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不同引物及数据分析方法对定量PCR结果的影响
被引量:
16
1
作者
刘正霞
徐阳
+3 位作者
徐进梅
杨明夏
马磊
朱昌亮
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第8期1112-1117,共6页
目的:研究不同引物及数据分析方法对实时荧光定量PCR SYBR Green染料法检测基因表达差异结果分析的影响。方法:通过Primer Express 2.0软件对目的基因CCND1、C-JUN分别设计4对不同引物进行SYBR Green染料法定量PCR扩增,并分别使用2-△...
目的:研究不同引物及数据分析方法对实时荧光定量PCR SYBR Green染料法检测基因表达差异结果分析的影响。方法:通过Primer Express 2.0软件对目的基因CCND1、C-JUN分别设计4对不同引物进行SYBR Green染料法定量PCR扩增,并分别使用2-△△CT法、Pfaffl法及相对标准曲线法计算肺癌紫杉醇敏感细胞株及耐药细胞株间目的基因的表达差异,分析不同引物和数据计算方法对实验结果的影响。结果:统计学分析表明,引物的扩增效率对定量PCR结果分析有显著影响,不同引物特异性扩增得到的样本间表达倍数有显著差异(P<0.05)。3种计算方法中,Pfaffl法与相对标准曲线法无统计学差异(P>0.05),而2-△△CT法与其他2种方法均有显著差异(P<0.05)。结论:引物的选择对于定量PCR结果有显著影响;Pfaffl法是更准确,更合理的相对定量计算方法。
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关键词
实时荧光定量PCR
2^-△△CT
法
pfaffl法
相对标准曲线
法
扩增效率
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职称材料
题名
不同引物及数据分析方法对定量PCR结果的影响
被引量:
16
1
作者
刘正霞
徐阳
徐进梅
杨明夏
马磊
朱昌亮
机构
南京医科大学病原生物学系
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第8期1112-1117,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30671827和30628022)
科技部自然资源平台项目(2005DKA21104)
文摘
目的:研究不同引物及数据分析方法对实时荧光定量PCR SYBR Green染料法检测基因表达差异结果分析的影响。方法:通过Primer Express 2.0软件对目的基因CCND1、C-JUN分别设计4对不同引物进行SYBR Green染料法定量PCR扩增,并分别使用2-△△CT法、Pfaffl法及相对标准曲线法计算肺癌紫杉醇敏感细胞株及耐药细胞株间目的基因的表达差异,分析不同引物和数据计算方法对实验结果的影响。结果:统计学分析表明,引物的扩增效率对定量PCR结果分析有显著影响,不同引物特异性扩增得到的样本间表达倍数有显著差异(P<0.05)。3种计算方法中,Pfaffl法与相对标准曲线法无统计学差异(P>0.05),而2-△△CT法与其他2种方法均有显著差异(P<0.05)。结论:引物的选择对于定量PCR结果有显著影响;Pfaffl法是更准确,更合理的相对定量计算方法。
关键词
实时荧光定量PCR
2^-△△CT
法
pfaffl法
相对标准曲线
法
扩增效率
Keywords
quantitative real-time PCR
2(-DehaDeltaC(T)) method
pfaffl
method
relative standand curve method
amplification efficiency
分类号
R781 [医药卫生—口腔医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同引物及数据分析方法对定量PCR结果的影响
刘正霞
徐阳
徐进梅
杨明夏
马磊
朱昌亮
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2009
16
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