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桃多胺合成S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因家族鉴定及对非生物胁迫的响应
1
作者
侯小进
宋小蝶
+3 位作者
张梦
张晓娜
王格格
王保全
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期107-117,共11页
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是植物多胺合成途径中的一个关键酶,通过调控植物体内多胺的含量来影响植物对逆境胁迫的响应.为探究桃PpSAMDCs基因的功能,利用生物信息学对桃PpSAMDCs基因进行鉴定及分析其蛋白序列特征,并采用qRT-PCR分析P...
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是植物多胺合成途径中的一个关键酶,通过调控植物体内多胺的含量来影响植物对逆境胁迫的响应.为探究桃PpSAMDCs基因的功能,利用生物信息学对桃PpSAMDCs基因进行鉴定及分析其蛋白序列特征,并采用qRT-PCR分析PpSAMDCs基因在非生物胁迫下的表达模式.结果表明:在桃中共鉴定出3个PpSAMDCs基因,进化分析显示PpSAMDC1位于植物外群,PpSAMDC2和PpSAMDC3与蔷薇科植物SAMDC亲缘关系近.PpSAMDCs均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,无跨膜区和信号肽.PpSAMDCs与多胺合成相关酶及甲基化转移酶发生互作.PpSAMDCs启动子上含有多个响应逆境胁迫的元件.荧光定量结果表明:PpSAMDC1受干旱和NaCl的诱导表达,但对低温无应答;PpSAMDC2参与桃对干旱、低温和盐害等逆境胁迫的调控;干旱胁迫负向调控PpSAMDC3的表达,但低温和盐胁迫却诱导该基因的表达.
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关键词
桃
ppsamdcs
基因
克隆
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
题名
桃多胺合成S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因家族鉴定及对非生物胁迫的响应
1
作者
侯小进
宋小蝶
张梦
张晓娜
王格格
王保全
机构
河南科技学院园艺园林学院
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期107-117,共11页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD1000300)
河南省科技攻关项目(105020224050)
+1 种基金
河南科技学院2018年博士科研启动项目(207010618005)
河南科技学院2023年大学生创新创业训练计划项目(2023CX059)。
文摘
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是植物多胺合成途径中的一个关键酶,通过调控植物体内多胺的含量来影响植物对逆境胁迫的响应.为探究桃PpSAMDCs基因的功能,利用生物信息学对桃PpSAMDCs基因进行鉴定及分析其蛋白序列特征,并采用qRT-PCR分析PpSAMDCs基因在非生物胁迫下的表达模式.结果表明:在桃中共鉴定出3个PpSAMDCs基因,进化分析显示PpSAMDC1位于植物外群,PpSAMDC2和PpSAMDC3与蔷薇科植物SAMDC亲缘关系近.PpSAMDCs均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,无跨膜区和信号肽.PpSAMDCs与多胺合成相关酶及甲基化转移酶发生互作.PpSAMDCs启动子上含有多个响应逆境胁迫的元件.荧光定量结果表明:PpSAMDC1受干旱和NaCl的诱导表达,但对低温无应答;PpSAMDC2参与桃对干旱、低温和盐害等逆境胁迫的调控;干旱胁迫负向调控PpSAMDC3的表达,但低温和盐胁迫却诱导该基因的表达.
关键词
桃
ppsamdcs
基因
克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
peach
ppsamdcs
cloning
bioinformatics
expression analysis
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
桃多胺合成S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因家族鉴定及对非生物胁迫的响应
侯小进
宋小蝶
张梦
张晓娜
王格格
王保全
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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