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Rooting Abilities in <i>Vitis vinifera</i>L.: Total Lipid and Fatty Acids Evolution in Perle Noir Cutting
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作者 Henda Cheikhrouhou Manel Zrida Bechir Ezzili 《Agricultural Sciences》 2015年第5期498-504,共7页
Rooting ability in Vitis vinifera L. is the phenomena studied. The evolution of the total lipids contents and fatty acids amount of cuttings during the rooting were determined. Total lipid extraction was carried out b... Rooting ability in Vitis vinifera L. is the phenomena studied. The evolution of the total lipids contents and fatty acids amount of cuttings during the rooting were determined. Total lipid extraction was carried out by an extraction solvent consisting of a mixture of chloroform and methanol. Methylation of fatty acids was carried out by the boron trifluoride methanol complex. Their analysis is performed by gas chromatography. We have obtained a content of merithallus lipids equivalent with then in bibliography. In other hand 3 fatty acids were obtained: eicosapentaenoic acid, oleic acid and docosanoic acid. Among the studied of rooting abilities, we observed decreased levels of total lipids and in the essential fatty acids: eicosapentaenoic acid C20:5 n-3 and oleic acid C18:1 n-9. Minor fatty acids cuttings experimental have a variable evolution. Lipids and certain fatty acids may be markers of rooting in the vine. 展开更多
关键词 Lipids CUTTING Fatty Acids ROOTING perle Noir VITIS VINIFERA L.
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基于特定序列的长牡蛎视黄酸反应元件预测
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作者 李言柯 徐晓莹 +6 位作者 魏磊 黄宝玉 张美溦 韩怡静 刘雅琼 王晓梅 王晓通 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期398-406,共9页
视黄酸受体和核受体超家族中的大部分成员对细胞整个分化、增殖过程都具有调控功能。视黄酸受体结合配体后激活,通过结合靶基因启动子区特定的核苷酸序列调控靶基因表达。视黄酸受体结合序列是由核心序列[A/G]G[T/G]TCA间隔不同碱基构... 视黄酸受体和核受体超家族中的大部分成员对细胞整个分化、增殖过程都具有调控功能。视黄酸受体结合配体后激活,通过结合靶基因启动子区特定的核苷酸序列调控靶基因表达。视黄酸受体结合序列是由核心序列[A/G]G[T/G]TCA间隔不同碱基构成的重复序列,称为视黄酸反应元件。为了实现对长牡蛎基因组中含有的视黄酸反应元件的快速筛选预测,本研究利用Perl工具编写了一个可以批量筛选视黄酸反应元件的脚本,并对长牡蛎基因组中启动子区域序列进行筛选预测,共筛选到412个启动子区含有视黄酸反应元件的基因。随后,将这些基因在各种数据库中比对分析,预测其参与的生物学过程及可能的生物学功能。结果显示,大部分基因与蛋白质结合、核苷酸结合、水解酶活性、蛋白激酶活性等功能有关。 展开更多
关键词 长牡蛎 视黄酸受体 视黄酸反应元件 基因组 PERL
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土壤微生物群落磷脂脂肪酸生物标记分析程序PLFAEco 被引量:16
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作者 林营志 刘波 +1 位作者 张秋芳 傅秀荣 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第14期286-290,共5页
【研究目的】磷脂脂肪酸(PLFAs)是一个良好的生物标记物,可应用于土壤微生物群落多样性的定性定量分析。为提高研究分析效率,编写了生物标记辅助分析程序PLFAEco,提供基于PLFAs的微生物群落分析功能。【方法】基于MIDI公司的Sherlock脂... 【研究目的】磷脂脂肪酸(PLFAs)是一个良好的生物标记物,可应用于土壤微生物群落多样性的定性定量分析。为提高研究分析效率,编写了生物标记辅助分析程序PLFAEco,提供基于PLFAs的微生物群落分析功能。【方法】基于MIDI公司的Sherlock脂肪酸微生物鉴定系统,采用Perl为编程语言。【结果】程序PLFAEco可计算样品的微生物群落特性,包括Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)、McIntosh多样性指数(H3)、丰富度指数(S)、Pielou均匀度(J)、Simpson优势度指数(D)计算,执行聚类分析,主成份分析;计算对象可分别为样品或PLFAs;也可依用户设定以PLFAs组合代替单一PLFA为计算单元便于比较真菌、放线菌、细菌等微生物类群之间的关系;根据样品重复、处理信息进行均值和标准差计算;计算结果以包含图表的网页形式显示,提供CSV格式的数据文件供其它软件使用。【结论】程序PLFAEco扩展了Sherlock系统在微生物群落分析方面的功能,避免了手工利用该系统带来的磷脂脂肪酸数据提取、数据矩阵构建、统计计算等复杂而繁重的工作。具有操作方便、速度快的特点,能满足大多数情况下的需求,已在烟田土壤、发酵床养猪场垫料的微生物群落分析中得到了验证。程序及手册、示例位于网站www.dagri.org。 展开更多
关键词 土壤 微生物群落 磷脂脂肪酸 PERL R语言
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利用Ontology和规则表达式的Web信息抽取 被引量:9
4
作者 张成洪 王向安 古晓洪 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期58-60,共3页
借助Ontology,基于成熟的Perl字符处理规则,提出了一种规则表达式方案来满足Web页面信息的抽取、转换和集成。介绍了实现过程。
关键词 本体论 XML 规则表达式 PERL
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高精度GPS数据在线处理系统的研究 被引量:7
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作者 叶虎春 聂桂根 +1 位作者 杨建会 孙传胜 《测绘通报》 CSCD 北大核心 2013年第5期16-19,53,共5页
介绍国外几个主要GPS在线数据处理服务系统及其局限性。基于Bernese软件,利用Apache Web服务器软件和Perl开发语言及HTML语言,开发出一套高精度GPS数据在线处理系统;论述该系统的系统结构、功能设计和具体实现,并通过实例验证该系统的... 介绍国外几个主要GPS在线数据处理服务系统及其局限性。基于Bernese软件,利用Apache Web服务器软件和Perl开发语言及HTML语言,开发出一套高精度GPS数据在线处理系统;论述该系统的系统结构、功能设计和具体实现,并通过实例验证该系统的可靠性,同时介绍该系统在连续运行参考站系统(CORS)中的应用。 展开更多
关键词 系统结构 Bernese软件 PERL 在线数据处理
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电子基因表达谱分析平台的建立及其应用 被引量:3
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作者 徐静 吕炳建 +4 位作者 张昊 陈俭 朱益民 谷雪梅 来茂德 《浙江大学学报(工学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第2期186-191,共6页
建立了利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)序列表达标签(EST)数据库(dbEST)电子EST构建特定组织电子基因表达谱的生物信息学分析平台,并利用该平台构建了人正常结直肠组织电子基因表达谱.从dbEST获取人正常结直肠电子EST 20 370条,利... 建立了利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)序列表达标签(EST)数据库(dbEST)电子EST构建特定组织电子基因表达谱的生物信息学分析平台,并利用该平台构建了人正常结直肠组织电子基因表达谱.从dbEST获取人正常结直肠电子EST 20 370条,利用自行开发的GetUni程序包,与下载于本地的人类同一基因转录子(UniGene)数据库匹配,获得了含有4 196个非冗余基因的正常结直肠组织电子基因表达谱.经在线基因组分析工具(Webgestalt)证实,表达谱中97%的基因在结直肠组织中表达,除涉及细胞生长、发育、分化、凋亡等基因外,还包括人正常结直肠功能特异性基因;3%未得到Webgestalt证实的基因经手工回溯查找,确证其EST均来自人正常结直肠.GetUni程序包是一个高效准确的高通量电子EST数据分析平台,构建的人正常结直肠组织基因表达谱将为结直肠特异性标志物的筛选提供大量数据. 展开更多
关键词 dbEST UNIGENE 结直肠 基因表达谱 生物信息学 PERL 5.0 GetUni程序包
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Perl程序设计语言综述 被引量:7
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作者 刘步权 廖湘科 吴庆波 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2002年第18期86-87,141,共3页
Perl语言是在吸收了众多程序设计语言的长处基础之上发展起来的是一门优秀的程序设计语言,在很多领域都有所应用。论文试图对该语言作一个较为全面的介绍,并期待该语言能在我国的计算机应用领域得到广泛的应用。
关键词 PERL语言 程序设计语言 面向对象 模块化设计
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MRTG的研究与部署 被引量:15
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作者 孙泳 史忠植 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2004年第3期22-24,共3页
研究了目前广泛应用的一款开放源码网络系统监控软件———MRTG,介绍了它的工作原理及其组成结构,详细阐述了每个部分的实现方法。给出了网络分布部署MRTG的方案,并介绍了通过它监控端口流量和主机资源的配置方法。
关键词 网络系统监控 MRTG SNMP PERL
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基于Perl脚本的大豆核苷酸序列高通量提取 被引量:3
9
作者 张大勇 王长彪 +2 位作者 易金鑫 何晓兰 马鸿翔 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期7-13,共7页
自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量... 自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量分析,还可用于某个基因在全基因组中的所有序列分析。本研究分别对大豆第4染色体Glyma04g00930.1~Glyma04g01740.1区间的基因序列和水通道蛋白基因家族成员TIP(液泡膜水通道蛋白)序列进行提取。结果发现:Glyma04g00930.1~Glyma04g01740.1区间共含有112个基因序列;大豆全基因组共有91个TIP基因,在20条染色体上均有分布,且在第12染色体上分布最多,多达10个,暗示该染色体可能对大豆的水分利用效率起着重要作用,基因所含内含子数为1~8个。序列提取所用的2个脚本程序可以从http://www.zlhyd.com/sxbi/soybean_strict.rar下载。 展开更多
关键词 大豆全基因组 序列提取 序列分析 液泡膜水通道蛋白 Perl程序
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利用荧光定量聚合酶链反应检测小鼠纹状体中Per1基因的表达规律 被引量:3
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作者 蔡彦宁 左晓虹 +3 位作者 刘姝 谢淑 温玫 陈彪 《首都医科大学学报》 CAS 2006年第1期63-65,共3页
目的建立定量检测Per1 mRNA表达水平的系统,并检测小鼠纹状体中该基因的表达规律。方法提取小鼠纹状体总RNA,用Per1基因特异性引物进行聚合酶链反应(PCR),以荧光染料SYBR green I法进行实时检测。结果确定了Per1基因荧光定量的扩增和检... 目的建立定量检测Per1 mRNA表达水平的系统,并检测小鼠纹状体中该基因的表达规律。方法提取小鼠纹状体总RNA,用Per1基因特异性引物进行聚合酶链反应(PCR),以荧光染料SYBR green I法进行实时检测。结果确定了Per1基因荧光定量的扩增和检测参数。证明在此条件下无非特异扩增,并且扩增效率在90%以上。利用此检测体系发现小鼠纹状体内Per1基因的表达呈节律性波动。结论所建立的方法能够定量测定Per1 mRNA表达水平,具有灵敏度高,线性范围广的特点。纹状体中Per1基因表达的节律性波动提示黑质纹状体系统间的相互调节可能具有昼夜节律性差异。 展开更多
关键词 PERL 实时定量RT—PCR SYBR green I 纹状体
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构建集成的Linux内核防火墙 被引量:9
11
作者 郑小军 赵轶群 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2003年第12期101-104,117,共5页
首先介绍了基于最新Linux内核的防火墙技术netfilter框架结构,包括包过滤防火墙、代理服务器、完全状态检测技术、NAT、DMZ的概念、原理和用途,以及在Linux中具体实现的方法。着重探讨了一个用Perl/CGI编写的集成的WebAdmin来构建一个... 首先介绍了基于最新Linux内核的防火墙技术netfilter框架结构,包括包过滤防火墙、代理服务器、完全状态检测技术、NAT、DMZ的概念、原理和用途,以及在Linux中具体实现的方法。着重探讨了一个用Perl/CGI编写的集成的WebAdmin来构建一个集成的带有状态检测功能的防火墙系统,该系统可以通过WebAdmin管理界面来进行本地/远程配置管理整个防火墙的策略,并提供了包括对于ADSL服务获得的动态IP地址的支持,DNS代理的集成,日志的记录,连接追踪,并特别集成了一个PPTPVPN的功能,使得该系统成为一个all in one的防火墙系统。 展开更多
关键词 防火墙 LINUX NETFILTER 包过滤 NAT DMZ Perl/CGI VPN
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基于校园网的信息发布的研究与开发 被引量:2
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作者 道焰 何海涛 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第z1期117-121,共5页
介绍基于WWW的网上信息发布的实现方法和技术路线,重点探讨了数据库技术和IIS、ASP、CGI、APACHE等。
关键词 WWW CGI PERL IIS ISP 信息发布
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肿瘤细胞节律基因对其药物敏感性的影响 被引量:1
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作者 段志青 要然 +5 位作者 薛建新 赵京卉 朱小云 汪宇辉 刘延友 王正荣 《航天医学与医学工程》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期76-78,共3页
目的通过体外实验诱导节律基因表达,探讨肿瘤细胞节律基因对其药物敏感性的影响。方法采用12-十四酸佛波酯-13-乙酸盐(PMA)诱导体外培养的EMT6乳腺癌细胞节律基因的表达;在不同时间点,以RT-PCR检测节律基因的代表mPer1基因的表达水平。... 目的通过体外实验诱导节律基因表达,探讨肿瘤细胞节律基因对其药物敏感性的影响。方法采用12-十四酸佛波酯-13-乙酸盐(PMA)诱导体外培养的EMT6乳腺癌细胞节律基因的表达;在不同时间点,以RT-PCR检测节律基因的代表mPer1基因的表达水平。在mPer1基因表达的高峰与低谷分别给予阿霉素(ADM)处理。采用二甲基噻唑二苯基四唑嗅蓝(MTT)法和流式细胞术检测ADM对EMT6细胞增殖的影响。结果PMA诱导后,EMT6细胞的mPer1基因呈近日节律。在mPer1基因表达高峰时,ADM对肿瘤细胞的抑制率高于其在低谷的抑制率。结论肿瘤细胞节律基因能够影响其对药物的敏感性。 展开更多
关键词 近日节律 Perl基因 EMT6细胞 阿霉素 细胞增殖
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全基因组预测目标基因的新方法及其应用 被引量:1
14
作者 张菁晶 冯晶 +1 位作者 朱英国 李阳生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1299-1305,共7页
运用隐马尔可夫模型,利用Perl编程,以几种模式生物的蛋白质数据库为基础,构建了目标基因的全基因组预测的新方法。该方法具有高通量,准确度高且操作简易等优点,特别在多结构域蛋白家族预测上更显优势。应用该方法对几种模式生物的全基因... 运用隐马尔可夫模型,利用Perl编程,以几种模式生物的蛋白质数据库为基础,构建了目标基因的全基因组预测的新方法。该方法具有高通量,准确度高且操作简易等优点,特别在多结构域蛋白家族预测上更显优势。应用该方法对几种模式生物的全基因组PPR和TPR蛋白家族进行了预测,其中粳稻日本晴中含有536个PPR蛋白、199个TPR蛋白;籼稻9311中含有519个PPR蛋白、177个TPR蛋白;拟南芥中含有735个PPR蛋白、292个TPR蛋白;红藻中6个PPR蛋白、32个TPR蛋白;蓝细菌以及古细菌中没有PPR蛋白,但蓝细菌含有10个TPR蛋白,古细菌有4个TPR蛋白,并对所得结果进行了进一步生物信息学分析。 展开更多
关键词 基因预测 PERL HMM 全基因组 PPR TPR
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三七总皂甙对脑出血大鼠脑内铁离子影响的实验研究 被引量:7
15
作者 张俊敏 朱培纯 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 2000年第8期43-47,共5页
目的 :观察三七总皂甙对脑出血后脑内铁离子的影响。方法 :用胶原酶注入 Wistar大鼠尾壳核造成脑出血模型 ,将其分为给药组和对照组 ,给药组每天腹腔注射三七总皂甙针剂 0 .5ml生理盐水 ,对照组给以 1 ml生理盐水 ,分别于造膜后 1 d、3d... 目的 :观察三七总皂甙对脑出血后脑内铁离子的影响。方法 :用胶原酶注入 Wistar大鼠尾壳核造成脑出血模型 ,将其分为给药组和对照组 ,给药组每天腹腔注射三七总皂甙针剂 0 .5ml生理盐水 ,对照组给以 1 ml生理盐水 ,分别于造膜后 1 d、3d、7d和 40 d取材 ,其组织切生用 perls's法观察脑出血后脑内铁离子分布变化。结果 :脑出血后 1 d,出血灶内反应比较弱 ,脑出血 3d后 ,反应迅速增强 ,主要在出血灶及其周围、黑质、尾壳核等区域表达 ,脑出血后 7d反应最为强烈 ,40 d时减弱 ,接近于正常动物脑内铁离子水平。给药组铁离子在各个时段均比对照组表达强度低 ,表达范围小。三七总皂甙在脑出血后 1 d到 40 展开更多
关键词 脑出血 铁离子 Perls’s反应 三七总皂甙
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基于Perl的本地网管无错失数据采集与处理 被引量:2
16
作者 成志明 陈光东 段三丁 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2003年第z1期83-85,共3页
介绍了一种利用Perl程序语言实现电信本地网管无错失数据采集与处理的方法。该方法确保网管数据完整可靠 ,并能提高网管监控能力 ,具备编程简单灵活、运行可靠。
关键词 业务支撑系统 电信管理网 PERL 无错失数据采集
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基于Web的高性能瘦客户/服务器网络计算模式的实现 被引量:3
17
作者 谢珩 卢显良 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2006年第7期239-241,共3页
在B/S(Browser/Server)模式和T/S(Thin-client/Server)体系的基础上,使用MVC设计方法,对B/S模式的三层模型进行改进,使B/S模式业务逻辑的输入、输出和数据表示进一步分离,实现了一种基于W eb的瘦客户/服务器网络计算模式。系统采用Perl... 在B/S(Browser/Server)模式和T/S(Thin-client/Server)体系的基础上,使用MVC设计方法,对B/S模式的三层模型进行改进,使B/S模式业务逻辑的输入、输出和数据表示进一步分离,实现了一种基于W eb的瘦客户/服务器网络计算模式。系统采用Perl脚本作为CG I程序,在Apache服务器中嵌入Mod_perl运行方式,以开放源码的BerkeleyDB作为数据库,进一步提升了服务器性能。该系统在B/S结构的基础上,提高了设计、开发的灵活性、可复用性和可维护性,具有低开销、高效率等一系列特点。 展开更多
关键词 T/S(Thin-client/Server)模式 CGI Mod—perl MVC模式 BERKELEYDB
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利用Perl实现Linux下隐藏进程的查找 被引量:1
18
作者 袁源 戴冠中 罗红 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第3期102-105,共4页
分析了LKM后门实现隐藏进程的机理。针对后门设计存在的缺陷,结合/proc文件系统特点,提出了一种按顺序遍历所有PID目录而找出全部进程的方法。再将结果与普通的进程查找输出作对比,可以发现隐藏的进程。最后给出采用Perl语言实现此查找... 分析了LKM后门实现隐藏进程的机理。针对后门设计存在的缺陷,结合/proc文件系统特点,提出了一种按顺序遍历所有PID目录而找出全部进程的方法。再将结果与普通的进程查找输出作对比,可以发现隐藏的进程。最后给出采用Perl语言实现此查找功能的流程图。实验表明该方法能准确、有效地发现被LKM后门隐藏的进程。 展开更多
关键词 LINUX LKM后门 隐藏进程 PID PERL
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Linux下的数据库MYSQL访问技术 被引量:3
19
作者 冯祖洪 李映姝 《现代电子技术》 2001年第4期7-10,共4页
介绍用 C语言、PERL语言访问 Linux操作系统下 MYSQL数据库的方法和步骤 ,并给出实际的例子。
关键词 数据库 LINUX MYSQL PERL语言 C语言
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英语教材编写过程特定内容的高亮显示 被引量:1
20
作者 熊文新 陈国华 许家金 《现代教育技术》 CSSCI 2008年第2期97-100,共4页
针对大学英语教材编写中的词语/词组控制问题,采用Perl和VB/VBA在Word环境下设计了一个特定词语、词组高亮凸显的计算机辅助标注系统。系统分为离线生词抽取和在线实际标注两个步骤,界面友好,稍加扩展适合各类语言类教材的编写。
关键词 凸显 教材编写 词语控制 PERL VisualBasic/VBA
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