烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1信号肽预测及分析

利用Signal P 4.0、Lipo P 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv.tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs（Open reading frame）所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽（SPI）,81条脂蛋白型信号肽（SPII）。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为11~42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示,具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间是高度保守的。该研究提供了野火病原菌致病因子的备选基因,提高该病菌致病因子的筛选效率。