基于叶绿体psbA-trnH序列和trnL-F序列的牡丹野生种间关系

对牡丹组全部9个野生种15个居群及凤丹的叶绿体psb A-trn H和trn L-F序列进行测序,并采用邻位相连法分别构建了psb A-trn H序列和trn L-F序列的系统发育树。结果显示:1)两段序列的基因树均支持牡丹组划分为两个亚组的分类方法,与前人的研究结果一致。2)psb A-trn H序列基因树表明大花黄牡丹与黄牡丹的亲缘关系最近,这与大花黄牡丹曾被确定为黄牡丹的一个变种的历史一致。3)革质花盘亚组内,基于psb A-trn H和trn L-F序列的研究结果大体一致,分歧主要在四川牡丹的地位问题。4)psb A-trn H序列和trn L-F序列基因树分别表明杨山牡丹与凤丹具有最近或较近的亲缘关系。

中药材DNA条形码技术研究进展

药用植物滥用现象带来的众多有害反应已经引起了国内外广泛的关注。药物安全使用问题亟待解决。DNA条形码是一种强有力的分子鉴定技术,它能弥补传统形态学和化学方法鉴定中药材的不足之处。近年,DNA条形码技术给中药材的鉴定带来了新的视野也获得了众多突出性成绩。一些热门的DNA条形码候选序列如ITS,ITS2,psb A-trn H,rbc L,mat K已经用于中药材的鉴定。

八个川贝母品种的分类鉴定

对8个川贝母品种采用高效液相色谱-蒸发光散射检测器(HPLC-ELSD)进行贝母碱分析、基于百合科植物特征序列trn H-psb A的分析、以及ISSR分子标记分析。结果表明,3种方法对川贝母的鉴定都是有效的。8个川贝母品种根据不同的贝母素含量均能独立区分开,trn H-psb A序列的分析和ISSR分子标记分析的聚类结果基本相符。

多重PCR方法同时鉴别人参、西洋参、三七

目的:建立一种能同时鉴别人参属人参、西洋参、三七3种药材的多重聚合酶链反应(PCR)方法。方法:通过分析人参、西洋参、三七psb A-trn H基因序列的差异设计了特异性引物对1,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)分子标记技术筛选获得的特异性片段的基因序列,设计了特异性引物对2;优化了多重PCR鉴别体系并验证其耐受性和实用性。结果:构建的多重PCR鉴别体系能够成功地鉴别人参、西洋参、三七,人参样本可扩增出片段大小约为150 bp的特异性条带,西洋参样本可扩增片段大小出约为150 bp和400bp 2条特异性片段,三七样本可扩增出片段大小约为400 bp的特异性条带。结论:本多重PCR鉴别体系特异性好,可准确、可靠地鉴别人参、西洋参、三七。

基于DNA条形码的芦荟属6种植物的分子鉴定

目的 筛选出适合芦荟属6种植物的DNA条形码序列。方法 采用试剂盒法提取芦荟属6个品种基原植物的18份样本基因组DNA,应用通用引物扩增其核基因ITS2序列和叶绿体psb A-trn H、rbc L、mat K基因序列并进行双向测序,采用Sequencher 4.1.4软件对测序峰图进行校对拼接,应用MEGA 5.0软件分析不同候选序列的特征,计算物种的种内、种间Kimura 2-Parameter（K2P）遗传距离,比较其种内、种间变异的大小,评估序列的条形码间距（barcoding gap）,采用邻接法（neighbor-joining,NJ）构建系统聚类树。结果 共获得72条序列,ITS2、psb A-trn H、rbc L、mat K基因序列各18条,测序成功率均为100%。比对后序列长度为255~723 bp,GC量范围为30.6%~68.2%。psb A-trn H基因序列的最大种内遗传距离均小于最小种间遗传距离,有明显的barcoding gap,ITS2、rbc L、mat K序列的种内变异和种间变异有一些重叠,没有明显的barcoding gap。基于psb A-trn H序列的发育树能将芦荟属6个品种完全区分,而其他3个序列在区分这些芦荟属品种时存在模糊鉴定。结论 DNA条形码技术可以准确鉴别芦荟属植物,psb A-trn H序列可以作为鉴别芦荟属植物的优选序列。

北京地区野生北柴胡种质资源遗传多样性分析

目的:研究北京地区野生北柴胡种质资源的遗传多样性,对其遗传分化进行分析。方法:应用叶绿体DNA psb A-trn H序列对北京地区4个居群的野生北柴胡进行遗传多样性分析。结果:北京地区野生北柴胡种质资源包括6种不同的单倍型,单倍型遗传多样性指数(h)为(0.488±0.082),核苷酸多样性指数(π)为0.00236,遗传分化系数(Gst)为0.35476,种群间基因流(Nm)为0.45。结论:北京地区野生北柴胡种质资源遗传多样性较高,但部分地区柴胡遗传多样性较低,急需加强柴胡属野生资源的科学保护与质量评价。