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马尾松谷胱甘肽过氧化物酶PmGPX基因的克隆及表达分析
被引量:
2
1
作者
陈虎
贾婕
+2 位作者
罗群风
吴东山
杨章旗
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期856-863,共8页
克隆获得马尾松Pinus massoniana PmGPX基因,进行生物信息学分析以及在不同抗虫材料表达模式分析。在前期马尾松转录组测序获得该基因片段基础上,用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得基因全长,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术分...
克隆获得马尾松Pinus massoniana PmGPX基因,进行生物信息学分析以及在不同抗虫材料表达模式分析。在前期马尾松转录组测序获得该基因片段基础上,用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得基因全长,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术分析该基因在不同抗虫材料中的表达模式。克隆获得基因cDNA全长序列,命名为PmGPX。该基因包含741 bp开放阅读框,编码246个氨基酸。序列分析表明:该基因具有GPX家族典型的保守结构域,等电点PI 8.29,蛋白分子量27.08 kDa,与针叶植物北美云杉Picea sitchensis的同源性较高,为91%。与单子叶和双子叶植物同源性较差,大部分在64%~80%,而在GPX家族典型保守结构域的同源性较高,为82%~100%。qRT-PCR技术分析表明:PmGPX在所有组织中均有表达,在针叶中表达量最高,嫩叶的表达量是根的33.45倍,在根、花和球果中的表达量较低,不同材料日表达模式相似,总体上随时间出现"升—降—升"模式。该基因在抗虫材料中启动较早,且表达量高于对照。推测该基因参与了马尾松抗虫防御体系。
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关键词
林木育种学
马尾松
谷胱甘肽过氧化物酶
pmgpx基因
克隆与表达
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职称材料
题名
马尾松谷胱甘肽过氧化物酶PmGPX基因的克隆及表达分析
被引量:
2
1
作者
陈虎
贾婕
罗群风
吴东山
杨章旗
机构
广西壮族自治区林业科学研究院国家林业局马尾松工程技术研究中心/广西马尾松工程技术研究中心
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期856-863,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31660219)
广西"八桂学者"专项经费资助项目(2011A015)
广西自然科学基金资助项目(2014GXNSFBA118104)
文摘
克隆获得马尾松Pinus massoniana PmGPX基因,进行生物信息学分析以及在不同抗虫材料表达模式分析。在前期马尾松转录组测序获得该基因片段基础上,用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得基因全长,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术分析该基因在不同抗虫材料中的表达模式。克隆获得基因cDNA全长序列,命名为PmGPX。该基因包含741 bp开放阅读框,编码246个氨基酸。序列分析表明:该基因具有GPX家族典型的保守结构域,等电点PI 8.29,蛋白分子量27.08 kDa,与针叶植物北美云杉Picea sitchensis的同源性较高,为91%。与单子叶和双子叶植物同源性较差,大部分在64%~80%,而在GPX家族典型保守结构域的同源性较高,为82%~100%。qRT-PCR技术分析表明:PmGPX在所有组织中均有表达,在针叶中表达量最高,嫩叶的表达量是根的33.45倍,在根、花和球果中的表达量较低,不同材料日表达模式相似,总体上随时间出现"升—降—升"模式。该基因在抗虫材料中启动较早,且表达量高于对照。推测该基因参与了马尾松抗虫防御体系。
关键词
林木育种学
马尾松
谷胱甘肽过氧化物酶
pmgpx基因
克隆与表达
Keywords
forest tree breeding
Pinus massoniana
glutathione peroxidase
pmgpx
cloning and expression analysis
分类号
S791.2 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马尾松谷胱甘肽过氧化物酶PmGPX基因的克隆及表达分析
陈虎
贾婕
罗群风
吴东山
杨章旗
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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