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光滑异装蟹(Heteropanope glabra)线粒体基因组测定及其在系统发生研究中的意义
被引量:
7
1
作者
陈建琴
张振华
+3 位作者
邢雨辉
姚文佳
张晨岭
尤蕾
《南京师大学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期108-114,共7页
本文应用高通量测序方法首次测定了光滑异装蟹(Heteropanope glabra)的线粒体基因组全序列.测序研究发现,光滑异装蟹线粒体基因组全长为16 008 bp,包含典型的蟹类线粒体基因组37条基因,结构紧凑;其碱基组成的AT含量为70.3%; tRNA二级结...
本文应用高通量测序方法首次测定了光滑异装蟹(Heteropanope glabra)的线粒体基因组全序列.测序研究发现,光滑异装蟹线粒体基因组全长为16 008 bp,包含典型的蟹类线粒体基因组37条基因,结构紧凑;其碱基组成的AT含量为70.3%; tRNA二级结构中共有8处错配,且以U/U错配为主.对线粒体基因排列顺序的比较研究发现,光滑异装蟹独享一种新的基因排列模式;这种重排模式与同属毛刺蟹总科(Pilumnoidea)的蝙蝠毛刺蟹(Pilumnus vespertilio)相比有一个trn L2(UUR)发生易位,它们彼此之间共享的nad1易位和trn L2(UUR)倒位则提示二者具有最近共同祖先.这种共享的基因排列顺序为解析毛刺蟹总科(Pilumnoidea)与扇蟹总科(Xanthoidea)的进化关系,并支持将毛刺蟹类从扇蟹总科(Xanthoidea)划分出来提供了独立的分子佐证.
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关键词
毛刺蟹总科
扇蟹总科
光滑异装蟹
线粒体基因组
系统发生
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职称材料
题名
光滑异装蟹(Heteropanope glabra)线粒体基因组测定及其在系统发生研究中的意义
被引量:
7
1
作者
陈建琴
张振华
邢雨辉
姚文佳
张晨岭
尤蕾
机构
江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院江苏省生物功能分子重点实验室
南京师范大学中北学院
南京师范大学生命科学学院
出处
《南京师大学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期108-114,共7页
基金
江苏省自然科学基金(BK20171406)
江苏省高等学校自然科学基金(16KJB170002)
江苏省水产养殖项目(Y2016-29)
文摘
本文应用高通量测序方法首次测定了光滑异装蟹(Heteropanope glabra)的线粒体基因组全序列.测序研究发现,光滑异装蟹线粒体基因组全长为16 008 bp,包含典型的蟹类线粒体基因组37条基因,结构紧凑;其碱基组成的AT含量为70.3%; tRNA二级结构中共有8处错配,且以U/U错配为主.对线粒体基因排列顺序的比较研究发现,光滑异装蟹独享一种新的基因排列模式;这种重排模式与同属毛刺蟹总科(Pilumnoidea)的蝙蝠毛刺蟹(Pilumnus vespertilio)相比有一个trn L2(UUR)发生易位,它们彼此之间共享的nad1易位和trn L2(UUR)倒位则提示二者具有最近共同祖先.这种共享的基因排列顺序为解析毛刺蟹总科(Pilumnoidea)与扇蟹总科(Xanthoidea)的进化关系,并支持将毛刺蟹类从扇蟹总科(Xanthoidea)划分出来提供了独立的分子佐证.
关键词
毛刺蟹总科
扇蟹总科
光滑异装蟹
线粒体基因组
系统发生
Keywords
pilumnoidea
Xanthoidea
Heteropanope glabra
mitochondrial genome
phylogeny
分类号
Q959.223.63 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
光滑异装蟹(Heteropanope glabra)线粒体基因组测定及其在系统发生研究中的意义
陈建琴
张振华
邢雨辉
姚文佳
张晨岭
尤蕾
《南京师大学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018
7
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