抗病毒治疗前的HIV-1感染者的耐药情况及其分子网络特征,为制定更科学有效的治疗方案提供参考。方法采集西昌市2019—2021年新报告的抗病毒治疗前的HIV-1感染者的血浆样本,采用巢式PCR扩增HIV-1 pol基因区的蛋白酶及逆转录酶区并进行耐药分析,使用卡方检验分析各变量的耐药发生差异,并应用HyPhy2.2.4与Cytoscape3.6.1软件对基因序列构建分子网络分析耐药传播特征。结果在764样本中获得703条有效分析序列,有72例(10.24%)出现了耐药突变。职业、感染途径和感染病毒亚型的耐药率差异均有统计学意义(P均<0.05)。分子传播网络分析发现当基因距离为0.007时,成簇数最多。有134例(19.0%)基因序列进入分子网络,形成36个簇。其中最大的簇包含44条序列,均为CRF07_BC。有1个耐药簇,是以Q58E为耐药突变位点的5位年轻男性。此外,1个包含10条序列的CRF08_BC亚型簇中出现6例均为E138Q+V179D耐药位点的病例。结论西昌市治疗前患者耐药率已达到中等水平,具有耐药毒株传播风险,需加强当地耐药监测,及时根据耐药情况调整治疗方案,同时运用分子传播网络方法以加强对耐药分子簇的干预。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1) 治疗前耐药(pdr) 耐药 分子传播网络
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