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银缕梅MADS-box家族基因PsuA P1的克隆、生物信息学表达分析
1
作者
陈云霞
薛晓明
+2 位作者
南程慧
蒋敬
郭海涛
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第1期72-79,共8页
本研究以珍稀濒危植物银缕梅为材料,利用同源克隆与RACE技术克隆得到一个AP1-like基因的c DNA全长序列,命名为Psu AP1。利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸序列进行分析,结果表明,该基因序列全长916 bp,开放阅读框长度为747 bp,编码...
本研究以珍稀濒危植物银缕梅为材料,利用同源克隆与RACE技术克隆得到一个AP1-like基因的c DNA全长序列,命名为Psu AP1。利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸序列进行分析,结果表明,该基因序列全长916 bp,开放阅读框长度为747 bp,编码248个氨基酸,分子质量约28.62 k D,理论等电点为9.84,是一种不稳定亲水蛋白。保守结构域分析表明该基因属于MADS-box家族基因;序列比对分析显示其氨基酸序列与连香树相似性最高,达78.57%,进化树聚类分析也表明Psu AP1与连香树的氨基酸亲缘关系最近。亚细胞定位分析显示该蛋白定位于细胞核。二级结构中同时含有琢-螺旋、延伸链和无规则卷曲结构,分别占比47.18%、11.29%、41.53%。荧光实时定量PCR分析表明,Psu AP1基因在花及果实中均有大量表达,推测其与花的发育以及果实的成熟相关。Psu AP1基因的克隆以及表达分析使银缕梅开花调控机理的研究取得了新的突破,为该基因功能的进一步深入研究提供了实验材料以及理论基础。
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关键词
银缕梅(
parrotia
subaequalis
)
MADS-BOX
基因克隆
序列分析
表达分析
原文传递
题名
银缕梅MADS-box家族基因PsuA P1的克隆、生物信息学表达分析
1
作者
陈云霞
薛晓明
南程慧
蒋敬
郭海涛
机构
南京森林警察学院
南京森林警察学院野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第1期72-79,共8页
基金
江苏省高校优秀科技创新团队“打击生态环境犯罪物证技术”项目
“十三五”江苏省重点建设学科“公安技术”项目共同资助。
文摘
本研究以珍稀濒危植物银缕梅为材料,利用同源克隆与RACE技术克隆得到一个AP1-like基因的c DNA全长序列,命名为Psu AP1。利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸序列进行分析,结果表明,该基因序列全长916 bp,开放阅读框长度为747 bp,编码248个氨基酸,分子质量约28.62 k D,理论等电点为9.84,是一种不稳定亲水蛋白。保守结构域分析表明该基因属于MADS-box家族基因;序列比对分析显示其氨基酸序列与连香树相似性最高,达78.57%,进化树聚类分析也表明Psu AP1与连香树的氨基酸亲缘关系最近。亚细胞定位分析显示该蛋白定位于细胞核。二级结构中同时含有琢-螺旋、延伸链和无规则卷曲结构,分别占比47.18%、11.29%、41.53%。荧光实时定量PCR分析表明,Psu AP1基因在花及果实中均有大量表达,推测其与花的发育以及果实的成熟相关。Psu AP1基因的克隆以及表达分析使银缕梅开花调控机理的研究取得了新的突破,为该基因功能的进一步深入研究提供了实验材料以及理论基础。
关键词
银缕梅(
parrotia
subaequalis
)
MADS-BOX
基因克隆
序列分析
表达分析
Keywords
parrotia subaequalis
MADS-box
Gene cloning
Sequence analysis
Expression analysis
分类号
S685.99 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
银缕梅MADS-box家族基因PsuA P1的克隆、生物信息学表达分析
陈云霞
薛晓明
南程慧
蒋敬
郭海涛
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
0
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