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Prognostic value of hypoxia-inducible factor-1 alpha and prolyl 4-hydroxylase beta polypeptide overexpression in gastric cancer 被引量:11
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作者 Jun Zhang Yue Wu +5 位作者 Yu-Hang Lin Shuai Guo Pei-Fang Ning Zhi-chao Zheng Yue Wang Yan Zhao 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第22期2381-2391,共11页
AIM To investigate the relationship between hypoxia-inducible factor-1α(HIF-1α), prolyl 4-hydroxylase beta(P4 HB) expression, and clinicopathologic parameters, as well as the prognostic value of these genes for pati... AIM To investigate the relationship between hypoxia-inducible factor-1α(HIF-1α), prolyl 4-hydroxylase beta(P4 HB) expression, and clinicopathologic parameters, as well as the prognostic value of these genes for patients with gastric cancer(Gc).METHODS Hypoxia is a critical factor that shapes the Gc microenvironment. In previous reports, we have demonstrated that P4 HB is a potential target of HIF-1α. In the present study, gene expression profiling interactive analysis(GEPIA) was used to analyze the relationship between P4 HB and hypoxia-associated genes. To this end, 428 Gc tissue samples were used to analyze the expression of HIF-1α and P4 HB via immunohistochemical staining. Patient samples were classified as having weak-expression or over-expression both in terms of HIF-1α and P4 HB. Correlations between biomarkers and clinicopathological factors were analyzed to predict survival. RESULTS P4 HB demonstrated a positive correlation with hypoxiaassociated genes(P < 0.05). HIF-1α and P4 HB overexpression have a significant correlation with TNM staging(χ2 = 23.32, P = 0.00; χ2 = 65.64, P = 0.00) and peritoneum cavity metastasis(χ2 = 12.67, P = 0.00; χ2 = 39.29, P = 0.00). In univariate analysis, patients with a high HIF-1α expression trend had a shorter disease-free survival(DFS: 44.80 mo vs 22.06 mo) and overall survival(OS: 49.58 mo vs 39.92 mo). P4 HB overexpression reflected similar results: patients with over-expression of P4 HB had a shorter survival time than those with weak-expression(DFS: 48.03 mo vs 29.64 mo, OS: 52.48 mo vs 36.87 mo). Furthermore, HIF-1α is also a clinicopathological predictor of dismal prognosis according to multivariate analysis(DFS, 95%c I: 0.52-0.88, P < 0.00; OS, 95%c I: 0.50-0.85, P < 0.00). However, P4 HB was meaningful in DFS(95%c I: 0.58-1.00, P < 0.05) but not in OS(95%c I: 0.72-1.23, P > 0.05).CONCLUSION Overexpression of HIF-1α and P4 HB is associated with poor prognosis in patients with Gc. Thus, these genes may be potential prognostic biomarker candidates in GC. 展开更多
关键词 Gastric cancer Hypoxia INDUCIBLE factor-1α prolyl 4-hydroxylase BETA POLYPEPTIDE Overall SURVIVAL CLINICOPATHOLOGICAL predictors Disease free SURVIVAL
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脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2通过肌醇需要酶1α介导的UPR信号通路调控肝癌细胞凋亡并预测早期肝细胞癌的不良预后
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作者 朱睿安 李朝英 姜颖 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期269-276,共8页
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)严重危害着人类健康。尽管大量研究表明,在HCC早期进行手术切除可提高患者的生存率,但其高复发率仍然阻碍着治疗进程。本研究分析蛋白质组学数据发现。脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2(prolyl 4-hydroxy... 肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)严重危害着人类健康。尽管大量研究表明,在HCC早期进行手术切除可提高患者的生存率,但其高复发率仍然阻碍着治疗进程。本研究分析蛋白质组学数据发现。脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2(prolyl 4-hydroxylase subunit α-2,P4HA2)在早期HCC组织中高表达,Kaplan-Meier曲线、Cox比例风险回归模型(cox regression model)证明,P4HA2高表达的早期肝癌患者预后较差,且P4HA2可作为患者预后的独立预测因子。通过敲低或过表达实验发现,P4HA2明显促进肿瘤细胞的增殖、迁移等恶性生物学行为。敲低P4HA2激活了由肌醇需要酶1α(inositol-requiring enzyme 1α,IRE1α)介导的促凋亡非折叠蛋白反应(unfolded protein response,UPR)。以上结果表明,P4HA2可能通过调节内质网稳态来调控肝癌细胞凋亡,P4HA2有望成为HCC潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 肝细胞癌 脯氨酰-4-羟化酶亚基α-2 预后 细胞凋亡
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脯氨酰4-羟化酶α亚单位3在胃癌中的表达及临床意义
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作者 吴海兰 丁永玲 王正 《癌症进展》 2023年第14期1570-1574,共5页
目的 探讨脯氨酰4-羟化酶α亚单位3(P4HA3)在胃癌中的表达及临床意义。方法 通过UALCAN数据库及基因表达综合(GEO)数据库分析胃癌组织和癌旁正常组织中P4HA3基因表达差异,并进一步分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中不同临床分期、分化... 目的 探讨脯氨酰4-羟化酶α亚单位3(P4HA3)在胃癌中的表达及临床意义。方法 通过UALCAN数据库及基因表达综合(GEO)数据库分析胃癌组织和癌旁正常组织中P4HA3基因表达差异,并进一步分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中不同临床分期、分化程度、年龄和性别胃癌患者P4HA3基因表达差异。以P4HA3基因表达中位值为界,将患者分为P4HA3高表达组和P4HA3低表达组,采用Kaplan-Meier plotter在线数据库比较两组患者的总生存时间、首次进展生存时间和进展后生存时间。收集107例胃癌患者的胃癌组织及癌旁正常组织标本,采用免疫组织化学染色法检测P4HA3蛋白表达情况,并结合临床特征及随访资料进行综合分析。结果 TCGA数据库和GEO数据库中的数据均显示,胃癌组织中P4HA3基因表达水平明显高于癌旁正常组织(P﹤0.01)。TCGA数据库显示,不同年龄、分化程度、临床分期胃癌患者的P4HA3基因表达水平比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。Kaplan-Meier plotter在线数据库分析发现,P4HA3高表达组患者的中位总生存时间、中位首次进展生存时间、中位进展后生存时间均明显短于P4HA3低表达组,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。胃癌组织中P4HA3蛋白阳性表达率高于癌旁正常组织(P﹤0.05)。不同肿瘤直径、分化程度、TNM分期、T分期胃癌患者胃癌组织中P4HA3蛋白表达情况比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05);P4HA3阴性表达患者的累积生存率明显高于P4HA3阳性表达患者(P﹤0.01)。结论 P4HA3在胃癌组织中高表达,且与胃癌的发生发展及预后有关,可能成为胃癌的预后评估指标和潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 脯氨酰4-羟化酶α亚单位3 胃癌 生物信息学 生存情况 免疫组织化学染色
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基于生物信息学分析骨肉瘤的关键基因和qRT-PCR实验验证
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作者 李威材 秦刚 +5 位作者 苏国威 刘金富 肖世富 刘俊良 范以东 吴广涛 《实用肿瘤杂志》 CAS 2024年第4期344-355,共12页
目的利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点。方法从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载2个符合本研究的OS相关数据集(GSE16088和GSE42572)... 目的利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点。方法从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载2个符合本研究的OS相关数据集(GSE16088和GSE42572),共包括21例OS组织样本和14例正常骨组织样本。对数据集进行矫正分析鉴定出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。通过加权基因共表达网络分析方法(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)与DEGs筛选出交集基因。对交集基因进行疾病本体论(Disease Ontology,DO)、基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估该PPI网络degree排名前10位的Hubbe基因的表达水平对OS患者的诊断效能,并以另一个OS数据集GSE19276对Hubbe基因进行验证筛选出关键基因。分析关键基因与浸润性免疫细胞的相关性。收集2020年9月1日至2022年6月30日于广西中医药大学第一附属医院住院手术的4例OS患者的OS组织及其癌旁组织,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)对关键基因进行实验验证。结果在OS组织与正常骨组织中共筛选出687个DEGs(上调基因523个和下调基因164个)。WGCNA关键模块基因2338个。DEGs与WGCNA关键模块基因共有交集基因545个。DO富集分析结果表明,DEGs与WGCNA结果的交集基因主要与泌尿系统癌症、肾癌、生殖细胞癌、肌肉骨骼系统癌症和胚胎癌等癌症相关。GO富集结果表明,交集基因主要参与骨化的形成、细胞外基质组织和生物矿物组织发育等生物学过程。KEGG通路富集在磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又名Akt)信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)信号通路及流体剪切应力和动脉粥样硬化等信号通路上。PPI网络分析中degree排名前10位的Hubbe基因为磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha,PIK3CA)、脯氨酰4-羟化酶亚单位α1(prolyl 4-hydroxylase subunit alpha 1,P4HA1)、整合素αⅤ(integrin alphaⅤ,ITGAⅤ)、组蛋白去乙酰化酶2(histone deacetylase 2,HDAC2)、连环蛋白β1(catenin beta 1,CTNNB1)、Ⅲ型胶原蛋白α1(collagen typeⅢalpha 1,COL3A1)、Ⅰ型胶原蛋白α2(collagen typeⅠalpha 2,COL1A2)、转导蛋白β样1X相关蛋白1(transducin beta-like 1X-related protein 1,TBL1XR1)、小核核糖核蛋白多肽G(small nuclear ribonucleoprotein polypeptide G,SNRPG)和Ras相关核蛋白(Ras-related nuclear protein,RAN)。以数据集GSE19276绘制ROC曲线验证Hubbe基因表明,P4HA1和ITGAV的准确度较高(均AUC>0.8且P<0.05)。qRT-PCR实验结果显示,P4HA1和ITGAV mRNA在OS组织中高表达(均P<0.01)。结论P4HA1和ITGAV是OS的潜在生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 骨肉瘤 生物信息学 差异表达基因 加权基因共表达网络分析 QRT-PCR 脯氨酰4-羟化酶亚单位α1 整合素αⅤ
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P4HA2通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路促进肝癌的发生和发展 被引量:2
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作者 商玲 姜雯迪 +1 位作者 张俊丽 武文娟 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期665-672,共8页
目的 探讨脯氨酸4-羟化酶Ⅱ(P4HA2)在肝癌细胞发生发展中的作用及相关机制。方法 利用GEPIA、Human Protein Atlas数据库预测P4HA2在肝癌中的表达情况,利用K-M plotter在线数据库分析P4HA2的表达情况与肝癌预后的关系,采用qRT-PCR和West... 目的 探讨脯氨酸4-羟化酶Ⅱ(P4HA2)在肝癌细胞发生发展中的作用及相关机制。方法 利用GEPIA、Human Protein Atlas数据库预测P4HA2在肝癌中的表达情况,利用K-M plotter在线数据库分析P4HA2的表达情况与肝癌预后的关系,采用qRT-PCR和Western blot检测肝癌细胞和正常肝细胞中P4HA2的表达。构建慢病毒载体,用携带P4HA2 shRNA和Con shRNA的慢病毒载体分别转染肝癌SNU-449和Hep-3B细胞系,建立沉默表达P4HA2的细胞株(shP4HA2组)和对照组细胞株(NC组)。采用CCK-8、集落形成试验、划痕实验和Transwell实验分别检测细胞增殖、迁移和侵袭能力。采用Western blot实验检测上皮-间质转化和PI3K/Akt/mTOR信号通路相关蛋白表达情况。结果 在线数据库分析结果显示,肝癌组织中P4HA2表达高于正常肝组织(P<0.05)。同时,肝癌细胞系中P4HA2 mRNA和蛋白表达水平也高于正常肝细胞(P<0.01)。慢病毒干扰后,与NC组相比,shP4HA2组中mRNA和蛋白表达水平下降(P<0.05)。P4HA2基因表达沉默后,细胞的增殖、迁移和侵袭受到抑制。Western blot显示,相对于NC组,shP4HA2组的E-cadherin蛋白表达上升,N-cadherin、Snail蛋白表达下降(P<0.05),在PI3K/AKT/mTOR通路中,磷酸化的PI3K(P-PI3K)、AKT(P-AKT)和m TOR(P-mTOR)显示出较低的水平(P<0.05)。结论 P4HA2通过激活PI3K/Akt/mTOR信号通路影响肝癌细胞的增殖、迁移、侵袭,促进肝癌的发生发展。 展开更多
关键词 肝癌 脯氨酸4-羟化酶II 迁移侵袭 PI3K/AKT/MTOR
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Expression of Prolyl 4-Hydroxylase Beta-Polypeptide in Non-Small Cell Lung Cancer Treated with Chinese Medicines 被引量:10
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作者 王淑美 林丽珠 +2 位作者 周岱翰 周京旭 熊绍权 《Chinese Journal of Integrative Medicine》 SCIE CAS CSCD 2015年第9期689-696,共8页
Objectives: To investigate the role of prolyl 4-hydroxylase beta polypeptide (P4HB) expressed in lung carcinoma and the intervention effect of Yiqi Chutan Formula (益气除痰方, YQCTF). Methods: Lung carcinoma mod... Objectives: To investigate the role of prolyl 4-hydroxylase beta polypeptide (P4HB) expressed in lung carcinoma and the intervention effect of Yiqi Chutan Formula (益气除痰方, YQCTF). Methods: Lung carcinoma model was established by subcutaneously inoculating LEWIS lung carcinoma cells in C57BL/6J mice. The differential expression of P4HB protein between the YQCTF (3.0 g/kg, gavage, once daily, 21 days) group and the control group was acquired by a 2 fluorescence difference gel electrophoresis (2D-DIGE), verified by Westem blotting and identified by matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF/'IOF-MS). The expression of P4HB and P4HB mRNA in cultured A549 cells from cisplatin (DDP) 1.5μg/mL group and 15% serum combined with DDP 1.5 μg/mL group were detected by cellular immunohistochemistry and reverse chain reaction, respectively. Results: The proteomics research discovered that one-third of differential proteins including P4HB were decreased in the YQCTF group (P〈0.01). Clinical pathology and tissue microarray studies showed that P4HB expression in lung cancer tissue was stronger than adjacent tissues and normal lung epithelial (P〈0.01). In the YQCTF and DDP combined groups, the expression of P4HB and P4HB mRNA in A549 cell were decreased significantly (P〈0.01). Conclusion: YQCTF could inhibit the LEWIS lung carcinoma's growth, decrease the expression of P4HB in LEWIS lung carcinoma and A549 cells. YQCTF might take effect through regulating P4HB in endoplasmic reticulum to inhibit the incidence and growth process of lung cercinoma. 展开更多
关键词 Yiqi Chutan Formula prolyl 4-hydroxylase beta polypeptide unfolded protein response Chinese medicine
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氨酰4-羟化酶A2通过抑制炎症反应缓解肾纤维化
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作者 葛名欢 祝恒成 +1 位作者 冷艳 杨康 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 2024年第7期768-772,共5页
目的:利用体内和体外模型探讨氨酰4-羟化酶A2(P4HA2)对肾间质纤维化的作用及其机制。方法:采用输尿管结扎模型构建动物肾纤维化,使用免疫组化技术检测P4HA2表达水平;采用不同梯度浓度TGF-β刺激HK2细胞构建细胞肾纤维化模型,利用免疫印... 目的:利用体内和体外模型探讨氨酰4-羟化酶A2(P4HA2)对肾间质纤维化的作用及其机制。方法:采用输尿管结扎模型构建动物肾纤维化,使用免疫组化技术检测P4HA2表达水平;采用不同梯度浓度TGF-β刺激HK2细胞构建细胞肾纤维化模型,利用免疫印迹和细胞免疫荧光检测P4HA2蛋白表达变化水平;利用腺病毒转染HK2细胞,使用免疫印迹和酶联免疫吸附试验技术探索P4HA2在细胞水平对NF-κB信号通路和下游炎症因子的影响。结果:与假手术组小鼠比较,模型组小鼠P4HA2表达量显著增加,且集中于肾小管细胞胞质与胞核中。使用50 ng/mL TGF-β刺激HK-2细胞24 h后P4HA2表达水平显著升高,且细胞形态由鹅卵石形变成针尖样长梭形;与转染对照组(scramble)比较,sh-P4HA2抑制NF-κB信号通路相关蛋白表达量,减少下游炎症因子IL-1β、IL-6和TNF-α水平。结论:P4HA2可能调控NF-κB信号通路,抑制机体炎症反应,缓解肾间质纤维化发展。 展开更多
关键词 氨酰4-羟化酶A2(P4HA2) 肾间质纤维化 炎症反应 NF-ΚB
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脯氨酰4-羟化酶α在肥厚型梗阻性心肌病合并房颤中的表达及意义
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作者 蒙延海 于海云 +4 位作者 刘平 张燕搏 王生伟 朱昌盛 王水云 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2019年第4期2996-3000,共5页
目的观察脯氨酰4-轻化酶a(P4Ha)在肥厚型梗阻性心肌病(HOCM)合并房颤(AF)的心房组织中的表达,探讨HOCM中AF发生的病理学机制。方法HOCM合并AF患者术中切除左心房标本15例为房颤组,倾向性匹配单纯HOCM患者左心房标本15例为对照组,H-E染色... 目的观察脯氨酰4-轻化酶a(P4Ha)在肥厚型梗阻性心肌病(HOCM)合并房颤(AF)的心房组织中的表达,探讨HOCM中AF发生的病理学机制。方法HOCM合并AF患者术中切除左心房标本15例为房颤组,倾向性匹配单纯HOCM患者左心房标本15例为对照组,H-E染色及Masson染色检测两组心房组织的胶原表达。免疫组化及Western blot方法检测心房组织中P4Ha的表达情况及蛋白表水平。实时PCR检测两组标本中P4Ha的mRNA表达水平。结果房颤组心房细胞肥大,间质胶原纤维明显增生,且排列紊乱,分布不匀;胶原半定量分析结果显示房颤组胶原面积百分比高于对照组.差异有统计学意义(P<0.01)。免疫组化结果显示房颤组P4Ha在心房壁各层均有表达,以内膜和成纤维细胞中阳性表达更显著。房颤组P4Ha的蛋白表达和RNA表达明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01).P4Ha平均光密度与Masson染色胶原表达量呈正相关(r=0.84,P<0.01).结论HOCM合并AF的患者心房组织中胶原表达量增加,纤维化明显,P4Ha的蛋白含量和mRNA水平增加,提示P4Ha在HCM合并房颤的发生过程中具有重要的作用,可能通过促进胶原的合成参与AF的发病。 展开更多
关键词 脯氨酰4轻化酶a 肥厚型心肌病 房颤
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Filling the Gaps to Solve the Extensin Puzzle 被引量:3
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作者 Eliana Marzol Cecilia Borassi +4 位作者 Mauro Bringas Ana Sede Diana Rosa Rodriguez Garcia Luciana Capece Jose M. Estevez 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2018年第5期645-658,共14页
Extensins (EXTs) are highly repetitive plant O-glycoproteins that require several post-translational modifi- cations (PTMs) to become functional in plant cell walls. First, they are hydroxylated on contiguous prol... Extensins (EXTs) are highly repetitive plant O-glycoproteins that require several post-translational modifi- cations (PTMs) to become functional in plant cell walls. First, they are hydroxylated on contiguous proline residues; then they are O-glycosylated on hydroxyproline and serine. After secretion into the apoplast, O-glycosylated EXTs form a tridimensional network organized by inter- and intra-Tyr linkages. Recent studies have made significant progress in the identification of the enzymatic machinery required to process EXTs, which includes prolyl 4-hydroxylases, glycosyltransferases, papain-type cysteine endopeptidases, and peroxidases. EXTs are abundant in plant tissues and are particularly important in rapidly expanding root hairs and pollen tubes, which grow in a polar manner. Small changes in EXT PTMs affect fastgrowing cells, although the molecular mechanisms underlying this regulation are unknown. In this review, we highlight recent advances in our understanding of EXT modifications throughout the secretory pathway, EXT assembly in cell walls, and possible sensing mechanisms involving the Catharanthus roseus cell surface sensor receptor-like kinases located at the interface between the apoplast and the cytoplasmic side of the plasma membrane. 展开更多
关键词 Arabidopsis thaliana cysteine endopeptidases EXTENSINS GLYCOSYLTRANSFERASES PEROXIDASES prolyl 4-hydroxylases
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