新疆野扁桃自交不亲和基因SBP1的克隆及序列分析

SBP1 (S-RNase-binding protein 1)是新疆野扁桃自交不亲和作用中的关键基因,本研究对新疆野扁桃SBP1基因进行克隆及序列分析。根据前期查询的近缘物种查考序列,预测新疆野扁桃的序列设计引物。以新疆野扁桃花粉cDNA为模板,利用RACE等分子生物学技术方法,克隆获得了一个新的SBP1基因全长序列。对新疆野扁桃SBP1氨基酸序列与其它植物间相应片段进行同源比对和系统进化分析,并对该基因所编码蛋白的理化性质,跨膜结构、二级结构等方面进行了有关的预测和分析。显示PetSBP1基因核苷酸序列全部长度为1 211 bp,PetSBP1编码蛋白所含有的氨基酸个数为338,相对分子质量38 281.25,等电点为5.29。其编码的氨基酸序列与甜樱桃具有较近的亲缘关系,与马铃薯、拟南芥亲缘关系较远。本次实验首次从新疆野扁桃上克隆出SBP1,为该基因在今后研究、培育自交亲和品种提供理论依据。