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PTPRA在血源性丙型肝炎病毒感染胎肝干细胞中的作用
1
作者
张雪莲
郭旋
+6 位作者
张坤明
谌志强
邱志刚
杨栋
金敏
刘伟丽
李君文
《解放军预防医学杂志》
CAS
2017年第8期869-873,共5页
目的采用核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)蛋白组学技术发现并鉴定血源性丙型肝炎病毒(blood borne hepatitis C virus,bb HCV)感染人胚胎肝干细胞(human fetal liver stem cells,...
目的采用核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)蛋白组学技术发现并鉴定血源性丙型肝炎病毒(blood borne hepatitis C virus,bb HCV)感染人胚胎肝干细胞(human fetal liver stem cells,h FLSCs)的新关键因子。方法按照bb HCV感染与否以及感染后不同时间点将细胞分为5组,去除各组细胞裂解后的高丰度蛋白,运用纳升液相色谱仪(LC-ESI-MSMS)发现并鉴定差异表达蛋白,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析,最后对所鉴定出的蛋白利用RT-q PCR和Western blot进行验证。结果对各个时间点的对照组和感染组间进行差异蛋白富集分析,得到bb HCV感染h FLSCs过程中表达差异蛋白PTPRA。针对鉴定的蛋白PTPRA,利用RT-q PCR和Western blot检测发现bb HCV感染后其表达明显升高;利用小RNA技术干涉PTPRA可以降低病毒进入细胞的量。结论 PTPRA可能在bb HCV感染侵入h FLSCs和子代病毒分泌过程中发挥着重要的作用。
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关键词
hFLSCs
bbHCV
蛋白组学
ptpra
下载PDF
职称材料
羊种布氏杆菌介导巨噬细胞mmu-miR-146a-5p的差异表达及其靶基因的初步鉴定
2
作者
焦寒伟
赵宇
+7 位作者
罗艺晨
顾国靖
李博文
李文杰
周志雄
伍莉
王红均
黄庆洲
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期1320-1324,共5页
羊种布氏杆菌(Brucella melitensis,B.melitensis)感染巨噬细胞后,运用高通量测序技术挖掘出mmu-miR-146a-5p差异表达。利用TargetScan和miRDB数据库分别进行mmu-miR-146a-5p靶基因的在线预测,结果分别有224和125个,利用韦恩分析发现,2...
羊种布氏杆菌(Brucella melitensis,B.melitensis)感染巨噬细胞后,运用高通量测序技术挖掘出mmu-miR-146a-5p差异表达。利用TargetScan和miRDB数据库分别进行mmu-miR-146a-5p靶基因的在线预测,结果分别有224和125个,利用韦恩分析发现,2个数据库的在线预测结果交集有70个;进一步利用PicTar数据库进行mmumiR-146a-5p靶基因的在线预测,并与韦恩分析结果取交集;转染mmu-miR-146a-5p mimics至巨噬细胞中,通过荧光定量PCR方法检测预测靶基因的相对表达量,发现Ptpra与Tfdp2表达量显著降低,结果初步表明,mmu-miR-146a-5p的靶基因为Ptpra与Tfdp2。该试验为进一步研究mmu-miR-146a-5p在羊种布氏杆菌感染巨噬细胞过程中的作用奠定了基础。
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关键词
羊种布氏杆菌
巨噬细胞
mmu-miR-146a-5p
ptpra
Tfdp2
原文传递
题名
PTPRA在血源性丙型肝炎病毒感染胎肝干细胞中的作用
1
作者
张雪莲
郭旋
张坤明
谌志强
邱志刚
杨栋
金敏
刘伟丽
李君文
机构
广西医科大学基础医学院
防化研究院第六研究所
军事医学科学院卫生学环境医学研究所
出处
《解放军预防医学杂志》
CAS
2017年第8期869-873,共5页
基金
国家自然科学基金青年项目(No.31600955)
文摘
目的采用核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)蛋白组学技术发现并鉴定血源性丙型肝炎病毒(blood borne hepatitis C virus,bb HCV)感染人胚胎肝干细胞(human fetal liver stem cells,h FLSCs)的新关键因子。方法按照bb HCV感染与否以及感染后不同时间点将细胞分为5组,去除各组细胞裂解后的高丰度蛋白,运用纳升液相色谱仪(LC-ESI-MSMS)发现并鉴定差异表达蛋白,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析,最后对所鉴定出的蛋白利用RT-q PCR和Western blot进行验证。结果对各个时间点的对照组和感染组间进行差异蛋白富集分析,得到bb HCV感染h FLSCs过程中表达差异蛋白PTPRA。针对鉴定的蛋白PTPRA,利用RT-q PCR和Western blot检测发现bb HCV感染后其表达明显升高;利用小RNA技术干涉PTPRA可以降低病毒进入细胞的量。结论 PTPRA可能在bb HCV感染侵入h FLSCs和子代病毒分泌过程中发挥着重要的作用。
关键词
hFLSCs
bbHCV
蛋白组学
ptpra
Keywords
hFLSCs
bbHCV
proteomics
ptpra
分类号
R51 [医药卫生—内科学]
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
羊种布氏杆菌介导巨噬细胞mmu-miR-146a-5p的差异表达及其靶基因的初步鉴定
2
作者
焦寒伟
赵宇
罗艺晨
顾国靖
李博文
李文杰
周志雄
伍莉
王红均
黄庆洲
机构
西南大学动物科学学院兽医科学工程研究中心
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期1320-1324,共5页
基金
国家自然科学基金青年基金资助项目(31802215)
重庆市基础研究与前沿探索资助项目(cstc2018jcyjA0807)
中央高校基本科研业务费资助项目(XDJK2019C02,XDJK2019D013)
文摘
羊种布氏杆菌(Brucella melitensis,B.melitensis)感染巨噬细胞后,运用高通量测序技术挖掘出mmu-miR-146a-5p差异表达。利用TargetScan和miRDB数据库分别进行mmu-miR-146a-5p靶基因的在线预测,结果分别有224和125个,利用韦恩分析发现,2个数据库的在线预测结果交集有70个;进一步利用PicTar数据库进行mmumiR-146a-5p靶基因的在线预测,并与韦恩分析结果取交集;转染mmu-miR-146a-5p mimics至巨噬细胞中,通过荧光定量PCR方法检测预测靶基因的相对表达量,发现Ptpra与Tfdp2表达量显著降低,结果初步表明,mmu-miR-146a-5p的靶基因为Ptpra与Tfdp2。该试验为进一步研究mmu-miR-146a-5p在羊种布氏杆菌感染巨噬细胞过程中的作用奠定了基础。
关键词
羊种布氏杆菌
巨噬细胞
mmu-miR-146a-5p
ptpra
Tfdp2
Keywords
Brucella melitensis
macrophages
mmu-miR-146a-5p
ptpra
Tfdp2
分类号
R378.5 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PTPRA在血源性丙型肝炎病毒感染胎肝干细胞中的作用
张雪莲
郭旋
张坤明
谌志强
邱志刚
杨栋
金敏
刘伟丽
李君文
《解放军预防医学杂志》
CAS
2017
0
下载PDF
职称材料
2
羊种布氏杆菌介导巨噬细胞mmu-miR-146a-5p的差异表达及其靶基因的初步鉴定
焦寒伟
赵宇
罗艺晨
顾国靖
李博文
李文杰
周志雄
伍莉
王红均
黄庆洲
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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