基于28S rRNA基因片段的翼形亚纲(Bivalvia:Pteriomorphia)系统发育的初步研究

采用从GenBank下载的翼形亚纲11个总科80个种类的28S部分序列,对翼形亚纲11个总科贝类进行系统发育关系研究。在获得的1252个序列位点中,去除插入缺失位点,变异位点共359个,其中简约位点300个。翼形亚纲各总科内各种间的遗传距离为0.01—0.14,明显小于各总科间的遗传距离(除蚶总科与拟锉蛤总科,双肌蛤总科与襞蛤总科以及两总科与贻贝总科外)。贝叶斯树和最大似然树均支持翼形亚纲为单系群,并将11个总科分为3个聚类簇:聚类簇Ⅰ为珍珠贝总科(Pterioidea)、牡蛎总科(Ostreoidea)和江珧总科(Pinnoidea),聚类簇Ⅱ为贻贝总科(Mytiloidea)、蚶总科(Arcoidea)和拟锉蛤总科(Limopsoidea),聚类簇Ⅲ为襞蛤总科(Plicatuloidea)、不等蛤总科(Anomioidea)、双肌蛤总科(Dimyoidea)、扇贝总科(Pectinoidea)和锉蛤总科(Limoidea)。根据本研究的结果,并结合其他学者提出的分类系统,构建了包括4目11总科的翼形亚纲分类系统。

基于28S rRNA 基因D_2序列的优茧蜂亚科分子系统发育(膜翅目:茧蜂科)(英文)

本文利用28S rRNA基因D2序列对优茧蜂亚科Euphorinae (昆虫纲Insecta: 膜翅目Hymenoptera: 茧蜂科Braconidae) 进行了分子系统学研究.本研究从95%-100%乙醇浸渍保存的标本中提取基因组DNA,扩增了5种内群种类和2种外群种类的28S rRNA基因D2片段序列并测序(序列已登录GenBank,序列号为AY290719,AY291565~70),利用BLAST搜索相关的同源序列,采用了GenBank中的17个种类的28S rRNA基因D2同源序列,然后据此进行分子分析,利用3个外群(共7个种类)和2种建树方法(距离邻近法distance-based neighbor-joining, NJ和最大简约法maximum-parsimony, MP)分析了优茧蜂亚科内的分子系统发育关系.结果表明,由分子数据产生的不同的分子系统树均显示优茧蜂亚科是一个单系群;亚科内依据形态和生物学特征的分群(族)及其系统发育关系仅得到部分支持;依据形态定义的优茧蜂族Euphorini、瓢虫茧蜂族Dinocampini、缘茧蜂族Perilitini、姬蜂茧蜂族Syntretini、大颚茧蜂族Comsophorini和宽鞘茧蜂族Centistini不是单系,但研究结果支持悬茧蜂族Meteorini和食甲茧蜂族Microctonini是单系的结论.由分子数据产生的所有系统树均表明悬茧蜂族Meteorini(包括悬茧蜂属Meteorus和赛茧蜂属Zele)是一个单系.'细柄茧蜂属Lecythodella+食甲茧蜂属Microctonus+猎户茧蜂属Orionis+长柄茧蜂属Streblocera'构成单系群,即形态学定义的食甲茧蜂族Microctonini.猎户茧蜂属Orionis起初归为优茧蜂族Euphorini,分子分析认为应划归食甲茧蜂族Microctonini.优茧蜂族Euphorini是个并系,可粗略地分为2分支:'蝽茧蜂族Aridelus+魏斯茧蜂属Wesmaelia'和'毛室茧蜂属Leiophron+常室茧蜂属Peristenus'.草蛉茧蜂属Chrysopophorus的位置不明.'瓢虫茧蜂族Dinocampus+缘茧蜂族Perilitus'和'大颚茧蜂属Cosmophorus+绕茧蜂属Rhopalophorus'两分支分别有42-96和97-100的置信值支持,表明各自形成单系群.宽鞘茧蜂族Centistini中的毡腹茧蜂属Pygostolus可能应归入食甲茧蜂族Microctonini或其它相关的族.

8种唇口目苔藓动物的分子系统发生——基于28S rRNA基因的证据

对我国沿海较为常见的 8种唇口目苔藓动物的 2 8SrRNA基因的部分序列进行了PCR扩增和序列测定 .用排序软件进行序列比对后 ,以腕足动物为外组群 ,运用MEGA遗传分析软件以邻接法 (NJ)和最大似然法 (MP)构建了系统发生树 .结果表明 ,有囊亚目的 4种苔藓动物 (刺轴拟缘孔苔虫、假缘孔苔虫、拟迷误裂孔苔虫、仿分胞苔虫 )构成一个单系群 ;无囊亚目则是一个复系群 ,其中 2种草苔虫 (匍茎草苔虫、多室草苔虫 )为单系发生 。

中国林蛙的分子系统关系

测定了 6种林蛙和用作外群的 2种侧褶蛙和 1种陆蛙的线粒体 12SrRNA基因序列 393bp。序列两两对位比较表明内外群间的位点替换率是 7 3%到 2 3 1% ,内群中物种间则为 0 0 %到 9 2 %。依据上述DNA序列 ,用距离法和最大简约法的系统发育分析表明 :①研究的 6种林蛙聚为一支 ,构成单系群 ,并有高的BPs值(90 %以上 )支持 ;② 6种林蛙可以分成 2个姐妹群 ,即中国林蛙、黑龙江林蛙和桓仁林蛙为一组 (BPs >94% ) ,峨眉林蛙、昭觉林蛙和镇海林蛙为一组 (BPs >5 0 % ) ;③昭觉林蛙与镇海林蛙有较近的亲缘关系 ;④中国林蛙的榆中种群与牡丹江种群间的遗传分化似乎达到了种级分化水平。

大步甲的分子系统与进化模式

大步甲主要分布于北半球,全世界大约有1000余种。因大步甲后翅退化,不能飞行,其移动能力和扩散范围都受到很大程度的限制,因此,容易产生地理隔离和遗传分化,从而成为研究物种分化和生物多样化的好材料。近年来,通过对大步甲分子系统的详细研究,不仅很大程度上解明了大步甲各分类群间的系统发育关系,而且对大步甲的系统演化过程和形态进化模式也有了较深的理解,获得了很多重要的见解。在此做一个简单的综述。