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Establishing a protein expression profile database for the normal human pituitary gland using two-dimensional high-performance liquid chromatography combined with LTQ-Orbitrap mass spectrometry 被引量:2
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作者 Rong Xie Wei Xu +4 位作者 Weimin Bao Hang Liu Luping Chen Yiwen Shen Jianhong Zhu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2012年第36期2922-2928,共7页
In this study, we selected adult normal pituitary gland tissues from six patients during operations for pituitary microadenomas via the transsphenoidal approach for extended normal pituitary tissue resection around th... In this study, we selected adult normal pituitary gland tissues from six patients during operations for pituitary microadenomas via the transsphenoidal approach for extended normal pituitary tissue resection around the tumor, and analyzed the protein expression of human normal pituitary using two-dimensional high-performance liquid chromatography combined with LTQ-Orbitrap mass spectrometry proteomics technology. The ten most highly expressed proteins in normal human pituitary were: alpha 3 type VI collagen isoform 5 precursor (abundance among tall pituitary proteins 1.30%), fibrinogen beta chain preproprotein (0.99%), vimentin (0.73%), prolactin (0.69%), ATP synthase, H~ transporting and mitochondrial F1 complex beta subunit precursor (0.52%), keratin I (0.49%), growth hormone (0.45%), carbonic anhydrase I (0.40%), heat shock protein 90 kDa I (0.31%), and annexin V (0.30%). Based on the biological function classifications of these proteins, the top three categories by content were neuroendocrine proteins (abundance among all pituitary proteins, 40.1%), catalytic and metabolic proteins (28.3%), and cell signal transduction proteins (9.8%). Based on cell positioning classification, the top three categories were cell organelle (24.5%) membrane (20.8%), and cytoplasm (13.0%). Based on biological process classification, the top three categories of proteins are involved in physiological processes (42.9%), cellular processes (40.4%), and regulation of biological processes (9.1%). Our experimental findings indicate that a protein expression profile database of normal human pituitary can be precisely and efficiently established by proteomics technology. 展开更多
关键词 two-dimensional high-performance liquid chromatography mass spectrum pituitary gland proteinS PROTEOMICS hypophyseal tumor physiological function pathological mechanism
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PP_(333)诱导黄瓜子叶节差异蛋白表达的分析 被引量:6
2
作者 李凤玉 潘德灼 +1 位作者 梁海曼 陈伟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期655-660,共6页
【目的】了解和寻找PP333处理所导致的差异蛋白表达,为深入研究PP333的作用规律和机理获取有价值的信息。【方法】应用双向凝胶电泳技术研究PP333处理后黄瓜离体子叶节培养物差异蛋白的表达,结合质谱分析和蛋白质数据库检索,确定所检出... 【目的】了解和寻找PP333处理所导致的差异蛋白表达,为深入研究PP333的作用规律和机理获取有价值的信息。【方法】应用双向凝胶电泳技术研究PP333处理后黄瓜离体子叶节培养物差异蛋白的表达,结合质谱分析和蛋白质数据库检索,确定所检出差异蛋白质的性质和功能。【结果】双向电泳检测到黄瓜离体子叶节培养物蛋白点有1000个左右,质谱(MALDI-TOF-TOF/MS)分析鉴定出5个有信息价值的差异表达蛋白点,分别为14-3-3蛋白(R2)、氨基肽酶(R7)、甲硫氨酸合酶(R11)、60s酸性核糖体蛋白(R20)和PEPC(R21)。这些蛋白质与代谢过程、蛋白质翻译及信号转导等关系密切。【结论】PP333处理导致多种蛋白质表达发生改变,并通过多种蛋白质的相互协调作用调控植物体的生长发育。 展开更多
关键词 PP333 黄瓜子叶节 差异蛋白 质谱
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盐胁迫下棉花叶片差异蛋白表达的分析 被引量:6
3
作者 崔宇鹏 樊保香 +3 位作者 王德龙 王俊娟 王帅 叶武威 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期48-54,共7页
以耐盐的陆地棉品种中07为研究材料,在其生长的三叶期,用未处理和0.4%NaCl胁迫处理24h的幼苗,分别提取其叶片全蛋白。通过等电聚焦和第二向SDS-PAGE技术获得完整的棉花叶片总蛋白图,利用ImageMaste-2DElite5.0软件分析各个差异蛋白在对... 以耐盐的陆地棉品种中07为研究材料,在其生长的三叶期,用未处理和0.4%NaCl胁迫处理24h的幼苗,分别提取其叶片全蛋白。通过等电聚焦和第二向SDS-PAGE技术获得完整的棉花叶片总蛋白图,利用ImageMaste-2DElite5.0软件分析各个差异蛋白在对照和0.4%NaCl胁迫24h后棉花叶片中的相对表达量,并选取质量好、实验重复性高的10个特异的差异表达蛋白质点进行基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(MALDI-TOF-TOF/MS)鉴定。结果表明,从对照和盐胁迫处理的双向电泳图谱中共检测到24个差异蛋白质点,这些差异蛋白质点的等电点分布集中在5.0~6.5之间,分子量分布集中在40.0~110.0kD之间;进一步质谱(MALDI-TOF-TOF/MS)分析鉴定的10个差异蛋白质点,其中4个蛋白质点获得了鉴定结果,这4个差异表达蛋白质点分别为1,5-二磷酸核酮糖羧化/氧化激酶α2(编号4)、1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/氧化酶大亚基(编号5)、未知蛋白产物(编号19)和OEE2(编号32)。我们初步推测OEE2和1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/氧化酶可能与棉花耐盐胁迫特性有关。 展开更多
关键词 棉花(Goss ypium hirsutumL.) 盐胁迫 差异蛋白 质谱分析
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琼氏不动杆菌对碳青霉烯类抗生素耐药分子机制研究 被引量:6
4
作者 张永 唐英春 +4 位作者 张扣兴 陆坚 莫晓能 潘晓娴 席云 《中国抗感染化疗杂志》 2005年第2期77-82,共6页
目的 研究琼氏不动杆菌对亚胺培南耐药的分子机制。方法 对耐亚胺培南琼氏不动杆菌临床分离株ZN3858,采用琼脂对倍稀释法进行药敏试验,协同抑制试验,质粒接合试验,Southern blot等电聚焦电泳,PCR扩增OXA、IMP、VIM型碳青霉烯酶基因及... 目的 研究琼氏不动杆菌对亚胺培南耐药的分子机制。方法 对耐亚胺培南琼氏不动杆菌临床分离株ZN3858,采用琼脂对倍稀释法进行药敏试验,协同抑制试验,质粒接合试验,Southern blot等电聚焦电泳,PCR扩增OXA、IMP、VIM型碳青霉烯酶基因及整合子编码序列及其分子克隆和测序,采用十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS PAGE)方法研究其外膜蛋白表达情况,阐述其对碳青霉烯类分子耐药机制。结果 受试琼氏不动杆菌具有多重耐药性;耐药基因分子克隆、测序并结合等电聚焦分析证实均产OXA 23型碳青霉烯酶,质粒接合试验、Southern blot显示其编码基因定位在染色体上;与敏感株相比,该菌22、35、47kDa外膜蛋白表达不同程度降低,飞行时间质谱显示:它们与一些耐药相关的外膜蛋白有一定的相似性。结论 表达OXA 23型碳青霉烯酶伴外膜蛋白下调是琼氏不动杆菌对碳青霉烯类抗生素耐药重要分子机制。 展开更多
关键词 琼氏不动杆菌 耐药 DNA序列分析 细菌外膜蛋白 质谱
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人类蛋白质组表达谱蛋白质鉴定的分步搜索策略 被引量:6
5
作者 吴松锋 朱云平 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期687-693,共7页
大规模蛋白质组表达谱研究的蛋白质鉴定一般采取基于数据库搜索的策略,因此数据库的选择及搜索策略在蛋白质鉴定中非常重要。现有的人类蛋白质数据库远不够完善,而从其他物种的蛋白质数据库中所能得到的补充非常有限,但人类基因组数据... 大规模蛋白质组表达谱研究的蛋白质鉴定一般采取基于数据库搜索的策略,因此数据库的选择及搜索策略在蛋白质鉴定中非常重要。现有的人类蛋白质数据库远不够完善,而从其他物种的蛋白质数据库中所能得到的补充非常有限,但人类基因组数据库中却可能存在很大的补充空间。在对国际人类蛋白质数据库充分调研、比较的基础上,提出了一种分步搜索的策略。这种策略首先利用一个质量较高、覆盖率相对较大的非冗余数据库进行基本鉴定,随后利用其他蛋白和核酸数据库进行补充鉴定和新蛋白挖掘。该策略能有效地鉴定尽可能多的高可靠蛋白,并能进一步充分利用质谱数据进行补充鉴定和新蛋白挖掘,对大规模蛋白质组表达谱研究具有重要的意义。 展开更多
关键词 蛋白质组 蛋白质鉴定 蛋白质数据库 质谱
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基于信息技术的蛋白质识别研究 被引量:2
6
作者 陈益强 高文 +2 位作者 付岩 李德泉 陈翔 《生命科学》 CSCD 2003年第2期70-78,共9页
随着质谱技术和NMR等仪器测定技术的飞速发展,利用大规模质谱技术可以得到海量蛋白质的质谱数据。同时,利用NMR技术也可获得蛋白质的精确三维结构数据。这些数据以及面向这些数据的分析方法使得蛋白质组研究迅速发展,其基础理论和技术方... 随着质谱技术和NMR等仪器测定技术的飞速发展,利用大规模质谱技术可以得到海量蛋白质的质谱数据。同时,利用NMR技术也可获得蛋白质的精确三维结构数据。这些数据以及面向这些数据的分析方法使得蛋白质组研究迅速发展,其基础理论和技术方法,都在不断地进步和完善。利用信息工程技术辅助生物学家开展面向质谱技术的高通量蛋白识别,面向NMR的蛋白质三维结构识别,以及功能发现研究,已经成为蛋白质组中的生命科学与信息科学交叉研究的热点和挑战问题。本文侧重从信息技术的角度对上述问题进行综述,并提出我们解决问题的思路和方法。 展开更多
关键词 蛋白质 质谱 三维结构 信息技术
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蛋白质组学技术在癌症相关研究中的应用 被引量:3
7
作者 眭维国 黄礼玲 +2 位作者 陈洁晶 黄河 戴勇 《医学综述》 2008年第23期3596-3599,共4页
寻找理想的表型生物标志物,阐明疾病发生、发展过程中起关键作用的蛋白质分子以用于癌症的早期检测诊断及预后评估一直是癌症研究领域的热点和难点。随着人类基因组测序的完成,癌症研究的重点从基因组学转移到蛋白质组学研究中,癌症研... 寻找理想的表型生物标志物,阐明疾病发生、发展过程中起关键作用的蛋白质分子以用于癌症的早期检测诊断及预后评估一直是癌症研究领域的热点和难点。随着人类基因组测序的完成,癌症研究的重点从基因组学转移到蛋白质组学研究中,癌症研究中的差异蛋白质组学技术也飞快发展,极大推动了与癌症相关的差异蛋白质组学研究,本文综述了近年来蛋白质组学技术在与癌症相关研究中的一些应用。 展开更多
关键词 蛋白质组学 癌症 蛋白质微阵列 质谱 表面等离子共振
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鹿角与鹿茸蛋白质鉴定 被引量:3
8
作者 杨欢 Roselyn Tehzee Gblinwon +7 位作者 杨娅娅 王强 陈香 卢梦瑶 郑晗雪 吴沅臻 夏国华 沈玉萍 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1859-1864,共6页
目的 鉴定鹿角与鹿茸蛋白质。方法 通过SDS-PAGE、2-DE分析鹿角与鹿茸蛋白质组成,比较两者电泳图谱,找出各自稳定的蛋白质条带或斑点及其差异。将两者SDS-PAGE蛋白质条带以胰蛋白酶进行胶内消化后,采用MALDI-TOF/TOF质谱分析,通过MASCO... 目的 鉴定鹿角与鹿茸蛋白质。方法 通过SDS-PAGE、2-DE分析鹿角与鹿茸蛋白质组成,比较两者电泳图谱,找出各自稳定的蛋白质条带或斑点及其差异。将两者SDS-PAGE蛋白质条带以胰蛋白酶进行胶内消化后,采用MALDI-TOF/TOF质谱分析,通过MASCOT检索匹配以鉴定蛋白质。结果 在SDS-PAGE图谱中,鹿角在约75、66.2 kD处呈现出2个清晰的蛋白质条带,而鹿茸则在约75、61、45、20 kD处呈出现4个蛋白质条带;2-DE分析显示,鹿角蛋白质斑点集中于Ⅰ区(pH5~7,M_(w) 45 kD)以及Ⅱ区(pH10,M_(w) 66.2 kD);鹿茸蛋白质斑点则主要分布在Ⅲ区(pH5~7,M_(w) 45 kD),另外,在pH5~6和M_(w) 20 kD的区域内存在3个稳定出现的蛋白质斑点。通过生物质谱分析,分别从鹿角与鹿茸中鉴定出2、4个蛋白质,评分高于100。结论 鹿角与鹿茸蛋白质电泳图谱存在明显差异,可为两者鉴别提供科学依据。 展开更多
关键词 鹿角 鹿茸 蛋白质 电泳 生物质谱
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重金属超富集植物龙葵对镉响应的蛋白组学分析 被引量:10
9
作者 罗琼 葛青 +4 位作者 刘小京 谢志霞 张苹 潘响亮 徐进 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1430-1436,共7页
龙葵是典型的重金属超富集植物,但是我们对其重金属耐受和超富集的分子机理仍不完全清楚。为了从蛋白组学层面探究重金属超富集植物龙葵如何响应金属镉,本研究采用双向电泳和MALDI-TOF MS分析方法,鉴定了重金属超富集植物龙葵叶片和根... 龙葵是典型的重金属超富集植物,但是我们对其重金属耐受和超富集的分子机理仍不完全清楚。为了从蛋白组学层面探究重金属超富集植物龙葵如何响应金属镉,本研究采用双向电泳和MALDI-TOF MS分析方法,鉴定了重金属超富集植物龙葵叶片和根中Cd胁迫下差异表达的蛋白。双向电泳在根和叶片中分别至少得到927和1 025个蛋白点,其中Cd胁迫下差异表达的蛋白点在根中有45个,叶片中有57个。采用MALDITOF MS分析,在根和叶片中分别鉴定了9个和12个蛋白点,分别代表了9个和6个差异表达的蛋白。生物信息学分析表明,这些蛋白涉及到激素合成、防御响应、能量代谢和细胞结构等。这些结果为进一步揭示重金属超富集植物龙葵响应Cd胁迫的分子调节机制,以及为通过现代生物技术手段进行重金属污染的植物修复提供了理论依据。 展开更多
关键词 龙葵 差异表达蛋白 双向电泳 质谱 生物信息学
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卵巢癌TP方案化疗敏感、耐药的预测研究 被引量:1
10
作者 赵营 杜佩妍 +1 位作者 汤凯雯 吴蕴瑜 《广西医学》 CAS 2010年第3期258-260,共3页
目的探讨蛋白质谱分析用于预测卵巢癌TP方案化疗敏感、耐药的临床价值。方法选择TP方案耐药和敏感的卵巢癌患者各20例,抽血进行蛋白质谱分析,比较不同敏感、耐药患者的蛋白质质谱差异。结果耐药组与敏感组的蛋白质谱分析比较,发现两组... 目的探讨蛋白质谱分析用于预测卵巢癌TP方案化疗敏感、耐药的临床价值。方法选择TP方案耐药和敏感的卵巢癌患者各20例,抽血进行蛋白质谱分析,比较不同敏感、耐药患者的蛋白质质谱差异。结果耐药组与敏感组的蛋白质谱分析比较,发现两组的蛋白质谱中存在M3819.54、M4474.06及M3158.49等3个差异蛋白。结论蛋白质谱分析法可用于预测卵巢癌TP方案化疗敏感、耐药,具有方法简便,特异性高、敏感性强等优点。 展开更多
关键词 卵巢癌 化疗 蛋白质谱分析 耐药
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双向电泳及质谱分析与蛋白组研究 被引量:16
11
作者 许克新 王云川 《第四军医大学学报》 北大核心 2002年第22期2017-2022,共6页
蛋白组分析是对生物蛋白组的分析与检测 ,即对生物蛋白质的大范围研究 .蛋白组分析首先要将混合蛋白质分离 ,分离的主要方法是蛋白双向电泳 .蛋白双向电泳是一种高效且广泛应用于分析由细胞、组织或其他生物样本中提取的复杂蛋白混合物... 蛋白组分析是对生物蛋白组的分析与检测 ,即对生物蛋白质的大范围研究 .蛋白组分析首先要将混合蛋白质分离 ,分离的主要方法是蛋白双向电泳 .蛋白双向电泳是一种高效且广泛应用于分析由细胞、组织或其他生物样本中提取的复杂蛋白混合物的方法 .此方法根据蛋白互不关联的两个特性 -等电点和分子量对蛋白进行分离 .它分辨率高 ,稳定性好 ,是蛋白组分析的关键技术之一 .已被分离的蛋白质由质谱分析对其进行鉴定 .质谱测量主要有两种方式 :基质辅助激光解吸电离 /飞行时间质谱测量法和电子喷雾电离质谱测量法 .此两种方法操作方式不同 ,但其所获得的信息互为补充 .前者以多肽质量 /电荷比为依据同数据库资料进行比较 ,进而对蛋白进行鉴定 ,此法通常被称为多肽质量指纹分析 .后者由离子谱推得多肽的氨基酸序列 ,并依据这些氨基酸序列进行蛋白鉴定 ,此法较多肽质量指纹分析鉴定更准确、可靠 .蛋白组分析可用于样本全蛋白检测 ,样本蛋白表达检测 ,蛋白相互作用检测和蛋白修饰检测等方面 ,具有广阔的前景 . 展开更多
关键词 质谱分析 双向电泳 蛋白质 蛋白组分析
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质谱在重组蛋白质质控中的应用 被引量:1
12
作者 田小琳 曾嵘 +1 位作者 邵晓霞 夏其昌 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1998年第5期11-13,共3页
利用质谱技术鉴定了重组白介素-3(rIL-3)的蛋白质纯度,精确测定了分子量、rIL-3的胰蛋白酶酶解图谱和各肽的分子量,在较高水平上简要阐明了重组蛋白分子的完整性和与天然IL-3的一致性,这对重组蛋白的质控具有普遍... 利用质谱技术鉴定了重组白介素-3(rIL-3)的蛋白质纯度,精确测定了分子量、rIL-3的胰蛋白酶酶解图谱和各肽的分子量,在较高水平上简要阐明了重组蛋白分子的完整性和与天然IL-3的一致性,这对重组蛋白的质控具有普遍的意义。 展开更多
关键词 重组技术 白介素-3 质谱 蛋白质 质量控制
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体外缺氧诱导子痫前期滋养细胞模型优化及代谢组学鉴定 被引量:11
13
作者 杨晓涛 韩顶立 +3 位作者 Philip N.Baker 漆洪波 童超 杨竹 《重庆医科大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1045-1052,共8页
目的:探讨滋养细胞体外缺氧不同处理方法模拟子痫前期模型的优化研究。方法:HTR8/SVneo滋养细胞分别在1%O2(缺氧环境)和21%O2(常氧环境)培养箱中培养1 h(记为H1、N1)或2 h(记为H2、N2),缺氧1 h后复氧1 h(记为H1R1)和缺氧2 h后复氧2 h(记... 目的:探讨滋养细胞体外缺氧不同处理方法模拟子痫前期模型的优化研究。方法:HTR8/SVneo滋养细胞分别在1%O2(缺氧环境)和21%O2(常氧环境)培养箱中培养1 h(记为H1、N1)或2 h(记为H2、N2),缺氧1 h后复氧1 h(记为H1R1)和缺氧2 h后复氧2 h(记为H2R2),H1R1后再缺氧1 h(记为H1R1H1),H2R2后再缺氧2 h(记为H2R2H2),H1R12个循环(记为H1R1H1R1)和H2R22个循环(记为H2R2H2R2),缺氧2 h后复氧6 h(记为H2R6),持续缺氧24 h,以及持续常氧4 h(记为N4)、8 h(记为N8)和24 h(记为Normoxia),然后提取蛋白以Western blot检测腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)磷酸化水平,以验证各组处理对于诱导滋养细胞能量应激的效果;HTR8/SVneo滋养细胞在常氧或者缺氧环境培养24 h后经气相质谱技术(gas chromatography mass spectrum,GS-MS)进行细胞代谢组学分析,以验证AMPK磷酸化水平上调是否与滋养细胞代谢组变化具有一致性。结果:缺氧组AMPK的活性(1.615±0.111)明显高于常氧组(1.000±0.107)和缺氧复氧组(1.277±0.113);缺氧时显著增加的代谢物有4-甲基-2-戊酮酸(log22.597为1.377)、水合乙醛酸(log22.483为1.312)、组氨酸(log21.188为0.248)、苯丙氨酸(log21.262为0.335)、缬氨酸(log21.518为0.602)、正亮氨酸(log21.519为0.603)、乙酰丝氨酸(log21.691为0.758)、丝氨酸(log21.783为0.834)、半胱氨酸(log21.851为0.889)、蛋氨酸(log22.072为1.051)、鸟氨酸(log22.251为1.170)等;而棕榈反油酸(log20.127为-2.983)、11,14,17-廿碳三烯酸(log20.334为-1.583)、二十四单烯酸(log20.600为-0.738)、共轭亚油酸(log20.680为-0.557)、顺式十八碳烯酸(log20.711为-0.492)、9-十七碳烯酸(log20.782为-0.355)、二十二碳六烯酸(log20.829为-0.271)、二十碳五烯酸(log20.841为-0.250)、芥酸(log20.844为-0.244)、二十二碳五烯酸(log20.898为-0.156)、柠檬酸(log20.279为-1.842)、苹果酸(log20.208为-2.264)、琥珀酸(log20.254为-1.980)、顺乌头酸(log20.260为-1.946)、β-柠檬酸-左旋谷氨酸(log20.093为-3.430)、β-丙氨酸(log20.139为-2.851)、胱硫醚(log20.267为-1.904)、顺式-4-羟脯氨酸(log20.500为-1.000)等在缺氧时显著降低。代谢途径结果分析显示缺氧时滋养细胞中核苷酸代谢[log2(1.811、1.149)分别为0.857、0.201]、能量代谢[log2(1.510、1.173、1.149)分别为0.595、0.230、0.201]、维生素代谢[log2(1.045、1.052、1.125)分别为0.064、0.073、0.170]、氨基酸代谢[log2(1.245、1.020、1.027、1.123、1.127、1.076)分别为0.316、0.028、0.039、0.167、0.173、0.106]、信号转导(log21.046为0.065)、蛋白翻译(log21.026为0.037)等途径被激活,而碳水化合物[log2(0.857、0.857、0.799)分别为-0.222、-0.222、-0.323]、脂肪酸[log2(0.944、0.912、0.826)分别为-0.083、-0.133、-0.276]、内分泌代谢[log2(0.885、0.799、0.799)分别为-0.176、-0.323、-0.323]和其他第二代谢物生物合成[log2(0.947、0.871、0.743)分别为-0.079、-0.199、-0.428]等代谢途径显著受到抑制。结论:单纯缺氧模型更适合用于子痫前期病理生理机制的体外研究。 展开更多
关键词 子痫前期 HTR8/SVneo滋养细胞 缺氧 腺苷酸活化蛋白激酶 气相质谱技术
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多囊卵巢综合征蛋白质指纹谱研究 被引量:2
14
作者 赵淑云 乔杰 李美芝 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期362-365,共4页
目的:探讨用蛋白质芯片技术筛选多囊卵巢综合征(polycysticovarysyndrome,PCOS)患者血清蛋白质表达谱,寻找血清中的标志性蛋白。方法:采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surfaceenhancedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmass... 目的:探讨用蛋白质芯片技术筛选多囊卵巢综合征(polycysticovarysyndrome,PCOS)患者血清蛋白质表达谱,寻找血清中的标志性蛋白。方法:采用表面增强激光解离飞行时间质谱技术(surfaceenhancedlaserdesorption/ionizationtimeofflightmassspectrometry,SELDITOFMS),运用WCX2(weakcationexchange)蛋白质芯片检测31例PCOS患者和30例正常对照血清蛋白质谱,获得的蛋白质谱采用BiomarkerWizard软件分析,初步筛选蛋白质峰,结合生物信息学的支持向量机(supportvectormachines,SVM)方法建立并测试PCOS患者的蛋白质指纹图谱模型。结果:在芯片上捕获到225种蛋白质,用质谱仪筛选出PCOS患者与正常对照组相比的23种差异蛋白,从中再次筛选出4种蛋白质组成PCOS的蛋白质谱最优化模型,PCOS患者中质荷比(m/z)分别为6628,6430,6834的3种蛋白质表达上调,m/z为3954的蛋白质表达下调。模型经三倍交叉验证后用盲法测定,其敏感性和特异性分别为83.3%和86.7%,阳性预测值为87.2%。结论:蛋白质芯片技术可以快速、有效地筛选出PCOS患者血清差异蛋白,结合SVM可建立一个由4种蛋白质组成的蛋白质指纹图谱模型,可对PCOS做很好的诊断预测,对这4种蛋白质尤其是m/z为6628的蛋白质进行研究,有助于PCOS病因学进展及诊断标记物的发现。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 蛋白质阵列分析 光谱分析 质量
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花生分离蛋白水解物中血管紧张素转化酶抑制肽的分离纯化与结构鉴定 被引量:5
15
作者 黎观红 乐国伟 施用晖 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第6期56-61,共6页
利用碱性蛋白酶Alcalase对花生分离蛋白进行水解,制备花生分离蛋白水解物,并测定不同水解时间所得产物对血管紧张素转化酶(ACE)的抑制作用。未水解的花生分离蛋白没有ACE抑制活性,而利用碱性蛋白酶Alcalase水解所得的水解物具有很强的AC... 利用碱性蛋白酶Alcalase对花生分离蛋白进行水解,制备花生分离蛋白水解物,并测定不同水解时间所得产物对血管紧张素转化酶(ACE)的抑制作用。未水解的花生分离蛋白没有ACE抑制活性,而利用碱性蛋白酶Alcalase水解所得的水解物具有很强的ACE抑制活性,水解30 min时水解物活性最高,其半抑制浓度为(IC50)0.56 mg/mL。通过超滤、Sephadex G-15凝胶过滤层析、反相高效液相色谱(RP-HPLC)、基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS/MS)和氨基酸组成分析等分析手段从水解30 min所得的水解物中分离鉴定出两种新的ACE抑制肽,氨基酸序列为Gln-Gly-Gly-Ser-Gly-Met-Thr-Leu-Ala-Phe-Pro-Leu-Pro-Lys和Lys-Ile-Phe-Leu-Arg-Leu-Ser,其IC50值分别为10.6μmol/L和36.6μmol/L。 展开更多
关键词 血管紧张素转化酶抑制肽 花生分离蛋白 碱性蛋白酶 分离纯化 质谱
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高温胁迫对淮阴苜蓿差异蛋白表达及生理的影响 被引量:4
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作者 王仪明 李伟民 +2 位作者 雷艳芳 魏臻武 韩正晟 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期441-446,共6页
为进一步了解紫花苜蓿在高温胁迫下的生理变化和相关差异蛋白表达情况,本研究以淮阴苜蓿(Medicago sativa L.cv.Huaiyin)为材料,以25℃为对照,对30℃、35℃和40℃不同高温胁迫下,淮阴苜蓿不同时期(0 h、0.5 h、1 h、4 h、12 h和24 h)幼... 为进一步了解紫花苜蓿在高温胁迫下的生理变化和相关差异蛋白表达情况,本研究以淮阴苜蓿(Medicago sativa L.cv.Huaiyin)为材料,以25℃为对照,对30℃、35℃和40℃不同高温胁迫下,淮阴苜蓿不同时期(0 h、0.5 h、1 h、4 h、12 h和24 h)幼苗叶片的电导率、丙二醛(MDA)、细胞活力的动态变化进行监测,并进一步对35℃和40℃高温处理24 h的幼苗叶片差异表达蛋白进行筛选、分析和鉴定研究。结果发现,淮阴苜蓿在35℃和40℃高温下,生长0.5 h,叶片的电导率含量开始急剧上升,1 h后电导率下降,并随着处理时间的延长,电导率变化趋缓;生长1 h时,叶片的MDA含量较高,4 h后MDA含量平缓下降;细胞活力随着时间的延长总体表现出下降的趋势。差异蛋白点筛选分析结果显示,在35℃处理24 h时,有27个点存在显著差异,其中19个点是上调的,与对照图谱相比,新增了5个特殊的蛋白点。在40℃处理24 h时,有51个点存在显著差异,其中40个点是上调的,与对照图谱相比,新增了11个特殊的蛋白点。对40℃时51个蛋白点进行二级质谱鉴定发现,20 k D chaperonin、Hsp70、Hsp23和Hsp17这4个蛋白与防御机制有关,说明40℃诱导产生更多的防御蛋白,对膜系统损伤起到一定的修复功能。 展开更多
关键词 淮阴苜蓿 高温胁迫 生理指标 蛋白质组 二级质谱 热激蛋白
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人成熟卵泡液蛋白质谱图的初步研究 被引量:2
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作者 李黎 邢福祺 +2 位作者 陈士岭 孙玲 李红 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2007年第6期453-456,共4页
目的:建立人成熟卵泡液的蛋白质谱图,筛选鉴定卵泡发育/卵母细胞成熟的相关蛋白质。方法:选取48例因男性因素行ICSI-ET治疗的女性为研究对象,收集取卵时获得的人成熟卵泡液,采用双向凝胶电泳-质谱技术分离鉴定人成熟卵泡液蛋白质谱图。... 目的:建立人成熟卵泡液的蛋白质谱图,筛选鉴定卵泡发育/卵母细胞成熟的相关蛋白质。方法:选取48例因男性因素行ICSI-ET治疗的女性为研究对象,收集取卵时获得的人成熟卵泡液,采用双向凝胶电泳-质谱技术分离鉴定人成熟卵泡液蛋白质谱图。结果:获得了较高分辨率的人成熟卵泡液蛋白质谱图,共检测到180多个蛋白质点,筛选鉴定了5个蛋白质点,分别是载脂蛋白E、PRO2044、Hypothetical protein、免疫球蛋白G重链以及转铁蛋白,PRO2044和Hypothetical protein根据蛋白数据库的鉴定分析结果可能是血清白蛋白的修饰产物。转铁蛋白和载脂蛋白E在以往卵泡发育机制的研究罕有报道。结论:蛋白质组学是全面分析人卵泡发育过程中卵泡液蛋白质表达变化的有效手段,筛选鉴定得到的卵母细胞成熟相关蛋白为进一步研究卵母细胞成熟机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 卵泡液 蛋白质谱图 电泳 凝胶 双向 光谱分析 质量
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不同盐度对Halomonas aquamarina外膜蛋白表达的影响 被引量:4
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作者 林向民 王风平 王三英 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B06期128-131,共4页
革兰氏阴性细菌的外膜蛋白(Omp)在维持细菌的生理状态和抵抗外界极端环境中起重要的作用.为研究革兰氏阴性细菌外膜蛋白的抗盐机制,通过比较深海中度嗜盐菌Halomonasaquamarina在正常盐度浓度(0.56mol/LNaCl)、较高(1mol/LNaCl)和高盐度... 革兰氏阴性细菌的外膜蛋白(Omp)在维持细菌的生理状态和抵抗外界极端环境中起重要的作用.为研究革兰氏阴性细菌外膜蛋白的抗盐机制,通过比较深海中度嗜盐菌Halomonasaquamarina在正常盐度浓度(0.56mol/LNaCl)、较高(1mol/LNaCl)和高盐度(2mol/LNaCl)下外膜蛋白的双向电泳图谱,获得11个差异点.对这11个差异点进行肽质量指纹图谱及其生物信息分析,鉴定出其中的6个蛋白,并对中度嗜盐细菌外膜蛋白的抗盐机理做了初步的探讨. 展开更多
关键词 蛋白表达 革兰氏阴性细菌 外膜蛋白 生物信息分析 双向电泳图谱 中度嗜盐菌 抗盐机制 极端环境 生理状态 抗盐机理 嗜盐细菌 指纹图谱 高盐度
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小鼠卵巢蛋白质双向凝胶电泳蛋白谱系的初步建立及其功能分析 被引量:4
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作者 马翔 钱云 +8 位作者 谢满鑫 侯振 孟艳 刘金勇 翟永宁 朱叶飞 周作民 沙家豪 刘嘉茵 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期581-586,共6页
目的:初步建立性成熟小鼠卵巢蛋白质图谱,并对其中的蛋白质功能进行研究。方法:通过双向电泳和质谱技术分析性成熟小鼠卵巢蛋白质组,并对其中的一种蛋白质进行免疫组化研究。结果:(1)获得高重复性和高分辨率小鼠卵巢蛋白图谱。软... 目的:初步建立性成熟小鼠卵巢蛋白质图谱,并对其中的蛋白质功能进行研究。方法:通过双向电泳和质谱技术分析性成熟小鼠卵巢蛋白质组,并对其中的一种蛋白质进行免疫组化研究。结果:(1)获得高重复性和高分辨率小鼠卵巢蛋白图谱。软件分析显示,3个不同卵巢样品24cm 银染蛋白凝胶上的蛋白点均有±2000点,胶重复性好,大部分蛋白点位于相对相同的位置。(2)质谱共鉴定出52种蛋白质,按功能对其进行分类:参与细胞代谢、细胞信号传导/交流、细胞结构/运动、细胞/器官防御与抗氧化作用、调节 RNA 合成、调节蛋白表达及未分类。(3)通过对其中的一种蛋白(GRP78)行免疫组化分析,发现随着卵巢由卵泡早期逐渐生长到排卵前卵泡期成熟并转向黄体期,其在颗粒细胞中的表达信号增强。结论:(1)3个不同卵巢样品蛋白质双向电泳图重复性好。我们通过质谱分析共鉴定出约52种蛋白质,初步构建了小鼠卵巢双向电泳蛋白图谱,对研究卵巢病理与生理、发育过程有着重要的参考价值。(2)行免疫组化分析结果显示,在卵巢周期变化过程中,GRP78蛋白对颗粒细胞的增生、分化、形成黄体颗粒细胞起着重要的调控作用。 展开更多
关键词 卵巢 小鼠 蛋白质 巢蛋白 免疫组化分析 颗粒细胞 双向电泳 双向凝胶电泳 银染 细胞信号传导
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蛋白质分离和鉴定的新技术新方法研究进展 被引量:4
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作者 杨开广 张丽华 张玉奎 《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》 CAS 2012年第5期1-7,12,共8页
综述了国家重大科学研究计划"蛋白质分离和鉴定新技术新方法"课题的研究进展:高丰度蛋白质去除方面,采用强阳离子交换色谱(SCX)和反相色谱(RPLC),构建二维液相色谱分离系统;利用分子印迹技术制备高丰度蛋白质印迹聚合物.低丰... 综述了国家重大科学研究计划"蛋白质分离和鉴定新技术新方法"课题的研究进展:高丰度蛋白质去除方面,采用强阳离子交换色谱(SCX)和反相色谱(RPLC),构建二维液相色谱分离系统;利用分子印迹技术制备高丰度蛋白质印迹聚合物.低丰度蛋白分离富集方面,采用新型功能材料磷酸化蛋白质/多肽、糖基化蛋白质/多肽、蛋白质/多肽实现对低丰度蛋白质的选择性富集.多维、多模式、阵列式的蛋白质高效分离方面,利用循环分离体积排阻色谱(csrSEC)和RPLC的联用构建多维分离系统;构建弱阴弱阳离子混合色谱-固定化酶反应器-RPLC-电喷雾质谱系统.高灵敏鉴定新技术新方法方面,发展液质联用接口技术,以中空纤维膜为根本,设计以此为核心的集成化样品预处理装置;新发展多肽衍生试剂,能够将肽段在质谱的检测灵敏度提高1—2个数量级;在靶体材料方面,采用复合核壳纳米功能靶体材料;在质谱数据处理方法方面,基于遗传算法发展筛选标准优化策略.这些新技术和新方法为蛋白质组研究提供了有效的方法.选择性吸附材料的研制为蛋白质组学研究中高丰度蛋白质去除和低丰度蛋白质富集提供了新的途径,进而避免了复杂体系对目标蛋白质鉴定的干扰.以多维、多模式、阵列式的蛋白质高效分离技术为核心构建的平台,实现了蛋白质组的高效、高通量、高可靠性分离;以液相色谱/质谱联用为核心的高灵敏鉴定的新技术新方法的发展,提高了低丰度蛋白质的质谱鉴定灵敏度和准确度. 展开更多
关键词 蛋白质组 高丰度蛋白去除 低丰度蛋白富集 色谱分离 质谱鉴定
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