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昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠磷酸二酯酶β亚单位编码基因pde6b序列特点的比较分析 被引量:1
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作者 闫果林 吴有盛 +3 位作者 郭群 安晶 刘新平 张作明 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期130-132,共3页
目的:分段克隆昆明种小鼠磷酸二酯酶(PDE)β亚单位编码基因pde6bCDS序列全长,分析比较昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠PDEβ亚单位编码基因pde6b序列的差异。方法:设计覆盖pde6bCDS区的引物序列,通过逆转录-聚合酶链式反应扩增并克隆入载体pMD... 目的:分段克隆昆明种小鼠磷酸二酯酶(PDE)β亚单位编码基因pde6bCDS序列全长,分析比较昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠PDEβ亚单位编码基因pde6b序列的差异。方法:设计覆盖pde6bCDS区的引物序列,通过逆转录-聚合酶链式反应扩增并克隆入载体pMD18-T中,转化大肠杆菌,酶切鉴定后测序。通过生物信息检索、序列拼接并应用生物信息学相关软件进行序列分析。结果:克隆了野生型昆明种小鼠的pde6bCDS全长。昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠pde6bCDS区(NM_008806)相比较存在如下不同:昆明种小鼠第706位碱基为A,而数据库中序列NM_008806为G;第1149位碱基前者为T,后者为C。昆明种小鼠与C57BL/6J小鼠pde6b编码的蛋白序列差异并不明显,仅有第236位氨基酸残基为甘氨酸(G)突变成丝氨酸(S),为相对保守性替换关系。结论:克隆了昆明种小鼠pde6bCDS区全长序列;pde6b基因在不同种属小鼠之间编码序列存在差异,表现出多样性特点,但蛋白序列保守性较高。 展开更多
关键词 视网膜色素变性 磷酸二酯酶 pde6b 多态性
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Novel mutations in PDE6B causing human retinitis pigmentosa 被引量:1
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作者 Lu-Lu Cheng Ru-Yi Han +10 位作者 Fa-Yu Yang Xin-Ping Yu Jin-Ling Xu Qing-Jie Min Jie Tian Xiang-Lian Ge Si-Si Zheng Ye-Wen Lin Yi-Han Zheng Jia Qu Feng Gu 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2016年第8期1094-1099,共6页
AIM: To identify the genetic defects of a Chinese patient with sporadic retinitis pigmentosa (RP). METHODS: Ophthalmologic examinations were performed on the sporadic RP patient, 144 genes associated with retinal dise... AIM: To identify the genetic defects of a Chinese patient with sporadic retinitis pigmentosa (RP). METHODS: Ophthalmologic examinations were performed on the sporadic RP patient, 144 genes associated with retinal diseases were scanned with capture next generation sequencing (CNGS) approach. Two heterozygous mutations in PDE6B were confirmed in the pedigree by Sanger sequencing subsequently. The carrier frequency of PDE6B mutations of reported PDE5B mutations based on the available two public exome databases (1000 Genomes Project and ESP6500 Genomes Project) and one in-house exome database was investigated. RESULTS: We identified compound heterozygosity of two novel nonsense mutations c.1133G>A (p.W378X) and c.2395C>T (p.R799X) in PDE6B, one reported causative gene for RP. Neither of the two mutations in our study was presented in three exome databases. Two mutations (p.R74C and p.T6041) in PDE5B have relatively high frequencies in the ESP6500 and in-house databases, respectively, while no common dominant mutation in each of the database or across all databases. CONCLUSION: We demonstrates that compound heterozygosity of two novel nonsense mutations in PDE6B could lead to RP. These results collectively point to enormous potential of next-generation sequencing in determining the genetic etiology of RP and how various mutations in PDE9B contribute to the genetic heterogeneity of RP. 展开更多
关键词 compound heterozygosity retinitis pigmentosa MUTATION capture next generation sequencing pde6b
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视网膜色素变性患者的相关致病基因PDE6B突变及其临床表型分析 被引量:4
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作者 崔云 赵堪兴 +4 位作者 王立 王擎 张伟 陈薇婴 王犁明 《中华眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期28-32,共5页
目的 了解磷酸二酯酶 β亚单位 (phosphodiesteraseβsubunit,PDE6B)基因突变在我国视网膜色素变性 (retinitispigmentosa ,RP)患者中的突变形式及其临床表型特征。方法 应用聚合酶链反应 异源双链 单链构像多态性及DNA序列分析技术 ... 目的 了解磷酸二酯酶 β亚单位 (phosphodiesteraseβsubunit,PDE6B)基因突变在我国视网膜色素变性 (retinitispigmentosa ,RP)患者中的突变形式及其临床表型特征。方法 应用聚合酶链反应 异源双链 单链构像多态性及DNA序列分析技术 ,对收集的 35个常染色体隐性家系和 5 5例散发RP患者进行PDE6B基因的 2 2个外显子和 5′ 端非编码区 ( 5′ UTR)全基因扫描 ,并行眼部检查及家系分析。结果 检测出 1例散发性RP患者第 6外显子第 2 492位点T→C碱基突变导致其编码氨基酸由甘氨酸变为丝氨酸 ,第 10外显子 5′ 端上游 (第 9内含子内 )第 2 7与 2 8碱基之间有 2个碱基 (TG)插入突变。以上两种突变在 10 0例正常人中均未检测出。RP患者表现为视乳头萎缩、血管变细及色素散布。多焦视网膜电图检测提示视杆细胞受损较重。 1例常染色体隐性家系患者PDE6B基因第 11外显子 5′ 端上游第 19位碱基 (第 10内含子内 )发生G→A颠换。另 2例散发RP患者分别发现第 4外显子 5′ 端上游 30与 31碱基间 2个碱基 (GT)插入和第 18外显子 3′ 端下游第 15个碱基发生G→C转换。结论 PDE6B基因的复合杂合突变可能是我国散发性RP患者的致病基因 ,通常以视杆细胞受累较重 ,其眼部临床表现符合典型的RP患者特征 。 展开更多
关键词 基因突变 视网膜色素变性 相关致病基因 临床表型 pde6b
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视网膜色素变性隐性遗传致病基因PDE6B的突变分析 被引量:2
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作者 崔云 王立 +3 位作者 赵堪兴 王擎 陈薇婴 王犁明 《中华医学遗传学杂志》 EI CAS CSCD 2003年第3期200-202,共3页
目的 了解常染色体隐性遗传视网膜色素变性 ( autosomal recessive retinitis pigmentosa,ARRP)致病基因磷酸二酯酶 β亚单位 ( phosphodiesteraseβ subunit,PDE6 B)基因在中国视网膜色素变性( retinitis pigmentosa,RP)患者中的突变... 目的 了解常染色体隐性遗传视网膜色素变性 ( autosomal recessive retinitis pigmentosa,ARRP)致病基因磷酸二酯酶 β亚单位 ( phosphodiesteraseβ subunit,PDE6 B)基因在中国视网膜色素变性( retinitis pigmentosa,RP)患者中的突变谱及突变率。方法 应用聚合酶链反应 -单链构象多态性 ,对收集的 35个常染色体隐性 RP家系 38例患者和 5 5例散发 RP患者进行 PDE6 B基因的 2 2个外显子和 5′端非翻译区突变筛选 ;对有变异条带者进行 DNA序列分析。结果 测得一个常染色体隐性家系患者 PDE6 B基因第 11外显子 5′端上游第 19位碱基 (第 10内含子内 )发生 G→ A转换。 1例散发 RP患者同时检测到第 6外显子第 2 4 92位点碱基 T颠换为 C和第 10外显子 5′端上游 (第 9内含子内 )第 2 7~ 2 8碱基之间有两个碱基 TG插入。另两例散发 RP患者分别发现第 4外显子 5′端上游 30~ 31碱基处两个碱基 GT插入和第18外显子 3′端下游第 15个碱基发生 G→C颠换。结论 发现 1名中国人的散发 RP患者携带 RP致病基因 PDE6 B基因的一种复合杂合突变。中国人的 PDE6 展开更多
关键词 常染色体隐性遗传 视网膜色素变性 致病基因 pde6b 基因突变
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先天性静止性夜盲的分子遗传学研究进展
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作者 庄树林 胡松年 +2 位作者 邹建卫 商志才 俞庆森 《国外医学(遗传学分册)》 2004年第1期43-45,共3页
先天性静止性夜盲(CSNB)是一类非进行性遗传性跟病,具有高度遗传异质性,患者在黑暗处视力受损。到目前已发现3个基因的5种杂合错义突变与常染色体显性遗传CSNB有关,这三个致病基因已被克隆,相关蛋白突变体的性质已通过体外表达得以研究... 先天性静止性夜盲(CSNB)是一类非进行性遗传性跟病,具有高度遗传异质性,患者在黑暗处视力受损。到目前已发现3个基因的5种杂合错义突变与常染色体显性遗传CSNB有关,这三个致病基因已被克隆,相关蛋白突变体的性质已通过体外表达得以研究,对于致病基因的结构、突变功能、蛋白突变体及其发病机制的研究目前已有了新的进展。 展开更多
关键词 先天性静止性夜盲 分子遗传学 RHO基因 pde6b基因 GNATl基因
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Retinal neovascularization induced by mutant Vldlr gene inhibited in an inherited retinitis pigmentosa mouse model:an in-vivo study
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作者 Wei-Ming Yan Pan Long +5 位作者 Mei-Zhu Chen Dong-Yu Wei Jian-Cong Wang Zuo-Ming Zhang Lei Zhang Tao Chen 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2021年第7期990-997,共8页
AIM:To explore whether the retinal neovascularization(NV)in a genetic mutant mice model could be ameliorated in an inherited retinitis pigmentosa(RP)mouse,which would help to elucidate the possible mechanism and preve... AIM:To explore whether the retinal neovascularization(NV)in a genetic mutant mice model could be ameliorated in an inherited retinitis pigmentosa(RP)mouse,which would help to elucidate the possible mechanism and prevention of retinal NV diseases in clinic.METHODS:The Vldlr^(-/-)mice,the genetic mutant mouse model of retinal NV caused by the homozygous mutation of Vldlr gene,with the rd1 mice,the inherited RP mouse caused by homozygous mutation of Pde6b gene were bred.Intercrossing of the above two mice led to the birth of the F1 hybrids,further inbreeding of which gave birth to the F2 offspring.The ocular genotypes and phenotypes of the mice from all generations were examined,with the F2 offspring grouped according to the genotypes.RESULTS:The rd1 mice exhibited the RP phenotype of outer retinal degeneration and loss of retinal function.The Vldlr^(-/-)mice exhibited the phenotype of retinal NV obviously shown by the fundus fluorescein angiography.The F1 hydrides,with the heterozygote genotype,exhibited no phenotypes of RP or retinal NV.The F2 offspring with homozygous genotypes were grouped into four subgroups.They were the F2-Ⅰmice with the wild-type Pde6b and Vldlr genes(Pde6b~(+/+)-Vldlr~(+/+)),which had normal ocular phenotypes;the F2-Ⅱmice with homozygous mutant Vldlr gene(Pde6b~(+/+)-Vldlr^(-/-)),which exhibited the retinal NV phenotype;the F2-Ⅲmice with homozygous mutant Pde6b gene(Pde6b^(-/-)-Vldlr~(+/+)),which exhibited the RP phenotype.Specifically,the F2-Ⅳmice with homozygous mutant Vldlr and Pde6b gene(Pde6b^(-/-)-Vldlr^(-/-))showed only the RP phenotype,without the signs of retinal NV.CONCLUSION:The retinal NV can be inhibited by the RP phenotype,which implies the role of a hyperoxic state in treating retinal NV diseases. 展开更多
关键词 retinitis pigmentosa retinal neovascularization pde6b gene Vldlr gene PHOTORECEPTOR
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磷酸二酯酶6b基因异常表达对视网膜色素变性的作用
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作者 袁莉 刘焰 刘特 《中国临床医学》 2017年第3期455-460,共6页
磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)是一个大家族,包括11个亚家族,即PDE1~PDE11。而PDE6是PDEs亚家族中的一种,由PDE6基因编码的PDE蛋白,水解cGMP,cGMP是视杆细胞外节膜盘离子通道的特异性受体,同时cGMP也是脊椎动物中感光细胞将光信号... 磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)是一个大家族,包括11个亚家族,即PDE1~PDE11。而PDE6是PDEs亚家族中的一种,由PDE6基因编码的PDE蛋白,水解cGMP,cGMP是视杆细胞外节膜盘离子通道的特异性受体,同时cGMP也是脊椎动物中感光细胞将光信号转化为电信号的重要分子。PDE6b基因的缺失使感光细胞内cGMP增多,引起感光细胞的阳离子增多,细胞中毒而坏死,视网膜的感光细胞不断破坏,从而间接影响到视网膜接受光信号转换为电信号。PDE6b基因异常是常染色体隐性遗传视网膜色素变性最主要的原因之一,因此对于PDE6b基因表达异常在动物模型及家族遗传逐渐成为近年来研究的热点。该文将重点阐述PDE6b基因的结构、功能和突变类型对视网膜色素变性相对应结构及其功能的影响。 展开更多
关键词 磷酸二酯酶β亚单位 视网膜 rd1 基因缺失 视网膜色素变性
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PDGF-C在退行性视网膜病变模型中的神经保护作用 被引量:1
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作者 张汝婷 陈伟 唐仲书 《热带医学杂志》 CAS 2018年第4期432-434,F0003,共4页
目的探讨血小板源性生长因子-C(PDGF-C)在视网膜变性小鼠模型的神经保护作用。方法检测在体外条件下PDGF-C的作用。使用的动物模型包括Pde6b^(rd1)小鼠和MNU诱导的视网膜光感受器细胞损伤模型。两种模型均分为两组,在视网膜下分别注射AA... 目的探讨血小板源性生长因子-C(PDGF-C)在视网膜变性小鼠模型的神经保护作用。方法检测在体外条件下PDGF-C的作用。使用的动物模型包括Pde6b^(rd1)小鼠和MNU诱导的视网膜光感受器细胞损伤模型。两种模型均分为两组,在视网膜下分别注射AAV-PDGF-C-Ires-ZsGreen和AAV-Ires-ZsGreen,然后通过切片HE染色观察视网膜光感受器细胞层厚度的变化来检测PDGF-C的神经保护作用。结果在Pde6b^(rd1)小鼠的视网膜下注射AAV-PDGF-C-Ires-ZsGreen,外核层与全层视网膜厚度比为(0.575 918±0.14),较对照组A(0.335 821±0.11)明显增加,差异有统计学意义(P<0.05)。本实验在MNU诱导的视网膜光感受器细胞损伤模型中,注射AAV-PDGF-C-Ires-Zs Green的实验组B(0.239 712±0.030 9)中外核层厚度较对照组B(0.193 552±0.022 4)增厚,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 PDGF-C在光感受器细胞损伤的动物模型中具有较强的神经保护作用。 展开更多
关键词 PDGF-C pde6b^rd1 退行性视网膜病变
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