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基于叶绿体DNA条形码的披麻草药材及其混伪品的分子鉴定
被引量:
2
1
作者
时瑞梓
田星
+2 位作者
赵禹
李荣姣
李国栋
《中国现代中药》
CAS
2023年第1期31-37,共7页
目的:分析trnV-atpE、psaC-ndhE序列变异特点,并通过该序列鉴别披麻草不同基原植物与其混伪品。方法:分别提取披麻草3种基原植物及其混伪品的总DNA,以trnV-atpE、psaC-ndhE为DNA条形码候选序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序。采用D...
目的:分析trnV-atpE、psaC-ndhE序列变异特点,并通过该序列鉴别披麻草不同基原植物与其混伪品。方法:分别提取披麻草3种基原植物及其混伪品的总DNA,以trnV-atpE、psaC-ndhE为DNA条形码候选序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序。采用DnaSP、MEGA软件统计其片段长度、鸟嘌呤(G)+胞嘧啶(C)占比、变异位点个数、简约信息位点、插入或缺失位点,并计算样品K2-P(Kimura 2-parameter)遗传距离和构建邻接法(NJ)系统发育树。结果:trnV-atpE、psaC-ndhE序列长度分别为373~381、491~534 bp,简约信息位点分别为18、15个。trnV-atpE和psaC-ndhE序列中披麻草3种基原植物最大遗传距离均小于与混伪品之间的最小遗传距离。基于2个序列构建的NJ系统发育树显示,披麻草与其混伪品能明显区分。结论:综合分析序列特点和种内、种间变异性,trnV-atpE和psaC-ndhE序列均可将披麻草3种基原植物与其混伪品区分开。
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关键词
披麻草
叶绿体DNA
trnV-atpE序列
psaC-ndhE序列
遗传距离
系统发育树
分子鉴定
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职称材料
题名
基于叶绿体DNA条形码的披麻草药材及其混伪品的分子鉴定
被引量:
2
1
作者
时瑞梓
田星
赵禹
李荣姣
李国栋
机构
云南医药健康职业学院
云南中医药大学云南省傣医药与彝医药重点实验室
出处
《中国现代中药》
CAS
2023年第1期31-37,共7页
基金
云南省教育厅科学研究基金项目(2021J1366)。
文摘
目的:分析trnV-atpE、psaC-ndhE序列变异特点,并通过该序列鉴别披麻草不同基原植物与其混伪品。方法:分别提取披麻草3种基原植物及其混伪品的总DNA,以trnV-atpE、psaC-ndhE为DNA条形码候选序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序。采用DnaSP、MEGA软件统计其片段长度、鸟嘌呤(G)+胞嘧啶(C)占比、变异位点个数、简约信息位点、插入或缺失位点,并计算样品K2-P(Kimura 2-parameter)遗传距离和构建邻接法(NJ)系统发育树。结果:trnV-atpE、psaC-ndhE序列长度分别为373~381、491~534 bp,简约信息位点分别为18、15个。trnV-atpE和psaC-ndhE序列中披麻草3种基原植物最大遗传距离均小于与混伪品之间的最小遗传距离。基于2个序列构建的NJ系统发育树显示,披麻草与其混伪品能明显区分。结论:综合分析序列特点和种内、种间变异性,trnV-atpE和psaC-ndhE序列均可将披麻草3种基原植物与其混伪品区分开。
关键词
披麻草
叶绿体DNA
trnV-atpE序列
psaC-ndhE序列
遗传距离
系统发育树
分子鉴定
Keywords
pimacao
chloroplast genome
trnV-atpE sequence
psaC-ndhE sequence
genetic distance
phylogenetic tree
molecular identification
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于叶绿体DNA条形码的披麻草药材及其混伪品的分子鉴定
时瑞梓
田星
赵禹
李荣姣
李国栋
《中国现代中药》
CAS
2023
2
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