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小立碗藓泛素连接酶U-box家族的鉴定及表达分析
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作者 吴小嫒 姜山 +1 位作者 陈波 闫慧清 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1678-1688,共11页
U-box家族编码E3泛素连接酶能够特异性识别底物,从而调控蛋白的修饰和降解过程。为鉴定小立碗藓U-box家族成员,分析其生物学特征及基因表达规律,该研究基于小立碗藓的全基因组测序数据,通过生物信息学技术对泛素连接酶U-box家族成员的... U-box家族编码E3泛素连接酶能够特异性识别底物,从而调控蛋白的修饰和降解过程。为鉴定小立碗藓U-box家族成员,分析其生物学特征及基因表达规律,该研究基于小立碗藓的全基因组测序数据,通过生物信息学技术对泛素连接酶U-box家族成员的理化性质、进化关系、顺式作用元件、组织表达模式、胁迫响应等进行了分析。结果表明:(1)在小立碗藓全基因组中共鉴定得到31个U-box家族成员,并且不均匀地分布于14条染色体上;其分子量大小在37.75~117.49 kDa之间,等电点介于5.32~8.55之间。(2)进化树显示,小立碗藓的U-box家族成员分布在I-IX亚家族中,其中亚家族VII含有小立碗藓成员最多,共11个(约占36.67%),说明小立碗藓在历史进化过程中具有高度保守性且功能多样化。(3)经启动子分析发现,小立碗藓U-box家族成员具有结合GA和ABA等多个激素的元件。(4)组织表达分析发现小立碗藓U-box家族成员主要在绿丝体、轴丝体和孢子体S3时期大量表达。(5)通过ABA、甘露醇和饱和LiCl处理后发现,配子体的拟茎均发生黄化且PpPUB21的表达量均被显著诱导。推测小立碗藓U-box家族成员在生长发育和响应逆境胁迫中发挥着重要作用,这为后续深入研究小立碗藓U-box家族成员的基因功能研究奠定了理论基础,也为其相关研究提供了参考。 展开更多
关键词 小立碗藓 U-box家族 基因表达 功能分析 全基因组鉴定
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不同培养基及酶对立碗藓原丝体的作用研究 被引量:18
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作者 李艳红 宋秀珍 张便勤 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期192-196,共5页
采用含不同成分的MS培养基处理立碗藓的原丝体 ,发现随蔗糖浓度的提高原丝体的生长相对趋于老化 ;当培养基中附加不同浓度的 2 ,4 D和 6 BA时 ,1 0日龄的原丝体出现了明显变化 ,当二者浓度均为 0 .5mg·L 1 ,幼嫩的原丝体上能长出... 采用含不同成分的MS培养基处理立碗藓的原丝体 ,发现随蔗糖浓度的提高原丝体的生长相对趋于老化 ;当培养基中附加不同浓度的 2 ,4 D和 6 BA时 ,1 0日龄的原丝体出现了明显变化 ,当二者浓度均为 0 .5mg·L 1 ,幼嫩的原丝体上能长出疏松易碎的白绿色愈伤组织。利用 1 %纤维素酶和 0 .8%的果胶酶分别处理 1 0日龄、2 0日龄的原丝体和 1 0日龄的茎叶体的叶片 2~ 1 0h ,结果发现1 0日龄的原丝体在酶解 2h后能游离出大量的原生质体 ;而 2 0日龄的原丝体效果较差 ,只能游离出极少量的原生质体 ;对于 1 0日龄的茎叶体酶解 1 0h仍看不到原生质体游离出来。这表明立碗藓原丝体对不同的外界条件可产生不同的反应 。 展开更多
关键词 培养基 立碗藓 原丝体 原生质体 苔藓植物
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小立碗藓PpCAD4基因敲除载体的构建及功能研究
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作者 田旭 闫慧清 +3 位作者 刘露 谢丽 成亮 姜山 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第3期423-428,共6页
木质素是植物抵御外界环境的重要成分,肉桂醇脱氢酶(cinnamic alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素合成途径中的关键酶和限速酶之一。前期数据表明,在灰霉菌侵染下,PpCAD4基因上调表达,但PpCAD4功能尚未明确。本次研究利用同源重组原理... 木质素是植物抵御外界环境的重要成分,肉桂醇脱氢酶(cinnamic alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素合成途径中的关键酶和限速酶之一。前期数据表明,在灰霉菌侵染下,PpCAD4基因上调表达,但PpCAD4功能尚未明确。本次研究利用同源重组原理构建PpCAD4.1-PTN182-PpCAD4.2敲除载体,从而破坏PpCAD4的alcohol dehydrogenase GroES-like domain(ADH_N)和zinc-binding dehydrogenase(ADH_zinc_N)结构域。利用PGE 6000介导小立碗藓原生质体转化,筛选并鉴定得到敲除PpCAD4突变体植株。qRT-PCR表明,敲除型植株中PpCAD4的表达量相对野生型减少了84%。通过对配子体的形态观察发现,PpCAD4突变株通过增加配子体中拟叶的数量,使得植株生物量增加,这表明CAD4在早期陆生植物的生长发育中起着重要作用。用灰霉菌侵染小立碗藓发现,0.5 d后野生型配子体菌丝入侵率为15%,cad4-ko菌丝入侵率为40%。侵染1 d后,Ppcad4-ko配子体菌丝侵入率是野生型的2倍。表明PpCAD4能够增加小立碗藓对真菌病原菌的抗性。 展开更多
关键词 木质素 肉桂醇脱氢酶 小立碗藓 PpCAD4 基因敲除 灰霉菌
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新疆葫芦藓科立碗藓属一新记录种——球蒴立碗藓
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作者 沙毕热木.斯热义力 张龙锋 +2 位作者 美丽排提.玉素甫 阿提古丽.毛拉 买买提明.苏来曼 《华中师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第1期75-79,共5页
该文报道了葫芦藓科(Funariaceae)立碗藓属一新疆新记录种—立碗藓[Physcomitrium sphaericum(Ludw.)Fürnr.].通过光学显微镜和扫描电子显微镜对植株体、叶片、茎、孢蒴、孢子等重要结构进行拍照,并对其特征进行描述.
关键词 立碗藓 新记录 新疆
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Divergence of trafficking and polarization mechanisms for PIN auxin transporters during land plant evolution
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作者 Han Tang Kuan-Ju Lu +3 位作者 YuZhou Zhang You-Liang Cheng Shih-Long Tu Jiri Friml 《Plant Communications》 SCIE CSCD 2024年第1期116-129,共14页
The phytohormone auxin,and its directional transport through tissues,plays a fundamental role in the development of higher plants.This polar auxin transport predominantly relies on PIN-FORMED(PIN)auxin exporters.Hence... The phytohormone auxin,and its directional transport through tissues,plays a fundamental role in the development of higher plants.This polar auxin transport predominantly relies on PIN-FORMED(PIN)auxin exporters.Hence,PIN polarization is crucial for development,but its evolution during the rise of morpho-logical complexity in land plants remains unclear.Here,we performed a cross-species investigation by observing the trafficking and localization of endogenous and exogenous PINs in two bryophytes,Physco-mitrium patens and Marchantia polymorpha,and in theflowering plant Arabidopsis thaliana.We confirmed that the GFP fusion did not compromise the auxin export function of all examined PINs by using a radioac-tive auxin export assay and by observing the phenotypic changes in transgenic bryophytes.Endogenous PINs polarize tofilamentous apices,while exogenous Arabidopsis PINs distribute symmetrically on the membrane in both bryophytes.In the Arabidopsis root epidermis,bryophytic PINs have no defined polarity.Pharmacological interference revealed a strong cytoskeletal dependence of bryophytic but not Arabidopsis PIN polarization.The divergence of PIN polarization and trafficking is also observed within the bryophyte clade and between tissues of individual species.These results collectively reveal the divergence of PIN traf-ficking and polarity mechanisms throughout land plant evolution and the co-evolution of PIN sequence-based and cell-based polarity mechanisms. 展开更多
关键词 ARABIDOPSIS evolution MARCHANTIA physcomitrium PINS POLARIZATION protein trafficking
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Parallel evolution of twoAIM24 protein subfamilies and their conserved functions in ER stress tolerance in land plants
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作者 Yanlong Guan Guanxiao Chang +9 位作者 Jinjie Zhao Qia Wang Jiali Qin Mengmeng Tang Shuanghua Wang Lan Ma Jianchao Ma Guiling Sun Yun Zhou Jinling Huang 《Plant Communications》 SCIE CSCD 2023年第3期183-196,共14页
Despite decades of efforts in genome sequencing and functional characterization,some important protein families remain poorly understood.In this study,we report the classification,evolution,and functions of the largel... Despite decades of efforts in genome sequencing and functional characterization,some important protein families remain poorly understood.In this study,we report the classification,evolution,and functions of the largely uncharacterized AIM24 protein family in plants,including the identification of a novel subfamily.We show that two AIM24 subfamilies(AIM24-A and AIM24-B)are commonly distributed in major plant groups.These two subfamilies not only have modest sequence similarities and different gene structures but also are of independent bacterial ancestry.We performed comparative functional investigations on the two AIM24 subfamilies using three model plants:the moss Physcomitrium patens,the liverwort Marchantia polymorpha,and the flowering plant Arabidopsis thaliana.Intriguingly,despite their significant differences in sequence and gene structure,both AIM24 subfamilies are involved in ER stress tolerance and the unfolded protein response(UPR).In addition,transformation of the AIM24-A gene from P.patens into the AIM24-B null mutant of A.thaliana could at least partially rescue ER stress tolerance and the UPR.We also discuss the role of AIM24 genes in plant development and other cellular activities.This study provides a unique example of parallel evolution in molecular functions and can serve as a foundation for further investigation of the AIM24 family in plants. 展开更多
关键词 physcomitrium MARCHANTIA unfolded protein response lncRNA
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