Construction of DNA Fingerprint Using SSR Marker for Hybrid Rice Cultivars Approved by Hunan Province

[Objective] This study aimed to construct DNA fingerprint for hybrid rice cultivars those have been approved by Hunan Province. [Method] The primers which produced polymorphic and bright DNA bands were selected to construct the DNA molecular fingerprint map for 77 major hybrid rice cultivars approved by Hunan Province. [ Result] A total of 48 SSR primers were selected. Every cultivar had its unique fingerprint map so that the obtained data could identify differ- ent hybrid rice cultivars. [ Conclusion] This study made great contributions to the perfection of hybrid rice germplasm identification.

基于SSR标记的12个非洲菊品种指纹图谱构建及杂交F_(1)后代鉴定

【目的】基于SSR分子标记对12份非洲菊种质进行亲缘关系分析及部分种质杂交F_(1)后代真假杂种鉴定,以期为非洲菊种质资源鉴评及创新利用提供技术支撑。【方法】收集12个非洲菊种质资源,提取其基因组DNA后,利用50对SSR引物进行PCR扩增,通过检测相关多态性结果进行聚类分析和指纹图谱构建,以及部分品种杂交F_(1)后代鉴定。【结果】18对引物在12份非洲菊材料中共扩增出74个多态性等位变异片段,平均每对引物扩增出多态性等位变异片段4.1个。利用74个等位位点,构建了12份非洲菊种质资源的系统进化树,UPGMA聚类分析结果显示,当遗传系数为0.75时,可将受测的12份种质分为5组,Ⅰ组为‘云南红’‘大088’‘情人’,Ⅱ组为‘粉佳人’‘粉球’‘真爱’和‘福娃’,Ⅲ组为‘绣色’‘淑女’和‘黄球’,Ⅳ组和Ⅴ组均只包含1个品种,分别是‘紫水晶’和‘深圳5号’。筛选出GHSSR-1、GHSSR-18、GHSSR-20和GHSSR-21等4对引物,可完全区分12份种质;其中,后3对引物鉴定出兼具双亲特异位点的单株分别是Gh-5、Gh-4和Gh-1,单独1对引物的鉴定率为33%。且受检的3个单株均为真杂种,真杂种率为100%。【结论】成功构建12份非洲菊品种的指纹图谱,综合3对多态性较好的引物鉴定出3株非洲菊杂交F_(1)后代实生苗为真杂种,为非洲菊资源鉴评和创新利用提供可靠的SSR标记引物。

29个梨品种SSR特征指纹数据表的构建

【目的】为便于果树种质区分鉴定,资源交换、管理和利用,新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,以29个梨品种SSR指纹数据作为基础数据,演示了一种二倍体果树品种SSR特征指纹数据表的构建方法。【方法】经过SSR位点基因型数目统计,SSR位点排序,供试品种排序区分和数据标示,表格优化等数据整合处理步骤,构建了29个梨品种SSR特征指纹数据表。【结果】12对SSR引物中,CH04h02和NAUpy65d 2对引物能将供试的29个梨品种全部区分开,可作为鉴定这29个梨品种时的核心引物加以利用。【结论】该方法简便易行,特征指纹数据表数据信息展示全面直观,品种区分关系一目了然,便于交流共享和指纹图谱数据库共建。

苹果品种的SSR分析

利用SSR方法对苹果25个品种进行了基因组多态性分析,从20对引物中筛选出10对多态性引物用于正式扩增,一共扩增出97个位点,平均每对引物扩增出9.7个位点,扩增条带的多态性百分率在56.4%～100%之间.用两对引物(GD142和02b1)即可区分全部供试品种.根据SSR分析结果,应用NTSYS软件进行相似性系数计算,利用UPGMA法构建聚类树状图.其结果表明,供试苹果品种分为4个类群,与传统系谱基本一致.

12个油茶品种的SSR特征指纹鉴别

为了对普通油茶(Camellia oleifera)优良品种的准确鉴别开发一种新的分子识别方法,为油茶优良品种资源的保护提供技术支持,本研究拟利用SSR荧光标记构建12个长林系列油茶品种的SSR特征指纹。14对多态性SSR引物从12个油茶品种的14个SSR位点共扩增出62个多态性条带、检测出77种基因型,平均每个SSR引物扩增出4.4个多态性条带、检测出5.5种基因型。12个油茶品种14个SSR位点的多态信息含量变化范围和Dice遗传相似系数变异范围分别为0.08~0.84和0.39~0.90。基于12个油茶品种在14个SSR位点的基因型差异,共选出45种SSR特征引物与其对应的基因型组合,即SSR特征引物-基因型,可作为11个油茶品种的SSR特征指纹,为品种鉴别提供分子依据。本研究也为在更大层面上建立油茶品种的DNA指纹数据库、为油茶品种的辅助选育、以及应用于DUS测试提供了技术思路。

11个芒果品种SSR指纹图谱的构建与品种鉴别

以11个有一定代表性的芒果品种为试材,从16对SSR引物中筛选14对多态性引物构建11个品种的指纹图谱。结果共检测出61个片段,其中多态性片段56个,每对引物可以检测到2～10个数目不等的片段,平均为4.4个,片段大小介于100～540bp之间。11个芒果品种的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各品种的特定图谱,单一多态性引物能将11个芒果品种区分为2～5个类型,平均为3.3个类型。14对多态性引物中不同的4对核心引物指纹图谱可以将11个品种区分开。

20个花生品种的SSR标记指纹图谱构建

为了保护农民以及育种者的利益,发展稳定可靠的品种鉴定方法具有重要意义。对南方花生主产区20个品种进行了SSR标记指纹图谱研究,从64对SSR标记引物中筛选出4对构建了20个花生品种的指纹图谱,该图谱能使19个品种相互区分。

花生新品种汕油21种子纯度SSR标记鉴定体系的建立和应用

为探索花生品种纯度的分子标记鉴定方法,采用SSR标记构建不同花生品种的指纹图谱。结果表明:利用3对SSR标记引物构建20个花生品种的指纹图谱,该图谱可以将汕油21与其它19个花生品种进行区分,这些品种包括汕油162、汕油212、汕油31、汕油33、汕油71、粤油5号、粤油7号、粤油29、粤油32、汕油27、汕油523、粤油9号、粤油13、粤油14、粤油79、粤油114、J11、仲恺花1号和泉608等;以3对SSR引物对汕油21繁育种子60个样品进行种子纯度检测,共有2对标记引物检测到3个杂株样品,该种子批的纯度为95.0%。因此,利用SSR标记构建花生品种指纹图谱并应用于汕油21品种纯度鉴定是可行的。

国产糖甜菜品种SSR指纹图谱的构建

为了构建14份国产甜菜品种的指纹图谱，利用6个差异较大的甜菜品系对50对SSR引物进行扩增，用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶对SSR-PCR产物进行分离，快速银染法进行染色，共选出7对多态性高、带型清晰、重复性好的SSR引物。利用这7对SSR引物对国产14份糖甜菜品种进行扩增，共获得40条谱带，其中多态性位点28个，多态性比率达75%；每对引物产生的等位基因数为5~8个，平均6.6个。利用其中3对引物S6、S13和BVGTT6构建了14份国产甜菜品种的DNA指纹图谱，结果表明，每个甜菜品种有唯一的数字指纹区别于其他品种，说明SSR标记适用于甜菜品种纯度和真实性的鉴定，同时甜菜品种指纹图谱库的构建也为将来可能出现的甜菜品种纠纷打下坚实的技术基础。

SSR分子标记在作物种质资源鉴定中的应用

介绍了SSR分子标记的特点及其在作物种质资源鉴定中的应用,主要包括亲缘关系鉴定、品种鉴定、真实性鉴定及纯度鉴定;提出了改进方法,并对其应用前景作了展望。

利用SSR标记构建湖南省审杂交水稻品种DNA指纹图谱

筛选出48对SSR引物对湖南省审定的77个杂交水稻品种进行了DNA分子指纹图谱构建和品种鉴定,成功建立了品种指纹图谱数据库,可有效进行杂交水稻品种鉴定。