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pncA、rpsA和panD基因突变对结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药性的预测效能分析 被引量:2
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作者 赵东阳 石洁 +7 位作者 苏茹月 郑丹薇 朱岩昆 马晓光 王少华 李辉 孙国清 孙定勇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2021年第3期404-408,共5页
目的:评估检测pncA、rpsA和panD基因突变用于预测吡嗪酰胺(PZA)耐药性的效能。方法:使用MIGT 960对152株耐多药(MDR)结核分枝杆菌菌株进行PZA药敏性测定。通过测序鉴定pncA、rpsA及panD的基因突变情况,并与标准菌株H37Rv的序列进行比较... 目的:评估检测pncA、rpsA和panD基因突变用于预测吡嗪酰胺(PZA)耐药性的效能。方法:使用MIGT 960对152株耐多药(MDR)结核分枝杆菌菌株进行PZA药敏性测定。通过测序鉴定pncA、rpsA及panD的基因突变情况,并与标准菌株H37Rv的序列进行比较。分析PZA耐药表型与基因突变的相关关系。结果:152株MDR结核分枝杆菌菌株中,105株为PZA耐药菌株,102株的pncA基因发生了突变。133株菌PZA药敏结果和pncA测序结果一致。8株PZA敏感的菌株发生了pncA基因的突变,其中5株表现为PZA低水平耐药。在11株未发生pncA突变的PZA耐药菌株中,2株的rpsA基因发生了突变,1株的panD基因发生突变。以PZA药敏结果为参照,检测pncA单个基因突变预测PZA耐药的灵敏度为89.52%,特异度为89.36%。当结合检测rpsA和panD基因突变后,可使灵敏度增加到92.38%。结论:检测pncA、rpsA和panD基因突变有利于MDR结核分枝杆菌菌株PZA耐药的及时诊断。 展开更多
关键词 吡嗪酰胺 PCNA rpsA pand 基因型
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Bacterial Community Diversity of a Congolese Traditional Fermented Food, “Pandé”, Revealed by Illumina MiseqTM Sequencing of 16S rRNA Gene
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作者 C. P. Limingui Polo A. A. Lebonguy +4 位作者 A. E. Lembella Boumba S. A. E. Nzaou M Bokamba Moukala J. Goma-Tchimbakala M. Diatewa 《Open Journal of Applied Sciences》 2022年第3期387-405,共19页
Pandé is a Congolese fermented food produced from fruit pulps of raffia palm. The aim of this study was to explore the diversities in bacterial communities in the unfermented pulps (control) (PNFL) and fermented ... Pandé is a Congolese fermented food produced from fruit pulps of raffia palm. The aim of this study was to explore the diversities in bacterial communities in the unfermented pulps (control) (PNFL) and fermented pulps obtained from fruits using boiling (PMF) and purchased at markets in Brazzaville (PFL) and using Illumina MiSeq<sup>TM</sup> sequencing of 16S rRNA gene. A total number of 157,054 sequences was obtained and grouped into 737 operational taxonomic units (OTUs). These were classified into 13 phyla, 26 classes, 48 orders, 96 families and 176 genera. At the phylum level, the most frequent bacterial communities were: for PFM, Proteobacteria (38.94%) and Firmicutes (19.37%);for PFL, Firmicutes (69.10%) and Proteobacteria (30.89%);for PNFL, Firmicutes (84.92%) and Proteobacteria (14.22%). were the most frequent in PFL, while Acidobacteria (40.02%), Proteobacteria (38.94%) and Firmicutes (19.37%) were preponderant in PFM. Firmicutes (84.92%) and Proteobacteria (14.22%) were the most common in unfermented pulps (PNFL). Lactobacillus (47.70%) and Gluconobacter genera (15.33%) were the most represented in the PFL sample. Acidipila (35.56%) and Rhizomicrobium (11.41%) were preponderant genera in the PFM sample. Weissella genus was the most frequent in the PNFL sample. Hierarchical cluster indicated that the samples could be grouped into two groups of different origins. PCA showed that main genera were higher in the fermented samples. The diversity was higher in the fermented pulps or Pandé than in the unfermented pulps. Pandé can be a potential source for the isolation of bacteria with biotechnological potential. 展开更多
关键词 Diversity pandé Bacterial Community Fermented Food Raffia Palm
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Dimension X Pand全自动生化分析仪常见故障的排除
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作者 陈荣贵 《现代检验医学杂志》 CAS 2004年第4期57-58,共2页
关键词 DIMENSION X pand全自动生化分析仪 常见故障 排除 试剂准备错误
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基于Python的朴素贝叶斯分类中文网络舆情分析
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作者 郑子伟 张晓兰 陈奋 《厦门城市职业学院学报》 2023年第2期79-84,共6页
在互联网时代,网络已成为反映社会舆情的主要载体,对网络舆情所表达的信念、态度、意见和情绪等,相关部门应及时反馈并引导,防患于未然。利用数据挖掘技术对舆情进行梳理,继而研判与引导,成为舆情分析的重要手段。在朴素贝叶斯分类模型... 在互联网时代,网络已成为反映社会舆情的主要载体,对网络舆情所表达的信念、态度、意见和情绪等,相关部门应及时反馈并引导,防患于未然。利用数据挖掘技术对舆情进行梳理,继而研判与引导,成为舆情分析的重要手段。在朴素贝叶斯分类模型基础上,使用Pands开源库与Jieba分词系统,可对中文网络舆情进行分析。以服饰网店评论为例,基于朴素贝叶斯对案例评价内容分类并加以训练,可得到评价分类与预测结果。实验表明该系统稳定可靠,准确度高。 展开更多
关键词 网络舆情 朴素贝叶斯分类 pands开源库 中文分词
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L-天冬氨酸α-脱羧酶工程菌株的构建及其培养条件研究 被引量:8
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作者 洪敏 赵春田 +3 位作者 张正波 吴瑶瑶 裘娟萍 白彦兵 《浙江工业大学学报》 CAS 北大核心 2011年第3期252-256,260,共6页
L-天冬氨酸α-脱羧酶以L-天冬氨酸为底物,脱去α-羧基后生成β-丙氨酸.利用PCR扩增技术,将Escherichia coliDH5α中的PanD基因克隆后连接到pET28c(+)载体上,先转化E.coliDH5α中,经过50μg/mL卡那霉素抗性筛选和酶切、测序验证后,转化... L-天冬氨酸α-脱羧酶以L-天冬氨酸为底物,脱去α-羧基后生成β-丙氨酸.利用PCR扩增技术,将Escherichia coliDH5α中的PanD基因克隆后连接到pET28c(+)载体上,先转化E.coliDH5α中,经过50μg/mL卡那霉素抗性筛选和酶切、测序验证后,转化表达菌株E.coliBL21(DE3),得到具有L-天冬氨酸α-脱羧酶活性的工程菌株E.coliBL21(DE3)/pET28c(+)-panD.经乳糖诱导该基因能有效表达C-末端具有组氨酸标签的L-天冬氨酸α-脱羧酶.通过对乳糖诱导时间、乳糖诱导质量浓度、诱导温度、诱导菌龄和培养基诱导初始pH值等发酵条件的优化,得到最佳培养条件为:乳糖诱导时间20 h,乳糖质量浓度12 g/L,诱导温度为35℃,诱导菌龄为3.5 h,诱导培养基初始pH 5.5,通过对转化产物β-丙氨酸的检测结果分析显示,工程菌株E.coliBL21(DE3)/pET28c(+)-panD在优化条件下,酶活力达186 U. 展开更多
关键词 L-天冬氨酸α-脱羧酶 pand 工程菌 诱导表达 培养条件
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7-苯基偶氮-变色酸与蛋白质的显色反应研究 被引量:7
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作者 杨平华 杨剑华 张正奇 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期409-411,共3页
研究了蛋白质与 7-苯基偶氮 -1 ,8-二羟萘 -3 ,6-二磺酸的显色反应。在 p H2 .7的缓冲溶液中 ,7-苯基偶氮 -1 ,8-二羟萘 -3 ,6-二磺酸与蛋白质形成红紫色复合物 ,λmax为 564 nm,ε为 1 .3× 1 0 5L· mol- 1· cm- 1,线性... 研究了蛋白质与 7-苯基偶氮 -1 ,8-二羟萘 -3 ,6-二磺酸的显色反应。在 p H2 .7的缓冲溶液中 ,7-苯基偶氮 -1 ,8-二羟萘 -3 ,6-二磺酸与蛋白质形成红紫色复合物 ,λmax为 564 nm,ε为 1 .3× 1 0 5L· mol- 1· cm- 1,线性范围为 6.6~ 1 3 2 mg/ L。实验证实7-苯基偶氮 -1 ,8-二羟萘 -3 ,6-二磺酸与蛋白质的作用符合 Pesavento模式。 展开更多
关键词 7-苯基偶氮-变化酸 显色反应 分光光度法 蛋白质 pandS 血清 花生 分析 显色剂
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制造业上市公司财务困境预测——基于panel logit模型的实证分析 被引量:5
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作者 卢永艳 王维国 《统计与信息论坛》 CSSCI 2010年第4期47-51,共5页
目前关于财务困境预测的模型大多是局限于横截面数据的静态模型,忽视了公司的财务状况是不断变化的事实。为了揭示公司财务状况的变化过程,利用面板数据建立了panel logit概率模型。在变量的选取上,不仅考虑了财务指标,还考虑了股权集... 目前关于财务困境预测的模型大多是局限于横截面数据的静态模型,忽视了公司的财务状况是不断变化的事实。为了揭示公司财务状况的变化过程,利用面板数据建立了panel logit概率模型。在变量的选取上,不仅考虑了财务指标,还考虑了股权集中度、公司治理结构和审计意见等方面的指标。研究结果表明,panel logit模型的判别准确率比较高,可以利用公司当年的数据预测下一年度公司陷入财务困境的可能性。 展开更多
关键词 pand LOGIT模型 财务困境 预测
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我国财产保险需求地区差异性分析 被引量:13
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作者 徐东炜 《北京工商大学学报(社会科学版)》 北大核心 2005年第5期93-96,共4页
我国财产保险需求的地区差异性是由各个影响因素在不同地区间作用的差异性所导致的。通过选取财产保险需求的主要影响因素,利用PanelData模型,对各个影响因素在时间和地区两个截面上的作用进行综合分析,得出各主要影响因素对我国不同地... 我国财产保险需求的地区差异性是由各个影响因素在不同地区间作用的差异性所导致的。通过选取财产保险需求的主要影响因素,利用PanelData模型,对各个影响因素在时间和地区两个截面上的作用进行综合分析,得出各主要影响因素对我国不同地区财产保险需求差异性作用的结论。 展开更多
关键词 财产保险需求 pand DATA 模型 差异性
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Evaluation of rational extent lymphadenectomy for local advanced gastric cancer 被引量:10
9
作者 Han Liang Jingyu Deng 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2016年第4期397-403,共7页
Based upon studies from randomized clinical trials, the extended (D2) lymph node dissection is now recommended as a standard procedure for local advanced gastric cancer worldwide. However, the rational extent lympha... Based upon studies from randomized clinical trials, the extended (D2) lymph node dissection is now recommended as a standard procedure for local advanced gastric cancer worldwide. However, the rational extent lymphadenectomy for local advanced gastric cancer has remained a topic of debate in the past decades. Due to the limitation of low metastatic rate in para-aortic nodes (PAN) in JCOG9501, the clinical benefit of D2+ para-aortic nodal dissection (PAND) for patients with stage T4 and/or stage N3 disease, which is very common in China and other countries except Japan and Korea, cannot be determined. Furthermore, the role of splenectomy for complete resection of No.10 and No.l I nodes has been controversial, and however, the final results from the randomized trial ofJCOG0110 have yet to be completed. Gastric cancer with the No.14 and No.13 lymph node metastasis is defined as MI stage in the current version of the Japanese classification. We propose that D2~No.14v and +No.13 lymphadenectomy may be an option in a potentially curative gastrectomy for tumors with apparent metastasis to the No.6 nodes or infiltrate to duodenum. The examined lymph node and extranodal metastasis are significantly associated with the survival of gastric cancer patients. 展开更多
关键词 RE-EVALUATION extended (D2) lymphadenectomy D2+No.14v lymphadenectomy para-aortic nodal dissection pand
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L-天冬氨酸-α-脱羧酶高产菌株初筛方法的建立
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作者 王姗姗 余志良 裘娟萍 《氨基酸和生物资源》 CAS 2016年第2期58-63,共6页
通过试管法、平板法、Berthelot法和纸层析法对L-天冬氨酸-α-脱羧酶(PanD)高产菌株的初筛方法进行研究。分别检测转化体系中底物L-天冬氨酸减少引起的pH变化及产物CO2和β-丙氨酸的增加量,并用高效液相色谱法比较这四种方法的准确性。... 通过试管法、平板法、Berthelot法和纸层析法对L-天冬氨酸-α-脱羧酶(PanD)高产菌株的初筛方法进行研究。分别检测转化体系中底物L-天冬氨酸减少引起的pH变化及产物CO2和β-丙氨酸的增加量,并用高效液相色谱法比较这四种方法的准确性。结果表明:CO2能溶于转化液,难以用倒置管收集完全;PanD系胞内酶,难以用平板点种法改变平板的pH;β-丙氨酸和L-天冬氨酸在Berthelot检测中吸收值均偏低,不适用于PanD高产菌的筛选;纸层析法可以直接检测β-丙氨酸和L-天冬氨酸,成本低,操作简单,具一定的精确度,可以较大规模地筛选PanD高产菌株。 展开更多
关键词 L-天冬氨酸-α-脱羧酶(pand) Β-丙氨酸 L-天冬氨酸 高产菌株 筛选
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结核分枝杆菌panD蛋白功能预测及生物信息学分析 被引量:14
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作者 伊星昊 张德峰 付玉荣 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期500-504,共5页
目的研究结核分枝杆菌panD(Rv3601c)基因及其编码蛋白的结构和功能,为耐药结核的治疗提供参考依据。方法运用ClustalX 2.1、MEGA 6.06软件以及ExPASy、NCBI等在线工具分析结核分枝杆菌panD基因信息,同时分析其进化特征、编码蛋白质的理... 目的研究结核分枝杆菌panD(Rv3601c)基因及其编码蛋白的结构和功能,为耐药结核的治疗提供参考依据。方法运用ClustalX 2.1、MEGA 6.06软件以及ExPASy、NCBI等在线工具分析结核分枝杆菌panD基因信息,同时分析其进化特征、编码蛋白质的理化性质、信号肽、磷酸化位点、结构特点并预测其功能;利用BepiPred 1.0Server和NetMHCIIpan 3.1Server预测panD蛋白的B细胞和T细胞抗原表位。结果结核分枝杆菌panD基因全长420bp,不同菌株panD基因序列相似度100%,具有高度同源性,进化关系较近,编码139个氨基酸。panD蛋白不稳定系数为8.72,亲水性平均系数为0.147,为稳定、疏水性蛋白、无跨膜区与信号肽,存在9个磷酸化位点。二级结构中以无规则卷曲为主,结构较疏松。三级结构同源建模成功。该蛋白具有多个潜在的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位。结论panD蛋白作为脱羧酶,在结核分枝杆菌合成β-丙氨酸过程中具有重要作用。panD蛋白序列保守稳定,具有多个优势抗原表位,是治疗耐药结核的潜在新靶标。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 pand 抗原表位 耐药 生物信息学
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A Recall of the Trauel to the Heauenly Pand
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作者 LINDA LEE 《Women of China》 1995年第12期50-51,共2页
THE pine trees of the Huangshan Mountains surprise many people because of their different artistic and expressive shapes. All through the ages many people have carved poems at the top of the Taishan Mountains. However... THE pine trees of the Huangshan Mountains surprise many people because of their different artistic and expressive shapes. All through the ages many people have carved poems at the top of the Taishan Mountains. However, my favorite spot is the Heavenly Pond on top of the Changbai Mountains. The Changbai Mountains are located in Antu County in the Yanbian Korean Autonomous Prefecture of Jilin Province. 展开更多
关键词 A Recall of the Trauel to the Heauenly pand
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