Poly(dA)·poly(dT)结构的喇曼光谱和晶格动力学研究

我们成功地获得了溶液中 poly(d A)·poly(d T)的喇曼光谱 ,并利用晶格动力学方法对于异规模型进行了简正分析。根据势能分布矩阵 (PED)对每一个模式进行了指定。结果表明异规模型的简振频率和 poly(d A)·poly(d T)的喇曼光谱符合得相当好 ,这说明溶液中的 poly(d A)· poly(d T)完全有可能保留了固体纤维中的异规模型结构。

钠离子对poly(dT)·poly(dA)·poly(dT)三螺旋DNA分子呼吸模式的影响

利用分子结构的螺旋对称性 ,建立了一个包括钠离子的三链 DNA分子 poly(d T)· poly(d A)· poly(d T)的晶格动力学模型 ,计算了 poly(d T)· poly(d A)· poly(d T)的氢键呼吸模式。结果发现钠离子的加入明显地淬灭了位于较低频率的几个最为强烈的 Hoogensteen氢键呼吸模式 ,而对 Watson- Crick氢键呼吸模式影响不明显 ,这说明钠离子能提高 poly(d T)· poly(d A)· poly(d T)三螺旋结构的稳定性 .该计算结果很好地解释了 poly(d T)· poly(d A)· poly(d T)

三螺旋DNA分子poly(dT)·poly(dA)·poly(dT)的构型和振动谱

我们计算了ｐｏｌｙ（ｄＴ）·ｐｏｌｙ（ｄＡ）·ｐｏｌｙ（ｄＴ）的Ｈｏｗａｒｄ模型的原子笛卡尔坐标，并利用晶格动力学方法对模型进行了简正分析。结果发现其０Ｐ０对称振动模式位于８０４ｃｍ－１，这和８１０ｃｍ－１附近没有拉曼和红外谱线的实验结果不符。在８００～１０００ｃｍ－１的范围内只有四个振动模式，明显少于拉曼和红外光谱在该范围内的谱线数目。所以我们认为Ｈｏｗａｒｄ模型需要进一步地完善和修正。

三螺旋DNA分子Poly(dT)·Poly(dA)·Poly(dT)碱基振动模式

利用晶格动力学方法计算了三螺旋 DNA分子 poly(d T)· poly(d A)· poly(d T)碱基振动模式 ,并根据势能分布矩阵对碱基振动模式进行了指定。

同聚DNA分子poly(dA)·poly(dT)主链的振动位移

基于同聚DNA分子poly(dA).poly(dT)的螺旋对称性,利用晶格动力学方法,计算了DNA分子poly(dA).poly(dT)主链振动的本征矢,探讨了振动位移矢量和线二色光谱的关系。结果表明,对应着磷酸双氧的反对称振动谱线可以用于直接确定磷酸根的取向,精度小于1°。其它谱线必须通过对分子的简正分析来帮助确定分子的结构。