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Improving Rice Blast Resistance by Mining Broad-Spectrum Resistance Genes at Pik Locus 被引量:1
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作者 ZHOU Ying WAN Tao +7 位作者 YUAN Bin LEI Fang CHEN Meijuan WANG Qiong HUANG Ping KOU Shuyan QIU Wenxiu LIU Li 《Rice science》 SCIE CSCD 2022年第2期133-142,共10页
Magnaporthe oryzae is known for its genetic diversity and pathogenic variability,leading to rapid breakdown of resistance in rice.Incorporating multiple broad-spectrum blast resistance genes into rice cultivars would ... Magnaporthe oryzae is known for its genetic diversity and pathogenic variability,leading to rapid breakdown of resistance in rice.Incorporating multiple broad-spectrum blast resistance genes into rice cultivars would extend disease resistance longevity.Effective resistance breeding in rice therefore requires continual enrichment of the reservoir of resistance genes and alleles.We conducted a large-scale screen of rice blast resistance in about 2000 rice accessions.Among them,247 accessions showed at least medium resistance to the natural infection of rice blast and 7 novel Pik alleles were identified from them.Variations in gene sequences were then correlated with the phenotypic trait to enable the identification of favorable alleles.Among the seven novel Pik alleles,the resistant rate of Pik-R0/ME/7017 donors was greater than 80%,and the disease score was less than 3.Through molecular marker-assisted backcross breeding,we successfully transferred the three Pik alleles,Pik-R0/ME/7017,into an elite cultivated line Kongyu 131 to obtain BC_(3)F_(2)lines,which showed enhanced resistance to rice blast compared with the recurrent parent.Assessment of these near-isogenic lines in the greenhouse using 31 isolates of M.oryzae from Heilongjiang Province of China revealed that the resistant levels of the BC_(3)F_(2)lines with Pik-R0/ME/7017 were significantly higher than those of the established cloned resistance genes Pik-m and Pi1.Exploring such alleles will enrich our gene library for resistance to rice blast. 展开更多
关键词 genetic diversity near-isogenic line pik gene resistance gene allele rice blast R gene
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PIK3CA gene mutations in Northwest Chinese esophageal squamous cell carcinoma 被引量:1
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作者 Shi-Yuan Liu Wei Chen +5 位作者 Ehtesham Annait Chughtai Zhe Qiao Jian-Tao Jiang Shao-Min Li Wei Zhang Jin Zhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2017年第14期2585-2591,共7页
AIM To evaluate PIK3 CA gene mutational status in Northwest Chinese esophageal squamous cell carcinoma(ESCC) patients, and examine the associations of PIK3 CA gene mutations with clinicopathological characteristics an... AIM To evaluate PIK3 CA gene mutational status in Northwest Chinese esophageal squamous cell carcinoma(ESCC) patients, and examine the associations of PIK3 CA gene mutations with clinicopathological characteristics and clinical outcome.METHODS A total of 210 patients with ESCC who underwent curative resection were enrolled in this study. Pyrosequencing was applied to investigate mutations in exons 9 and 20 of PIK3 CA gene in 210 Northwest Chinese ESCCs. The associations of PIK3 CA gene mutations with clinicopathological characteristics and clinical outcome were examined.RESULTS PIK3 CA gene mutations in exon 9 were detected in 48 cases(22.9%) of a non-biased database of 210 curatively resected Northwest Chinese ESCCs. PIK3 CA gene mutations were not associated with sex, tobacco use, alcohol use, tumor location, stage, or local recurrence. When compared with wild-type PIK3 CA gene cases, patients with PIK3 CA gene mutations in exons 9 experienced significantly better disease-free survival and overall survival rates.CONCLUSION The results of this study suggest that PIK3 CA gene mutations could act as a prognostic biomarker in Northwest Chinese ESCC patients. 展开更多
关键词 pik3CA gene mutations Esophageal squamous cell carcinoma Northwest Chinese Prognostic significance
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利用HRM功能标记检测黑龙江省水稻抗稻瘟病基因Pita和pik的基因型分布 被引量:3
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作者 郭震华 黄翠红 +6 位作者 罗文龙 黄晓群 王瑞英 陈志强 关世武 张淑华 蔡丽君 《农学学报》 2021年第1期11-16,共6页
为明确Pita及pik基因在黑龙江省水稻种质资源中的分布情况,本研究以67份黑龙江省主栽品种及优异种质资源作为试验材料,通过HRM技术,利用Pita及pik的HRM功能型分子标记Pita-G/T、Pik2-C/T,对67份材料进行基因分型。结果表明,67份种质中,... 为明确Pita及pik基因在黑龙江省水稻种质资源中的分布情况,本研究以67份黑龙江省主栽品种及优异种质资源作为试验材料,通过HRM技术,利用Pita及pik的HRM功能型分子标记Pita-G/T、Pik2-C/T,对67份材料进行基因分型。结果表明,67份种质中,含纯合Pita有27份,占参试种质的40.3%;纯合pik有22份,占参试种质的32.9%,同时含有两基因的为12份,比例为17.9%。综上,Pita-G/T及Pik2-C/T标记可以高效准确地对黑龙江水稻资源进行基因分型,同时,通过基因分型,明确了Pita及pik在黑龙江省的分布情况,为抗稻瘟病育种提供了理论基础。 展开更多
关键词 水稻 高分辨率熔解曲线 Pita基因 pik基因 基因分型
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水稻稻瘟病抗性基因座Piz和Pik的探秘之旅
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作者 田大刚 《福建农业科技》 CAS 2022年第5期1-11,共11页
由稻瘟病菌Magnaporthe oryzae引起的稻瘟病是我国乃至世界水稻生产上的重要病害。目前生产上主要有栽培管理、化学药剂和选用抗病品种等防治方法,其中利用抗病基因培育抗病品种已被证实为最经济有效和环境友好的选择。回顾了本课题组... 由稻瘟病菌Magnaporthe oryzae引起的稻瘟病是我国乃至世界水稻生产上的重要病害。目前生产上主要有栽培管理、化学药剂和选用抗病品种等防治方法,其中利用抗病基因培育抗病品种已被证实为最经济有效和环境友好的选择。回顾了本课题组在过去10多年利用分子生物学和多组学等研究技术,在抗性基因筛选、鉴定和应用以及抗病机制解析方面的工作。另外,还综述了近年来关于水稻抗性基因和稻瘟病菌无毒基因方面的研究进展,以及与抗病基因Piz-t相关的物质和代谢途径,如五羟色胺和色氨酸途径等。这些信息有望为水稻分子设计抗病育种提供参考。 展开更多
关键词 稻瘟病 抗性基因 Piz基因座 pik基因座 标记辅助育种 五羟色胺
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水稻稻瘟病抗性基因Pik-2的遗传变异及进化分析 被引量:1
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作者 牛玉芳 肖贵 +3 位作者 吴俊 柏斌 周波 肖应辉 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期21-25,共5页
Pik位点是水稻第11染色体上稻瘟病抗性基因成簇分布的热点区域,对该位点抗性基因在水稻品种中多样性分布的研究,有助于揭示该基因的进化规律和进一步挖掘其等位基因。对来自不同国家和地区的400份非洲稻和400份亚洲稻稻种抗稻瘟病基因Pi... Pik位点是水稻第11染色体上稻瘟病抗性基因成簇分布的热点区域,对该位点抗性基因在水稻品种中多样性分布的研究,有助于揭示该基因的进化规律和进一步挖掘其等位基因。对来自不同国家和地区的400份非洲稻和400份亚洲稻稻种抗稻瘟病基因Pik-2编码区序列进行了测序分析,发现非洲稻和亚洲稻品种Pik-2编码区碱基变异非常丰富,非洲稻种中出现了113个变异位点,亚洲稻种中有78个碱基位点发生多样性变异,其中两者均在1879位点显示出极高的变异频率;根据其碱基变异特点,非洲稻种和亚洲稻种分别呈现出17和12种单倍型。单倍型的地区分布研究显示,非洲稻的分布呈现出大聚集、小分散的特点,而亚洲稻的分布来源就显得非常广泛。不同单倍型的系统进化分析表明,大多类群中同时包含非洲稻与亚洲稻的单倍型,暗示非洲稻与亚洲稻在相互独立的进化过程中在Pik-2 LRR结构域各自形成了相似的单倍型。 展开更多
关键词 非洲稻 亚洲稻 稻瘟病 抗病基因 pik-2
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黑龙江省稻瘟病菌无毒基因AVR-Pib、AVR-Pik和AvrPiz-t的检测与分析 被引量:7
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作者 孟峰 张亚玲 +2 位作者 靳学慧 张晓玉 姜军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第23期4262-4273,共12页
【目的】检测黑龙江省稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)无毒基因AVR-Pib、AVR-Pik和AvrPiz-t在不同地区、年份间流行菌株的分布情况与变异机制,了解其等位基因的致病表型,为黑龙江省抗瘟品种布局提供参考依据。【方法】利用NCBI中公布的无... 【目的】检测黑龙江省稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)无毒基因AVR-Pib、AVR-Pik和AvrPiz-t在不同地区、年份间流行菌株的分布情况与变异机制,了解其等位基因的致病表型,为黑龙江省抗瘟品种布局提供参考依据。【方法】利用NCBI中公布的无毒基因序列对3个无毒基因AVR-Pib、AVR-Pik和AvrPiz-t的基因全长和编码序列(coding sequence,CDS)分别设计特异性引物,将2016年和2017年采自黑龙江省不同地区335个稻瘟病菌单孢分离菌株的DNA进行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测分析,并挑选不同带型和不同地区代表菌株的PCR产物进行测序。测序结果与相应无毒基因序列进行碱基与氨基酸序列的比较分析,并利用水稻抗性单基因系,对不同变异类型的稻瘟病菌菌株进行致病型测定。【结果】在PCR电泳检测中AVR-Pib、AVR-Pik和AvrPiz-t均出现特异性条带,说明这3个无毒基因在黑龙江省均有分布,并以不同分布频率与突变类型出现。3个无毒基因平均扩增频率分别为75.52%、87.16%和85.67%。其中AVR-Pib通过电泳检测与PCR产物测序检测出4种带型(无带、高带、中高带与低带)和5种变异类型AVR-Pib(1-1、1-2、2、3、3-1),基因型AVR-Pib-1-1、AVR-Pib-1-2、AVR-Pib-2和AVR-Pib-3-1为新发现的变异类型,其中基因型AVR-Pib-1-1和AVR-Pib-1-2均为转座子Pot2的插入,但插入位点不同;基因型AVR-Pib-2在阅读框上游存在小片段的插入;基因型AVR-Pib-3-1碱基序列与原序列比对有4处差异,即32(C/G)35(T/A)36(T/A)38(T/A),导致氨基酸翻译提前终止。对检测到的5种等位基因型进行致病型测定,分析发现除正常基因型AVR-Pib-3外,其他变异基因型无毒功能均已丧失。而AVR-Pik经PCR产物测序检测出7种等位基因型,AVR-Pik(D、A、B、C、E、F、F2),碱基序列的变化均导致氨基酸错义突变,7种等位基因型均已见报道。无毒基因AvrPiz-t通过电泳检测和PCR产物测序分析,发现2种带型(高带和正常带型)与4种基因型AvrPiz-t(A、B、C、D),其中AvrPiz-t-A为正常基因型;基因型AvrPiz-t-B在191位处有碱基A的插入,导致氨基酸翻译提前终止;基因型AvrPiz-t-C为新发现的等位基因型,其特点在于与A类型存在17(T/C)和19位处碱基C的插入,发生移码突变翻译提前终止;高带型对应的无毒基因型AvrPiz-t-D经测序验证为Pot3转座子的插入。4种基因型菌株分别接种水稻单基因系发现,AvrPiz-t-A可以被Piz-t识别表现无毒,AvrPiz-t(B、C、D)均不能被Piz-t所识别而表现为有毒性。【结论】黑龙江省稻瘟病菌无毒基因AVR-Pib、AVR-Pik和AvrPiz-t分布较为广泛,且变异类型丰富,研究结果可为选育和推广携带相应抗病基因的水稻品种提供参考。 展开更多
关键词 黑龙江省 稻瘟病菌 无毒基因 AVR-Pib AVR-pik AvrPiz-t
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水稻稻瘟病抗性基因Pik-2的遗传变异及进化分析
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作者 邢运高 王宝祥 +5 位作者 陈庭木 孙志广 徐波 杨波 李健 徐大勇 《热带农业工程》 2019年第2期49-51,共3页
Pik-2位于水稻基因序列中第11号染色体,通过研究分析Pik-2位点在水稻基因遗传过程中的变异与进化,可以掌握水稻基因序列中第11号染色体的自然进化规律与恶性突变的诱发因素,从而制定相关的防治方案,提高水稻对稻瘟病的抗性。选择了400... Pik-2位于水稻基因序列中第11号染色体,通过研究分析Pik-2位点在水稻基因遗传过程中的变异与进化,可以掌握水稻基因序列中第11号染色体的自然进化规律与恶性突变的诱发因素,从而制定相关的防治方案,提高水稻对稻瘟病的抗性。选择了400份非洲地区的水稻样本和400份亚洲地区的水稻样本,对所有水稻的第11号染色体Pik-2位点进行基因测序。结果显示:非洲水稻样本中有113个变异点,而亚洲水稻样本中有78个碱基对出现了变异;非洲水稻样本测序结果显示非洲水稻具有大聚集、小分散的特性,而亚洲水稻分布得较为广泛,由此可以证实非洲水稻与亚洲水稻在相互独立的进化演变过程中,第11号染色体Pik-2位点在LRR结构域形成了相似的单倍型。 展开更多
关键词 非洲水稻 亚洲水稻 稻瘟病 抗病基因 pik-2位点 基因测序
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PIK3CD基因变异致儿童PI3Kδ过度活化综合征1型1例报告并文献复习 被引量:1
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作者 谭章华 宋发英 +4 位作者 郑红艳 王伟 王磊 沈昌桃 刘兴楼 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期829-831,835,共4页
目的总结PI3Kδ过度活化综合征(APDS)的临床诊治。方法总结1例APDS1型患儿的临床表现、实验室检查以及基因检测结果和治疗经过。结果女性患儿,4岁3个月,主要表现为反复出现呼吸道感染、脾大、淋巴结肿大、肠病,高IgM综合征、T淋巴细胞和... 目的总结PI3Kδ过度活化综合征(APDS)的临床诊治。方法总结1例APDS1型患儿的临床表现、实验室检查以及基因检测结果和治疗经过。结果女性患儿,4岁3个月,主要表现为反复出现呼吸道感染、脾大、淋巴结肿大、肠病,高IgM综合征、T淋巴细胞和CD4+T淋巴细胞比例下降。经全外显子测序诊断为APDS1型,予以抗感染和丙种球蛋白治疗,临床症状明显改善。结论APDS可表现为反复呼吸道感染、淋巴增殖性疾病、肠病以及高IgM综合征等,基因检测可明确诊断。抗感染和丙种球蛋白替代治疗有效。 展开更多
关键词 pik 3CD PI3Kδ过度活化综合征 基因变异 儿童
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稻瘟病菌无毒基因AVR-Pik一个新单倍型的功能鉴定
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作者 郭嘉媛 黄健强 +2 位作者 吴亦灵 洪永河 陈晓峰 《福建农业科技》 CAS 2022年第3期7-12,共6页
稻瘟病菌无毒基因的变异会导致水稻抗病品种丧失抗性,因此,稻瘟病菌无毒基因变异机制的研究对于水稻抗病育种及抗病品种合理布局具有重要指导意义。为了更加全面地了解稻瘟病菌无毒基因AVR-Pik的变异机制,对课题组前期获得的来自全国各... 稻瘟病菌无毒基因的变异会导致水稻抗病品种丧失抗性,因此,稻瘟病菌无毒基因变异机制的研究对于水稻抗病育种及抗病品种合理布局具有重要指导意义。为了更加全面地了解稻瘟病菌无毒基因AVR-Pik的变异机制,对课题组前期获得的来自全国各地100多株稻瘟病菌田间菌株中AVR-Pik位点的突变进行分析,发现了一个新单倍型AVR-PikG,其编码产物含有一个未见报道的点突变M58I。进一步的功能鉴定结果显示,表达Avr-PikG的稻瘟病菌菌株对所有供试Pik单基因系水稻均有毒,而表达Avr-PikD^(M58I)的菌株则对所有供试Pik单基因系水稻无毒,表明目前所有已知Pik等位基因的编码产物均无法识别新单倍型Avr-PikG,而Avr-PikG所含点突变M58I可能与其成功逃避抗病蛋白识别无关。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 无毒基因AVR-pik 新单倍型 毒性分析
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水稻Pik位点五个等位基因特异分子标记的开发及应用
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作者 杨好 黄衍焱 +6 位作者 易春霖 谭楮湉 任文芮 黄富 石军 李小艳 王文明 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期571-581,共11页
由于绝大多数水稻亲本的稻瘟病抗性基因组成不清楚,等位基因间的高度同源,导致分子标记辅助选择技术在水稻抗病育种中的应用受到限制。本研究首先分析了稻瘟病抗性基因Pik位点11个等位基因编码区的核苷酸序列,筛选出Pikp-1、Pikh-1、Pi... 由于绝大多数水稻亲本的稻瘟病抗性基因组成不清楚,等位基因间的高度同源,导致分子标记辅助选择技术在水稻抗病育种中的应用受到限制。本研究首先分析了稻瘟病抗性基因Pik位点11个等位基因编码区的核苷酸序列,筛选出Pikp-1、Pikh-1、Pik-1、Pikm-1和Pi1-1特异的多态性位点,再与水稻资源中心(Rice Resource Center)中155个水稻基因组进行比对分析,在序列特异性最强的位置设计引物,成功地为这5个等位基因开发出了特性的分子标记。以24个抗稻瘟病单基因系为对照,应用这些分子标记,明确了109个水稻亲本中含有Pik-1、Pikh-1、Pikp-1、Pi1-1和Pikm-1基因的材料分别有0、1、5、14和20个。对‘绵恢365’中的Pi1基因测序,验证了分子标记的有效性及准确性。本研究为Pik位点在水稻抗稻瘟病育种中的应用提供了明确的亲本资源和可靠的分子标记。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 pik基因位点 等位基因 分子标记
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稻瘟病抗性位点Pik-InDel分子标记开发及其在育种上的应用 被引量:4
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作者 郑祥正 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第18期6058-6061,共4页
水稻Pik位点含有至少6个抗病基因,它们都包含在该位点功能区域中。因此,有效区分出功能区域是鉴定该基因座功能基因的首要条件。本研究通过对水稻抗稻瘟病Pik基因座上已克隆的功能基因,包括Pik、Pi-k^p、Pi-k^h、Pi-1、Pi-k^m和Pi-k^s... 水稻Pik位点含有至少6个抗病基因,它们都包含在该位点功能区域中。因此,有效区分出功能区域是鉴定该基因座功能基因的首要条件。本研究通过对水稻抗稻瘟病Pik基因座上已克隆的功能基因,包括Pik、Pi-k^p、Pi-k^h、Pi-1、Pi-k^m和Pi-k^s及非功能基因序列的相互对比,鉴定到Pik基因座特异的核苷酸差异,开发了基于PCR技术的Pik基因座的插入/缺失(insert-deletion, InDel)标记,能有效地将Pik上功能基因与其它非功能基因的基因座区分开。利用Pik基因座的分离群体进行标记选择与接种鉴定,结果表明Pik-InDel标记能精确的选择出Pik功能基因座。用Pik-InDel标记对20份重要水稻不育系进行分子检测,该标记能准确地将抗性基因座与其它非抗病基因座区分开来,这为筛选水稻稻瘟病抗性种质资源,以及抗性标记辅助抗病育种提供了便利。 展开更多
关键词 水稻 抗性基因 分子标记 分子标记辅助选择 pik位点
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抑制polo-like kinase-1基因表达对5-氟脲嘧啶及顺铂体外诱导胃癌细胞凋亡的影响
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作者 兰斌 刘炳亚 +4 位作者 陈雪华 瞿颖 张晓青 蔡劬 朱正纲 《中华普通外科杂志》 CSCD 北大核心 2005年第12期796-799,共4页
目的观察抑制polo-like kinase-1(Plk-1)基因对5-氟脲嘧啶(5-Fu)及顺铂(CDDP)体外诱导胃癌细胞株-MKN45凋亡的影响。方法小片断干扰RNA(siRNA)阻断MKN45细胞Plk-1 基因的表达;定量PCR及Western blot检测Plk-1表达的变化;MTT法检测MKN45... 目的观察抑制polo-like kinase-1(Plk-1)基因对5-氟脲嘧啶(5-Fu)及顺铂(CDDP)体外诱导胃癌细胞株-MKN45凋亡的影响。方法小片断干扰RNA(siRNA)阻断MKN45细胞Plk-1 基因的表达;定量PCR及Western blot检测Plk-1表达的变化;MTT法检测MKN45细胞增殖速率;流式细胞仪检测MKN45细胞凋亡率。结果经靶向Plk-1的siRNA作用24 h、48 h及72 h后,Plk-1 mRNA水平分别下降了51.91%、89.45%、91.03%,蛋白水平在48 h及72 h分别降低了38.43%和 60.66%;联合应用5-Fu、CDDP与靶向Plk-1 siRNA组的MKN45细胞增殖速率较单用5-Fu、CDDP或靶向Plk-1 siRNA组明显减慢(P<0.05);在48 h及72 h细胞凋亡率明显上升(P<0.05)。结论 Plk-1基因表达抑制在体外可增强5-Fu及CDDP对MKN45细胞的凋亡诱导作用;联合应用靶向Plk-1 的siRNA有可能提高5-Fu及CDDP对胃癌细胞杀伤作用。 展开更多
关键词 胃肿瘤 凋亡 化学治疗
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