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基于分子模拟方法预测PIP_(2)在双孔钾通道TREK-1上结合位点的研究
被引量:
1
1
作者
雷晓彤
金怡卿
孟烜宇
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期2550-2557,共8页
磷脂酰肌醇4,5-二磷酸酯(PIP_(2))是一类分布在质膜内层的信号磷脂分子,对钾、钠和氯等离子通道和转运蛋白等多种跨膜蛋白具有调节作用. TREK-1是一类重要的背景钾通道,受温度、机械拉伸及胞内pH等多种因素调节, PIP_(2)在特定浓度范围...
磷脂酰肌醇4,5-二磷酸酯(PIP_(2))是一类分布在质膜内层的信号磷脂分子,对钾、钠和氯等离子通道和转运蛋白等多种跨膜蛋白具有调节作用. TREK-1是一类重要的背景钾通道,受温度、机械拉伸及胞内pH等多种因素调节, PIP_(2)在特定浓度范围内可激活TREK-1通道,在内面向外膜片钳记录TREK-1通道电流中使用PIP_(2)抗结剂(如多聚赖氨酸)可导致TREK-1通道关闭.利用分子对接和全原子分子动力学模拟探索了PIP_(2)与双孔钾通道TREK-1的相互作用.分子对接计算结果表明, PIP_(2)在TREK-1通道上有两个可能的结合位点.进一步的分子动力学模拟和均力势(PMF)计算结果表明,其中位于螺旋M4和螺旋M1的位点可能是PIP_(2)激活TREK-1的优先结合位点.模拟展示了PIP_(2)与TREK-1结合的可能构象. PIP_(2)的肌醇头部磷酸根与位于M1和M4上的碱性残基K45, K304和R311形成稳定盐桥;M1螺旋上的一系列疏水残基对稳定PIP_(2)的脂肪长链具有关键作用.
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关键词
TREK-1通道
磷脂酰肌醇
4
5
-二磷酸酯
分子对接
分子动力学模拟
均力势
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职称材料
腺苷及其类似物对猪红细胞膜上磷脂酰肌醇磷酸化的抑制作用
2
作者
陈庆辉
梁念慈
《生物化学杂志》
CSCD
1989年第6期543-548,共6页
本文研究了腺苷及其类似物对猪红细胞膜上磷脂酰肌醇磷酸化的影响。研究结果表明:1、腺苷对磷脂酰肌醇磷酸化有明显的抑制作用,IC_(50)=15μmol/L;动力学分析表明,这种抑制作用机理是与ATP竞争性的;2、腺嘌呤、AMP、ADP、5'-氯-5'-脱...
本文研究了腺苷及其类似物对猪红细胞膜上磷脂酰肌醇磷酸化的影响。研究结果表明:1、腺苷对磷脂酰肌醇磷酸化有明显的抑制作用,IC_(50)=15μmol/L;动力学分析表明,这种抑制作用机理是与ATP竞争性的;2、腺嘌呤、AMP、ADP、5'-氯-5'-脱氧腺苷、阿糖腺苷、2'-脱氧腺苷对磷脂酰肌醇磷酸化有不同程度的抑制作用;3、cAMP对磷脂酰肌醇磷酸化也有抑制作用,这提示了cAMP与肌醇脂质信使系统有联系;5、6-氯-嘌呤核苷(100μmol/L)对该磷酸化无显著抑制作用。
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关键词
腺苷
磷脂酰肌醇
磷酸化
腺苷类似物
磷脂酰肌醇-
4
-磷酸
磷脂酰肌醇-
4
5
-二磷酸
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职称材料
题名
基于分子模拟方法预测PIP_(2)在双孔钾通道TREK-1上结合位点的研究
被引量:
1
1
作者
雷晓彤
金怡卿
孟烜宇
机构
苏州大学医学部放射医学与防护学院
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期2550-2557,共8页
基金
国家自然科学基金(批准号:21503140)资助。
文摘
磷脂酰肌醇4,5-二磷酸酯(PIP_(2))是一类分布在质膜内层的信号磷脂分子,对钾、钠和氯等离子通道和转运蛋白等多种跨膜蛋白具有调节作用. TREK-1是一类重要的背景钾通道,受温度、机械拉伸及胞内pH等多种因素调节, PIP_(2)在特定浓度范围内可激活TREK-1通道,在内面向外膜片钳记录TREK-1通道电流中使用PIP_(2)抗结剂(如多聚赖氨酸)可导致TREK-1通道关闭.利用分子对接和全原子分子动力学模拟探索了PIP_(2)与双孔钾通道TREK-1的相互作用.分子对接计算结果表明, PIP_(2)在TREK-1通道上有两个可能的结合位点.进一步的分子动力学模拟和均力势(PMF)计算结果表明,其中位于螺旋M4和螺旋M1的位点可能是PIP_(2)激活TREK-1的优先结合位点.模拟展示了PIP_(2)与TREK-1结合的可能构象. PIP_(2)的肌醇头部磷酸根与位于M1和M4上的碱性残基K45, K304和R311形成稳定盐桥;M1螺旋上的一系列疏水残基对稳定PIP_(2)的脂肪长链具有关键作用.
关键词
TREK-1通道
磷脂酰肌醇
4
5
-二磷酸酯
分子对接
分子动力学模拟
均力势
Keywords
TREK-1 channel
phosphatidylinositol 4
,
5
-bisphosphate
(
pip
_(2))
Molecular docking
Molecular dynamics simulation
Potential of mean force(PMF)
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
腺苷及其类似物对猪红细胞膜上磷脂酰肌醇磷酸化的抑制作用
2
作者
陈庆辉
梁念慈
机构
湛江医学院生化教研室
出处
《生物化学杂志》
CSCD
1989年第6期543-548,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目
文摘
本文研究了腺苷及其类似物对猪红细胞膜上磷脂酰肌醇磷酸化的影响。研究结果表明:1、腺苷对磷脂酰肌醇磷酸化有明显的抑制作用,IC_(50)=15μmol/L;动力学分析表明,这种抑制作用机理是与ATP竞争性的;2、腺嘌呤、AMP、ADP、5'-氯-5'-脱氧腺苷、阿糖腺苷、2'-脱氧腺苷对磷脂酰肌醇磷酸化有不同程度的抑制作用;3、cAMP对磷脂酰肌醇磷酸化也有抑制作用,这提示了cAMP与肌醇脂质信使系统有联系;5、6-氯-嘌呤核苷(100μmol/L)对该磷酸化无显著抑制作用。
关键词
腺苷
磷脂酰肌醇
磷酸化
腺苷类似物
磷脂酰肌醇-
4
-磷酸
磷脂酰肌醇-
4
5
-二磷酸
Keywords
Adenosine
phosphatidylinositol
(PI)
Phosphorylation
Adenosine analogues
phosphatidylinositol
=
4
-phosphate(
pip
)
phosphatidylinositol
-
4
,
5
-bisphosphate
(
pip
_(2))
分类号
R963 [医药卫生—微生物与生化药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于分子模拟方法预测PIP_(2)在双孔钾通道TREK-1上结合位点的研究
雷晓彤
金怡卿
孟烜宇
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
下载PDF
职称材料
2
腺苷及其类似物对猪红细胞膜上磷脂酰肌醇磷酸化的抑制作用
陈庆辉
梁念慈
《生物化学杂志》
CSCD
1989
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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