Perl程序设计语言综述

Perl语言是在吸收了众多程序设计语言的长处基础之上发展起来的是一门优秀的程序设计语言,在很多领域都有所应用。论文试图对该语言作一个较为全面的介绍,并期待该语言能在我国的计算机应用领域得到广泛的应用。

基于Perl脚本的大豆核苷酸序列高通量提取

自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量分析,还可用于某个基因在全基因组中的所有序列分析。本研究分别对大豆第4染色体Glyma04g00930.1～Glyma04g01740.1区间的基因序列和水通道蛋白基因家族成员TIP(液泡膜水通道蛋白)序列进行提取。结果发现:Glyma04g00930.1～Glyma04g01740.1区间共含有112个基因序列;大豆全基因组共有91个TIP基因,在20条染色体上均有分布,且在第12染色体上分布最多,多达10个,暗示该染色体可能对大豆的水分利用效率起着重要作用,基因所含内含子数为1～8个。序列提取所用的2个脚本程序可以从http://www.zlhyd.com/sxbi/soybean_strict.rar下载。

利用Perl实现Linux下隐藏进程的查找

分析了LKM后门实现隐藏进程的机理。针对后门设计存在的缺陷,结合/proc文件系统特点,提出了一种按顺序遍历所有PID目录而找出全部进程的方法。再将结果与普通的进程查找输出作对比,可以发现隐藏的进程。最后给出采用Perl语言实现此查找功能的流程图。实验表明该方法能准确、有效地发现被LKM后门隐藏的进程。

基于Perl的本地网管无错失数据采集与处理

介绍了一种利用Perl程序语言实现电信本地网管无错失数据采集与处理的方法。该方法确保网管数据完整可靠 ,并能提高网管监控能力 ,具备编程简单灵活、运行可靠。

基于Perl语言的序列同源性分析过程自动化的实现

Perl语言已经成为用于生物信息学应用程序开发最流行的语言。为了简化本地的序列同源性分析过程,作者基于Perl语言设计开发了序列同源性分析的自动化程序,该程序具有无需编译、可移植性好、简单易用等优点,大大提高了工作效率,充分体现了Perl语言在生物信息学研究中所具备的优势。

Perl语言在群机系统中的应用

Perl语言是实用性很强的一门程序设计语言。本文介绍了Perl语言的特点、功能,以及Perl 语言的效率问题。另外,还讨论了该语言在群机系统领域,特别是系统管理软件中的重要应用。

基于Perl语言的含能材料耐热性能模拟

含能材料中聚合物的玻璃化转变温度(Tg)的高低可以作为其耐热性能的一个重要指标,为了方便快捷地使用Materials Studio分子模拟软件预测出含能材料中聚合物的Tg,在使用Materials Studio软件时引入Perl语言,开发了能自动进行升温的模拟程序,并在Perl语言环境下结合XML语言,设计与实现了一种基于XML的图形界面化的预测聚合物Tg的程序。以聚合物(PE)为算例预测了其Tg,实验结果表明该方法能自动、方便地对给定的分子模型进行阶段升温(降温)MD模拟,同时获得模型在不同温度下的密度,通过对模拟得到的密度-温度作图,可求得模型的Tg。其模拟结果与实验值相比,吻合得较好,表明该方法可以快速而有效地对聚合物的性能进行自动预测。

基于MySQL和Perl Fcgi的上海市农业专家网的建立

搜集整理了1996年以来有关出版著作中的上海市农业专家资料,通过问卷调查的方式,对部分专家的资料进行了添加和更新,采用MySQL-NT工具,建立了上海市农业专家数据库和数据更新维护方法,结合Perl Fcgi技术,最后建立了上海市农业专家网。该项工作初步建立了可让社会通过网络了解上海市农业专家的途径,为农业专题信息网络化的实现提供了一个范例。

Perl语言辅助的信息计量学研究

利用Perl语言的出色文本处理能力,以植物类分子生物学为题,以GenBank为数据源,进行信息计量学分析的应用研究。结果表明,Perl语言十分适用于信息计量学研究,能够从海量的GenBank数据库中挖掘整理出植物分子生物学的研究动态、研究热点、核心作者等信息,从而有助于在图书馆开展专题咨询服务。

Perl后端到JVM的移植

描述了Perl解释器的框架,介绍其后端虚拟机(Perl VM)的工作机理,给出了PVM所用到的栈、数据类型以及操作码函数(PP Code)在Java中的设计和实现,并陈述了在此移植中的几个关键问题及其解决方法。

基于Perl语言多文件上传的分析与实现

分析了基于WEB模式的文件上传的数据格式,并给出了采用Perl编程语言实现文件上传的代码及ASP+组件的编码。

Perl在Web上的应用

从正则表达式入手，阐述了Ｐｅｒｌ在文本处理上的强大功能，并结合Ｗｅｂ上的常见应用，给出了几个典型的 Ｐｅｒｌ ＣＧＩ脚本程序。

Perl语言环境下生物信息学的数据库技术

生物信息学是一个集成了生物学、数学和计算机科学的新兴学科.而Perl语言是一种在生物信息学研究领域功能强大的脚本语言.本文综述了在Perl语言环境下应用于生物信息学的数据库技术以及互联网应用.

FS2M01.pl,转换片段大小表为0/1矩阵的Perl脚本

用Perl语言编写了一个脚本———FS2M01.pl来实现片段大小表向0/1矩阵的转换,解决了由人工方法将遗传图谱的位点信息转换成0/1矩阵的问题。

用Perl语言实现Huffman编码

Perl是一种功能强大的编程语言.Hu ffm an编码是压缩文件的一种常用算法.采用Perl语言编程来产生Hu ffm an编码,并阐述了用Perl编写此程序的基本思想及其数据类型的使用技巧.最后根据此程序的输出结果,简要讨论并分析了Hu ffm an算法对文件的压缩率随字符种类及其出现频率的变化规律.

Perl中使用Win32::OLE模块读写Excel的方法

Perl最初是由Larry Wall为UNIX开发的一种脚本语言,随着World Wide Web的发展,Perl的用途有了极大的拓展。在功能强大的Win32移植版本出现之后,Perl成为Windows系统的脚本语言之一,特别是在系统管理、网站管理与编程方面大显身手。利用Perl的Win32::OLE模块进行Windows系统文件操作的实践步骤,以求得正确读写Excel文档的方法。

Perl语言环境下XML文档解析方法

数据准备是生物信息学研究中的重要步骤,数据准备过程中常常需要进行复杂的数据解析。本文详尽地描述了在Perl语言环境下如何利用XML::Smart模块对NCBI发布的同源基因数据集HomoloGene进行解析提取其中目标数据的方法及其技巧。对单个XML项目用对象实例->{‘项目名’}解析;对同层有多个项目的情况用对象数组解析。

基于Perl与CGI的报告自动生成方法研究

在大型实时处理系统的运行中会产生大量的运行状态数据资料,运行工程师需要通过运行状态报告分析处理结果及进行处理数据统计,以保证对系统进行切实有效的管理和维护。文章提出了一种运行状态报告自动生成的解决方案,该方案应用Perl程序提取运行状态报告文档所需的数据库和文本信息,同时与web应用集成开发出一个报告自动生成系统。该系统目前已在国家数据中心运行平台上稳定实施。

基于perl维护网络设备本地认证帐号的方法

大型网络运行着许多网络设备，网管员可以采用本地认证方式来登录到这些设备进行相关操作。对于大量设备和帐号信息，可使用Excel表来管理，但这些帐号信息必须同步到相关设备才有意义，若采用手工方式来同步既繁琐又费时。针对这个问题，借助perl脚本程序，基于该Excel表，对这些网络设备的用户帐号进行维护，不失为一种可行方法。

Perl&R在语料库语言学中的应用

语料库语言学需要从大规模文本提取语言特征,通过量化分析研究语言规律。现有语料库工具过于注重索引和检索功能,无法开展涉及复杂统计的多因素分析。通过3个基于语料库的研究实例,探讨编程语言Perl和R在研究方法层面的应用。结果表明,Perl和R能够处理大规模文本,进行多变量统计与可视化分析,可以弥补现有语料库软件的不足,帮助研究者分析数据与验证假设,为后续定性研究奠定基础。