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杨树KT、HAK、KUP基因家族鉴定及钾肥处理对杨树生长的影响
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作者 安伟 张玲玲 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期1-8,共8页
KT、HAK、KUP基因家族是植物进行K^(+)转运的最大蛋白系统。以毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)全基因组数据为基础,利用生物信息学方法对杨树KT、HAK、KUP家族进行了全基因组鉴定,并在毛果杨全基因组中鉴定出20个KT、HAK、... KT、HAK、KUP基因家族是植物进行K^(+)转运的最大蛋白系统。以毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)全基因组数据为基础,利用生物信息学方法对杨树KT、HAK、KUP家族进行了全基因组鉴定,并在毛果杨全基因组中鉴定出20个KT、HAK、KUP家族成员。理化性质预测分析表明:KT、HAK、KUP基因家族成员均为疏水性蛋白,等电点在5.30~9.16;亚细胞定位预测显示家族成员蛋白集中在细胞质膜上。应用拟南芥和杨树构建系统进化树显示,KT、HAK、KUP基因家族可分为5个亚家族。基因结构及基序(motif)分析表明,KT、HAK、KUP基因进化过程相对保守。顺式作用元件分析表明,KT、HAK、KUP基因家族成员含有诸多与激素、逆境胁迫的响应元件。杨树不同钾离子浓度处理下,植株的净生长情况呈现了显著的差异,说明钾元素对杨树生长影响较大。 展开更多
关键词 钾转运蛋白 杨树
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黄瓜HAK基因家族的鉴定与生物信息学分析
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作者 卢朝辉 樊怀福 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期38-47,共10页
为了深入研究黄瓜K^(+)转运蛋白基因家族KUP/HAK/KT的相关功能,本研究通过全基因组分析技术等生物信息学手段鉴定CsHAK家族成员,分析其进化关系、基因结构,蛋白质三级结构、顺式作用元件及共线性关系。结果发现,黄瓜基因组共有15个CsHA... 为了深入研究黄瓜K^(+)转运蛋白基因家族KUP/HAK/KT的相关功能,本研究通过全基因组分析技术等生物信息学手段鉴定CsHAK家族成员,分析其进化关系、基因结构,蛋白质三级结构、顺式作用元件及共线性关系。结果发现,黄瓜基因组共有15个CsHAK基因,不均匀分布在黄瓜染色体chr1、chr3、chr4、chr5、chr7上,亚细胞定位预测发现CsHAK基因位于细胞质膜;CsHAK基因家族可分为3个亚家族,大部分家族成员包含12个保守基序和K_trans保守功能结构域,基因启动子区所含元件与激素调节、光响应、胁迫密切相关;CsHAK家族成员之间发生2个串联重复事件,Ks/Ka值均小于1,表明其进化受纯化选择作用。研究结果为进一步深入挖掘CsHAKs在黄瓜生长发育及逆境胁迫响应中的功能及作用机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 黄瓜 高亲和K^(+)转运蛋白 基因家族 全基因组鉴定
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萝卜HAK/KUP/KT基因家族鉴定与表达特性分析 被引量:1
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作者 程瑞 汪国莲 +5 位作者 孙玉东 王林闯 罗德旭 王玮 仲秀娟 赵建锋 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期777-787,共11页
钾元素是植物生长发育过程中必需的主要矿质营养元素之一,对作物的产量和品质有决定性影响,细胞内K+含量水平在很大程度上受K+转运蛋白控制。通过生物信息学方法从全基因组水平鉴定出萝卜K^(+)转运蛋白HAK/KUP/KT基因家族成员,并对其基... 钾元素是植物生长发育过程中必需的主要矿质营养元素之一,对作物的产量和品质有决定性影响,细胞内K+含量水平在很大程度上受K+转运蛋白控制。通过生物信息学方法从全基因组水平鉴定出萝卜K^(+)转运蛋白HAK/KUP/KT基因家族成员,并对其基因结构、蛋白质特性、保守基序、染色体定位、启动子顺式作用元件、系统进化及表达特性等进行分析。结果表明,鉴定出的17个萝卜HAK/KUP/KT基因不均等地分布在萝卜6条染色体及Scaffold00840上,根据与拟南芥的同源关系将其命名为RsHAK1~RsHAK17;RsHAKs基因结构、保守基序、蛋白质理化特性等均具有高度保守性,启动子区域存在大量与环境因素、植物激素、逆境胁迫应答等有关的顺式作用元件;系统进化分析结果显示,17个RsHAKs基因聚为4个亚家族,全基因组复制事件是RsHAKs基因扩张的主要驱动力。转录组和qRT-PCR表达分析结果表明,除RsHAK5仅在萝卜根部表达外,其他RsHAKs在萝卜各器官及发育过程中均有特异性表达,且在高钾渗透胁迫下在叶片中相对表达量显著上调,RsHAK3、RsHAK9、RsHAK11和RsHAK12在根部呈现明显的缺钾诱导表达模式。研究结果为进一步全面解析HAK/KUP/KT基因在萝卜中的生物学功能以及提高萝卜栽培品质提供了一定理论依据。 展开更多
关键词 萝卜 钾转运蛋白 基因家族 K^(+) 表达分析
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根际微生态系统中钾素转化与循环研究进展
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作者 张丽红 刘英杰 +4 位作者 张宏 陈光 吕江涛 刘正学 王禄山 《山东农业科学》 北大核心 2023年第3期166-172,共7页
钾是植物生长所必需的大量营养元素之一,钾素在植物代谢和植物组织与器官之间营养物质的运输机制中起着关键作用。植物主要通过根部吸收土壤中的钾素并由转运蛋白运输,此外钾素的转化和循环与解钾微生物紧密相关,在植物-土壤-微生物生... 钾是植物生长所必需的大量营养元素之一,钾素在植物代谢和植物组织与器官之间营养物质的运输机制中起着关键作用。植物主要通过根部吸收土壤中的钾素并由转运蛋白运输,此外钾素的转化和循环与解钾微生物紧密相关,在植物-土壤-微生物生态系统中起着至关重要的作用。本文综述了根际微生态系统中钾素的转化与循环,包括土壤中钾的存在形式和转化、植物对钾的吸收和利用、土壤微生物解钾菌的研究。深入了解根际微生态领域钾素转化与循环的过程,可为农业生产中钾素调控及植物生态修复提供理论依据。 展开更多
关键词 根际微生态 转运蛋白 生物胁迫 非生物胁迫 解钾微生物 解钾机理
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植物钾(K^+)离子通道的研究 被引量:9
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作者 程钰宏 赵瑞雪 董宽虎 《山西农业科学》 2008年第2期3-7,共5页
钾在植物生长发育过程中具有许多重要的作用,钾离子通道是植物吸收钾离子的重要途径之一,根据结构和功能的不同钾离子通道可分为Shaker家族通道、KCO通道、其他通道。对上述植物钾离子通道蛋白的生化特性以及结构功能及相关基因研究的... 钾在植物生长发育过程中具有许多重要的作用,钾离子通道是植物吸收钾离子的重要途径之一,根据结构和功能的不同钾离子通道可分为Shaker家族通道、KCO通道、其他通道。对上述植物钾离子通道蛋白的生化特性以及结构功能及相关基因研究的进展进行了详细的综述。 展开更多
关键词 钾离子 通道蛋白 转运体
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钾对夏谷灌浆过程中蛋白质周转的影响 被引量:4
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作者 冯献忠 郭蔼光 +1 位作者 张慧 杨素欣 《西北农业学报》 CAS CSCD 1997年第2期61-63,共3页
研究了开花前叶喷KHCO3(20mg/kg)对夏谷灌浆过程中蛋白质周转的影响。结果表明,钾处理能提高籽粒产量,增加籽粒总蛋白质、可溶性蛋白质和游离氨基酸的含量。钾对灌浆过程中籽粒蛋白质积累的影响与旗叶的氮素周转紧密相... 研究了开花前叶喷KHCO3(20mg/kg)对夏谷灌浆过程中蛋白质周转的影响。结果表明,钾处理能提高籽粒产量,增加籽粒总蛋白质、可溶性蛋白质和游离氨基酸的含量。钾对灌浆过程中籽粒蛋白质积累的影响与旗叶的氮素周转紧密相关。旗叶中蛋白水解酶活性在灌浆初期低于对照。 展开更多
关键词 谷子 灌浆 蛋白质周转
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蓖麻耐盐基因RcKUP 7克隆及分子特征分析 被引量:2
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作者 张继星 丛娇娇 +1 位作者 耿学军 刘海臣 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2018年第4期311-318,共8页
本试验以蓖麻叶片为材料,克隆K+吸收蛋白基因Rc KUP 7,并对其进行生物信息学分析.结果显示,Rc KUP 7基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为2583 bp,编码860个氨基酸,蛋白分子量为95.149k D,p I值5.15.通过氨基酸组分分析得到含量最... 本试验以蓖麻叶片为材料,克隆K+吸收蛋白基因Rc KUP 7,并对其进行生物信息学分析.结果显示,Rc KUP 7基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为2583 bp,编码860个氨基酸,蛋白分子量为95.149k D,p I值5.15.通过氨基酸组分分析得到含量最高的是亮氨酸(Leu),占该蛋白总摩尔质量的11.74%和分子质量的11.96%;含量最低的氨基酸为色氨酸(Trp),其摩尔质量与分子质量分别占总蛋白的1.16%和1.84%.进行多重序列比对和系统发育树分析可得出与麻枫树、木薯、橡胶树亲缘性较近.通过保守区蛋白分析可以得出该蛋白为钾离子转运蛋白家族的一员.通过亲水疏水性分析,可知该蛋白为疏水性蛋白.跨膜结构分析显示该蛋白具有10个蛋白跨膜结构,是典型的跨膜蛋白,并预测了该蛋白的三级结构. 展开更多
关键词 蓖麻 钾离子转运蛋白 基因克隆 分子特征分析
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利用子房滴注法获得转高亲和性钾离子转运蛋白基因(AlHAK1)棉花植株
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作者 刘灵娣 唐宏亮 +8 位作者 董丽君 张书玲 吴立柱 杜环 高佳佳 赵晓雅 刘晗 蒋肖 刘建凤 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2015年第1期9-15,共7页
棉花植株再生困难、基因型依赖性强和转化周期长等因素一直制约着棉花遗传转化的发展。本研究利用1种不依赖组织培养的转化方法,即子房滴注转化方法将獐茅高亲和性钾离子转运蛋白基因(AIHAK1)导入棉花基因组中。结果表明在1006株转... 棉花植株再生困难、基因型依赖性强和转化周期长等因素一直制约着棉花遗传转化的发展。本研究利用1种不依赖组织培养的转化方法,即子房滴注转化方法将獐茅高亲和性钾离子转运蛋白基因(AIHAK1)导入棉花基因组中。结果表明在1006株转化幼苗中有44株为卡那抗性植株,其中35株经PCR检测为阳性(T0代),转化率为3.5%。Southem与Northem杂交结果进一步表明外源基因已整合至棉花基因组中并在转录水平上表达。在提供外源0.05mmol·L-1K+水平下,T1转基因棉花叶片中K+含量约为对照植株的2倍.在根中约为野生型植株的1.5倍;而在2.5mmol·L-1K+的正常水平下,转基因棉花与野生型植株K+含量差异不明显。在50~200mmol·L-1NaC1胁迫条件下,转基因棉花的种子发芽率明显高于野生型植株.尤其是在150mmol·L-1NaC1胁迫条件下,转基因植株种子的发芽率是野生型的2.8倍左右。本研究为子房滴注转化体系在生产实践中的广泛应用提供了理论依据,并为培育适应土壤钾素匮乏及盐渍化环境下生长的棉花新品种提供了新的种质资源。 展开更多
关键词 棉花 子房滴注转化 钾离子转运蛋白 转基因植株 钾营养 盐胁迫
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Molecular modeling of voltage-gated potassium channel pore
9
作者 赵善荣 陈凯先 +3 位作者 王蔚 顾健德 胡增建 嵇汝运 《中国药理学报》 CSCD 1997年第4期323-330,共8页
目的:建立和验证电压门控型钾通道的结构模型.方法:(1)从实验和理论研究结果中提取结构约束条件;(2)建立满足这些约束条件的初始结构模型,并进一步用限制性分子力学优化;(3)根据模型能否成功地解释通道功能分子机制和许... 目的:建立和验证电压门控型钾通道的结构模型.方法:(1)从实验和理论研究结果中提取结构约束条件;(2)建立满足这些约束条件的初始结构模型,并进一步用限制性分子力学优化;(3)根据模型能否成功地解释通道功能分子机制和许多实验事实来判断其合理性.结果:(1)建立了一个孔区模型,其中信号序列残基(对应Shaker439-446)以非周期性构象嵌入膜中并形成孔区比较窄的部分,而孔区域的其它残基构成孔区外口;(2)通道离子选择性在445,447位置处分别通过阳离子π轨道作用机理和氧笼机理来实现;(3)CTX和AgTx2与孔区的不同结合方式导致了它们通道亲和力的差异;(4)孔区内侧静电势主要为负.结论:构建的模型与从实验结果导出的限制信息是相一致的. 展开更多
关键词 分子模型 钾通道 蛋白质构象 离子运输
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The Involvement of Ca^2+ Signal Pathways in Distal Colonic Myocytes in a Rat Model of Dextran Sulfate Sodium-induced Colitis 被引量:4
10
作者 Yan Wang Jun-Xia Li +3 位作者 Guang-Ju Ji Kui Zhai Hua-Hong Wang Xin-Guang Liu 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2016年第10期1185-1192,共8页
Background: Disrupted Ca2+ homeostasis contributes to the development of colonic dysmotility in ulcerative colitis (UC), but the underlying mechanisms are unknown. This study aimed to examine the alteration of col... Background: Disrupted Ca2+ homeostasis contributes to the development of colonic dysmotility in ulcerative colitis (UC), but the underlying mechanisms are unknown. This study aimed to examine the alteration of colonic smooth muscle (SM) Ca2+ signaling and Ca2+ handling proteins in a rat model of dextran sulfate sodium (DSS)-induced UC. Methods: Male Sprague-Dawley rats were randomly divided into control (n = 18) and DSS (n = 17) groups. Acute colitis was induced by 5% DSS in the drinking water for 7 days. Contractility of colonic SM strips (controls, n = 8 and DSS, n = 7) was measured in an organ bath. Cytosolic resting Ca2+ levels (n = 3 in each group) and Ca2+ transients (n = 3 in each group) were measured in single colonic SM cells. Ca2+ handling protein expression was determined by Western blotting (n = 4 in each group). Differences between control and DSS groups were analyzed by a two-sample independent t-test. Results: Average tension and amplitude of spontaneous contractions of colonic muscle strips were significantly enhanced in DSS-treated rats compared with controls (1.25 ± 0.08 g vs. 0.96 - 0.05 g, P = 0.007; and 2.67 - 0.62 g vs. 0.52 ±0.10 g, P= 0.013). Average tensions of carbachol-evoked contractions were much weaker in the DSS group (1.08 ±0.10 g vs. 1.80 ±0.19 g, P = 0.006). Spontaneous Ca2+ transients were observed in more SM cells from DSS-treated rats (15/30 cells) than from controls (5/36 cells). Peak caffeine-induced intracellular Ca2+ release was lower in SM cells of DSS-treated rats than controls (0.413 ±0.046 vs. 0.548 ±0.041, P = 0.033). Finally, several Ca2+ handling proteins in colonic SM were altered by DSS treatment, including sarcoplasmic reticulum calcium-transporting ATPase 2a downregulation and phospholamban and inositol 1,4,5-trisphosphate receptor 1 upregulation. Conclusions: Impaired intracellular Ca2+ signaling of colonic SM, caused by alteration of Ca2+ handing proteins, contribute to colonic dysmotility in DSS-induced UC. 展开更多
关键词 CALCIUM Dextran Sulfate Sodium Inositol 1 4 5-trisphosphate Receptor Large-conductance Calcium-activated potassium Channels Phospholamban protein Sarcoplasmic Reticulum Calcium-transporting ATPase Calcium ATPase Ulcerative Colitis
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