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Simultaneous Detection of 13 Key Bacterial Respiratory Pathogens by Combination of Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis 被引量:9
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作者 JIANG Lu Xi REN Hong Yu +5 位作者 ZHOU Hai Jian ZHAO Si Hong HOU Bo Yan YAN Jian Ping QIN Tian CHEN Yu 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2017年第8期549-561,共13页
Objective Lower respiratory tract infections continue to pose a significant threat to human health. It is important to accurately and rapidly detect respiratory bacteria. To compensate for the limits of current respir... Objective Lower respiratory tract infections continue to pose a significant threat to human health. It is important to accurately and rapidly detect respiratory bacteria. To compensate for the limits of current respiratory bacteria detection methods, we developed a combination of multiplex polymerase chain reaction (PCR) and capillary electrophoresis (MPCE) assay to detect thirteen bacterial pathogens responsible for lower respiratory tract infections, including Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Moraxella catorrholis, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Mycoplasma pneumoniae, Legionella spp., Bordetella pertussis, Mycobacterium tuberculosis complex, Corynebactefium diphthefiae, and Streptococcus pyogenes. Methods Three multiplex PCR reactions were built, and the products were analyzed by capillary electrophoresis using the high-throughput DNA analyzer. The specificity of the MPCE assay was examined and the detection limit was evaluated using DNA samples from each bacterial strain and the simulative samples of each strain. This assay was further evaluated using 152 clinical specimens and compared with real-time PCR reactions. For this assay, three nested-multiplex-PCRs were used to detect these clinical specimens. Results The detection limits of the MPCE assay for the 13 pathogens were very low and ranged from 10-7 to 10-2 ng/μL. Furthermore, analysis of the 252 clinical specimens yielded a specificity ranging from 96.5%-100.0%, and a sensitivity of 100.0% for the 13 pathogens. Conclusion This study revealed that the MPCE with high specificity and sensitivity. This assay survey of respiratory pathogens. assay is a rapid, reliable, and high-throughput method has great potential in the molecular epidemiological. 展开更多
关键词 respiratory pathogens Lower respiratory tract infections Multiplex PCR Capillary electrophoresis
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Clinical Diagnosis and Treatment Characteristics of Acute Respiratory Infections in Children and New Developments in Laboratory Testing 被引量:2
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作者 Yueliao Ma Lingyu Lu Qiangcai Mai 《Open Journal of Pediatrics》 2021年第1期114-124,共11页
Acute respiratory tract infection</span><span style="font-family:""><span style="font-family:Verdana;"> (ARTI) in children is the most common infectious disease in childhood,... Acute respiratory tract infection</span><span style="font-family:""><span style="font-family:Verdana;"> (ARTI) in children is the most common infectious disease in childhood, and its pathogens include viruses, bacteria and fungi, mycoplasma, chlamydia and rickettsia. In recent years, with the continuous development of pathogen detection methods, the diagnosis and treatment of acute respiratory infections has received more and more clinical attention. The clinical diagnosis and treatment characteristics of acute respira</span><span style="font-family:Verdana;">tory infections in children and the research of clinical laboratory detection </span><span style="font-family:Verdana;">methods have also been continuously developed. The author collected refer</span><span style="font-family:Verdana;">ences to review the clinical features and new developments in laboratory</span><span style="font-family:Verdana;"> testing of acute respiratory tract infection in children. 展开更多
关键词 CHILDREN respiratory tract infections pathogens Laboratory Testing ACUTE
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Telithromycin versus clarithromycin for the treatment of community-acquired respiratory tract infections: a meta-analysis of randomized controlled trials 被引量:4
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作者 LI Xiu-min WANG Feng-chun YANG Feng JIN Ying-hua 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2013年第11期2179-2185,共7页
Background The emergence of bacterial resistance to commonly used antibiotics, such as macrolides, is complicating the management of respiratory tract infections (RTIs). Telithromycin, a ketolide antimicrobial struc... Background The emergence of bacterial resistance to commonly used antibiotics, such as macrolides, is complicating the management of respiratory tract infections (RTIs). Telithromycin, a ketolide antimicrobial structurally related to macrolides, is approved for the treatment of community-acquired RTIs, and shows lower pathogen resistance rates. The purpose of this study was to compare the efficacy and safety of telithromycin with clarithromycin, a macrolide routinely used as therapy for RTIs. Methods We performed a meta-analysis of relevant randomized-controlled trials (RCTs) identified in PubMed, the Cochrane Library, Embase, CNKI and VIP databases. The primary efficacy outcome was clinical treatment success assessed at the test-of-cure time in the per-protocol population, and the primary safety outcome was drug related adverse effects. Results Seven RCTs, involving 2845 patients with RTIs, were included in the meta-analysis. Oral telithromycin and clarithromycin showed a similar clinical treatment success in modified intention to treat and per-protocol population (cure and improvement) (odds ratios (ORs): 0.84, 95% confidence intervals (C/): 0.64-1.11 and OR: 1.14, 95% CI: 0.71-1.85, respectively). Similar findings were obtained for secondary efficacy outcomes: clinical treatment success at a late post- therapy visit (OR: 0.92, 95% CI: 0.57-1.48) and microbiological treatment success at the test-of-cure time (OR: 1.14; 95% CI: 0.71-1.85). The safety outcome analysis indicated telithromycin had a similar risk of drug-related adverse effect and serious adverse effect with clarithromycin. Conclusions Our findings indicate that oral telithromycin and clarithromycin have similar treatment efficacy and adverse effect. The advantages of lower antimicrobial resistance rates, once-daily short-duration dosing and reported lower health- care costs make oral telithromycin a useful option for the empiric management of mild-to-moderate RTIs. 展开更多
关键词 TELITHROMYCIN CLARITHROMYCIN community-acquired respiratory tract infections META-ANALYSIS
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2023年北京某医院呼吸道感染的流行病学分析
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作者 孙海青 刘辉 +1 位作者 娄金丽 刘宁 《标记免疫分析与临床》 CAS 2024年第6期1084-1090,共7页
目的分析2023年我院呼吸道感染的流行病学特征及血清学指标变化,为呼吸道感染疾病的诊断和治疗提供依据。方法选取2023年1月至2023年12月就诊于北京佑安医院的483例呼吸道病原体IgM阳性者为研究对象,采用间接免疫荧光法检测血清中的肺... 目的分析2023年我院呼吸道感染的流行病学特征及血清学指标变化,为呼吸道感染疾病的诊断和治疗提供依据。方法选取2023年1月至2023年12月就诊于北京佑安医院的483例呼吸道病原体IgM阳性者为研究对象,采用间接免疫荧光法检测血清中的肺炎支原体(MP)、肺炎衣原体(CP)、甲型流感病毒(INFA)、副流感病毒(PIV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、柯萨奇病毒(COX)、嗜肺军团菌(LP)、乙型流感病毒(INFB)9种病原体免疫球蛋白(Ig)M抗体。采用卡方检验对不同性别、年龄、季节患者的血清呼吸道病原体IgM阳性率进行统计分析,采用Kru’skal-Wallis检验分析不同病原体感染者间的血清学指标。结果(1)483例呼吸道感染患者中,单一病原体IgM阳性者占比为39.3%(190/483),>2种病原体IgM阳性者占比为60.7%(293/483)。单一病原体IgM阳性患者中,位居前3位的依次为INFB(39.5%,75/190)、INFA(24.2%,46/190)及MP(20%,38/190);混合病原体IgM阳性患者中,以2种病原体混合感染为主,占比为61.7%(181/293),其中以病原体INFA+INFB为主,占比43.3%(127/293),其次为MP+INFA+INFB,占比17.4%(51/293)。(2)女性患者血清MP、ADV IgM阳性率高于男性,INFB IgM阳性率低于男性,差异均具有统计学意义(P<0.05)。(3)0~18、19~45、46~59、>60岁4个年龄段患者血清MP、COX病原体IgM阳性率比较,差异均有统计学意义(P均<0.05),其中0~18岁MP、COX阳性率分别高于19~45、46~59、>60岁(P均<0.05),19~45岁MP阳性率高于46~59、>60岁(P均<0.05)。(4)春、夏、秋、冬4个季节血清MP、INFA IgM阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05);其中春季MP阳性率高于秋季(P<0.05),冬季阳性率分明高于夏季、秋季(P均<0.05);INFA阳性率冬季高于夏季(P<0.05)。(5)将483例呼吸道感染者分为MP IgM阳性组、病毒IgM阳性组、混合感染组,3组间eGFR、EOS、PLT比较,差异有统计学意义(P<0.05),其中混合感染组中EOS高于MP IgM阳性组(P<0.05),eGFR、PLT高于病毒IgM阳性组(P均<0.05),肝功能指标在3组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论2023年全年以MP、INFA、INFB病原体感染为主,且混合感染多见;女性及年龄小的人群更易感染MP;春季和冬季更易发生MP感染,甲型流感病毒更易发生于冬季;混合感染可能更易引起机体的免疫反应。 展开更多
关键词 呼吸道感染 呼吸道病原体 IGM抗体 流行病学
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急性下呼吸道感染患儿支气管肺泡灌洗液病原菌特征分析
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作者 张炜煜 柳鸿敏 +3 位作者 杨显达 张立夫 姚佳彤 李静 《中国实验诊断学》 2024年第5期505-509,共5页
目的研究急性下呼吸道感染患儿病原菌特点,探讨支气管肺泡灌洗液荧光PCR检测对儿童急性呼吸道感染病原学的诊断价值。方法选择2018年6月至2019年5月吉林大学第一医院收治的急性呼吸道感染住院患儿172例为研究对象,收集其支气管肺泡灌洗... 目的研究急性下呼吸道感染患儿病原菌特点,探讨支气管肺泡灌洗液荧光PCR检测对儿童急性呼吸道感染病原学的诊断价值。方法选择2018年6月至2019年5月吉林大学第一医院收治的急性呼吸道感染住院患儿172例为研究对象,收集其支气管肺泡灌洗液,通过多重实时荧光定量PCR检测其病原体。结果本研究中172例支气管肺泡灌洗液样本致病菌检出有106例,阳性率为61.63%(106/172);排在前三位的病原菌检出率依次为肺炎链球菌26.74%(46/172),流感嗜血杆菌17.44%(30/172),百日咳鲍特菌8.14%(14/172),且不同年龄组的病原菌检出率存在差异,P<0.01。结论急性下呼吸道感染患儿支气管肺泡灌洗液中肺炎链球菌检出率最高,依次为流感嗜血杆菌、百日咳鲍特菌、卡他莫兰汉菌、金黄色葡萄球菌。急性下呼吸道感染患儿的病原菌检出率在不同年龄段分组中存在差异。 展开更多
关键词 呼吸道病原菌、支气管肺泡灌洗液 下呼吸道感染 实时荧光定量PCR
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猫上呼吸道疾病的病原、诊断与防治
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作者 孙凡媛 刘怡婷 +7 位作者 郭昕怡 陈建材 周华波 覃一峰 欧阳康 韦祖樟 黄伟坚 陈樱 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2345-2356,共12页
猫上呼吸道疾病(feline upper respiratory tract disease, FURTD)是一种在猫中广泛传播的以上呼吸道、口腔和眼部症状为主的疾病。引起FURTD的病原多样,除常见的猫杯状病毒(feline calicivirus, FCV)、猫疱疹病毒Ⅰ型(feline herpesvir... 猫上呼吸道疾病(feline upper respiratory tract disease, FURTD)是一种在猫中广泛传播的以上呼吸道、口腔和眼部症状为主的疾病。引起FURTD的病原多样,除常见的猫杯状病毒(feline calicivirus, FCV)、猫疱疹病毒Ⅰ型(feline herpesvirus type 1,FHV-1)、猫衣原体(Chlamydia felis,C.felis)、猫支原体(Mycoplasma felis,M.felis)、支气管败血波氏杆菌(Bordetella bronchiseptica,Bb)外,临床中还有许多其他的病原偶见感染。临床中常出现由多种病原体混合感染的情况,并且病原的不断进化容易造成致病性的增强和组织嗜性的改变,这种病因的复杂性往往使得FURTD的防治较为困难。同时,由于许多病原感染引起猫的症状相似,仅凭临床症状无法准确判断出病因,准确认识不同病原的特性、掌握不同的病原检测方法对FURTD的病因快速诊断和提出高效的治疗方案至关重要。目前,不同病原引起的FURTD病例常被报道,而针对FURTD的诊断方法、治疗以及疫苗研制都尚未成熟,本文将对该疾病的常见和新发病原、诊断方法、治疗手段和防控措施进行系统地阐述,旨在为FURTD的防治工作提供更多的思路。 展开更多
关键词 猫上呼吸道疾病 病原 混合感染 诊断方法
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某院2019年至2021年下呼吸道病原菌分布与耐药性分析
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作者 刘鸿儒 陈华伟 +4 位作者 靳秀宏 董强 赵晶晶 李亚楠 白彩革 《中国药业》 CAS 2024年第11期112-116,共5页
目的 分析某院住院患者下呼吸道感染病原菌的分布及耐药性,促进临床合理应用抗菌药物。方法 选取北京市平谷区医院2019年1月至2021年12月收治的住院下呼吸道感染患者12 040例,统计并分析送检的合格下呼吸道分离标本细菌培养、药物敏感试... 目的 分析某院住院患者下呼吸道感染病原菌的分布及耐药性,促进临床合理应用抗菌药物。方法 选取北京市平谷区医院2019年1月至2021年12月收治的住院下呼吸道感染患者12 040例,统计并分析送检的合格下呼吸道分离标本细菌培养、药物敏感试验(简称药敏试验)结果,根据指南评价抗菌药物处方合理性。结果 送检的合格下呼吸道标本5 074份,病原学送检率为42.14%(5 074/12 040)。共分离病原菌3 137株,其中革兰阴性杆菌2 966株(94.55%),革兰阳性球菌171株(5.45%)。常见革兰阴性杆菌包括肺炎克雷伯菌889株(28.34%),铜绿假单胞菌819株(26.11%),鲍曼不动杆菌284株(9.05%),嗜麦芽窄食单胞菌212株(6.76%),阴沟肠杆菌168株(5.36%)及大肠埃希菌163株(5.20%)。肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌对亚胺培南的耐药率分别为5.85%,16.12%,13.03%。革兰阳性球菌中以金黄色葡萄球菌为主(111株,3.54%),对万古霉素及利奈唑胺的耐药率均为0,对青霉素的耐药率为90.99%。共收集4 719张抗菌药物不合理处方,环丙沙星、左氧氟沙星、复方新诺明不合理用药率分别为41.43%,35.16%,33.95%;常见不合理用药行为包括药物品种选择不当(40.16%)、联合用药不合理(15.60%)及无指征使用(13.67%)。结论 革兰阴性杆菌是该院下呼吸道感染的主要致病菌,常见病原菌对抗菌药物有不同程度的耐药。故应加强病原菌耐药性监测及分析,促进抗菌药物的合理应用。 展开更多
关键词 呼吸科 下呼吸道感染 病原菌 耐药性 合理用药
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mNGS检测肺泡灌洗液病原体在儿童下呼吸道感染中的应用价值
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作者 曾祥妮 李岚 +3 位作者 胡次浪 杜云 吴爱民 朱晓华 《江西医药》 CAS 2024年第6期524-529,544,共7页
目的本研究旨在深入探究支气管肺泡灌洗液宏基因二代测序技术(mNGS)在儿童重症或难治性下呼吸道感染病原学检测中的独特优势及其对临床治疗的指导意义。方法回顾性分析江西省儿童医院呼吸内科在2021年10月至2022年10月期间收治的50例重... 目的本研究旨在深入探究支气管肺泡灌洗液宏基因二代测序技术(mNGS)在儿童重症或难治性下呼吸道感染病原学检测中的独特优势及其对临床治疗的指导意义。方法回顾性分析江西省儿童医院呼吸内科在2021年10月至2022年10月期间收治的50例重症或难治性下呼吸道感染患儿的临床资料,所有患儿均接受了肺泡灌洗液mNGS检测以及传统方法检测(包括痰培养、肺泡灌洗液培养、血培养、病原血清学检测等)。通过对mNGS及传统方法检测结果的分析和判读,比较不同检测方法的阳性率、病原学分布、监测时间及检测结果的一致性等多个关键指标。同时,我们结合患儿的临床资料,依据检测结果判断病原菌,并据此调整抗感染治疗方案。结果灌洗液mNGS检测的阳性率显著高于传统方法检测(96%vs 52%),且对细菌、病毒、真菌的检测阳性率同样高于传统方法。此外,传统病原菌培养的平均耗时超过72小时,而mNGS的检测时间仅为24小时,检测周期显著缩短。更重要的是,mNGS指导下的抗感染方案调整指导率明显高于传统方法检测(42%vs 6%)。结论支气管肺泡灌洗液mNGS技术的应用能够显著提高重症或难治性儿童下呼吸道感染病原体的检出率,为临床提供快速、准确的病原体检测手段。同时,该技术能够有效指导临床用药,提高治疗效果,降低死亡率,为儿童重症或难治性下呼吸道感染的诊疗提供了新的有力工具。 展开更多
关键词 儿童下呼吸道感染 病原监测 mNGS 支气管肺泡灌洗液
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老年呼吸道感染9项常见病原体分布特点及危险因素分析
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作者 王一律 钟文 +2 位作者 王真 张晓娟 陈睿 《老年医学与保健》 CAS 2024年第3期730-733,738,共5页
目的了解老年呼吸道感染(RTI)9项常见病原体的分布情况及老年RTI危险因素,为临床降低感染发生率及合理用药提供依据。方法选取2021年1月—2023年9月于成都市第三人民医院收治的接受9项常见呼吸道病原体IgM抗体检测的老年RTI患者395例,... 目的了解老年呼吸道感染(RTI)9项常见病原体的分布情况及老年RTI危险因素,为临床降低感染发生率及合理用药提供依据。方法选取2021年1月—2023年9月于成都市第三人民医院收治的接受9项常见呼吸道病原体IgM抗体检测的老年RTI患者395例,分析其病原体检出及分布特点,另按1∶1的比例选取同期住院部收治的未出现RTI老年患者395例为对照组,使用多因素Logistic回归分析老年RTI的影响因素。结果9项常见呼吸道病原体IgM抗体阳性率为12.91%(51/395),其中肺炎支原体(MP)IgM抗体阳性率6.08%(24/395);病原体IgM抗体阳性率在四季中差异无统计学意义(P>0.05);肺炎、支气管肺炎患者的MP的IgM抗体阳性率、病原体IgM抗体总阳性率均高于急性上呼吸道感染、急性支气管肺炎、喘息性支气管肺炎患者(P<0.05);年龄≥75岁人群MP IgM阳性率、病原体IgM抗体总阳性率均高于60~74岁人群(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,抗生素≥2种、使用免疫抑制剂、基础疾病≥3种是老年RTI的独立危险因素(P<0.05)。结论老年患者RTI病原体可能以MP为主,多见于肺炎、支气管肺炎,多发于年龄≥75岁年龄段,有使用抗生素、免疫抑制剂和合并多种基础疾病可增加老年RTI风险。 展开更多
关键词 老年 呼吸道感染 病原体 影响因素
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探讨恒温扩增法在下呼吸道感染病原体检测的价值
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作者 杨增利 陈洁 +2 位作者 惠开元 顾洁 蒋晓东 《工业微生物》 CAS 2024年第2期148-151,共4页
探究运用恒温扩增法(Loop—mediated isothermal amplification,LAMP)在感染人群病原体诊断方面的价值。收集2022年1-8月255名下呼吸道感染患者的痰液或肺泡灌洗液(Bronchoalveolar lavage fluid,BALF),运用LAMP法和痰培养法同时对其进... 探究运用恒温扩增法(Loop—mediated isothermal amplification,LAMP)在感染人群病原体诊断方面的价值。收集2022年1-8月255名下呼吸道感染患者的痰液或肺泡灌洗液(Bronchoalveolar lavage fluid,BALF),运用LAMP法和痰培养法同时对其进行检测,分析病原体检出情况、恒温扩增芯片法与痰培养法符合率。运用LAMP法检出阳性标本200例,总阳性率为78.43%,共检出呼吸道病原体10种;运用痰培养法检测出阳性标本80例,总阳性率为31.37%,共检出呼吸道病原体8种。两种方法检出的铜绿假单胞菌的阳性率具有高度一致性(Kappa=0.516),鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌的阳性率具有中等一致性(0.4<Kappa<0.6)。恒温扩增法的病原体检出率显著高于传统痰培养法;相较于金标准痰培养法,其对苛养菌的检测具有较好的一致性。但LAMP法检测时间更短、总阳性率更高,更有助于临床医生快速精准地识别所感染的病原体。 展开更多
关键词 下呼吸道感染 恒温扩增法 痰培养 病原体
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某基层医院与三甲儿童医院儿童呼吸道感染病原谱比较
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作者 黄宇轩 贾立平 +2 位作者 德日 赵林清 李晓惠 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第7期1200-1203,共4页
目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛... 目的 比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法 收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛细电泳联用技术检测13种呼吸道病原,统计学方法分析两家医院急性呼吸道感染儿童病原谱差异。结果 基层医院纳入患儿112例,男女比例为1∶1,呼吸道病原总阳性检出率为71.43%(80/112),单种病原感染72例(64.29%,72/112),混合感染8例(7.14%,8/112,均为2种病原);三甲儿童医院纳入患儿115例,男女比例1.02∶1,呼吸道病原总阳性检出率为70.43%(81/115),单种病原感染66例(57.39%,66/115),混合感染15例(包括2种病原感染12例,10.43%,12/115;3种病原感染3例,2.61%,3/115)。0~3岁婴幼儿中,基层医院与三甲儿童医院HMPV阳性检出率(52.9%,9/17;5.3%,4/75)差异有统计学意义(χ^(2)=38.10,P<0.05);三甲儿童医院儿童RSV阳性检出率(44.0%,33/75)高于基层医院(23.5%,4/17),但差异无统计学意义(χ^(2)=2.415,P>0.05)。4~15岁儿童中,基层医院Flu B阳性检出率为31.58%(30/95),三甲儿童医院为20.0%(8/40),差异有统计学意义(χ^(2)=6.96,P<0.05);三甲儿童医院MP阳性检出率为37.5%(15/40),基层医院未检出,差异有统计学意义(χ^(2)=40.08,P<0.05)。结论 2021-2022年冬春季节北京某基层医院与三甲儿童医院的儿童呼吸道感染病原谱构成存在差异,各年龄段病原谱分布也不同,提示分级诊疗以及基层医院开展核酸检测的必要性。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原谱 分级诊疗 基层医院 三甲儿童医院
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恒温扩增芯片法在ICU肺部感染患者下呼吸道病原体检测中的应用
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作者 田刚 成彬 +4 位作者 刘艳枚 陈晨 陈凌娟 徐令清 尹卫国 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第9期1700-1703,1712,共5页
目的探讨恒温扩增芯片法在重症监护病房肺部感染患者下呼吸道病原体检测中的应用价值。方法收集2022年1月至2022年7月期间清远市人民医院重症监护室752例患者痰液或肺泡灌洗液标本,同时进行LAMP法和痰培养检测,比较各病原体检出率以及... 目的探讨恒温扩增芯片法在重症监护病房肺部感染患者下呼吸道病原体检测中的应用价值。方法收集2022年1月至2022年7月期间清远市人民医院重症监护室752例患者痰液或肺泡灌洗液标本,同时进行LAMP法和痰培养检测,比较各病原体检出率以及两种方法的一致性。结果恒温扩增芯片法检出576例阳性(76.60%),培养法检出418例阳性(55.59%),恒温扩增芯片法检出率更高,差异具有统计学意义(χ^(2)=74.064,P<0.001)。LAMP法检出率较高的病原体是鲍曼不动杆菌(45.48%),肺炎克雷伯菌(36.97%),铜绿假单胞菌(20.48%),金黄色葡萄球菌(11.84%);培养法检出率较高的病原体与LAMP一致,其检出率分别为23.80%,13.16%,7.98%,2.93%。两种方法对各病原体检出率的比较中,除结核分枝杆菌外,LAMP法对其余九种病原体的检出率均高于培养法,差异有统计学意义(P均<0.05)。两种方法的总体阳性一致性Kappa值为0.242,一致性一般。其中,对结核分枝杆菌的检出一致性较强,Kappa值为0.665;对鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌检出一致性中等,Kappa值分别为0.551和0.409;对流感嗜血杆菌和嗜麦芽窄食单胞菌检出一致性较差,Kappa值分别为0.079和0.150。结论恒温扩增芯片法较传统培养法,具有操作简便、速度快、阳性率高等优点,可同时检测十三种病原体,对于混合感染和苛养菌的检测效果更好,对于临床早期诊断和精准治疗有着至关重要的作用。 展开更多
关键词 恒温扩增芯片法 痰培养 下呼吸道病原体 肺部感染
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2108例儿童呼吸道病原体感染的流行病学特征 被引量:2
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作者 曹宪振 马杰彦 +2 位作者 胡亮 李高驰 刘维强 《新发传染病电子杂志》 2024年第1期12-16,共5页
目的 探讨呼吸道病原体感染住院儿童的病原谱特征,为相关感染性疾病的诊治和预防控制提供依据。方法 收集2022年6月至2023年3月深圳市龙岗区妇幼保健院采集住院儿童呼吸道病原体样本2108份,采用多重聚合酶链反应技术对样本进行甲型流行... 目的 探讨呼吸道病原体感染住院儿童的病原谱特征,为相关感染性疾病的诊治和预防控制提供依据。方法 收集2022年6月至2023年3月深圳市龙岗区妇幼保健院采集住院儿童呼吸道病原体样本2108份,采用多重聚合酶链反应技术对样本进行甲型流行性感冒病毒(influenza A virus,FluA)、乙型流行性感冒病毒(influenza B virus,FluB)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)、腺病毒(respiratory adenovirus,ADV)、鼻病毒(respiratory rhinovirus,HRV)、肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae,MP)6种病原体检测,分析总体检出情况,并对不同年龄、性别、疾病、月份、时间段的病原体分布特点进行比较。结果 病原体的阳性总检出率为50.05%,单一感染中HRV(333例,15.80%)、RSV(237例,11.24%)、FluA(194例,9.20%)占比较高,混合感染中以HRV与RSV组合频次最高;住院患儿不同年龄组病原体单一感染、混合感染(3种病原体混合感染除外)的阳性检出率差异均有统计学意义(均P<0.05)。不同性别住院患儿病原体单一感染、混合感染的阳性检出率差异均无统计学意义(均P>0.05)。FluA在急性支气管炎患儿中检出率最高(27.24%),支气管肺炎患儿中以RSV阳性检出率最高(19.14%),急性咽炎患儿中以ADV阳性检出率最高(47.06%),喘息性支气管炎患儿中以HRV和RSV阳性检出率最高(50.00%和48.08%),重症肺炎患儿中以MP阳性检出率最高(36.73%)。FluA检出率在2022年7月和2023年3月有2个小高峰,RSV在2022年12月检出率最高,HRV检出率在2022年11月和2023年2月有2个小高峰,ADV和MP每月均有检出。结论 呼吸道感染住院患儿感染的主要病原体是HRV和RSV,同时应注意防控重叠感染。 展开更多
关键词 住院 儿童 呼吸道 感染 病原体 流行病学
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长沙县地区门诊儿童常见上呼吸道感染病原体共感染特征 被引量:1
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作者 彭杜平 洪迎瑞 +6 位作者 喻娟娟 范英杰 李兴军 王群 周凡琦 杨牡丹 李敏 《检验医学与临床》 2024年第4期524-529,共6页
目的分析长沙县上呼吸道感染病原谱特点,探讨该地区常见呼吸道病原体的共感染分布特征,为该地区呼吸道感染疾病的早期诊断和治疗提供可靠依据。方法回顾性分析湖南省长沙市长沙县妇幼保健院门急诊于2022年1—6月收治的17456例上呼吸道... 目的分析长沙县上呼吸道感染病原谱特点,探讨该地区常见呼吸道病原体的共感染分布特征,为该地区呼吸道感染疾病的早期诊断和治疗提供可靠依据。方法回顾性分析湖南省长沙市长沙县妇幼保健院门急诊于2022年1—6月收治的17456例上呼吸道感染患儿(年龄<14岁)的临床资料,患儿均采集咽拭子标本,采用多重聚合酶链反应检测6种常见病原体:甲型流感病毒(Flu.A)、乙型流感病毒(Flu.B)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、鼻病毒(HRV)、肺炎支原体(MP),分析不同性别、年龄患儿病原体检出情况,以及单一感染率与混合感染率等感染分布特征。结果17456例患儿病原体检出率为52.93%,主要感染病原体依次为Flu.B(24.00%)、HRV(11.41%)、Flu.A(8.41%)、RSV(6.54%)、ADV(5.20%)和MP(1.45%),混合感染率为4.02%。男童中MP与Flu.B或ADV混合感染率高于女童,差异有统计学意义(P<0.05)。随着年龄增长,Flu.B及MP检出率明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。MP、ADV感染患儿更易发生混合感染,MP混合感染约占MP总感染的24.11%,MP混合感染患儿白细胞计数异常、中性粒细胞百分比异常、淋巴细胞百分比异常的比例相对MP单一感染患儿更高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论该地区儿童常见上呼吸道感染病原体主要为Flu.B、HRV、Flu.A,常见病原体检出率及其混合感染率呈现年龄差异性,MP感染患儿易发生混合感染,及时、准确鉴别呼吸道感染病原体有利于早期诊断和合理用药。 展开更多
关键词 上呼吸道 病原体 共感染 儿童 肺炎支原体 甲型流感病毒 乙型流感病毒 呼吸道合胞病毒
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肺炎支原体肺炎患儿血清MICA、OPN水平及其与反复呼吸道感染的相关性研究
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作者 梁文婷 霍开明 +1 位作者 古裕鸟 吴小红 《检验医学与临床》 CAS 2024年第13期1870-1874,共5页
目的探究肺炎支原体肺炎患儿血清主要组织相容性复合物Ⅰ链相关基因A(MICA)、骨桥蛋白(OPN)水平及其与反复呼吸道感染的相关性。方法选取该院2019年3月至2021年3月收治的肺炎支原体肺炎患儿106例作为研究组,另选取同期于该院进行体检的... 目的探究肺炎支原体肺炎患儿血清主要组织相容性复合物Ⅰ链相关基因A(MICA)、骨桥蛋白(OPN)水平及其与反复呼吸道感染的相关性。方法选取该院2019年3月至2021年3月收治的肺炎支原体肺炎患儿106例作为研究组,另选取同期于该院进行体检的健康儿童106例作为对照组,根据肺炎支原体肺炎患儿是否发生反复呼吸道感染分为反复呼吸道感染发生组和反复呼吸道感染未发生组;使用全自动微生物鉴定系统和纸片扩散试纸进行病原菌检测以及耐药性试验;血清MICA、OPN水平检测采用酶联免疫吸附试验;采用多因素Logistic回归分析影响肺炎支原体肺炎反复呼吸道感染发生的危险因素;绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清MICA、OPN单独及联合检测对肺炎支原体肺炎患儿发生反复呼吸道感染的预测价值。结果106例肺炎支原体肺炎患儿共分离出116株菌株,其中革兰阴性菌77株(66.38%),包括流感嗜血杆菌29株(25.00%),肺炎克雷伯菌17株(14.66%),鲍曼不动杆菌14株(12.07%),铜绿假单胞菌8株(6.90%),阴沟肠杆菌6株(5.17%),其他菌3株(2.59%);革兰阳性菌39株(33.62%),包括金黄色葡萄球菌16株(13.79%),表皮葡萄球菌10株(8.62%),肠球菌6株(5.17%),溶血葡萄球菌5株(4.31%),其他菌2株(1.72%)。流感嗜血杆菌耐药率较高的为头孢哌酮,占75.86%,肺炎克雷伯菌耐药率较高的为氨苄西林,占88.24%。16株金黄色葡萄球菌中,对红霉素耐药12株(75.00%),对环丙沙星耐药8株(50.00%),对四环素耐药6株(37.50%),对苯唑西林耐药4株(25.00%),对克林霉素耐药2株(12.50%),未发现对万古霉素和利奈唑胺耐药的金黄色葡萄球菌。研究组血清MICA、OPN水平均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。46例患儿发生反复呼吸道感染,60例患儿未发生反复呼吸道感染。反复呼吸道感染发生组使用药物不当比例,血清MICA、OPN水平均明显高于反复呼吸道感染未发生组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,MICA水平升高(95%CI:1.782~3.949)、OPN水平升高(95%CI:1.989~5.012)均为肺炎支原体肺炎发生反复呼吸道感染的危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清MICA预测肺炎支原体肺炎反复呼吸道感染的曲线下面积(AUC)为0.899(95%CI:0.836~0.962),截断值为153.702 pg/mL,灵敏度为76.51%,特异度为87.24%。血清OPN预测肺炎支原体肺炎反复呼吸道感染的AUC为0.898(95%CI:0.835~0.960),截断值为101.231 pg/mL,灵敏度为78.29%,特异度为84.41%。二者联合检测预测肺炎支原体肺炎反复呼吸道感染的AUC为0.954(95%CI:0.918~0.989),灵敏度为88.35%,特异度为80.24%。二者联合检测预测肺炎支原体肺炎患儿发生反复呼吸道感染的AUC优于血清MICA、OPN各自单独预测的AUC(Z_(联合vs.MICA)=2.624、Z_(联合vs.OPN)=2.735,P<0.05)。结论肺炎支原体肺炎患儿血清MICA、OPN水平明显升高,二者与反复呼吸道感染密切相关。 展开更多
关键词 肺炎支原体肺炎 主要组织相容性复合体I类链相关蛋白 骨桥蛋白 反复呼吸道感染 病原菌
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老年非小细胞肺癌放化疗患者下呼吸道感染病原菌分布及危险因素分析
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作者 孔文杰 李宝亮 +2 位作者 邹芳 高晶 谢晓娟 《传染病信息》 2024年第1期61-64,69,共5页
目的分析老年非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)放化疗患者发生下呼吸道感染的病原菌分布及危险因素。方法采用回顾性分析,将我院108例行放化疗的老年NSCLC患者根据是否发生下呼吸道感染分为感染组(40例)和未感染组(68例)... 目的分析老年非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)放化疗患者发生下呼吸道感染的病原菌分布及危险因素。方法采用回顾性分析,将我院108例行放化疗的老年NSCLC患者根据是否发生下呼吸道感染分为感染组(40例)和未感染组(68例),取分泌物作病原菌培养,同时对发生下呼吸道感染的相关因素进行单因素和多因素Logistic回归分析。结果NSCLC患者下呼吸道感染发生率37.04%,感染率高于我院近年来医院感染平均水平(2019—2022年平均感染率分别为8.39%、8.05%、8.17%、7.04%)。共培养分离出病原菌44株,革兰阴性菌占56.82%,革兰阳性菌占38.64%,真菌占4.55%。病原菌构成与我院总体病原菌构成无明显差异。感染组年龄≥70岁、合并糖尿病、TNM分期Ⅲ、Ⅳ期、住院时间>15 d、CD4^(+)/CD8^(+)比值≤1患者的比例均高于未感染组,差异有统计学意义(P均<0.05)。年龄≥70岁、CD4^(+)/CD8^(+)比值≤1、住院时间>15 d、TNM分期Ⅲ、Ⅳ期为老年NSCLC放化疗患者发生下呼吸道感染的危险因素(OR=1.574、2.416、3.995、2.186,P<0.05)。结论我院老年NSCLC放化疗患者发生下呼吸道感染的病原菌谱近年来无明显变化,肺炎克雷伯菌和金黄色葡萄球菌占比较高。高龄、CD4^(+)/CD8^(+)比值降低、住院时间长及TNM分期高是患者发生下呼吸道感染的危险因素。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 老年患者 放化疗 下呼吸道感染 病原菌 危险因素
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成都地区2 829例儿童呼吸道病原体IgM抗体检测结果分析
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作者 胡琴 胡皓月 +1 位作者 刘海霞 何榕 《检验医学与临床》 CAS 2024年第S01期119-123,共5页
目的探索成都市金堂地区儿童的9种常见呼吸道病原体IgM抗体感染情况及其季节性特征。方法回顾性分析2022年3月-2023年2月在该院住院治疗的2829例呼吸道感染患儿的呼吸道病原体IgM抗体检测资料,采用磁微粒化学发光法检测血清中的9种常见... 目的探索成都市金堂地区儿童的9种常见呼吸道病原体IgM抗体感染情况及其季节性特征。方法回顾性分析2022年3月-2023年2月在该院住院治疗的2829例呼吸道感染患儿的呼吸道病原体IgM抗体检测资料,采用磁微粒化学发光法检测血清中的9种常见呼吸道病原体IgM抗体,包括合胞病毒(RSV-IgM)、甲型流感病毒(AIV-IgM)、乙型流感病毒(BIV-IgM)、副流感病毒(HPIV-IgM)、腺病毒(ADV-IgM)、柯萨奇病毒(CVB-IgM)、埃柯病毒(ECHO-IgM)、肺炎支原体(MP-IgM)、肺炎衣原体(CP-IgM)。结果2829例患儿中,呼吸道病原体抗体检出例数1157例,检出率为48.90%,各种病毒检出率前三位,BIV-IgM 444例(15.69%),MP-IgM 424例(14.99%),AIV-IgM 378例(13.36%)。春夏秋冬四季呼吸道病原体检出率依次为48.07%,30.36%,36.76%,36.13%,总体以春季为主,不同季节呼吸道病原体抗体检出率差异有统计学意义(χ^(2)=55.174,P<0.001),性别方面,男女儿童检出率依次为46.16%,49.74%,总检出率差异无统计学意义(P>0.05)。年龄段分段显示,1~3岁检出率最高(53.91%),差异有统计学意义(χ^(2)=34.676,P<0.001)。在四季不同年龄段的患儿中,春季、夏季、秋季呼吸道病原体感染以3~7岁患儿为主,冬季呼吸道病原体感染以7~14岁患儿为主。结论成都市9种常见呼吸道病原体IgM抗体的检出率各自存在不同季节性特征与易感人群,可据此特征对当地儿童进行针对性防控及临床诊断。 展开更多
关键词 儿童 季节性 呼吸道病原体 IGM抗体 呼吸道感染
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117例肺泡灌洗液阳性老年下呼吸道感染患者病原菌分布及耐药性分析
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作者 夏珺 李泉 +3 位作者 张吉 曾建涛 吴永琴 刘钉宾 《检验医学与临床》 CAS 2024年第12期1806-1810,共5页
目的分析肺泡灌洗液(BALF)阳性的老年下呼吸道感染患者相关病原菌的分布和耐药性,为老年下呼吸道感染的预防及合理用药提供依据。方法对该院2020年1月1日至2023年6月30日送检的高度怀疑下呼吸道感染的664例住院老年患者BALF标本进行培养... 目的分析肺泡灌洗液(BALF)阳性的老年下呼吸道感染患者相关病原菌的分布和耐药性,为老年下呼吸道感染的预防及合理用药提供依据。方法对该院2020年1月1日至2023年6月30日送检的高度怀疑下呼吸道感染的664例住院老年患者BALF标本进行培养,采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果BALF标本中分离出病原菌147株,BALF标本阳性率为22.1%(147/664)。排除来自同一患者的重复分离菌株后,分离的病原菌为117株。117株病原菌中革兰阳性菌占7.7%,革兰阴性菌占72.6%,真菌占19.7%。其中革兰阴性菌以鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌为主;革兰阳性菌以肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌为主;真菌以白色假丝酵母菌为主。分离出117株病原菌的下呼吸道感染患者中,医院获得性肺炎46例(39.3%),社区获得性肺炎71例(60.7%)。药敏试验结果显示:鲍曼不动杆菌对呋喃妥因和头孢唑啉耐药率最高,为100.0%,对亚胺培南、美罗培南耐药率均为84.0%,对多黏菌素B、米诺环素、头孢噻肟耐药率均为0.0%;铜绿假单胞菌对氨苄西林/舒巴坦耐药率最高,为85.7%,对复方磺胺甲噁唑、氯霉素、米诺环素耐药率分别为64.3%、78.6%、45.5%;肺炎克雷伯菌除对氨苄西林天然耐药外,对其他测试药物的耐药率在0.0%~35.3%;白色假丝酵母菌对伏立康唑、两性霉素B均敏感。结论老年下呼吸道感染患者BALF标本检出病原菌以革兰阴性菌为主,其中鲍曼不动杆菌的耐药情况较严重,真菌感染也应该引起重视。 展开更多
关键词 下呼吸道感染 肺泡灌洗液 病原菌 耐药性 老年患者
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住院患儿下呼吸道感染病原菌分布、流行特征及危险因素
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作者 刘颖 曾小金 胡宇 《中国医学创新》 CAS 2024年第18期175-179,共5页
目的:探讨住院患儿下呼吸道感染病原菌分布、流行特征及危险因素。方法:回顾性分析2021年1月—2023年1月瑞金市妇幼保健院收治的460例呼吸道感染患儿的临床资料,根据患儿呼吸道感染的部位,将下呼吸道感染患儿纳入观察组(n=350),其余非... 目的:探讨住院患儿下呼吸道感染病原菌分布、流行特征及危险因素。方法:回顾性分析2021年1月—2023年1月瑞金市妇幼保健院收治的460例呼吸道感染患儿的临床资料,根据患儿呼吸道感染的部位,将下呼吸道感染患儿纳入观察组(n=350),其余非下呼吸道感染患儿纳入对照组(n=110)。分析下呼吸道感染患儿病原菌分布情况和耐药性,并比较不同性别、年龄、季节的病原菌检出情况,以logistic回归分析影响下呼吸道感染的因素。结果:350例下呼吸道感染患儿中,革兰阴性菌占比最高,为62.86%,其次为真菌(20.29%)、革兰阳性菌(16.86%)。革兰阴性菌以大肠埃希菌为主,占22.29%,革兰阳性菌以金黄色葡萄球菌为主,占8.29%。革兰阴性菌对阿莫西林、哌拉西林、氨苄西林、头孢唑林有较高耐药性。男患儿革兰阴性菌检出率高于女患儿,春冬季节革兰阴性菌检出率高于夏秋季节(P<0.05)。观察组有创操作、春冬季节、营养不良、合并病毒感染、抗菌药物滥用占比均高于对照组(P<0.05)。多因素分析结果显示,有创操作、春冬季节、营养不良、合并病毒感染、抗菌药物滥用均为下呼吸道感染的危险因素(OR=12.692、20.968、23.784、19.011、7.783,P<0.05)。结论:下呼吸道感染病原菌分布中以革兰阴性菌为主,多发生在春冬季节,且春冬季节、营养不良、合并病毒感染、抗菌药物滥用、有创操作与下呼吸道感染有关。 展开更多
关键词 下呼吸道感染 病原菌分布 流行特征 影响因素
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2023年厦门市1939例急性呼吸道感染住院儿童病原学特征分析
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作者 魏艳丽 邹良能 +4 位作者 洪山 蔡加锭 方宇露 郑壹林 张军能 《山西医药杂志》 CAS 2024年第14期1043-1047,共5页
目的探讨2023年厦门地区急性呼吸道感染儿童的呼吸道病原学流行特征。方法收集2023年厦门市患急性呼吸道感染(ARTI)的儿童1939个病例咽拭子,进行甲型流感(FluA)、甲型H_(1)N_(1)流感(FluA-H_(1)N_(1))、甲型H_(3)N_(2)流感(FluA-H_(3)N_... 目的探讨2023年厦门地区急性呼吸道感染儿童的呼吸道病原学流行特征。方法收集2023年厦门市患急性呼吸道感染(ARTI)的儿童1939个病例咽拭子,进行甲型流感(FluA)、甲型H_(1)N_(1)流感(FluA-H_(1)N_(1))、甲型H_(3)N_(2)流感(FluA-H_(3)N_(2))、鼻病毒(RVs)、呼吸道合胞病毒(RSV)、偏肺病毒(MPV)、腺病毒(ADV)、副流感病毒(PIV)、博卡病毒(BoV)、冠状病毒(CoV),乙型流感病毒(FluB)、肺炎支原体(MP)和衣原体的病原体检测,并对以上呼吸道13项病原体检测数据进行分析。结果ARTI儿童中,75.66%的患儿至少有1种呼吸道病原体呈阳性;不同年龄阶段中,学龄期儿童组呼吸道13项病原体阳性检出率79.41%,占比最高,其余依次是学龄前期儿童组、幼儿期儿童组及婴儿期儿童组(P<0.05);PIV、RSV和衣原体感染多发生在婴儿期,阳性检出率分别为12.16%、23.87%、2.25%,RVs、BoV感染多发生在幼儿期,阳性检出率分别为25.13%、3.54%,ADV感染多发生在学龄前期,阳性检出率为11.85%,FluA、FluA-H_(3)N_(2)、MP和FluB感染多发生在学龄期,阳性检出率分别为13.32%、8.13%、49.31%、和7.79%(P<0.05);FluA、FluA-H_(3)N_(2)、FluB、MP病原体检出率随患者年龄阶段增长占比增加,PIV、RSV病原体检出率随患者年龄阶段增长占比减小(P<0.05)。FluA-H_(1)N_(1)、RVs感染多发生在春季,阳性检出率分别为12.80%、21.48%,PIV、RSV感染多发生在夏季,阳性检出率分别为10.40%、24.32%,MPV、MP和BoV感染多发生在秋季,阳性检出率分别为8.54%、48.93%、2.96%,FluA、FluA-H_(3)N_(2)、ADV、FluB和衣原体感染多发生在冬季,阳性检出率分别为20.88%、17.78%、9.79%、14.95%和1.80%(P<0.05)。结论2023年厦门市ARTI儿童呼吸道13项病原体流行与性别、季节性和年龄阶段相关,不同季节性和年龄阶段病原体流行类型呈交替出现,因此需要加强ARTI儿童呼吸道病原学监测,进行精准临床治疗。 展开更多
关键词 呼吸道感染 流行病学监测 儿童 病原
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