腐生性钩端螺旋体Potoc菌株全基因组学分析

目的 了解腐生性钩端螺旋体(简称钩体)Potoc菌株的全基因组分子特征。方法 将腐生性钩体Potoc菌株培养后,应用高通量测序技术进行全基因组序列测定和比较基因组学分析,并将Potoc菌株灭活菌液与国内15种不同血清群致病性钩体代表菌株的兔血清进行免疫印迹分析。结果 腐生性钩体Potoc菌株全基因组序列全长为3 942 789 bp,共含有编码基因3685个,其中具有直系同源簇功能2052个,其平均GC含量为39.0%。比较基因组学分析发现Potoc菌株与国外已发表的腐生性钩体Ames菌株基因组核苷酸一致性高,同时也证实其基因组中并不存在O抗原生物合成基因簇(rfb)序列或类似基因。与问号基因种、波氏基因种和中间型L.licerasiae菌株存在共有基因1110个,而Potoc菌株基因组中所含有特有的基因共计2278个。免疫印迹分析结果发现Potoc菌株与致病性钩体中存在种属特异性的蛋白抗原成分。此外,基于全基因组水平的系统发育进化树显示,不同致病性钩体分为不同进化分支,具有特定进化历程。结论 获得了腐生性钩体Potoc菌株基因组的基本特征,探究了钩体属特异性抗原,揭示了不同基因种钩体基因组多样性,为后续致病性钩体的诊断和进化等研究奠定一定基础。