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基于COⅠ基因探讨北京及其周边地区跳钩虾种群遗传结构
1
作者
崔昕宇
刘宏广
李枢强
《四川动物》
北大核心
2019年第4期402-407,共6页
跳钩虾Platorchestia japonica栖息于湖泊、河流岸边,是重要的环境指示生物。本研究以线粒体COⅠ基因片段为分子标记,对北京及其周边地区22个采样点的128个样本进行种群遗传多样性和遗传结构研究。结果显示,623 bp的COⅠ基因序列中有56...
跳钩虾Platorchestia japonica栖息于湖泊、河流岸边,是重要的环境指示生物。本研究以线粒体COⅠ基因片段为分子标记,对北京及其周边地区22个采样点的128个样本进行种群遗传多样性和遗传结构研究。结果显示,623 bp的COⅠ基因序列中有567个保守位点、56个变异位点和38个简约信息位点。128个样本检测到43个单倍型,单倍型多样性为0.938,核苷酸多样性为0.011 72。最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树以及单倍型网络图表明,研究区域跳钩虾没有明显的地理种群结构,但所有单倍型形成2个遗传进化支。分子变异分析结果证实,跳钩虾2个进化支间的遗传变异显著高于进化支内的,进化支间固定系数为0.852 19,表明2个进化支遗传分化明显。本研究为进一步研究中国区域跳钩虾的遗传结构提供了有意义的基础数据。
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关键词
跳钩虾
COⅠ
系统发育
遗传结构
遗传多样性
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职称材料
题名
基于COⅠ基因探讨北京及其周边地区跳钩虾种群遗传结构
1
作者
崔昕宇
刘宏广
李枢强
机构
中国人民大学附属中学
中国科学院动物进化与系统学重点实验室
出处
《四川动物》
北大核心
2019年第4期402-407,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31772417)
文摘
跳钩虾Platorchestia japonica栖息于湖泊、河流岸边,是重要的环境指示生物。本研究以线粒体COⅠ基因片段为分子标记,对北京及其周边地区22个采样点的128个样本进行种群遗传多样性和遗传结构研究。结果显示,623 bp的COⅠ基因序列中有567个保守位点、56个变异位点和38个简约信息位点。128个样本检测到43个单倍型,单倍型多样性为0.938,核苷酸多样性为0.011 72。最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树以及单倍型网络图表明,研究区域跳钩虾没有明显的地理种群结构,但所有单倍型形成2个遗传进化支。分子变异分析结果证实,跳钩虾2个进化支间的遗传变异显著高于进化支内的,进化支间固定系数为0.852 19,表明2个进化支遗传分化明显。本研究为进一步研究中国区域跳钩虾的遗传结构提供了有意义的基础数据。
关键词
跳钩虾
COⅠ
系统发育
遗传结构
遗传多样性
Keywords
platorchestia japonica
COⅠ
phylogeny
genetic structure
genetic diversity
分类号
Q173 [生物学—水生生物学]
Q953 [生物学—动物学]
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作者
出处
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1
基于COⅠ基因探讨北京及其周边地区跳钩虾种群遗传结构
崔昕宇
刘宏广
李枢强
《四川动物》
北大核心
2019
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