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抗白粉病基因PmCH1357相关分子标记验证与评价
被引量:
5
1
作者
陈芳
李欣
+8 位作者
乔麟轶
李锐
郭慧娟
常利芳
张树伟
阎晓涛
畅志坚
张晓军
李东方
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期41-48,共8页
由禾本科布氏白粉菌Blumeria graminis(DC.)f.sp.tritici(Bgt)引起的白粉病是影响小麦产量和品质的一种主要病害。为了评价小麦抗白粉病基因相关分子标记在育种中的有效性与实用性,本试验利用感白粉病品种晋麦66和小偃麦衍生品系CH1357...
由禾本科布氏白粉菌Blumeria graminis(DC.)f.sp.tritici(Bgt)引起的白粉病是影响小麦产量和品质的一种主要病害。为了评价小麦抗白粉病基因相关分子标记在育种中的有效性与实用性,本试验利用感白粉病品种晋麦66和小偃麦衍生品系CH1357构建的341个F 2:3家系为材料,利用本课题组前期已定位的8个与抗白粉病基因PmCH1357相关的分子标记(Xcfd81、Xbwm20、Xbwm21、Xbwm25、Xmp510、Xbwm8、Xbwm9和Xgwm190)对群体进行PCR检测,并接种白粉菌株E09进行苗期抗病性鉴定,分析PCR扩增产物与白粉病抗性间的相关性。结果表明,4个标记(Xcfd81、Xbwm20、Xbwm21和Xbwm25)对群体检测的纯合抗病基因型与纯合抗病表现型符合率均达到93%以上,可用于抗白粉病基因PmCH1357的筛选;为进一步提高标记筛选的准确性,可使用多个标记组合,使用基因同一侧的标记组合进行选择会降低选择效率,使用基因两侧标记组合进行选择可有效提高选择的准确性。使用标记组合Xcfd81+Xbwm8对抗白粉病基因PmCH1357进行选择可以获得更高的准确性及更多有效植株。
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关键词
小麦
抗白粉病
基因
pmch
1357
分子标记
选择效率
育种
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职称材料
鄱阳湖泥鳅黑色素聚集激素1基因及其蛋白结构特征分析
被引量:
1
2
作者
徐敏圣
史建伍
+5 位作者
胡芳琴
肖芳美
方磊
盛军庆
王军花
洪一江
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期1114-1120,共7页
为研究黑色素聚集激素(Melanin-concentrating hormone,MCH)在泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)皮肤黑色素沉着过程中所起的作用,研究采用RACE-PCR技术首次克隆出了鄱阳湖泥鳅前原黑色素聚集激素1(Prepro-melanin-concentrating hormon...
为研究黑色素聚集激素(Melanin-concentrating hormone,MCH)在泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)皮肤黑色素沉着过程中所起的作用,研究采用RACE-PCR技术首次克隆出了鄱阳湖泥鳅前原黑色素聚集激素1(Prepro-melanin-concentrating hormone 1,Pmch1)基因c DNA全长序列,将其命名为Ma Pmch1。运用生物信息学软件对Ma Pmch1基因及其蛋白的理化性质和结构特征进行了分析,构建了系统进化树。其c DNA全长为570 bp,存在一个长度为110 bp的Cp G岛,位于263—372 bp;该基因开放阅读框共375 bp,编码含124个氨基酸的蛋白质,共有7个潜在的磷酸化位点;PMCH1蛋白经水解产生17个氨基酸的环形神经肽黑色素聚集激素1(MCH1)。PMCH1和MCH1均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主;MCH1超二级结构具有一个反平行β-折叠片层,通过二硫键连接形成环形神经肽。同源性分析表明鄱阳湖泥鳅MCH1(Ma MCH1)氨基酸序列与其他硬骨鱼类的高度一致。系统进化树显示,包括泥鳅在内的鲤形目PMCH1聚为一支,且物种间PMCH1的亲缘关系与传统的分类地位相吻合。在脊椎动物中,MCH存在高度保守的序列RCM*GRVYRPCW(*代表随机氨基酸),证明该基因在进化上是极为保守的。
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关键词
泥鳅
鄱阳湖
pmch基因
黑色素聚集激素
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职称材料
题名
抗白粉病基因PmCH1357相关分子标记验证与评价
被引量:
5
1
作者
陈芳
李欣
乔麟轶
李锐
郭慧娟
常利芳
张树伟
阎晓涛
畅志坚
张晓军
李东方
机构
山西大学生命科学学院
山西省农业科学院作物科学研究所/作物遗传与分子改良山西省重点实验室
农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室
新疆生产建设兵团第六师农业科学研究所
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期41-48,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0100600)
山西省重点研发计划项目(201803D221018-5,201703D211007,201803D421020)
+1 种基金
山西省农业科学院项目(YGG17123,YCX2018D2YS01)
山西省重点科技创新平台项目(201605D151002)。
文摘
由禾本科布氏白粉菌Blumeria graminis(DC.)f.sp.tritici(Bgt)引起的白粉病是影响小麦产量和品质的一种主要病害。为了评价小麦抗白粉病基因相关分子标记在育种中的有效性与实用性,本试验利用感白粉病品种晋麦66和小偃麦衍生品系CH1357构建的341个F 2:3家系为材料,利用本课题组前期已定位的8个与抗白粉病基因PmCH1357相关的分子标记(Xcfd81、Xbwm20、Xbwm21、Xbwm25、Xmp510、Xbwm8、Xbwm9和Xgwm190)对群体进行PCR检测,并接种白粉菌株E09进行苗期抗病性鉴定,分析PCR扩增产物与白粉病抗性间的相关性。结果表明,4个标记(Xcfd81、Xbwm20、Xbwm21和Xbwm25)对群体检测的纯合抗病基因型与纯合抗病表现型符合率均达到93%以上,可用于抗白粉病基因PmCH1357的筛选;为进一步提高标记筛选的准确性,可使用多个标记组合,使用基因同一侧的标记组合进行选择会降低选择效率,使用基因两侧标记组合进行选择可有效提高选择的准确性。使用标记组合Xcfd81+Xbwm8对抗白粉病基因PmCH1357进行选择可以获得更高的准确性及更多有效植株。
关键词
小麦
抗白粉病
基因
pmch
1357
分子标记
选择效率
育种
Keywords
Wheat
Powdery mildew resistance gene
pmch
1357
Molecular markers
Selection efficiency
Breeding
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
鄱阳湖泥鳅黑色素聚集激素1基因及其蛋白结构特征分析
被引量:
1
2
作者
徐敏圣
史建伍
胡芳琴
肖芳美
方磊
盛军庆
王军花
洪一江
机构
南昌大学生命科学学院
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期1114-1120,共7页
基金
江西省科技支撑计划重大项目(20152ACF60013)
江西省科技支撑计划(20123BBF61121
+2 种基金
20123BBE50096
20132BBF60052)资助
江西省特种水产产业技术体系(JXARS-10)~~
文摘
为研究黑色素聚集激素(Melanin-concentrating hormone,MCH)在泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)皮肤黑色素沉着过程中所起的作用,研究采用RACE-PCR技术首次克隆出了鄱阳湖泥鳅前原黑色素聚集激素1(Prepro-melanin-concentrating hormone 1,Pmch1)基因c DNA全长序列,将其命名为Ma Pmch1。运用生物信息学软件对Ma Pmch1基因及其蛋白的理化性质和结构特征进行了分析,构建了系统进化树。其c DNA全长为570 bp,存在一个长度为110 bp的Cp G岛,位于263—372 bp;该基因开放阅读框共375 bp,编码含124个氨基酸的蛋白质,共有7个潜在的磷酸化位点;PMCH1蛋白经水解产生17个氨基酸的环形神经肽黑色素聚集激素1(MCH1)。PMCH1和MCH1均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主;MCH1超二级结构具有一个反平行β-折叠片层,通过二硫键连接形成环形神经肽。同源性分析表明鄱阳湖泥鳅MCH1(Ma MCH1)氨基酸序列与其他硬骨鱼类的高度一致。系统进化树显示,包括泥鳅在内的鲤形目PMCH1聚为一支,且物种间PMCH1的亲缘关系与传统的分类地位相吻合。在脊椎动物中,MCH存在高度保守的序列RCM*GRVYRPCW(*代表随机氨基酸),证明该基因在进化上是极为保守的。
关键词
泥鳅
鄱阳湖
pmch基因
黑色素聚集激素
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
Poyang Lake
pmch
gene
Melanin-concentrating hormone
分类号
Q344.1 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
抗白粉病基因PmCH1357相关分子标记验证与评价
陈芳
李欣
乔麟轶
李锐
郭慧娟
常利芳
张树伟
阎晓涛
畅志坚
张晓军
李东方
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
下载PDF
职称材料
2
鄱阳湖泥鳅黑色素聚集激素1基因及其蛋白结构特征分析
徐敏圣
史建伍
胡芳琴
肖芳美
方磊
盛军庆
王军花
洪一江
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
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