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马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEX基因的分子克隆及表达分析
1
作者
范闪闪
郑哲
+4 位作者
焦钰
黄荣莲
王庆恒
邓岳文
杜晓东
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期2339-2349,共11页
β-N-乙酰-己糖胺酶(beta-N-acetylhexosaminidase/beta-Hexosaminidase,HEX)是一种糖苷水解酶,在几丁质降解、N-糖基化修饰、糖复合物代谢等过程发挥重要作用。为了探究PmHEX在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利用RACE技术克隆获...
β-N-乙酰-己糖胺酶(beta-N-acetylhexosaminidase/beta-Hexosaminidase,HEX)是一种糖苷水解酶,在几丁质降解、N-糖基化修饰、糖复合物代谢等过程发挥重要作用。为了探究PmHEX在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利用RACE技术克隆获得马氏珠母贝PmHEX(Pinctada fucata martensii HEX,PmHEX)cDNA全长序列并通过qRT-PCR检测其在不同组织的表达模式。结果表明,PmHEX序列全长3 812 bp,其中5'UTR为22 bp,3'UTR为364 bp,开放阅读框(ORF)为3 426 bp,编码1 141个氨基酸;预测其相对分子量为125.92 kD,理论等电点为9.06;SMART软件分析PmHEX蛋白质序列,发现它具有典型的GH20和GH20b结构域和一个碳水化合物结合结构域;多序列比对显示PmHEX与其它物种的HEX具有较高的保守性,与珠母贝HEX序列相似度高达54%;q RT-PCR表达分析显示PmHEX在外套膜各区表达量较高,且在边缘区的表达量显著高于其他组织。综上所述,PmHEX可能参与马氏珠母贝贝壳的形成过程。
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关键词
马氏珠母贝
β-N-乙酰-己糖胺酶
克隆
表达分析
原文传递
题名
马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEX基因的分子克隆及表达分析
1
作者
范闪闪
郑哲
焦钰
黄荣莲
王庆恒
邓岳文
杜晓东
机构
广东海洋大学水产学院
广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期2339-2349,共11页
基金
国家自然科学基金“基于珍珠贝基因组测序分析的珍珠形成矿化关键基因和蛋白质的研究”(31272635)
广东省海洋与渔业局“马氏珠母贝优质抗逆选系苗种规模化繁育与示范养殖”(Z2014009)
广东海洋大学创新强校“马氏珠母贝高精度遗传连锁图谱构建与生长性状QTLs的精细定位”(GDOU2014050207)共同资助
文摘
β-N-乙酰-己糖胺酶(beta-N-acetylhexosaminidase/beta-Hexosaminidase,HEX)是一种糖苷水解酶,在几丁质降解、N-糖基化修饰、糖复合物代谢等过程发挥重要作用。为了探究PmHEX在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利用RACE技术克隆获得马氏珠母贝PmHEX(Pinctada fucata martensii HEX,PmHEX)cDNA全长序列并通过qRT-PCR检测其在不同组织的表达模式。结果表明,PmHEX序列全长3 812 bp,其中5'UTR为22 bp,3'UTR为364 bp,开放阅读框(ORF)为3 426 bp,编码1 141个氨基酸;预测其相对分子量为125.92 kD,理论等电点为9.06;SMART软件分析PmHEX蛋白质序列,发现它具有典型的GH20和GH20b结构域和一个碳水化合物结合结构域;多序列比对显示PmHEX与其它物种的HEX具有较高的保守性,与珠母贝HEX序列相似度高达54%;q RT-PCR表达分析显示PmHEX在外套膜各区表达量较高,且在边缘区的表达量显著高于其他组织。综上所述,PmHEX可能参与马氏珠母贝贝壳的形成过程。
关键词
马氏珠母贝
β-N-乙酰-己糖胺酶
克隆
表达分析
Keywords
pinctadafueata martensii
β-N-acetylhexosaminidase
Cloning
Expression Analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEX基因的分子克隆及表达分析
范闪闪
郑哲
焦钰
黄荣莲
王庆恒
邓岳文
杜晓东
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
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