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Association Analysis of Quantitative Traits in F_1 Families Derived from Two Maize Landraces
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作者 Yuanqi WU Ling ZHENG Jiankang WANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2012年第6期1-8,共8页
[Objective]The objective of this study was to evaluate the genetic diversity and characterization of special maize population consisting of 135 F1 families. [Method]In this study,association analysis was conducted in ... [Objective]The objective of this study was to evaluate the genetic diversity and characterization of special maize population consisting of 135 F1 families. [Method]In this study,association analysis was conducted in 135 F1 families derived from two maize landraces,and the efficiency of this method was evaluated through simulation. [Result]Association analysis with different kinds of families showed that large population size and robust phenotypic data were required for association mapping. For all the phenotypic traits,the model controlling both population structure and relative kinship (Q+K) performed better than the model controlling relative kinship (K),and similarly to the model controlling population structure (Q). Across 100 simulation runs in QULINE,the average power of QTL detection for the two models were 88. 64% and 83. 64% respectively,and the number of false QTL was reduced from 399 with GLM model to 199 with K model. Our simulation results suggested that these F1 families can be used for association analysis,and the power of the QTL detection was related to the maximum allele frequency (MAF) and the phenotypic variation ( PVE) explained by QTL. [Conclusion]The results from this study suggest that association analysis using the F1 families is an effective approach to study maize landraces for discovering elite genes which we are interested in from these special populations. 展开更多
关键词 关联分析 特用玉米 地方品种 家庭 数量性状 QTL检测 等位基因频率 模型控制
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Progress in the Study of Molecular Genetic Improvements of Poplar in China 被引量:4
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作者 Shan-Zhi Lin Zhi-Yi Zhang Qian Zhang Yuan-Zhen Lin 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第9期1001-1007,共7页
白杨是由于它在木材工业并且作为为木质的植物的学习的模型材料的宽申请的最经济地重要、强烈地学习的树种类之一。在中国的白杨的自然资源是饱满的。在过去的 10 年,到在白杨种类的基因改进的分子的生物技术的申请广泛地在中国被学习... 白杨是由于它在木材工业并且作为为木质的植物的学习的模型材料的宽申请的最经济地重要、强烈地学习的树种类之一。在中国的白杨的自然资源是饱满的。在过去的 10 年,到在白杨种类的基因改进的分子的生物技术的申请广泛地在中国被学习了。在白杨的分子的基因改进的最近的进展包括 cDNA 图书馆建设,基因克隆和鉴定,遗传工程,基因表示,基因连接地图建设,量的特点 loci (QTL ) 和分子帮助选择印射,在现在的纸被考察。另外,到白杨和一些未解决的问题的基因特点地的分子的改进的现代生物工学的申请被讨论。 展开更多
关键词 分子遗传 白杨树 中国 植物研究
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杨树叶片数量性状相关联标记及其图谱定位研究 被引量:28
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作者 苏晓华 李金花 +2 位作者 陈伯望 张绮纹 张香华 《林业科学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期33-40,共8页
利用数量遗传学方法和分子标记相结合,对美洲黑杨与青杨杂交产生的F2 群体5 个叶片数量性状进行了相关联标记及其图谱定位研究。用单因素方差分析检测出与叶长、叶宽、叶长/ 宽比、叶柄长和叶面积相关联的RAPD 标记分别为10... 利用数量遗传学方法和分子标记相结合,对美洲黑杨与青杨杂交产生的F2 群体5 个叶片数量性状进行了相关联标记及其图谱定位研究。用单因素方差分析检测出与叶长、叶宽、叶长/ 宽比、叶柄长和叶面积相关联的RAPD 标记分别为10 ,10 ,4 ,9 ,12 个;联合贡献率分别为66-23 % ,61-82 % ,32-86 % ,59-67 % ,81-79 % 。用双因素方差分析检测出与互作QTLs 紧密相关联的标记位点共19 对,其中与叶长、叶宽、叶长/ 宽比、叶柄长和叶面积显著相关联的标记分别有4 对,2 对,1 对,5 对,7 对。与这5 个性状相关联的标记多数集中分布于第4 ,12 ,15 和17 条连锁群上。 展开更多
关键词 杨树 数量性状 关联标记 图谱定位 叶片
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紫花苜蓿QTL与全基因组选择研究进展及其应用 被引量:7
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作者 康俊梅 张铁军 +2 位作者 王梦颖 张怡 杨青川 《草业学报》 CSCD 北大核心 2014年第6期304-312,共9页
四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱... 四倍体紫花苜蓿是重要的豆科牧草之一,由于其复杂的遗传背景与二倍体作物相比遗传作图与重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位研究相对滞后。然而,二倍体苜蓿的相关研究起步较早,已经建立了高密度遗传图谱和物理图谱,这些研究为四倍体苜蓿遗传作图与QTL定位奠定了基础。随着第三代分子标记与测序技术的快速发展,极大地促进了四倍体苜蓿的高密度遗传图谱构建与QTL定位研究,并借助分子标记辅助育种技术对提高苜蓿选育效率,加速育种进程具有重要意义。本文对苜蓿遗传图谱构建与QTL定位研究及发展趋势进行了总结,并对苜蓿关联作图与全基因组选择的研究进展及应用前景加以概述,旨在为读者就相关研究领域有较全面的了解。 展开更多
关键词 苜蓿 遗传连锁图谱 QTL 全基因组选择 分子标记辅助育种
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茶树分子标记辅助育种研究进展 被引量:2
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作者 王让剑 杨军 +2 位作者 孔祥瑞 陈常颂 余文权 《茶叶学报》 2017年第4期157-163,共7页
茶树是多年生异花授粉作物,育种效率低。分子标记辅助选择技术可以显著提高育种效率,已成为作物遗传育种领域的研究重点。发掘与目标性状紧密连锁的功能性分子标记是开展分子标记辅助选择育种的前提,目前主要依靠QTL作图与关联作图两种... 茶树是多年生异花授粉作物,育种效率低。分子标记辅助选择技术可以显著提高育种效率,已成为作物遗传育种领域的研究重点。发掘与目标性状紧密连锁的功能性分子标记是开展分子标记辅助选择育种的前提,目前主要依靠QTL作图与关联作图两种方法。简述了QTL作图和关联作图在茶树分子标记辅助育种研究中的进展及存在的问题,并对其发展趋势进行了展望。 展开更多
关键词 茶树 分子标记辅助育种 数量性状位点 遗传作图 关联作图
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Molecular Tagging and Mapping of Quantitative Trait Loci for Lint Percentage and Morphological Marker Genes in Upland Cotton 被引量:14
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作者 Wang-Zhen Guo Guo-Jia Ma Yi-Chao Zhu Chen-Xin Yi Tian-Zhen Zhang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第3期320-326,共7页
用个人们由交叉开发了的 219 F2,基因标准衬里 TM-1and 在 Gossypium hirsutum L. 的多重主导的标记线 T586,与 19linkage 组一起的一张基因连锁图基于简单顺序重复(SSR ) 被构造标记。与 ourtetraploid backboned 相比分子的遗传图... 用个人们由交叉开发了的 219 F2,基因标准衬里 TM-1and 在 Gossypium hirsutum L. 的多重主导的标记线 T586,与 19linkage 组一起的一张基因连锁图基于简单顺序重复(SSR ) 被构造标记。与 ourtetraploid backboned 相比分子的遗传图谱从一(TM-1 x Hai 7124 ) x TM-1 BC1 人口, 17 个 the19 连接组被联合并且抛锚到 12 个染色体(亚染色体) 。这些组,在 T586 的四词法标记基因被印射进分子的连锁图。同时,为棉绒百分比的三量的特点 loci 在 A03 连接组和染色体上独立被标注并且印射 6 …… 展开更多
关键词 分子标记 形态学 基因表达 棉花
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黄瓜苗期主要农艺性状相关QTL定位分析 被引量:9
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作者 苗晗 顾兴芳 +4 位作者 张圣平 张忠华 黄三文 王烨 方智远 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期879-887,共9页
利用以华北保护地类型黄瓜9930和欧洲温室类型黄瓜9110Gt为亲本构建的含148株系的F9代RILs群体遗传图谱,结合春秋两季4次黄瓜苗期相关性状的表型鉴定数据,使用MapQTL4.0软件采用多座位QTL模型(MQM)进行QTL定位分析?在RIL群体中检测... 利用以华北保护地类型黄瓜9930和欧洲温室类型黄瓜9110Gt为亲本构建的含148株系的F9代RILs群体遗传图谱,结合春秋两季4次黄瓜苗期相关性状的表型鉴定数据,使用MapQTL4.0软件采用多座位QTL模型(MQM)进行QTL定位分析?在RIL群体中检测到与子叶长、子叶宽、下胚轴长、第一雌花节位、始花期等5个性状相关的QTL共19个,分布在1、3、5、6号染色体上,其中主效QTL(贡献率≥10.0%)17个,占总数的89.5%,可在不同季节重复检出的QTL3个;检测到的QTL的LOD值在3.28~15.25之间,可解释的表型变异在6%~37.8%之间。结合基因组序列信息对主效QTL定位区域进行了基因预测。 展开更多
关键词 黄瓜 苗期相关性状 QTL 重组自交系 SSR标记
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关联分析及其在果树育种研究中的应用 被引量:2
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作者 赵惠 房玉林 +4 位作者 张颖 樊秀彩 孙海生 姜建福 刘崇怀 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期2291-2299,共9页
果树在中国农业发展中具有重要作用,而且其经济性状大多属于数量性状。基于连锁分析的QTL作图是研究这些复杂性状的有效手段,但尚存在一定的局限性。随着分子生物学的发展,关联分析已然成为发掘性状控制基因的重要手段之一,它以连锁不... 果树在中国农业发展中具有重要作用,而且其经济性状大多属于数量性状。基于连锁分析的QTL作图是研究这些复杂性状的有效手段,但尚存在一定的局限性。随着分子生物学的发展,关联分析已然成为发掘性状控制基因的重要手段之一,它以连锁不平衡为基础,发掘生物性状与遗传标记之间的对应关系,寻找控制性状的关键候选基因。本研究全面论述了关联分析的基本概念、原理、方法及其优越性。并综述了关联分析在果树数量性状、标记开发及功能基因挖掘方面的最新研究进展,进而,探讨关联分析在果树种质资源中的发展方向,并对其应用前景提出展望。 展开更多
关键词 关联分析 连锁不平衡 数量性状 功能标记 功能基因
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