为改善传统N-Calculator模型的局限性,加强食物氮足迹核算结果与环境影响的联系,提高活性氮管理预见性,将N-Calculator模型与食物系统养分流动(Nutrient Flows in Food Chains,Environment and Resources Use,NUFER)模型进行耦合,以估...为改善传统N-Calculator模型的局限性,加强食物氮足迹核算结果与环境影响的联系,提高活性氮管理预见性,将N-Calculator模型与食物系统养分流动(Nutrient Flows in Food Chains,Environment and Resources Use,NUFER)模型进行耦合,以估算我国2001—2020年人均食物氮足迹,建立组合预测体系。结果显示:2001—2020年,我国人均食物氮足迹由16.04 kg N/a增至18.95 kg N/a;全国食物氮足迹由20.47 Mt N/a增至26.76 Mt N/a;居民饮食结构正由以植物源食物为主的低氮消费模式转向以动物源食物为主的高氮消费模式;食物生产过程产生的活性氮的最终归宿为大气(64.3%)、水体和深层土壤(35.7%);我国食物氮足迹与人均可支配收入、城市化率、动物源食物消费氮占比呈正相关性,与恩格尔系数呈负相关性;未来10 a我国人均食物氮足迹呈增长趋势,预测结果显示年均增幅为0.16 kg N/a。展开更多
本文借助文献计量法分析预测微生物学研究概况、研究热点与发展趋势,为今后的研究提供思路。在Web of Science核心合集数据库中,检索2006—2021年间以预测微生物学为主题的相关文献,基于文献计量法及CiteSpace软件进行可视化分析展示。...本文借助文献计量法分析预测微生物学研究概况、研究热点与发展趋势,为今后的研究提供思路。在Web of Science核心合集数据库中,检索2006—2021年间以预测微生物学为主题的相关文献,基于文献计量法及CiteSpace软件进行可视化分析展示。预测微生物学文献数量显著增长,从2006年的57篇增至2021年的138篇;研究方向主要是食品科学技术、微生物学、传染病学、生物技术应用微生物学等领域;全球共有73个国家/地区开展预测微生物学的研究,发文量排名前15的国家共占总发文量的42.90%;中国发文量在全球排名第6,且与美国、欧洲等国家/地区跨区域合作密切;诊断、性能、死亡率、治疗、参数估计、乳酸菌、猪肉、指南、风险因素等关键词是被广泛关注的热点。预测微生物学以其快速、高效、准确等优点未来将在食品科学、生物学、医学等研究领域发挥重要作用。展开更多
将机器学习算法和文本挖掘融入酱卤肉制品货架期预测中,基于对文献数据库中酱卤肉制品的货架期及其影响因素(包装方式、储藏方式、保鲜剂和二次杀菌)进行收集,构建原始数据集;通过比较多种编码方法(JamesStein、BaseNEncoder、TargetEnc...将机器学习算法和文本挖掘融入酱卤肉制品货架期预测中,基于对文献数据库中酱卤肉制品的货架期及其影响因素(包装方式、储藏方式、保鲜剂和二次杀菌)进行收集,构建原始数据集;通过比较多种编码方法(JamesStein、BaseNEncoder、TargetEncoder、OrdinalEncoder、PolynomialEncoder),选择效果较好的JamesStein编码作为分类型特征变量的编码方式。通过比较多种机器学习算法(包括随机森林算法、K最近邻算法、逻辑回归、XGboost和多层感知机分类器),结果显示最优模型为随机森林算法[其准确度为0.95、精确度为0.97、曲线下面积(area under curve,AUC)值为0.99,F1-score 0.91]。通过对酱牛肉和盐水鸭的实际样品测试分析,发现该模型在预测不同酱卤肉制品的货架期方面均具有较高的准确性。此外,该文从另一个角度验证储藏温度、包装方式、保鲜剂和二次杀菌等因素对酱卤肉制品货架期的显著影响。展开更多
The so-called growth curve is of help to understand the underlying physiology of microbial cultures. A number of reported models describe the observed growth trends and the effects produced by the changes of the cultu...The so-called growth curve is of help to understand the underlying physiology of microbial cultures. A number of reported models describe the observed growth trends and the effects produced by the changes of the culture environment. However, the collected data (plate counts and/or Optical Density records) very often do not reliably comply with the number of fitting parameters of such models. An alternative semi empirical model describes the observed experimental trends of growth and decay of batch microbial cultures. Major advantages of the model include: reduced number and direct physical meaning of the best-fit parameters, easy comparison between different microbial cultures and/or different environment conditions for a given microbial strain. The experimental data (either plate counts or OD records) allow the estimation of the fitting parameters: that is why the model is substantially empirical and applies to any batch microbial culture. The present paper reports the formal details of the model and its extension to cases of environment changes occurred because of an exterior perturbation. The model seems adequate for predictive microbiology investigations, as well as for studies on the effects of bactericidal drugs.展开更多
酸土脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus acidoterrestris)是引起橙汁劣变的主要微生物,为研究酸土脂环酸芽孢杆菌在橙汁中的生长规律,利用近红外光谱获取橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌含量的信息,采用标准化(autoscale)、多元散射校正(multip...酸土脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus acidoterrestris)是引起橙汁劣变的主要微生物,为研究酸土脂环酸芽孢杆菌在橙汁中的生长规律,利用近红外光谱获取橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌含量的信息,采用标准化(autoscale)、多元散射校正(multiplicative scatter correction,MSC)、标准正态变换(standard normal variate,SNV)、去趋势化(detrend)对光谱进行预处理,结合化学计量学,构建近红外光谱与酸土脂环酸芽孢杆菌含量预测模型。在此基础上,将近红外光谱转换为酸土脂环酸芽孢杆菌预测菌落数据,并采用“一步法”直接基于预测菌落数构建橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌的生长模型。结果表明,利用标准化进行光谱预处理建立的偏最小二乘(partial least squares,PLS)模型对橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌含量的预测效果相对较好,其预测决定系数(prediction determination coefficient,Rp2)与预测均方根误差(root mean square error of prediction,RMSEP)分别为0.733和0.242 lg CFU/mL,相对分析误差(relative percent deviation,RPD)为1.919。4种预测模型的均方误差(mean square error,MSE)介于0.0046~0.0300 lg CFU/mL之间;均方根误差(root mean square error,RMSE)介于为0.068~0.173 lg CFU/mL之间;赤池信息准则(akaike information criterion,AIC值)介于-66.383~-53.944之间,且Huang-full模型的3种指标相较更小,较适合描述橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌的生长。将近红外光谱获得预测菌落数构建的4种生长模型与平板计数法构建的生长模型分别进行相关性分析,发现4种模型的相关系数(r)均大于0.900,且Huang-full模型的拟合效果最优。所构建的模型通过准确因子(accuracy factor,Af)和偏差因子(bias factor,Bf)进行验证,证实模型均具有良好的可靠性。因此,利用近红外光谱分析结合适当的化学计量学方法描述酸土脂环酸芽孢杆菌生长预测是可行的。展开更多
文摘为改善传统N-Calculator模型的局限性,加强食物氮足迹核算结果与环境影响的联系,提高活性氮管理预见性,将N-Calculator模型与食物系统养分流动(Nutrient Flows in Food Chains,Environment and Resources Use,NUFER)模型进行耦合,以估算我国2001—2020年人均食物氮足迹,建立组合预测体系。结果显示:2001—2020年,我国人均食物氮足迹由16.04 kg N/a增至18.95 kg N/a;全国食物氮足迹由20.47 Mt N/a增至26.76 Mt N/a;居民饮食结构正由以植物源食物为主的低氮消费模式转向以动物源食物为主的高氮消费模式;食物生产过程产生的活性氮的最终归宿为大气(64.3%)、水体和深层土壤(35.7%);我国食物氮足迹与人均可支配收入、城市化率、动物源食物消费氮占比呈正相关性,与恩格尔系数呈负相关性;未来10 a我国人均食物氮足迹呈增长趋势,预测结果显示年均增幅为0.16 kg N/a。
文摘本文借助文献计量法分析预测微生物学研究概况、研究热点与发展趋势,为今后的研究提供思路。在Web of Science核心合集数据库中,检索2006—2021年间以预测微生物学为主题的相关文献,基于文献计量法及CiteSpace软件进行可视化分析展示。预测微生物学文献数量显著增长,从2006年的57篇增至2021年的138篇;研究方向主要是食品科学技术、微生物学、传染病学、生物技术应用微生物学等领域;全球共有73个国家/地区开展预测微生物学的研究,发文量排名前15的国家共占总发文量的42.90%;中国发文量在全球排名第6,且与美国、欧洲等国家/地区跨区域合作密切;诊断、性能、死亡率、治疗、参数估计、乳酸菌、猪肉、指南、风险因素等关键词是被广泛关注的热点。预测微生物学以其快速、高效、准确等优点未来将在食品科学、生物学、医学等研究领域发挥重要作用。
文摘将机器学习算法和文本挖掘融入酱卤肉制品货架期预测中,基于对文献数据库中酱卤肉制品的货架期及其影响因素(包装方式、储藏方式、保鲜剂和二次杀菌)进行收集,构建原始数据集;通过比较多种编码方法(JamesStein、BaseNEncoder、TargetEncoder、OrdinalEncoder、PolynomialEncoder),选择效果较好的JamesStein编码作为分类型特征变量的编码方式。通过比较多种机器学习算法(包括随机森林算法、K最近邻算法、逻辑回归、XGboost和多层感知机分类器),结果显示最优模型为随机森林算法[其准确度为0.95、精确度为0.97、曲线下面积(area under curve,AUC)值为0.99,F1-score 0.91]。通过对酱牛肉和盐水鸭的实际样品测试分析,发现该模型在预测不同酱卤肉制品的货架期方面均具有较高的准确性。此外,该文从另一个角度验证储藏温度、包装方式、保鲜剂和二次杀菌等因素对酱卤肉制品货架期的显著影响。
文摘The so-called growth curve is of help to understand the underlying physiology of microbial cultures. A number of reported models describe the observed growth trends and the effects produced by the changes of the culture environment. However, the collected data (plate counts and/or Optical Density records) very often do not reliably comply with the number of fitting parameters of such models. An alternative semi empirical model describes the observed experimental trends of growth and decay of batch microbial cultures. Major advantages of the model include: reduced number and direct physical meaning of the best-fit parameters, easy comparison between different microbial cultures and/or different environment conditions for a given microbial strain. The experimental data (either plate counts or OD records) allow the estimation of the fitting parameters: that is why the model is substantially empirical and applies to any batch microbial culture. The present paper reports the formal details of the model and its extension to cases of environment changes occurred because of an exterior perturbation. The model seems adequate for predictive microbiology investigations, as well as for studies on the effects of bactericidal drugs.
文摘酸土脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus acidoterrestris)是引起橙汁劣变的主要微生物,为研究酸土脂环酸芽孢杆菌在橙汁中的生长规律,利用近红外光谱获取橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌含量的信息,采用标准化(autoscale)、多元散射校正(multiplicative scatter correction,MSC)、标准正态变换(standard normal variate,SNV)、去趋势化(detrend)对光谱进行预处理,结合化学计量学,构建近红外光谱与酸土脂环酸芽孢杆菌含量预测模型。在此基础上,将近红外光谱转换为酸土脂环酸芽孢杆菌预测菌落数据,并采用“一步法”直接基于预测菌落数构建橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌的生长模型。结果表明,利用标准化进行光谱预处理建立的偏最小二乘(partial least squares,PLS)模型对橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌含量的预测效果相对较好,其预测决定系数(prediction determination coefficient,Rp2)与预测均方根误差(root mean square error of prediction,RMSEP)分别为0.733和0.242 lg CFU/mL,相对分析误差(relative percent deviation,RPD)为1.919。4种预测模型的均方误差(mean square error,MSE)介于0.0046~0.0300 lg CFU/mL之间;均方根误差(root mean square error,RMSE)介于为0.068~0.173 lg CFU/mL之间;赤池信息准则(akaike information criterion,AIC值)介于-66.383~-53.944之间,且Huang-full模型的3种指标相较更小,较适合描述橙汁中酸土脂环酸芽孢杆菌的生长。将近红外光谱获得预测菌落数构建的4种生长模型与平板计数法构建的生长模型分别进行相关性分析,发现4种模型的相关系数(r)均大于0.900,且Huang-full模型的拟合效果最优。所构建的模型通过准确因子(accuracy factor,Af)和偏差因子(bias factor,Bf)进行验证,证实模型均具有良好的可靠性。因此,利用近红外光谱分析结合适当的化学计量学方法描述酸土脂环酸芽孢杆菌生长预测是可行的。