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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌共同外膜蛋白
被引量:
4
1
作者
李昂
孙俊毅
+3 位作者
孙媛媛
石建峰
饶国洲
苟建重
《中华口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期614-618,共5页
目的 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术筛选多种牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)共同外膜蛋白(outer membr...
目的 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术筛选多种牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)共同外膜蛋白(outer membrane protein,OMP),为针对多种Pg设计具有交叉保护作用的疫苗提供候选靶抗原.方法 应用超速离心法提取PgATCC33277、Pgw83、Pg301和Pg381菌株外膜蛋白,SELDI疏水性蛋白芯片H50检测OMP,Biomarker Wizard软件分析4种菌株OMP质谱图.结果 OMP质谱图显示,PgATCC33277、PgW83、Pg301和Pg381分别有71、74、76和72个蛋白质峰,并存在13种共同OMP 在美国国立生物信息中心蛋白库中鉴定到一种已知蛋白gil116636495,其功能尚不清楚.结论 发现13种共同OMP可作为牙周病疫苗候选抗原,证实基于SELDI-TOF-MS技术适合检测小相对分子质量(<20000)、低丰度、疏水性蛋白,且操作简单、重复性好,可用于大规模寻找Pg的共同OMP.
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关键词
紫单胞菌
龈
细菌外膜蛋白质类
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
原文传递
联合应用二维液相色谱及串联质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌外膜蛋白抗原的初步研究
被引量:
1
2
作者
李昂司薇杭王嗣岑石建峰饶国洲苟建重
司薇杭
+3 位作者
王嗣岑
石建峰
饶国洲
苟建重
《中华口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期749-753,共5页
目的 联合应用二维液相色谱(two-dimensional liquid phase fractionation,PF2D)及基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight/time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF...
目的 联合应用二维液相色谱(two-dimensional liquid phase fractionation,PF2D)及基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight/time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF/TOF-MS)技术,筛选多种牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)共同外膜蛋白(outer membrane protein,OMP),为针对多种Pg设计具有交叉保护作用的疫苗提供候选靶抗原.方法 超高速离心法提取Pg301、PgATCC33277和PgW83菌株OMP,应用PF2D目标蛋白快速分离系统分离OMP,对比分析得到共同OMP,用MALDI-TOF/TOF-MS串联质谱结合数据库搜索,确定蛋白质一级结构.结果 第一维色谱聚焦分离,3株Pg共获得99个蛋白质样本;选定OMP组分B7,进行第二维反相色谱分离,3株Pg共确定了8个共同的蛋白色谱峰,运用MALDI-TOF/TOF-MS对蛋白样品进行鉴定,结果 确定了其中一个为已知的蛋白精氨酸-牙龈素A.结论 PF2D分离系统分辨率高、重现性好,结合MALDI-TOF/TOF-MS串联质谱技术,可用于鉴定Pg的共同OMP.
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关键词
紫单胞菌
龈
细菌外膜蛋白质类
色谱法
液相
基质辅助激光解析/电离飞行时间串联质谱
原文传递
题名
应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌共同外膜蛋白
被引量:
4
1
作者
李昂
孙俊毅
孙媛媛
石建峰
饶国洲
苟建重
机构
西安交通大学医学院附属口腔医院口腔医学研究中心
出处
《中华口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期614-618,共5页
基金
基金项目:国家自然科学基金(30500560)
陕西省自然科学基础研究计划(2006C242)
文摘
目的 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术筛选多种牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)共同外膜蛋白(outer membrane protein,OMP),为针对多种Pg设计具有交叉保护作用的疫苗提供候选靶抗原.方法 应用超速离心法提取PgATCC33277、Pgw83、Pg301和Pg381菌株外膜蛋白,SELDI疏水性蛋白芯片H50检测OMP,Biomarker Wizard软件分析4种菌株OMP质谱图.结果 OMP质谱图显示,PgATCC33277、PgW83、Pg301和Pg381分别有71、74、76和72个蛋白质峰,并存在13种共同OMP 在美国国立生物信息中心蛋白库中鉴定到一种已知蛋白gil116636495,其功能尚不清楚.结论 发现13种共同OMP可作为牙周病疫苗候选抗原,证实基于SELDI-TOF-MS技术适合检测小相对分子质量(<20000)、低丰度、疏水性蛋白,且操作简单、重复性好,可用于大规模寻找Pg的共同OMP.
关键词
紫单胞菌
龈
细菌外膜蛋白质类
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
Keywords
porphyromonas gingivalis bacterial outer membrane proteins surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry
分类号
R78 [医药卫生—口腔医学]
原文传递
题名
联合应用二维液相色谱及串联质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌外膜蛋白抗原的初步研究
被引量:
1
2
作者
李昂司薇杭王嗣岑石建峰饶国洲苟建重
司薇杭
王嗣岑
石建峰
饶国洲
苟建重
机构
西安交通大学医学院附属口腔医院口腔医学研究中心
西安交通大学医学院附属口腔医院牙周科
西安交通大学医学院天然药物工程研究中心
出处
《中华口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期749-753,共5页
基金
国家自然科学基金(30500560)
陕西省自然科学基础研究计划(2006C242)
文摘
目的 联合应用二维液相色谱(two-dimensional liquid phase fractionation,PF2D)及基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight/time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF/TOF-MS)技术,筛选多种牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,Pg)共同外膜蛋白(outer membrane protein,OMP),为针对多种Pg设计具有交叉保护作用的疫苗提供候选靶抗原.方法 超高速离心法提取Pg301、PgATCC33277和PgW83菌株OMP,应用PF2D目标蛋白快速分离系统分离OMP,对比分析得到共同OMP,用MALDI-TOF/TOF-MS串联质谱结合数据库搜索,确定蛋白质一级结构.结果 第一维色谱聚焦分离,3株Pg共获得99个蛋白质样本;选定OMP组分B7,进行第二维反相色谱分离,3株Pg共确定了8个共同的蛋白色谱峰,运用MALDI-TOF/TOF-MS对蛋白样品进行鉴定,结果 确定了其中一个为已知的蛋白精氨酸-牙龈素A.结论 PF2D分离系统分辨率高、重现性好,结合MALDI-TOF/TOF-MS串联质谱技术,可用于鉴定Pg的共同OMP.
关键词
紫单胞菌
龈
细菌外膜蛋白质类
色谱法
液相
基质辅助激光解析/电离飞行时间串联质谱
Keywords
porphyromonas
gingivalis
bacterial
outer
membrane
proteins
Chromatography liquid
Matrix-assisted
laser
desorption
ionization
time-of-flight
/
time-of-flight
mass
spectrometry
分类号
R446.1 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌共同外膜蛋白
李昂
孙俊毅
孙媛媛
石建峰
饶国洲
苟建重
《中华口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
4
原文传递
2
联合应用二维液相色谱及串联质谱技术筛选牙龈卟啉单胞菌外膜蛋白抗原的初步研究
李昂司薇杭王嗣岑石建峰饶国洲苟建重
司薇杭
王嗣岑
石建峰
饶国洲
苟建重
《中华口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
原文传递
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