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Association of TNF-α-238G/A and 308 G/A Gene Polymorphisms with Pulmonary Tuberculosis among Patients with Coal Worker’s Pneumoconiosis 被引量:12
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作者 HONG-MIN FAN ZHUO WANG +7 位作者 FU-MIN FENG KONG-LAI ZHANG JU-XIANG YUAN HONG SUI HONG-YAN QIU LI-HUA LIU XIAO-JUAN DENG JING-XUE REN 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期137-145,共9页
Objectives Tumor necrosis factor-α (TNF-α) may play an important role in host's immune response to mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) infection. This study was to investigate the association of TNF-α... Objectives Tumor necrosis factor-α (TNF-α) may play an important role in host's immune response to mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) infection. This study was to investigate the association of TNF-α gene polymorphism with pulmonary tuberculosis (TB) among patients with coal worker's pneumoconiosis (CWP). Methods A case-control study was conducted in 113 patients with confirmed CWP complicated with pulmonary TB and 113 non-TB controls with CWP. They were matched in gender, age, job, and stage of pneumoconiosis. All participants were interviewed with questionnaires and their blood specimens were collected for genetic determination with informed consent. The TNF-α gene polymorphism was determined with polymerase chain reaction of restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Frequency of genotypes was assessed for Hardy-Weinberg equilibrium by chi-square test or Fisher's exact probability. Factors influencing the association of individual susceptibility with pulmonary TB were evaluated with logistic regression analysis. Gene-environment interaction was evaluated by a multiplieative model with combined OR. All data were analyzed using SAS version 8.2 software. Results No significant difference in frequency of the TNF-α-308 genotype was found between CWP complicated with pulmonary TB and non-TB controls (2,2=5.44, P=-0.07). But difference in frequency of the TNF-α-308 A allele was identified between them (2,2-5.14, P=0.02). No significant difference in frequencies of the TNF-α-238 genotype and allele (P=0.23 and P=0.09, respectively) was found between cases and controls either, with combined (GG and AA) OR of 3.96 (95% confidence interval of 1.30-12.09) at the -308 locus of the TNF-α gene, as compared to combination of the TNF-α-238 GG and TNF-α-308 GG genotypes. Multivariate-adjusted odds ratio of the TNF-α-238 GG and TNF-α-308 GA genotypes was 1.98 (95% CI of 1.06-3.71) for risk for pulmonary TB in patients with CWP. There was a synergic interaction between the TNF-a-308 GG genotype and body mass index (OR=4.92), as well as an interaction between the TNF-α-308 GG genotype and history of BCG immunization or history of TB exposure. And, the interaction of the TNF-α-238 GG genotype and history of BCG immunization or TB exposure with risk for pulmonary TB in them was also indicated. Conclusions TNF-α-308 A allele is associated with an elevated risk for pulmonary TB, whereas TNF-α-238 A allele was otherwise. 展开更多
关键词 Coal worker's pneumoeoniosis (CWP) pulmonary tuberculosis (TB) SUSCEPTIBILITY Polymorphism Tumor necrosis factor (TNF) α-308 α-238 polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism pcr-RFLP) Interaction
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Detecting drug resistant genetic mutation among pneumoconiosis patients complicated with tuberculosis in Mycobacterium tuberculosis L-forms application of PCR-SSCP technique in Huainan mining district
2
作者 JUN Lu Shah Jiang +1 位作者 Song Ye Chaopin Li 《Journal of Nanjing Medical University》 2007年第3期180-184,共5页
Objective: To study the relationship between drug resistant genetic mutation and drug resistance in Mycobacterium tuberculosis L-form, discuss the internal relationship between drug resistances and drug-resistant rel... Objective: To study the relationship between drug resistant genetic mutation and drug resistance in Mycobacterium tuberculosis L-form, discuss the internal relationship between drug resistances and drug-resistant related genes and explore the value of PCR- SSCP to clinical application. Methods: A total of 52 clinically isolated strains of tuberculosis L-form were collected among 97 pneumoconiosis patients complicated with tuberculosis. The gene mutations of katG, rpoB and rpsL were detected by PCR-SSCP, and the results were compared with those analyzed by traditional antimicrobial susceptibility test(AST). Results: The gene muta- tion rates of katG, rpoB and rpsL by PCR-SSCP were respectively 57.70% (30/52), 65.38% (32/52) and 40.38% (21/52). The rate of reversion was 78.85%(41/52) and the result of drag-resistant genes was invariable. The results of AST showed that there were 40 (76.92%) multi-drug resistant strains in 52 clinically isolated strains. The number for three-drug resistant strain was 21 (40.38%) and that of two-drug resistant was 19(36.54%), but only 12(23.08%) strains were one drug resistant. The rate of total drug-resistance was 100%, but there were 15 strains of allied mutation of three genes, 16 of two mutations and 6 of only one by PCR-SSCP. The coincidences were respectively 71.43%, 84.12% and 50.00%. Then there was no significant difference between the allied mutations of multi-drug resistant gene and the mutations of only one drug resistant gene (P 〉 0.05). Conclusion: PCR-SSCP technique has a higher sensibility and specificity to detect the genes of katG, rpoB and rpsL in tuberculosis L-form among pneumoconiosis complicated with tuberculosis,and the detecting rate of two drug resistant strains and three drug resistant strains was higher. The combined application of PCR-SSCP and AST has advantages at earlier diagnosis and guidance of clinical medications. 展开更多
关键词 tuberculosis Mycobacterium tuberculosis L-form DRUG-RESISTANCE KATG rpoB RPSL polymerase chain reaction and single-strand conformation polymorphism pcr-SSCP)
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PCR技术在皮肤结核诊断中的作用 被引量:6
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作者 张开明 王春芳 +1 位作者 唱文娟 李慧仙 《中国皮肤性病学杂志》 CAS 北大核心 1996年第3期133-134,共2页
采用PCR技术对68例皮肤结核及相关疾病进行结核杆菌基因扩增,结果寻常狼疮19/21例为阳性,疣状皮肤结核5/5例阳性,颜面粟粒性狼疮1/23例阳性,而硬红斑均为阴性,结显示PCR是皮肤结核一种快速、简便及敏感性高的... 采用PCR技术对68例皮肤结核及相关疾病进行结核杆菌基因扩增,结果寻常狼疮19/21例为阳性,疣状皮肤结核5/5例阳性,颜面粟粒性狼疮1/23例阳性,而硬红斑均为阴性,结显示PCR是皮肤结核一种快速、简便及敏感性高的诊断方法。 展开更多
关键词 皮肤结核 pcr技术 诊断 结核
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荧光定量PCR测定支气管肺泡灌洗液中TbDNA对涂阴肺结核的诊断价值 被引量:9
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作者 张红漫 李志惠 +4 位作者 赵杰 刘朋冲 耿书军 李毅 宋韬 《中国防痨杂志》 CAS 2009年第4期227-229,共3页
目的探讨纤支镜肺泡灌洗液中结核分枝杆菌DNA在涂阴肺结核诊断中的价值。方法应用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)技术对300例涂阴肺结核,178例菌阳肺结核及119例肺炎或肺癌患者的纤支镜肺泡灌洗液标本进行结核分枝杆菌DNA检测。结果3种... 目的探讨纤支镜肺泡灌洗液中结核分枝杆菌DNA在涂阴肺结核诊断中的价值。方法应用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)技术对300例涂阴肺结核,178例菌阳肺结核及119例肺炎或肺癌患者的纤支镜肺泡灌洗液标本进行结核分枝杆菌DNA检测。结果3种病因肺泡灌洗液结核分枝杆菌DNA阳性检出率分别为:74.3%(223/300)、94.9%(169/178)、17.6%(21/119)。结论荧光定量聚合酶链反应检测肺泡灌洗液结核分枝杆菌DNA,用于肺结核诊断可提高肺结核诊断的敏感性和准确性,明显优于痰抗酸染色,亦较痰结核菌培养诊断灵敏、快速,可作为肺结核诊断较可靠指标。 展开更多
关键词 结核 肺/诊断 支气管肺泡灌洗液 分枝杆菌 结核 DNA 细菌 聚合酶链反应
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荧光定量PCR技术在肺结核诊断中的临床应用研究 被引量:6
5
作者 吴驰 张红梅 +3 位作者 詹能勇 邓永聪 单万水 余卫业 《中国防痨杂志》 CAS 2010年第10期647-650,共4页
目的评价荧光定量PCR技术在肺结核病诊断中的应用价值。方法采用荧光定量PCR、金胺0染色荧光镜检和培养法同时检测860例肺结核患者的痰标本,对检测结果进行比较。结果荧光定量PCR检测灵敏度可达10~100cfu/ml,重复性好,对其他呼吸... 目的评价荧光定量PCR技术在肺结核病诊断中的应用价值。方法采用荧光定量PCR、金胺0染色荧光镜检和培养法同时检测860例肺结核患者的痰标本,对检测结果进行比较。结果荧光定量PCR检测灵敏度可达10~100cfu/ml,重复性好,对其他呼吸道病原体检测结果均为阴性。肺结核患者痰标本荧光定量PCR检测阳性率要高于金胺O染色荧光镜检和培养法的阳性率,差异有统计学意义(P〈0.01)。结论应用荧光定量PCR方法检测结核杆菌,具有特异、灵敏、简便、快速的特点,可作为结核病诊断的方法之一。 展开更多
关键词 结核 肺/诊断 分枝杆菌 结核 聚合酶链反应
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荧光定量PCR测定支气管肺泡灌洗液中TbDNA诊断肺结核的临床价值 被引量:6
6
作者 李志惠 张红漫 +5 位作者 刘建强 刘朋冲 赵杰 李毅 崔丹 冯秀莉 《中国防痨杂志》 CAS 2010年第10期634-636,共3页
目的探讨纤支镜肺泡灌洗液中结核分枝杆菌DNA在肺结核诊断中的价值。方法对187例初治肺结核患者及41例肺炎患者分别应用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)技术检测结核分枝杆菌DNA、肺泡灌洗液结核菌培养、纤维支气管镜刷片抗酸染色。结果... 目的探讨纤支镜肺泡灌洗液中结核分枝杆菌DNA在肺结核诊断中的价值。方法对187例初治肺结核患者及41例肺炎患者分别应用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)技术检测结核分枝杆菌DNA、肺泡灌洗液结核菌培养、纤维支气管镜刷片抗酸染色。结果肺结核患者肺泡灌洗液结核分枝杆菌DNA阳性率为:78.6%、肺泡灌洗液结核菌培养阳性率为28.8%、刷片抗酸染色阳性率为21.9%。肺炎患者肺泡灌洗液结核分枝杆菌DNA、肺泡灌洗液结核菌培养、刷片抗酸染色均阴性。结论荧光定量聚合酶链反应检测肺泡灌洗液结核分枝杆菌DNA,特异性高,用于肺结核诊断可提高肺结核诊断的敏感性和准确性,明显优于纤维支气管镜刷片抗酸染色,亦较肺泡灌洗液结核菌培养诊断灵敏、快速,可作为肺结核诊断较可靠指标。 展开更多
关键词 结核 肺/诊断 支气管肺泡灌洗液 DNA 细菌 聚合酶链反应
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实时荧光PCR检测儿童肺结核粪便中Mtb-DNA的效果评价 被引量:4
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作者 黄慧谦 吴驰 +3 位作者 陈建波 杨燕 侯志平 李小勇 《中国防痨杂志》 CAS 2012年第5期315-318,共4页
目的应用实时荧光PCR快速检测肺结核患儿粪便中Mtb-DNA,并初步评估其临床效果。方法收集肺结核住院儿童粪便标本76份,应用实时荧光PCR检测Mtb-DNA,检测结果与20例其他呼吸系统疾病患儿的粪便实时荧光PCR检测Mtb-DNA、76例粪便抗酸杆菌... 目的应用实时荧光PCR快速检测肺结核患儿粪便中Mtb-DNA,并初步评估其临床效果。方法收集肺结核住院儿童粪便标本76份,应用实时荧光PCR检测Mtb-DNA,检测结果与20例其他呼吸系统疾病患儿的粪便实时荧光PCR检测Mtb-DNA、76例粪便抗酸杆菌涂片检查以及41例患儿痰标本的涂片和(或)培养、实时荧光PCR检测结果进行比较。结果粪便实时荧光PCR检测敏感度达到23.68%(18/76),特异度为100.00%(20/20),肺结核患儿粪便PCR阳性率[23.68%(18/76)]明显高于涂片阳性率[6.58%(5/76)],41例患儿中痰涂片和(或)培养阳性例数(15例)和痰PCR检测阳性例数(18例)高于粪便PCR检测阳性例数(11例)。结论实时荧光PCR检测儿童粪便Mtb-DNA,是一种特异度高、比较敏感、非侵入性且相对安全的儿童肺结核快速诊断方法。 展开更多
关键词 结核 肺/诊断 分枝杆菌 结核 DNA 细菌 粪便 聚合酶链反应 儿童
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结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR检测体系的建立和应用 被引量:6
8
作者 李自慧 吕翎娜 +4 位作者 杜博平 潘丽萍 贾红彦 孙琦 张宗德 《北京医学》 CAS 2018年第4期314-317,322,I0004,共6页
目的建立结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR(droplet digital PCR,dd PCR)检测体系,并用于不同类型临床样本的检测。方法常规提取13株结核分枝杆菌和14株非结核分枝杆菌临床分离株DNA,9例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和4例其他肺部... 目的建立结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR(droplet digital PCR,dd PCR)检测体系,并用于不同类型临床样本的检测。方法常规提取13株结核分枝杆菌和14株非结核分枝杆菌临床分离株DNA,9例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和4例其他肺部疾病患者痰DNA,12例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和7例健康者血浆DNA。设计合成IS6110和IS1081扩增引物和检测探针,建立dd PCR检测体系。应用该体系检测分枝杆菌、痰和血浆3种DNA样本中靶标拷贝数,进行统计学分析。结果建立了能同时检测IS6110和IS1081的dd PCR体系,该体系检测2个靶标的线性范围分别为0.5~8 733和0.2~2 893拷贝/μl反应体系。该体系具有较好的重复性(r>0.95),以非结核分枝杆菌为对照检测结核分枝杆菌的灵敏度和特异度均为100%。在痰和血浆DNA样本检测中,2个靶标拷贝数在肺结核组均显著高于对照组。结论结核分枝杆菌特异性核酸的dd PCR体系,可用于肺结核患者临床分离株、痰和血浆样本的微量核酸检测,对提高结核病病原学诊断能力有重要意义。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 聚合酶链式反应 微滴数字pcr IS6110 IS1081
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肺结核患者结核菌L型感染及其荧光定量PCR检测的意义 被引量:6
9
作者 朱明利 张永乐 +3 位作者 张利诚 章松平 刘寿荣 娄国强 《中国实验诊断学》 2008年第5期632-635,共4页
目的评价荧光定量PCR(FQ-PCR)和结核菌(MTB)L型检测的临床价值。方法收集61例痰阴性肺结核患者痰、血标本分别进行分枝杆菌及其L型培养,并采用染色、免疫组化和FQ-PCR技术进行检测和鉴定,部分标本透射电镜观察。结果痰MTB及其L型检测的... 目的评价荧光定量PCR(FQ-PCR)和结核菌(MTB)L型检测的临床价值。方法收集61例痰阴性肺结核患者痰、血标本分别进行分枝杆菌及其L型培养,并采用染色、免疫组化和FQ-PCR技术进行检测和鉴定,部分标本透射电镜观察。结果痰MTB及其L型检测的阳性率为72.4%,血液阳性率为28.3%,而痰血检测总的阳性率为75.4%。痰直接FQ-PCR33.3%,培养后FQ-PCR40.4%,总阳性率45.5%。血直接FQ-PCR0/35,培养后FQ-PCR 22.5%。痰血FQ-PCR阳性率比较,χ2=5.3028,P<0.05,差异有统计学意义,痰阳性率明显高于血。痰和血FQ-PCR阳性率低于相应的涂片和培养结果。结论分枝杆菌L型的分离和FQ-PCR的应用可提高痰菌阴性肺结核的诊断效率。FQ-PCR阴性不能完全排除结核病,但可用于痰及血中分枝杆菌L型的辅助诊断,尤其对不易从感染部位取得标本的患者更有帮助。 展开更多
关键词 结核 分枝杆菌 结核 L型 荧光定量聚合酶链反应
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结核分支杆菌荧光PCR试剂盒的研制及临床试验 被引量:13
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作者 程钢 何蕴韶 +2 位作者 周新宇 邓文国 李虎 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第6期533-535,共3页
目的用荧光PCR(fluorescence PCR,F-PCR)方法研制结核分支杆菌(TB)DNA检测试剂盒,通过临床试验评价其性能,并与其他方法进行比较。方法F-PCR是PCR和荧光探针杂交技术结合所产生的PCR方法。由于采用完全闭管荧光检测,避免了PCR后处理导... 目的用荧光PCR(fluorescence PCR,F-PCR)方法研制结核分支杆菌(TB)DNA检测试剂盒,通过临床试验评价其性能,并与其他方法进行比较。方法F-PCR是PCR和荧光探针杂交技术结合所产生的PCR方法。由于采用完全闭管荧光检测,避免了PCR后处理导致的假阳性污染;又采用了荧光检测技术,可以提高检测的灵敏性。应用F-PCR检测了297份肺结核病人和249份非结核对照者的痰液标本,以改良罗氏培养法、金胺荧光染液涂片法、Abbott公司的LCx试剂盒检测作为对照。结果设计合成了TB F-PCR诊断试剂盒。检测阳性率49.1%,灵敏性89.2%,特异性98.8%,符合率93.6%。结论F-PCR在灵敏性上显著优于培养法和涂片法,与LCx试剂盒检测无显著差异。F-PCR试剂盒可以检测TB的真实感染情况,对于临床诊断和疗效考察有一定的指导意义。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 荧光pcr试剂盒 研制 临床试验
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适用于结核分枝杆菌微测序耐药基因芯片的多重PCR体系的优化与评价 被引量:3
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作者 孙照刚 李自慧 +4 位作者 张洪静 孙琦 潘丽萍 张宗德 许绍发 《临床肺科杂志》 2020年第2期163-166,共4页
目的优化结核分枝杆菌耐药相关基因多重PCR反应体系并评估其优缺点。方法利用改进的方法提取结核分枝杆菌基因组DNA,优化适合扩增rpoB,katG,mabA/inhA,pncA,embB,gyrA,rpsL,rrs和eis耐药基因片段的多重PCR体系,经测序确定所扩增出的基... 目的优化结核分枝杆菌耐药相关基因多重PCR反应体系并评估其优缺点。方法利用改进的方法提取结核分枝杆菌基因组DNA,优化适合扩增rpoB,katG,mabA/inhA,pncA,embB,gyrA,rpsL,rrs和eis耐药基因片段的多重PCR体系,经测序确定所扩增出的基因片段,计算PCR操作过程所用的时间和材料成本等,分析多重PCR反应体系存在的优缺点。结果经过优化煺火温度、引物浓度以及添加NH 4^+和二甲基亚砜可以较好的扩增出5重和4重PCR产物,达到两管同时扩增9个结核分枝杆菌耐药相关基因的目的。利用该条件可以扩增出全部培养出的135株菌株DNA样本和80.56%的痰菌DNA样本,并且可以缩短PCR操作时间、降低试剂耗材成本,减少操作失误。结论优化的两管多重PCR法在同时扩增9个结核分枝杆菌耐药相关基因,具有明显的优势,具有良好的实用价值。 展开更多
关键词 结核病 结核分枝杆菌 耐药 基因 多重pcr
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应用多重PCR方法检测石蜡包埋组织标本中的分枝杆菌DNA 被引量:3
12
作者 李子玲 秦卫松 +2 位作者 岳清华 孟奎 林勍 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期69-75,共7页
应用多重PCR方法检测并鉴别石蜡包埋组织中的结核分枝杆菌复合体与非结核分枝杆菌DNA扩增片段类型 ,为结核分枝杆菌复合体感染与非结核分枝杆菌感染的病理学诊断提供一种补充的鉴别诊断方法。应用三对具有特异性的寡核苷酸引物 ,进行多... 应用多重PCR方法检测并鉴别石蜡包埋组织中的结核分枝杆菌复合体与非结核分枝杆菌DNA扩增片段类型 ,为结核分枝杆菌复合体感染与非结核分枝杆菌感染的病理学诊断提供一种补充的鉴别诊断方法。应用三对具有特异性的寡核苷酸引物 ,进行多重PCR扩增。这三对引物分别对应于分枝杆菌 6 5kD表面抗原、结核分枝杆菌插入序列IS6 1 1 0及人类β 珠蛋白基因的部分序列 ,其扩增产物分别为 3 83bp、1 2 3bp和 2 6 8bp。此种多重PCR方法检测的灵敏度为 0 6pg。经多重PCR扩增后进行凝胶电泳 ,结核分枝杆菌复合体 (结核分枝杆菌、牛型结核分枝杆菌、BCG)均可见 3 83bp、1 2 3bp片段 ,而非结核分枝杆菌 (鸟、龟、瘰疬、蟾蜍、堪萨斯、胞内、耻垢分枝杆菌 )仅见 3 83bp片段 (猿猴分枝杆菌与结核分枝杆菌复合体相同 )。与上述相比 ,分枝杆菌感染的临床标本分别增加了一条 2 6 8bp片段。对 2 0 9例临床初步诊断为淋巴结结核病人的石蜡包埋组织标本进行了多重PCR检测 ,1 93例病理诊断为淋巴结结核、结核性肉芽组织、结核性肉芽肿性炎症病人的标本 ,检测结果符合结核分枝杆菌复合体感染。1 6例病理诊断为可疑淋巴结结核病人的标本 ,1 5例检测结果符合结核分枝杆菌复合体感染 ,1例符合非结核分枝杆菌感染。此种多重PCR方法可? 展开更多
关键词 多重聚合酶链反应 结核分枝杆菌复合体 非结构分枝杆菌 石蜡包埋组织标本 病毒DNA 检测
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抗酸染色与荧光定量PCR检测在淋巴结结核诊断中的应用 被引量:4
13
作者 黄蓉飞 蔡玮 +1 位作者 樊元春 王晓燕 《成都医学院学报》 CAS 2020年第5期630-633,共4页
目的探讨提高淋巴结空芯针穿刺活检(CNB)诊断淋巴结结核的准确性。方法选取2016年1月1日至2019年12月31日在成都医学院第一附属医院病理科收集的淋巴结CNB病例共68例,进行抗酸染色与荧光定量PCR检测,并将两项辅助检测联合使用与单独使... 目的探讨提高淋巴结空芯针穿刺活检(CNB)诊断淋巴结结核的准确性。方法选取2016年1月1日至2019年12月31日在成都医学院第一附属医院病理科收集的淋巴结CNB病例共68例,进行抗酸染色与荧光定量PCR检测,并将两项辅助检测联合使用与单独使用情况对淋巴结结核的诊断效果进行比较。结果联合使用抗酸染色与荧光定量PCR检测结核的敏感性、特异性和确诊率分别为65.62%(42/64)、100.00%(4/4)、61.76%(42/68),高于单独使用一项辅助检测的确诊率。对于不伴有坏死的肉芽肿性炎病例,辅助检测阴性的比率较高。结论联合应用抗酸染色和PCR检测能提高淋巴结CNB结核诊断的准确率,具有临床应用价值。 展开更多
关键词 空芯针穿刺活检 淋巴结结核 pcr 诊断 联合应用
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绵羊肺腺瘤PCR诊断方法的建立及应用 被引量:2
14
作者 周艳喜 苏佳 +2 位作者 李靖 刘霄卉 马学恩 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第10期24-28,共5页
利用特异性PCR方法实现对绵羊肺腺瘤病毒(OPAV)快速精确诊断和病毒类型的分析。参照GenBank中公布的外源性绵羊肺腺瘤病毒基因序列,针对病毒env基因YXXM基序设计了特异性PCR引物,建立了特异性PCR检测方法。成功扩增出病毒囊膜基因(env)... 利用特异性PCR方法实现对绵羊肺腺瘤病毒(OPAV)快速精确诊断和病毒类型的分析。参照GenBank中公布的外源性绵羊肺腺瘤病毒基因序列,针对病毒env基因YXXM基序设计了特异性PCR引物,建立了特异性PCR检测方法。成功扩增出病毒囊膜基因(env)多变区序列片段(ST)通过序列比对确定病毒类型。此方法操作简便,可用于绵羊肺腺瘤的快速诊断,可望在绵羊肺腺瘤发病机制等研究中起到重要作用。 展开更多
关键词 绵羊肺腺瘤病毒 聚合酶链反应 检测
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痰标本PCR-反向斑点杂交法对疑似非结核分枝杆菌肺病的诊断价值 被引量:5
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作者 程丽平 张晓岩 沙巍 《中国防痨杂志》 CAS 2018年第8期834-839,共6页
目的 探讨痰PCR-反向斑点杂交法对疑似非结核分枝杆菌(NTM)肺病的诊断价值。方法 搜集2014年1月至2017年10月同济大学附属上海市肺科医院收治的、通过临床症状和影像学检查疑诊为NTM肺病的患者334例,分别取痰液行PCR-反向斑点杂交法... 目的 探讨痰PCR-反向斑点杂交法对疑似非结核分枝杆菌(NTM)肺病的诊断价值。方法 搜集2014年1月至2017年10月同济大学附属上海市肺科医院收治的、通过临床症状和影像学检查疑诊为NTM肺病的患者334例,分别取痰液行PCR-反向斑点杂交法分枝杆菌菌种鉴定基因检测及分枝杆菌传统培养法[对硝基苯甲酸(PNB)、噻吩-2-羧酸肼(TCH)培养基生长试验]检测,最终确诊为NTM肺病患者218例(NTM肺病组)、结核病患者42例(结核病组)、其他肺部疾病患者74例(研究中予以排除)。以最终确诊结果为金标准,对痰PCR-反向斑点杂交法诊断临床疑诊NTM肺病患者的敏感度、特异度、阳性预测值和符合率进行分析。结果 疑诊NTM肺病的334例患者中,培养法分枝杆菌检出率为67.66%(226/334),PCR-反向斑点杂交法分枝杆菌检出率为64.67%(216/334),两种方法分枝杆菌检出率的比较,差异无统计学意义(χ^2=0.67,P=0.231)。确诊的218例NTM肺病患者中,PCR-反向斑点杂交法检出NTM的敏感度为82.57%(180/218),阳性预测值为98.36%(180/183);培养法检出NTM的敏感度为87.61%(191/218),阳性预测值为100.00%(191/191);两种方法检出NTM的敏感度比较,差异无统计学意义(χ^2=1.20,P=0.169)。以42例结核病组患者作为对照,PCR-反向斑点杂交法检测的特异度为78.57%(33/42),诊断结核病的阳性预测值为100.00%(33/33);培养法的特异度为83.33%(35/42),诊断结核病的阳性预测值为100.00%(35/35);两种检测方法特异度的比较,差异无统计学意义(χ^2=0.31,P=0.391)。PCR-反向斑点杂交法在两组患者中的诊断符合率为83.08%(216/260),培养法在两组患者中的诊断符合率为86.92%(226/260),差异无统计学意义(χ^2=1.51,P=0.134)。 结论 以胸部CT检查为诊断基础的疑似NTM肺病患者中,应用PCR-反向斑点杂交法行痰液NTM检测具有较高的敏感度和特异度,对临床的快速准确诊断和及时治疗有一定的参考意义。 展开更多
关键词 分枝杆菌 非典型性 结核 诊断 聚合酶链反应 酶联免疫斑点检测
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利用PCR技术检测537份新疆结核病人痰标本中的结核分枝杆菌 被引量:1
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作者 蔡宏 李君莲 +5 位作者 呼西旦 李淑霞 黄丽茜 陈银华 许苗 朱玉贤 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2001年第4期65-67,共3页
目的 提高聚合酶链反应在检测人结核分枝杆菌中的特异性和敏感性。方法 在聚合酶链反应中对 4种DNA片段即结核杆菌特异插入序列IS6 110 ,IS10 81,和 16SrRNA ,6 5kDa摸板进行了比较 ;为获取较多的细菌DNA ,临床痰标本处理采用了国际... 目的 提高聚合酶链反应在检测人结核分枝杆菌中的特异性和敏感性。方法 在聚合酶链反应中对 4种DNA片段即结核杆菌特异插入序列IS6 110 ,IS10 81,和 16SrRNA ,6 5kDa摸板进行了比较 ;为获取较多的细菌DNA ,临床痰标本处理采用了国际标准化方法主要包括用一定量的N -乙酰 -L半胱胺酸和氢氧化钠处理痰标本 ;改进了RCR混和液的成份即添加了甘油 ,dUTP -尿嘧啶糖基化酶。结果 选择IS6 110作为结核杆菌特异性摸板用于检测细菌DNA ,制备出了 6批人结核杆菌PCR检测试剂盒 ,在对来自新疆结核病研究所的 5 37份痰标本的检测中发现 ,该试剂盒检测的特异性为 6 5 .97% ,敏感性为 93 .5 3 %。结论改良TB -PCR试剂盒显示有较高的敏感性 ,特异性还有待于进一步完善 ,该试剂盒在临床诊断中有一定的价值。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 痰标本 聚合酶链式反应 结核杆菌pcr检测试剂盒 结核病
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PCR-SSCP法检测结核分枝杆菌L型rpsL耐药基因 被引量:1
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作者 陆军 叶松 金强 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期107-108,共2页
目的探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌(MT)L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素(SM)的关系。方法用PCR-SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验(AST法)的结果进行对比分析。结果采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共... 目的探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌(MT)L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素(SM)的关系。方法用PCR-SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验(AST法)的结果进行对比分析。结果采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共有26株(50.0%)耐SM;PCR-SSCP法检出rpsL基因突变率为40.4%(21/52),2种方法检测耐药株的符合率为80.8%。结论结核杆菌L型对SM的耐药与rpsL基因突变有关。 展开更多
关键词 尘肺 结核分枝杆菌L型 耐药 RPSL基因 聚合酶链反应-单链构象多态性分析
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等位基因特异多重PCR快速检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性研究 被引量:1
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作者 焦伟伟 孙琳 +3 位作者 李兆娜 顾艺 孙桂芝 申阿东 《标记免疫分析与临床》 CAS 2009年第1期34-37,共4页
了解北京地区异烟肼(INH)耐药结核分枝杆菌(MTB)的分子特点,评价等位基因特异多重PCR在INH耐药性快速检测中的应用价值。选取102株北京地区MTB临床分离株,首先分别采用PCR-RFLP和反向线性杂交技术(RLB)检测耐药相关基因katG和inhA突变,... 了解北京地区异烟肼(INH)耐药结核分枝杆菌(MTB)的分子特点,评价等位基因特异多重PCR在INH耐药性快速检测中的应用价值。选取102株北京地区MTB临床分离株,首先分别采用PCR-RFLP和反向线性杂交技术(RLB)检测耐药相关基因katG和inhA突变,然后运用等位基因特异多重PCR方法同时检测katG和inhA基因突变,并与PCR-RFLP和RLB分别检测的结果进行比较。采用等位基因特异多重PCR检测发现,INH耐药株中60.3%(35/58)存在katG315突变,13.8%(8/58)发生了inhA突变,两者同时突变率为6.9%(4/58),INH敏感株中没有发现katG315突变,而inhA突变率为18.2%(8/44)。上述检测结果与PCR-RFLP和RLB分别检测的结果完全一致,且等于两种方法结果之和,提示等位基因特异多重PCR可完全取代PCR-RFLP和RLB。北京地区INH耐药菌株以katG315 AGC→ACC突变为主;联合检测katG315和inhA基因可提高INH耐药株的检出率。等位基因特异多重PCR操作简便,结果易于判断,可作为临床MTB菌株中INH耐药性快速检测的辅助手段。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 抗药性 异烟肼 等位基因特异多重pcr 反向线形杂交 pcr-RFLP
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结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的二重PCR快速检测试剂盒的研究 被引量:4
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作者 谢志勤 谢芝勋 +7 位作者 刘加波 庞耀珊 邓显文 谢丽基 温娟 蓝如束 张振荣 黄海强 《湖南农业科学》 2010年第10期26-29,共4页
根据已发表的结核分枝杆菌23S rRNA和牛分枝杆菌特殊基因序列,设计并合成了2对可扩增结核分枝杆菌和牛分枝杆菌特异性基因片段的引物,建立二重PCR快速检测结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的方法,并研制出检测试剂盒。结果表明,该检测试剂盒对... 根据已发表的结核分枝杆菌23S rRNA和牛分枝杆菌特殊基因序列,设计并合成了2对可扩增结核分枝杆菌和牛分枝杆菌特异性基因片段的引物,建立二重PCR快速检测结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的方法,并研制出检测试剂盒。结果表明,该检测试剂盒对结核分枝杆菌能特异性地扩增出838 bp条带而扩增不出631 bp条带,牛分枝杆菌能特异地扩增出838 bp和631 bp条带,而对其他牛菌株的DNA扩增结果均为阴性;敏感性试验表明最低能检测出50 pg的结核分枝杆菌和牛分枝杆菌DNA模板;保存期测定结果表明,在-20℃条件下保存至1、3、6、9个月时,试剂盒的敏感性无明显变化,仍能检测到50 pg的DNA模板,保存至12个月时其敏感度仍能100%检出阳性样品。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 牛分枝杆菌 二重pcr 试剂盒
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结核杆菌(TB)PCR荧光诊断试剂盒的临床应用 被引量:1
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作者 雷建平 熊国亮 +3 位作者 周平桢 蔡建荣 钭芳芳 宋小莲 《江西医学检验》 2000年第3期135-137,共3页
探讨半定量TB-PCR 荧光探针诊断试剂盒的临床应用价值.方法 以双盲法对115例结核病和59例非结核病人的痰标本进行厚涂片抗酸染色检查、结核菌培养、荧光探针 TB-PCR 检查对比.结果 三种方法检测的敏感性分别为32.2%、59.1%、71.3%... 探讨半定量TB-PCR 荧光探针诊断试剂盒的临床应用价值.方法 以双盲法对115例结核病和59例非结核病人的痰标本进行厚涂片抗酸染色检查、结核菌培养、荧光探针 TB-PCR 检查对比.结果 三种方法检测的敏感性分别为32.2%、59.1%、71.3%,荧光探针TB-PCR 法的敏感性显著高于培养法和涂片法(P<0.01和P<0.05).特异性分别为93.2%、91.5%、94.9%,差异无显著性.结论 半定量TB-PCR荧光探针诊断试剂盒可应用于临床结核杆菌检测. 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 聚合酶链反应 荧光探针 试剂盒
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